首个百亿级可部署基因组基础模型发布
10月23日,在第二十届国际基因组学大会上,华大生命科学研究院与之江实验室联合发布了首个百亿参数可部署的基因组通用基础模型(Genos)。这一针对人类基因组深度优化的基因组基础模型,可支持高达百万碱基对的超长上下文分析,并实现单碱基分辨率的精准识别,有望为临床疾病诊断、个人基因组解读及前沿科学研究带来突破性变革。相关研究成果于22日发表于GigaScience。基因组学领域内的现有模型大多基于一到两个参考基因组进行训练,难以捕捉人类丰富的遗传多样性。而Genos则系统整合了人类泛基因组参考联盟、人类基因组结构变异图谱计划等多个权威公开资源,首次汇聚了全球范围内636个“端粒到端粒”级别的高质量人类基因组作为训练数据。这些数据覆盖了全球不同人群,旨在从源头减少数据偏见,更全面地代表人类遗传多样性。基因组的语言极其复杂,一个微小的单碱基突变,其影响可能由百万碱基之外的“遥远”调控元件决定。这要求模型既要有“显微镜”般的单碱基精度,又......阅读全文
日本与英国将联合开展“基因组编辑”基础研究
日英两国政府间医疗研究机构将合作开展“基因组编辑”的基础研究,它是一项能自由改变生物基因的新技术。基因组编辑有望治疗先天性疑难疾病,英国在该领域处于领先地位,日英合作将共享最新的研究数据,提高研究能力。 日本医疗研究开发机构(AMED)将与英国国立卫生研究院(NIHR)、英国医学研
大模型驱动的基因组环形可视化生成研究获进展
近日,中国科学院计算机网络信息中心科研团队研发出大模型驱动的基因组环形可视化智能生成框架AuraGenome。AuraGenome突破“人工-脚本-静态”传统范式,开创“自然语言-智能体-交互”新模式,能够将基因组数据快速转化为高质量、可交互的可视化结果,并支持全流程的可追溯与复用。在急性髓系白血病
CRISPR–Cas9基因组编辑可用于耳聋小鼠模型恢复听觉
一篇论文称,研究将CRISPR–Cas9基因组编辑技术用于恢复人类遗传性耳聋小鼠模型的听力。这项于12月21日发表于《自然》的研究凸显了CRISPR-Cas9用于治疗某些显性遗传性听觉损失疾病的潜力。 将近一半的耳聋是由遗传因素造成的,但能治疗遗传性听觉损失的方法却有限。美国马萨诸塞州哈佛大学
以磁珠为基础分离基因组-DNA-的实验方法
试剂、试剂盒 全血 口腔涂片或样品污染物 二硫苏糖酵 乙醇 异丙醇 裂解缓冲液
以磁珠为基础分离基因组-DNA-的实验方法
试剂、试剂盒 全血口腔涂片或样品污染物二硫苏糖酵乙醇异丙醇裂解缓冲液仪器、耗材 自动定位器P250 盒装吸头 血液基因组高产量系96 孔收集板BiomekFX 自动机械工作平台分离装置传热板储液器微量吸头离心架筐加热块磁分离架DNAIQ系统实验步骤 方法1:利用液体处理自动机械工作平台从20ul全血
以磁珠为基础分离基因组-DNA-的实验方法
Wizard Magne Sil 基因组 DNA 纯化系统是使用一种固相顺磁性硅质顆粒来纯化基因组 DNA。该技术取代了以真空过滤和离心为基础的 DNA 纯化形式,而且还使样本处理更加经济、高效。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒全血口腔涂片或样品污染物二硫苏
为国产优异大豆品种培育奠定基础-中黄13基因组发布
中科院遗传与发育生物学研究所联合中国科技大学、江苏省农业科学院种质资源与生物技术所、北京贝瑞和康生物技术有限公司等,对中国国审大豆品种“中黄13”(Gmax_ZH13)的基因组进行从头组装,最终得到1.025 Gb的基因组序列,包含20条染色体和1条叶绿体。相关成果近日以封面文章形式在线发表于《
国自然之三临床疾病基础研究课题;细胞模型及检测指标
上回我们说到,临床基础研究课题,创新点在基因时研究内容该如何设计。三大块,临床相关性(A-C),功能(A-D),机制(A-B)。从而验证我们的假设“A基因通过调控B机制在C疾病中发挥D功能”。 遗留了一个问题,细胞模型(动物模型)和检测指标如何选择。机制的严谨性(深度)和热度(机制细分方向
解析斑鳖的全基因组序列及其适应性进化基础
斑鳖(Rafetus swinhoei)是目前地球上现存体型最大的鳖类物种,其背甲长度可达1.5米、体重可达115公斤。此外,斑鳖也是全球目前最濒危的龟鳖类物种。在2019年初,全球已经明确记录的斑鳖个体仅仅只有4只。然而,2019年4月13日,我国的雌性个体意外死亡(这也是当时全球唯一确定性别
蝴蝶基因组大小进化进展-发现表型多样性进化遗传基础
蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
在全基因组水平上解析玉米籽粒淀粉含量的遗传基础
玉米是全球最重要的农作物之一。淀粉为玉米籽粒的主要组分,约占籽粒干重的70%,不仅是影响籽粒产量的重要因素,还为食品生产和工业加工如造纸业、医药行业、生物燃料等领域提供原料。因此,解析玉米籽粒淀粉含量的遗传基础,对高产优质玉米新品种的培育意义重大。 近日,中国农业大学国家玉米改良中心杨小红团队
大豆“中黄13”基因组发布-为国产优异大豆品种培育定基础
中科院遗传与发育生物学研究所联合中国科技大学、江苏省农业科学院种质资源与生物技术所、北京贝瑞和康生物技术有限公司等,对中国国审大豆品种“中黄13”(Gmax_ZH13)的基因组进行从头组装,最终得到1.025 Gb的基因组序列,包含20条染色体和1条叶绿体。相关成果近日以封面文章形式在线发表于《中国
帕金森体外模型帕金森体外模型
体外培养的中脑多巴胺能神经元MPTP损伤模型l实验操作:实验采用胚胎龄14一16天的大鼠,剖子宫取胎,取胎鼠中脑腹侧区。可将多个胚胎来源的组织收集在一起,置Fl2培养基(Gibco)至35mm的培养皿中,以细剪刀剪碎。将2ml含0.125%的胰酶的F12加入到组织中,该混合物于37oC孵育10分钟后
基于模型的GaN-PA设计基础知识:内部IV波形的定...(二)
我们来检验一下这些内部I‑V 波形的预期值和细微差别。A 类:我们预期电流和电压本质上都是正弦波形,此时信号电平达到电流或电压波形(或者两者)均在I‑V “足球场”局限区域内的边缘出现削波时的点。这与上图所示的波形是一致的,电流和电压波形都是正弦曲线。由于电流在正弦波周期的整个360‑度范围
基于模型的GaN-PA设计基础知识:内部IV波形的定...(三)
采用“波形工程”,对F 类功率放大器设计示例进行微调但是,如果您的内部波形不能反映您的工作类型所需的I‑V 波形呢?可进行谐波调谐。所有的Modelithics Qorvo GaN 库模型都允许电路设计人员在调整或优化负载匹配电路时监测内部电压和电流波形,直到获得所需的波形。有时候这称之为功
AI赋力显微镜:国产装备+基础模型-破局进口设备依赖困局
复旦大学计算机科学技术学院教授颜波带领的团队的研究成果发布在科学期刊《自然-方法》(Nature Methods)上。他们发明的跨任务、多维度图像增强基础AI模型(UniFMIR),实现了对现有荧光显微成像极限的突破。据悉,这一显微镜可以帮助科学家们能更清晰地观察到活细胞内部的微小结构和复杂过程,加
基于模型的GaN-PA设计基础知识:内部IV波形的定...(一)
基于模型的GaN PA设计基础知识:内部I-V波形的定义及其必要性对于氮化镓(GaN) 功率放大器,设计师需要考虑非线性操作,包括RF 电流-电压(I‑V) 波形会发生的状况。优化非线性行为设计的一种方法就是仿真内部I-V 波形。本文将为您介绍:· I-V 波形的定义· 功率放大器工作类型· 内部和
大模型基础设施如何建?首先要搭万卡规模的网络架构
“生成式AI是一个跨越式的技术,和原来的技术有了非常大的变革,可以说是划时代的技术。它最大的特点就是模型大,过去几年以每年10倍参数量的速度在增长。之前AI应用里,很多训练的任务都是单卡或单机就能完成,但在大模型时代,需要千卡、万卡来完成一个任务。”5月23日,百度杰出系统架构师王雁鹏在深圳举行的文
褪黑素细胞受体模型基础上开发了治疗睡眠障碍的新方法
三分之一美国人有睡眠障碍,他们中的许多人靠吃褪黑素缓解。然而,科学家们并不完全理解褪黑素在生物钟中的作用,也就是说,研究人员也不知道褪黑素有没有副作用。 现在,由一个国际团队组成的科学家小组对褪黑素的作用进行了非常必要的研究,为开发受褪黑素影响的健康问题以及治疗睡眠障碍打开了大门。 他们建立
构建单细胞癌症基因组时间序列模型,可预测乳腺癌细...
构建单细胞癌症基因组时间序列模型,可预测乳腺癌细胞克隆适应性不同生物会随着时间的推移不断进化,环境压力可促使具有某些特征的个体在群体中变得更加普遍。癌症也不例外,在不断增殖的肿瘤中,具有最佳竞争资源和抵御环境压力的癌细胞会逐渐占据主导地位。癌细胞的适应性(fitness)并不是一成不变的。在化疗药物
现代玉米杂种优势群遗传演化基因组学基础获揭示
玉米种质资源的杂种优势群划分。中国农科院供图 近日,中国农业科学院作物科学研究所玉米优异种质资源发掘与创新利用团队联合华南农业大学、中国农业科学院生物技术研究所等单位研究揭示了玉米父、母本杂种优势群趋同与趋异选择的遗传规律,解析了玉米基因组分化特征及其对杂种优势的贡献。该团队通过总结过去,将玉
揭示玉米杂种优势群遗传改良与分化基因组学基础
近日,华南农业大学生命科学学院教授王海洋团队联合中国农业科学院作物科学研究所玉米优异种质资源发掘与创新利用团队和中国农业科学院生物技术研究所玉米功能基因组创新团队揭示了玉米父、母本杂种优势群趋同与趋异选择的遗传规律,解析了玉米基因组分化特征及其对杂种优势的贡献,为新时期玉米自交系创制和杂种优势利用提
在玉米全基因组水平上解析玉米籽粒淀粉含量的遗传基础
近期,中国农业大学国家玉米改良中心杨小红团队在国际学术期刊Plant Biotechnology Journal上在线发表了题为“Genetic basis of kernel starch content decoded in a maize multi-parent population”的
研究开发出酵母泛基因组数字模型与代谢网络分析方法
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员周雍进团队与上海交通大学副教授鲁洪中合作,在酵母系统生物学研究中取得新进展。研究团队通过整合分析全球1807株酿酒酵母菌株的基因组与生态位数据,构建了高覆盖度的酿酒酵母泛基因组及菌株特异性代谢模型,系统解析了酵母通过基因组精简与代谢重编程适应多样化环境的分子机
研究开发出酵母泛基因组数字模型与代谢网络分析方法
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员周雍进团队与上海交通大学副教授鲁洪中合作,在酵母系统生物学研究中取得新进展。研究团队通过整合分析全球1807株酿酒酵母菌株的基因组与生态位数据,构建了高覆盖度的酿酒酵母泛基因组及菌株特异性代谢模型,系统解析了酵母通过基因组精简与代谢重编程适应多样化环境的分
除了指数增长模型和逻辑斯蒂增长模型,还有哪些增长模型?
除了指数增长模型和逻辑斯蒂增长模型,还有以下一些增长模型: **一、Gompertz 增长模型** 1. 特点: - Gompertz 模型也是描述种群增长的一种模型,其增长曲线也呈“S”型。与逻辑斯蒂增长模型相比,Gompertz 模型在初期增长相对较慢,然后逐渐加速,最后增长速度
科学家揭示心血管疾病家兔模型的基因组和转录组特征
6月1日,由中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所李亦学研究组、美国密歇根大学医学中心和日本山梨大学分子病理系等单位研究人员合作完成的论文“Hyperlipidemia-associated gene variations and expression patterns revealed
动物模型及动物疾病模型技术介绍
动物模型|动物疾病模型技术介绍人类疾病的动物模型(animal model of human disease)是指各种医学科学研究中建立的具有人类疾病模拟表现的动物。在生物科研整体实验中,动物模型是非常重要的一环。一、动物模型的意义1、动物模型可复制临床上一些疾病不常见,如放射病、毒气中毒、烈性传染
动物模型及动物疾病模型技术介绍
动物模型|动物疾病模型技术介绍 人类疾病的动物模型(animal model of human disease)是指各种医学科学研究中建立的具有人类疾病模拟表现的动物。在生物科研整体实验中,动物模型是非常重要的一环。 一、动物模型的意义 1、动物模型可复制临床上一些疾病不常见,
电脑孕妇检查模型-电子孕妇腹部触诊模型
电脑孕妇检查模型又称为电子孕妇腹部触诊模型和四步触诊模型,按标准孕妇的身体尺寸大小设计制造,胎心音的听诊由电脑线路芯片控制,模型由热塑弹性体塑胶材料制成,外观和触感与人的身体相似,具有真实感并给实习生以临床真实环境感受,是各类医学院、卫生学校、护校、医院等妇产科医护人员临床实习培训的理想教具。一、模