科学家解析野生近缘种渗入在小麦遗传背景下的表达调控机制

野生近缘种对于农作物遗传改良有重要作用。野生近缘种提升小麦农艺性状的遗传与分子机制是研究热点。中国科学院遗传与发育生物学研究所等提出了定量渗入片段表达丰度的新策略——利用公共泛基因组资源构建囊括麦族近缘种基因序列信息的基因参考集合,从而最大限度地定量外源片段的转录本。团队使用小麦种质群体的苗期转录组测序数据,为麦族近缘种的基因构建了eQTL图谱。研究发现近缘物种基因进入小麦基因组后,其表达调控整体受到抑制,但响应胁迫的基因倾向于更加活跃地表达。结合多年多点大田试验数据,团队利用eQTL预测了GWAS位点的农艺性状候选基因。这些候选基因不仅来自于标准的“中国春”参考基因组,也来自二倍体、四倍体等野生近缘物种,是开展基因克隆和功能解析的重要基础。研究为理解野生近缘种提升小麦农艺性状的遗传机制提供了新角度。相关研究成果在线发表在《自然-通讯》(Nature communications)上。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基......阅读全文

科学家解析野生近缘种渗入在小麦遗传背景下的表达调控机制

野生近缘种对于农作物遗传改良有重要作用。野生近缘种提升小麦农艺性状的遗传与分子机制是研究热点。中国科学院遗传与发育生物学研究所等提出了定量渗入片段表达丰度的新策略——利用公共泛基因组资源构建囊括麦族近缘种基因序列信息的基因参考集合,从而最大限度地定量外源片段的转录本。团队使用小麦种质群体的苗期转录组

基因表达的转录机制介绍

  转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。  基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转录本序列的

研究揭示基因表达调控核心复合物LDB1/SSBP2的分子机制

  12月31日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了题为Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的论文,该项工作由中国科学院生物物理研究所许文青/梁栋材课题组和美国国立卫生研究院Ann Dean课题组合作完成。  增强子是

DNA与RNA能协同互补调控基因表达

比利时布鲁塞尔自由大学主导的一项研究揭示,DNA和RNA的表观遗传学协同调控比过去想象的更加紧密。这项发表在最新一期《细胞》杂志上的研究,结合了DNA和RNA研究结果,指出这两种调控方式共同作用,形成一个互补系统:DNA表观遗传学决定了哪些基因可以被激活,而RNA表观遗传学则动态调整这些基因的表达水

关于真核生物基因表达调控的介绍

  真核生物基因表达调控与原核生物有很大的差异。原核生物同一群体的每个细胞都和外界环境直接接触,它们主要通过转录调控,以开启或关闭某些基因的表达来适应环境条件(主要是营养水平的变化),故环境因子往往是调控的诱导物。而大多数真核生物,基因表达调控最明显的特征是能在特定时间和特定的细胞中激活特定的基因,

Cell重要发现:揭示基因表达调控新层面

  在几乎每个人类细胞的内部都有着一个直径为6微米(大约是人类头发宽度的1/300)的细胞核,细胞核中填满了大约3米长的DNA。DNA被紧密压缩装在细胞核内,其必须要接近细胞的转录机器才能充当指令引导所有的细胞过程。长期以来科学家们都认为DNA的包装方式影响了基因表达。现在,Whitehead研究所

反义RNA调控细菌基因的表达功能介绍

  反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来,和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补,因此在体外m

蜕皮激素调控诱导细胞基因表达实验

实验材料 带有荧光素酶报道基因并受蜕皮激素诱导表达的质粒带有感兴趣的基因并受蜕皮激素诱导表达的质粒pVgRXR培养的哺乳动物细胞试剂、试剂盒 新霉素松甾酮 AZeocin培养液实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液稀释到适当浓度。新霉素松甾酮 A蜕皮激素的另一种类似物是 muristerone A(Sig

关于原核生物的基因表达调控介绍

  原核生物的基因表达调控虽然比真核生物简单,然而也存在着复杂的调控系统,如在转录调控中就存在着许多问题:如何在复杂的基因组内确定正确的转录起始点?如何将DNA的核苷酸按着遗传密码的程序转录到新生的RNA链中?如何保证合成一条完整的RNA链?如何确定转录的终止?  上述问题决定于DNA的结构、RNA

基因表达的转录后调控的相关介绍

  基因表达的转录后调控:真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出,因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的,受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。  携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译,因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的

关于基因表达调控的基本内容介绍

  基因表达调控是生物体内基因表达的调节控制,使细胞中基因表达的过程在时间、空间上处于有序状态,并对环境条件的变化作出反应的复杂过程。基因表达的调控可在多个层次上进行,包括基因水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平的调控。基因表达调控是生物体内细胞分化、形态发生和个体发育的分子基础。

Nature:血清素竟然也调控基因表达?!

  美国西奈山伊坎医学院的Ian Maze领导了这项研究。清华大学医学院的李海涛课题组、普林斯顿大学等机构的研究人员也参与了研究。这项成果于3月份发表在《Nature》杂志上,有助于人们更好地了解各种脑部疾病,包括情绪失调、药物滥用/成瘾和神经退行性疾病。  这项研究围绕着DNA以及它如何形成每个人

蜕皮激素调控诱导细胞基因表达实验

            实验材料 带有荧光素酶报道基因并受蜕皮激素诱导表达的质粒 带有感兴趣的基因并受蜕皮激素诱导表达的质粒 pVgRXR 培养的哺乳动物细胞

反义RNA的调控细菌基因的表达功能

反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来,和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补,因此在体外mic

Cell-Res发布重要基因表达调控新技术

  来自Whitehead研究所的研究人员通过构建出一种叫做CRISPR-on的强大新基因调控系统,现在能够同时提高多个基因的表达,并精确操控每个基因的表达水平。他们证实这一系统能够有效应用于小鼠细胞、人类细胞和人类胚胎中。研究人员在发表于8月27日《细胞研究》(Cell Research)杂志

Cell-亮点|-反义lncRNA如何调控基因的表达?

  反义lncRNA(antisense lncRNA)是指由基因(通常是蛋白编码基因)的反义链转录,并与该基因的mRNA存在序列重叠的RNA分子。随着对非编码RNA研究的深入,研究发现约70%的基因均有反义lncRNA【1】。更为重要的是,反义lncRNA往往与其正义链基因的表达存在相关性,提示反

真核生物基因表达调控有哪些环节

可分为三种主要途径环节:1、遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2、调控转录因子与转录机制相互作用,3、表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。转录调控通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合位点,具

植物形态建成与基因表达调控的关系

植物形态建成即植物的个体发育,指植物生命所经历的全过程。从受精卵的最初分裂开始,经过种子萌发、营养体形成、生殖体形成、开花、传粉和受精、结实等阶段,直至衰老和死亡。但一般以种子萌发为开始阶段。构成植物个体的细胞和器官也有其自身发端、形成和衰老的发育过程。发育包括生长和分化。生长指植物细胞、组织和器官

蜕皮激素调控诱导细胞基因表达实验

下面的方案是从蜕皮激素诱导的哺乳动物表达系统(Invitrogen 公司)附带的方案修改而来。Stratagene 公司也出售相似的系统。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W.拉塞尔。实验材料带有荧光素酶报道基因并受蜕皮激素诱导表达的质粒带有感兴趣的基因并

基因表达调控的基本规律是什么

过表达,即表达过度,当基因表达(转录)的严格控制被打乱时,基因可能不恰当被“关闭”,或以高速度进行转录。高速转录导致大量mRNA产生,大量蛋白质(protein)产物出现。在RNA聚合酶的催化下,以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录。在双链DNA中,作为转录模板的链称为模板链或反义链;而不作为转

基因表达RNA加工的机制介绍

  原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA(mRNA),但真核基因的转录会产生RNA的初级转录本(pre-mRNA),必须经过一系列加工才能成为成熟RNA(mRNA)。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优势。在原核生物中

关于基因表达的转录机制介绍

  基因表达的转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。  基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转

PLoSONE:IGF1调控乳腺癌miRNA表达

  乳腺癌是由于恶性肿瘤侵略并破坏乳房正常组织而形成的癌变肿瘤,也可能扩散到其他地方,是全世界女性最常见的癌病,世界一年约有50万人死于乳腺癌。美国研究者对IGF-1调控乳腺癌miRNA表达的机制进行了系统研究*,研究结果发表在11月30日的PLoS ONE上。   MiRNA在肿瘤的发展和转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

启动子与转录因子/基因表达调控蛋白

目的基因的表达调控生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类

关于胸苷激酶的胸表达和调控介绍

  哺乳动物细胞中染色体DNA的复制是限制在细胞周期中的某一特定期内进行的,它称为S期。DNA前体合成和DNA复制过程中所需要的许多酶的酶活性在细胞进入S期时升高,并在DNA合成完成后降低。一类型类的S期特殊酶,包括TK、胸苷酸合成酶、二磷酸核糖核苷还原酶、二氢叶酸还原酶,其特徵是这类型酶被大幅度诱

简述基因治疗中外源基因表达的调控

  研究人员大都不希望导入的外源基因过度表达,尤其在基因治疗中,我们希望外源基因表达的诱导和抑制能够得到控制。目前这方面的研究主要包括两个方面:效应元件调节和生理活动调节。效应元件的作用,例如类固醇类激素诱导的效应元件中,在卵清蛋白启动子5′远端019kb 处有一个雌激素效应元件,将具有此元件的基因