首个百亿级可部署基因组基础模型发布
10月23日，在第二十届国际基因组学大会上，华大生命科学研究院与之江实验室联合发布了首个百亿参数可部署的基因组通用基础模型（Genos）。这一针对人类基因组深度优化的基因组基础模型，可支持高达百万碱基对的超长上下文分析，并实现单碱基分辨率的精准识别，有望为临床疾病诊断、个人基因组解读及前沿科学研究带来突破性变革。相关研究成果于22日发表于GigaScience。基因组学领域内的现有模型大多基于一到两个参考基因组进行训练，难以捕捉人类丰富的遗传多样性。而Genos则系统整合了人类泛基因组参考联盟、人类基因组结构变异图谱计划等多个权威公开资源，首次汇聚了全球范围内636个“端粒到端粒”级别的高质量人类基因组作为训练数据。这些数据覆盖了全球不同人群，旨在从源头减少数据偏见，更全面地代表人类遗传多样性。基因组的语言极其复杂，一个微小的单碱基突变，其影响可能由百万碱基之外的“遥远”调控元件决定。这要求模型既要有“显微镜”般的单碱基精度，又......阅读全文
首个百亿级可部署基因组基础模型发布
10月23日，在第二十届国际基因组学大会上，华大生命科学研究院与之江实验室联合发布了首个百亿参数可部署的基因组通用基础模型（Genos）。这一针对人类基因组深度优化的基因组基础模型，可支持高达百万碱基对的超长上下文分析，并实现单碱基分辨率的精准识别，有望为临床疾病诊断、个人基因组解读及前沿科学研究带
动物模型基础
第一部分 动物模型的分类一、按产生原因分类（一）自发性动物模型（Spontaneous Animal Models）是指实验动物未经任何有意识的人工处置，在自然情况下所发生的疾病。包括突变系的遗传疾病和近交系的肿瘤疾病模型。突变系的遗传疾病很多，可分为代谢性疾病、分子疾病和特种蛋白质合成异常性疾病。
核小体模型的建立基础和研究
人们接着用化学交联、高盐分离组蛋白，以及X衍射等方法进一步研究组蛋白多聚体的结构、排列以及怎样和DNA结合的，从而建立了核小体模型。1984年Klug和Butler进行了修正。核小体的构造可用图表示：每一个核小体结合的DNA总量为200bp左右，一般在150~250变化范围（micrococcal
智能CT基础模型助力放疗精准决策
宫颈癌是威胁女性健康的重大疾病，对于局部晚期患者，虽然标准的同步放化疗能让约70%的患者获得无病生存，但仍有近三分之一面临复发转移风险。为提高治疗成功率，临床开始探索强化治疗策略，但这些方案在改善生存的同时也带来更高的毒性和费用负担。因此，如何在治疗前精准识别出真正需要强化治疗的高风险患者，既确保他
细胞化学基础叶绿体基因组－－cpDNA
叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA（cpDNA）是双链环状，缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝位于类核
全球首个百亿级遥感解译基础模型发布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/10/531092.shtm
广州首个基础大模型“黄埔星”正式问世
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515970.shtm1月12日，第二届粤港澳大湾区（黄埔）国际算法算例大赛颁奖典礼、第三届启动会暨大模型圆桌论坛在广东广州开发区、广州市黄埔区举办。活动当天，10个赛道共计80支队伍登上粤港澳大湾区（黄埔
香港首个自主研发基础大模型初步完成
中新社香港4月14日电 (记者 戴梦岚)第二届香港国际创科展日前在香港会议展览中心开幕。香港科技大学首席副校长兼“香港生成式人工智能研发中心”(HKGAI)主任郭毅可在展会上接受记者采访时透露，由HKGAI训练、香港首个自主研发的基础大模型已初步完成。郭毅可表示，该大模型支持中文和英语，将为香港人工
人造器官模型为乙肝药物开发打下基础
乙型肝炎病毒（HBV）感染目前无法治愈，它在全球影响几亿人。由于缺乏能用于测试潜在疗法的模型，治疗领域发展缓慢。近日，伦敦帝国理工学院（Imperial College London）的科学家们在人造器官模型中测试了病毒感染，这一成功有望加速该领域研究。相关论文已发表在《Nature Commu
蛋白质结构和功能的基础模型
蛋白质设计程序使用在体内环境中驱动蛋白质的分子力的计算机模型。为了使问题易于解决，蛋白质设计模型简化了这些作用力。尽管蛋白质设计程序相差很大，但它们必须解决四个主要的建模问题：设计的目标结构是什么，目标结构允许什么样的灵活性，搜索中包括哪些序列，以及将使用哪个力场来分数序列和结构。目标结构蛋白质功能
科研人员开发出RNA基础语言模型
在真核生物中，RNA转录、剪接、翻译和降解等生物学过程受到顺式调控元件、RNA结构和反式作用因子的调控。解析RNA多层次调控，对研究基因表达分子机制和设计RNA药物具有重要意义。但是，由于调控复杂和数据量不足，构建RNA调控的预测模型面临挑战。 近日，中国科学院上海营养与健康研究所研究员张国庆
新思路！学者使用基础模型化解小样本学习问题
如何让模型算法仅利用“少量、低质量的有标注样本”，就能实现或接近“大量、高质量、有标注数据的样本”所能达到的结果，是小样本学习领域的关键问题。为此，之江实验室前沿基础研究中心博士后邵帅为小样本计算研究提出了新思路。他的思路是，通过利用已有基础模型资源的优势潜力，实现下游任务中小样本测试数据的精准分类
专著《树鼩基础生物学与疾病模型》出版
在国家863计划课题的支持下，中国科学院昆明动物研究所联合中国科学技术大学等7家单位的专家学者共同编著《树鼩基础生物学与疾病模型》。该书较全面地介绍了树鼩基础生物学和疾病模型研究相关领域的最新进展与发展趋势，其中许多研究成果属于首次报道。 中国科学院副院长张亚平院士为本专著作序，全书分为树鼩
新思路！学者使用基础模型化解小样本学习问题
如何让模型算法仅利用“少量、低质量的有标注样本”，就能实现或接近“大量、高质量、有标注数据的样本”所能达到的结果，是小样本学习领域的关键问题。为此，之江实验室前沿基础研究中心博士后邵帅为小样本计算研究提出了新思路。 他的思路是，通过利用已有基础模型资源的优势潜力，实现下游任务中小样本测试数据的
相分离调控线粒体基因组空间秩序的模型
中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘兴国团队联合清华大学、南方科技大学、北京大学、香港中文大学等科研人员，研究发现线粒体基因组与其结合蛋白，利用生物分子最基础的自发聚集的相分离性质，调控线粒体类核的组装以及转录的复杂过程，构建了首个相分离调控线粒体基因组结构与功能的模型。相关研究10月28日在
大型研究为癌症基因组分析奠定基础
12月9日，国际癌症基因组协会（ICGC）在著名的《Nature Communications》杂志，发表了一篇令人瞠目的文章，它为即将到来的癌症基因组学研究时代，奠定了基础。该项目，是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German
首个！百亿级遥感解译基础模型“空天·灵眸”发布
9月21日，在第一届空天信息技术大会上，中国科学院空天信息创新研究院（空天院）研究员付琨团队联合鹏城实验室，正式发布自主研制的百亿级遥感解译基础模型——“空天·灵眸”3.0版，这是迄今为止全球首个百亿参数级空天一体遥感解译基础模型。近年来，我国遥感数据获取能力不断增强，已进入遥感大数据时代，人工智能
全球首个跨物种大脑空间转录组基础模型发布
7月11日，由临港实验室牵头，联合上海科学智能研究院、上海交通大学、东京大学国际神经智能研究中心等多家单位，共同发布了全球首个跨物种大脑空间转录组基础模型BrainBeacon。生命科学中的细胞“语言”由DNA、RNA、蛋白质和基因表达等分子“词语”构成。开发基于这种特殊“语言”的人工智能（AI）细
全球首个跨物种大脑空间转录组基础模型发布
7月11日，由临港实验室牵头，联合上海科学智能研究院、上海交通大学、东京大学国际神经智能研究中心等多家单位，共同发布了全球首个跨物种大脑空间转录组基础模型BrainBeacon。生命科学中的细胞“语言”由DNA、RNA、蛋白质和基因表达等分子“词语”构成。开发基于这种特殊“语言”的人工智能（AI）细
AI模型“Evo”：揭开基因组“密码全书”新篇章
《科学》杂志15日发布了一项突破性研究成果：美国斯坦福大学Arc研究所团队利用人工智能（AI），开发出一种大规模基因组基础模型“Evo”，翻开了生命的“密码全书”。该模型采用先进架构，能够以前所未有的精度，解析和设计从分子层面到整个基因组级别的DNA、RNA及蛋白质序列。其不仅能够预测突变对细胞内部
提出相分离调控线粒体基因组空间秩序的模型
中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘兴国团队联合清华大学、南方科技大学、北京大学、香港中文大学等科研人员，研究发现线粒体基因组与其结合蛋白，利用生物分子最基础的自发聚集的相分离性质，调控线粒体类核的组装以及转录的复杂过程，构建了首个相分离调控线粒体基因组结构与功能的模型。相关研究1
以硅膜为基础分离基因组－DNA－实验
硅化学法已成为从小鼠尾剪取物、动物组织和组织培养细胞等样品中纯化高质量基因组 DNA 的方法之一。Wizard SV 基因组 DNA 纯化体系是利用一个充有固相硅的滤膜来纯化 基因组 DNA 的。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒PBSNa2 HP04KH2P
以硅膜为基础分离基因组－DNA－实验
试剂、试剂盒 PBS Na2 HP04 KH2PO4 NaCl KC1 消化液 MasterMix 蛋白酶 K
研究系统揭示番木瓜驯化的基因组基础
近日，中国热带农业科学院热带生物技术研究所/热带作物生物育种全国重点实验室分子设计育种研究团队在番木瓜优良基因资源挖掘和驯化性状基因组选择方面取得进展。研究构建两个表型差异的两性株栽培品种的高质量基因组及其单倍型分型的性别决定区（SDRs），破译了番木瓜果实产量和品质性状逐步选择及其两性株性状独特起
以硅膜为基础分离基因组－DNA－实验
试剂、试剂盒 PBSNa2 HP04KH2PO4NaClKC1消化液 MasterMix蛋白酶 K仪器、耗材 自动定位器P250 盒装吸头 平板密封条Vac-Man96 真空装置 真空泵实验步骤 一、材料1.缓冲液、溶液和试剂1XPBS(用于组织培养细胞）将下列试剂溶解于1L消毒的去离子水中，高压灭
遥感跨模态基础模型关键技术研究项目获批
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500252.shtm近日，科技创新2030—“新一代人工智能”重大项目中的“遥感跨模态基础模型关键技术研究”项目获批。 ?为落实国务院印发的《新一代人工智能发展规划》总体部署，科技部启动实施科
黄瓜变异组研究奠定全基因组设计育种基础
中国农业科学院蔬菜花卉研究所领导的国际黄瓜变异组研究团队，对115个黄瓜品系进行深度重测序，构建了包含360多万个位点的全基因组遗传变异图谱，为全面了解黄瓜进化及多样性提供了新思路，并为全基因组设计育种打下了基础。相关成果10月20日在线发表于《自然·遗传学》杂志。 据国际黄瓜基因组计划首
细胞化学基础蓝藻和叶绿体基因组的比较研究
原核的蓝藻和真核植物（包括其他藻类）中的叶绿体，都同样进行放氧的光合作用，这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析，证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测
全球首个百亿级空天一体遥感解译基础模型发布
日前，全球首个百亿参数级遥感解译基础模型“空天·灵眸”3.0版发布。该模型由中国科学院空天信息创新研究院付琨研究员团队与鹏城实验室联合研制，可实现对遥感观测数据的自动化、高精度解译处理，已在应急、国土、海洋、住建等多个行业部署试运行。近年来，随着遥感数据获取能力不断增强，我国已进入遥感大数据时代，人
新的谷氨酸棒杆菌基因组规模代谢网络模型
谷氨酸棒状杆菌（Corynebacterium glutamicum），是重要的工业微生物之一，被广泛应用于氨基酸、有机酸、维生素和生物能源等的工业化生产。作为工业生产菌种，谷氨酸棒杆菌具有耐受高强度发酵的鲁棒性、环境适应性强等特点。该菌的基因组测序已完成，遗传操作系统正在被不断地完善。目前，谷