“寄生虫”DNA片段会破坏癌症基因组稳定性
27日的《科学》杂志发表了一项研究，揭示了人类基因组中一类可“跳跃”的DNA片段——被称为遗传“寄生虫”的LINE-1（L1）元件，如何成为破坏癌症基因组稳定性的主要力量。基因组的不稳定正是癌症演化的温床，为恶性细胞提供了更多生长、适应和逃避治疗的机会。该研究挑战了传统观点，发现了对癌症基因组有全面影响的一个关键因素。西班牙巴塞罗那基因组调控中心联合多国团队此次聚焦于肿瘤中异常活跃的L1元件，并采用长读长测序新技术，首次完整描绘了这类“跳跃基因”对癌症基因组结构的全面影响。他们发现，L1不仅能通过插入突变破坏单个基因，更能驱动大规模且具有破坏性的基因组结构重排，例如缺失、易位等。在分析的10个L1高活性肿瘤中，共观察到6418次跳跃事件，其中大约每40次跳跃就会引发一次大规模结构改造，这种重排有3/4是传统短读长测序技术难以检测的。尤为重要的是，约65%的L1事件发生在肿瘤演化的早期阶段，且大多出现在“全基因组倍增”（癌细胞复制......阅读全文
DNA的端粒长度可以有效预测癌症风险
匹兹堡大学癌症研究所（UPCI）的科学家在美国华盛顿特区的AACR年会上报道，保护染色体末端的DNA端粒长度可以预测癌症的风险并成为未来治疗的潜在靶标。 皮特和新加坡科学家率先研究的研究表明，超过预期的端粒由重复的DNA序列组成，每次细胞分裂时都会缩短---与癌症风险增加相关。 持有阿诺德·
癌症DNA环“密码”被科学家破解
美国斯坦福大学医学院团队及其国际合作者在《自然》杂志上发表了三篇研究论文，彻底改变了科学界对小DNA环（ecDNA）在人类癌症中所起作用的理解。这些研究详细阐述了ecDNA在近15000例癌症患者中的分布及对预后的影响，揭示了一种违反遗传学基本规律的新型遗传方式，并介绍了一种针对ecDNA的抗癌
DNA发现之前的基因
三一学院地处都柏林的中心，它那灰色的三层新古典主义建筑环绕在草坪和运动场周围。校园的最东头是另一栋灰色建筑，落成于1905年，则是另一种截然不同的风格。那是菲尔兹杰拉德大楼，或者依据其门楣上刻的字叫物理实验楼。这栋楼的最顶层是一个演讲厅，1943年2月第一个周五的傍晚，约有400余人聚集在这里，
DNA（基因）检测－Southern－Blot
DNA（基因）检测－Southern BlotDNA吸印转移1．室温下将电泳后的琼脂糖凝胶浸入500ml溶液A中，摇动30分钟后换500ml新鲜溶液A再摇30分钟，使DNA双链碱变性。溶液A：5M NaCl 300.0ml10M NaOH 50.0mlH2O 650.0
癌症基因疗法亮点频现－用好基因修复坏基因
当前，探索各种有效而实用的抗癌方法已成为研究人员和临床医生研究的重点，同时也成为患者关注的焦点。毫无疑问，2010年的癌症治疗在基因疗法方面出现了一些亮点，如果假以时日，基因疗法将成为癌症治疗的实用技术。 核糖核酸干扰显神威 癌症的基因疗法有很多，其中有一种更显示了独特的魅力，这就是
Science：重要的癌症基因开关
来自瑞典Karolinska研究所和芬兰赫尔辛基大学的科学家们证实了一些调控基因表达的“开关”在癌症的形成中起重大作用。在发表于《科学》(Science)杂志上的这项研究中，他们研究了一个基因区域，该区域包含了某个与结直肠癌和前列腺癌风险增高相关的特异单核苷酸变异，发现移除这一区域可显著抵制肿瘤
癌症基因检测“揭示家族性”
科学家们已经发现了为什么一些家族会患许多不同类型的癌症，这要得益于基因检测。在对1,100例罹患罕见癌症（也称为肉瘤）患者的检测中发现，半数以上患者具有增加癌症风险的先天性基因突变。这项发表在柳叶刀《》肿瘤学》杂志上的研究称，遗传性突变可能成为癌症治疗新靶点。可以为那些易患癌症家庭提供筛查和建
最全面的癌症基因普查
图片来源于网络 该“癌症基因普查”描述了所有与致命癌症密切相关的基因，以及这些基因在各种疾病中的功能，形成了超过700个基因的资源目录，帮助科学家了解癌症原因，找到药物靶点和设计治疗方案。为改善个体化医学铺平了道路，建立了针对特定遗传功能或突变的抗癌药物合集。 癌症是一种遗传性疾病，DNA突变会
Nature揭示新型癌症致病基因
来自英国癌症研究中心(Cancer Research UK)的科学家们在小鼠中发现了一个防止卵巢癌的新基因，如果其发生缺陷就可以提高形成这一疾病的机会。这项研究发表在9月4日的《自然》(Nature)杂志上。 这一称作为HELQ的基因，可帮助修复细胞增殖时DNA复制过程中所发生的所有的
eLife：lncRNA调控癌症关键基因
Salk研究所的科学家们发现，一种长非编码RNA(lncRNA)是癌症发展过程中的一个关键基因开关。这项研究于四月二十九日发表在eLife杂志上，为相关癌症的治疗提供了一条新的途径。 研究人员将这种lncRNA命名为PACER(p50-associated COX-2 extragenic
NatureGenetics揭示儿童癌症致病基因
来自约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心和费城儿童医院(CHOP)的科学家们在对74个儿童神经母细胞瘤进行全基因组测序后，发现ARID1A和ARID1B两个基因发生改变的患儿相比无此基因改变的患儿生存期缩短了四分之三。这一发现有可能最终导致早期确认患有侵袭性神经母细胞瘤的儿童，他们或许需要接受其
JBC：验血可检测癌症基因
Texas大学MD Anderson癌症中心的科学家们发现，癌细胞释放到血液中的胞外体(Exosome)，包含了癌细胞的整个遗传学蓝图。这一基因组数据可以用于检测癌症相关的突变，帮助医生尽早诊断癌症，以便对患者进行有效治疗。文章发表在本期的Journal of Biological Ch
基因疗法，治好“不可治愈”癌症
近日，英国研究者采用一种基因疗法，成功治愈了一个患有耐药性白血病的一岁女孩，成为免疫细胞疗法治愈“不可治愈”的癌症的全球首个案例。 该患儿名为Layla Richards，在位于伦敦中心的大奥蒙德街医院（Great Ormond Street Hospital）接受治疗，该
一个癌症转移基因
结肠直肠癌在西方国家是最流行的癌症之一。肿瘤的发生以息肉为开端，然后变成入侵性的和恶劣的癌症，而且往往会扩散到肝脏中。在最新出版的Cancer Research杂志上发表的一篇文章中，来自以色列魏兹曼研究所分子细胞生物学系的Avri Ben-Zev教授和Nancy Gavent博士确定出了有助于解释
基因解码：量身订做癌症治疗
癌症长年高居国人10大死因之首，然而现在即使是晚期癌症，随着致癌途径的基因不断被解码，肿瘤科专家指出，未来每个癌症患者可以找到更符合自己的标靶药，让癌症治疗朝向量身订做。 抗癌除了透过手术除恶务尽，随着找到癌细胞的特殊生长因子、特殊蛋白、阻断肿瘤血管生成等标靶，让无法手术的患者，若带有这些特殊
敏感检测癌症DNA甲基化技术，有望改进非侵入式癌症检测
检测肿瘤释放进入血液中的游离DNA（cfDNA，cell-free DNA）的突变是一种极具潜力的癌症检测方法。然而这类检测的敏感性和准确性及其检测早期癌症的能力目前仍然处于低水平。一种潜在的替代方法是检测cfDNA上的甲基化水平，因为在肿瘤中，DNA甲基化水平会发生显着的变化。 早期的全基因
国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium，简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症，加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所
纯化DNA实验_基因组DNA的快速纯化
试剂、试剂盒尾部缓冲液蛋白酶 K仪器、耗材离心管玻璃棒实验步骤第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中，加 35 ul 10 mg/ml 蛋白酶 K，在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液（配 25 ml）50 mmol/L
新DNA分析技术可快速诊断癌症等疾病
加拿大研究人员取得的一项技术突破，有望用以更快地开展癌症及各种产前诊断。新开发的工具将允许研究人员在类似人体条件下，将长链DNA（脱氧核糖核酸）装载入可调谐纳米成像室，同时维持其结构不变。此项重要发现发表在本周美国《国家科学院学报》上。 麦吉尔大学物理系教授萨波莉娜·莱斯利、沃尔特
Nature：基于DNA甲基化的早期癌症检测
加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法，能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证，但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。 研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案，能够分析少量循环游离DN
循环肿瘤DNA“液体活检”或将颠覆癌症治疗
循环DNA是一种无细胞状态的胞外DNA，存在于血液、滑膜液和脑脊液等体液中，其主要是由单链或双链DNA以及单链与双链DNA的混合物组成，以DNA蛋白质复合物或游离DNA两种形式存在。早在1947年Mandel和Metais就发现了循环核酸；30年后Leon等人的研究表明肿瘤患者外周血清DNA水平
－循环肿瘤DNA“液体活检”或将颠覆癌症治疗
循环DNA是一种无细胞状态的胞外DNA，存在于血液、滑膜液和脑脊液等体液中，其主要是由单链或双链DNA以及单链与双链DNA的混合物组成，以DNA蛋白质复合物或游离DNA两种形式存在。早在1947年Mandel和Metais就发现了循环核酸；30年后Leon等人的研究表明肿瘤患者外周血清DNA水平
染色体外DNA——导至癌症恶变的罪魁
北京时间11月21日，发表在《Nature》上的一篇新研究发现，在人类肿瘤细胞中发现大量如“甜甜圈”般的环状染色体外DNA(EcDNA)，改变了与癌症相关基因的表达方式，从而促进了癌细胞的侵袭性，并在肿瘤快速进化和抵御威胁的能力（如化疗、放疗和其他治疗）中发挥了关键作用。该研究由美国加州大学圣地亚哥
DNA甲基化与癌症之NGS检测篇
摘要 DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中，DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化，大量实验研究表明，在多种类型癌症中，DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外，甲基化还与非
DNA甲基化：诊断癌症的强大工具
最近，来自香港中文大学的研究人员，通过分析血浆DNA中的甲基化序列，能够检测到癌症患者的肝肿瘤和淋巴瘤，以及孕妇胎盘中的遗传异常。他们使用已知的组织甲基化图谱，能够识别循环DNA的组织起源，从而使其成为一种强大的工具，用于筛选、癌症检测和治疗监测。这项研究是由几个机构的研究人员合作，由香港中文大
Nature：DNA损伤机制癌症免疫联合治疗的希望
一周前，对细胞如何检测DNA损伤的新见解于7月24日在线发表在Nature上。解释了为什么与DNA结合的一个叫cGAS（环GMP–AMP合成酶）的关键分子会因DNA损害和自体免疫失调而引发炎症。cGAS可以DNA破损形成的微核和DNA结合，启动导致炎症的机制（详细）。而一周后同样的关键词cGAS
Nature：基于DNA甲基化的早期癌症检测
加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法，能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证，但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。 研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案，能够分析少量循环游离DN
当被“垃圾”DNA堵塞后，癌症就跟着来了
他们的研究表明，非编码DNA是如何阻碍我们基因组的复制和修复的，这可能会导致突变的积累。此前已经发现，DNA的非编码或重复模式——约占我们基因组的一半——可能会破坏基因组的复制。但到目前为止，科学家们还不了解其潜在机制，也不知道它是如何导致癌症发展的。在这项新研究中，伦敦癌症研究所的科学家们在试管中
新研究证实癌症存在基因“开关”
瑞典和芬兰研究人员最新研究发现,基因组区域中一种特定核苷酸变异与大肠癌和前列腺癌患病风险有着重要联系,是引发这两种癌症的“开关”。 瑞典卡罗林斯卡医学院和芬兰赫尔辛基大学研究人员在新一期美国《科学》杂志上报告说,他们在动物实验中移除了实验鼠体内存在核苷酸变异风险的基因区域 “Myc33
基因检测能够预防癌症吗？
谈癌色变的年代，如何能躲过癌症的袭击？不仅是科学家们在研究，普通人也在寻觅。随着科技的进步，“基因检测”变成了热门话题。扑面而来的各种信息也让很多人不知所措。家里有多个癌症患者，其他人该不该进行基因检测？ 目前，我国各种疾病及肿瘤的发病率均不断升高，面对该现状，我国的医学研究更多的亦趋向于基因