研究提出单氨基酸突变靶蛋白动态构象解析新策略
Ras超家族蛋白的致病突变,大多通过诱发微小且高度动态的构象变化导致生物学功能紊乱。针对这类“不可成药”靶标,X射线晶体学等传统的常规结构解析方法存在明显局限,即通常仅能捕捉到非生理状态下的静态结构,难以反映蛋白质在溶液中的关键功能构象。 3月16日,中国科学院上海药物研究所联合大连化学物理研究所,创新性地整合了非变性质谱、紫外激光解离技术及X射线晶体学,揭示了弥漫性胃癌相关靶蛋白RhoA的Y42C突变体“隐藏”动态构象,并发现了针对该“隐藏”构象的共价抑制剂。这一多维技术路线充分利用了紫外激光解离质谱在靶蛋白动态构象和瞬态互作测量方面的高选择性与高灵敏度优势,为靶向高动态“不可成药”蛋白建立了新的研究范式。 此前,研究团队在GDP结合态RhoA Y42C突变体研究中,通过晶体学技术解析得到两种结构,其中Mg2+分别由Thr37或Pro36骨架羰基配位,导致其真实致病分子机制研究陷入“盲区”。为突破这一技术瓶颈,研究团队......阅读全文
FOX转录因子突变方式诠释前列腺癌治疗新靶点
基因突变是物种不断进化的动力泉源,与此同时基因突变也可能导致癌症。人体中基因变异的方式各有不同,如今密歇根大学罗盖尔癌症中心的研究人员发现了基因突变的三种方式。该研究结果发表在《Nature》杂志上。DOI: 10.1038/s41586-019-1347-4 FOXA1是转录因子FOX家族中
蛋白质和氨基酸的代谢试验
1.吲哚(靛基质)试验 主要用于肠杆菌科细菌的鉴定。2.硫化氢试验 主要用于肠杆菌科中属及种的鉴别。如沙门菌属、爱德华菌属、亚利桑那菌属、枸橼酸杆菌属、变形杆菌属细菌,绝大多数硫化氢阳性,其他菌属阴性。沙门菌属中也有硫化氢阴性菌种。3.尿素分解试验 主要用于肠杆菌科中变形杆菌属细菌的鉴定。奇异
构成蛋白质氨基酸有哪些类型
甘氨酸 (Glycine, Gly):是分子量最小的氨基酸,因其侧链仅为一个氢原子,从而使得其在蛋白质结构中具有极大的灵活性。 丙氨酸 (Alanine, Ala):具有较小的疏水性侧链,使其能够在蛋白质内部稳定存在。 缬氨酸 (Valine, Val):是一个分支链氨基酸,其较大的疏水性侧
蛋白质和氨基酸什么区别
蛋白质是由氨基酸组成的大分子有机化合物,而氨基酸是构成蛋白质的基本单元。 蛋白质是由许多氨基酸通过肽键连接而成的长链状分子,每个氨基酸都由一个氨基(-NH2)和一个羧基(-COOH)组成,并且都有一个特定的侧链。蛋白质在生物体内具有多种功能,如构成细胞和组织、调节代谢、传递信号等。 氨基酸是
构成蛋白质的氨基酸的条件
构成蛋白质的氨基酸均为a-氨基酸,就是氨基必须直接和中心碳原子(手性碳原子)相连.这种氨基酸均为天然氨基酸,为20种左右.
碱基突变对多肽链中氨基酸序列的影响类型
同义突变同义突变(same sense mutation):碱基置换后,虽然每个密码子变成了另一个密码子,但由于密码子的简并性,因而改变前、后密码子所编码的氨基酸不变,故实际上不会发生突变效应。例如,DNA分子模板链中GCG的第三位G被A取代,变为GCA,则mRNA中相应的密码子CGC就变为CGU,
蛋白质是由氨基酸组成的,那么吃氨基酸片和蛋白质粉有什么差别?
在人体内起的作用都一样,主要是吸收速度不一样。通常情况下,蛋白质需用2-4小时才能被消化。但如果将蛋白质分裂为短肽(微肽由2-3个氨基酸构成)和单个的自由氨基酸 ,则在30-60分钟内就能被人体吸收。因此,氨基酸非常容易被人体消化吸收,这也是氨基酸的最大优势。
最新抗衰老靶点:控制蛋白质组代谢
“蛋白质合成对细胞来说是一个极耗能的过程,当细胞投入宝贵资源生产蛋白时,其他重要功能很可能就会被忽视。我们的工作表明,正常和异常老化的一个驱动器会加速蛋白质周转(protein turnover),”文章通讯作者、Salk研究所首席科学官和副总裁Martin Hetzer说道。 注:Water
Science:药物绑定靶蛋白的效果首次可直接测量
瑞典卡罗林斯卡医学院的研究人员开发出一种方法,首次能够直接测量药物抵达其位于细胞中的目标蛋白的效果。《科学》杂志上描述的这项新技术,对于开发新的、改良型的原料药将是一个重大贡献。 大多数药物都是通过与一种或多种蛋白质结合并影响其功能来发挥效力的,但药物开发也因此面临两个常见问题:
《Nature》子刊:新型免疫治疗靶点——凝血蛋白
10月15日,《Nature Immunology》发表了他们的文章,研究人员用神经变性模型模拟血脑屏障渗漏、慢性炎症和血管异常相关的两种主要脑部疾病:多发性硬化和阿尔兹海默症。 正常情况下,血液中的蛋白质纤维不会进入大脑。但是,一些神经疾病情况下,阻止血液中大分子进入大脑的血脑屏障渗透性异常增大
点突变大小鼠在体内体外临床研究的应用(一)
点突变与人类疾病基因是很多生命的蓝图,基因突变虽有对物种的多样性和演化有重要的作用,但同时也是很多疾病的根源。点突变就是突变类型中最常见的一种,是色盲症、镰刀状细胞贫血症、囊性纤维化以及很多肿瘤病变中的罪魁祸首。除了引发癌症以外,一些点突变还能提高癌细胞的药物抗性,因此针对同一靶点有时需要设计不同的
寡核苷酸探针的用途介绍
寡核苷酸探针还有一个重要用途。在用于检测单个碱基差异时尚可采用一种称为寡核苷酸限制(oligonucleotiderestriction)的技术。该技术只有在突变点位于某一限制性内切酶识别位点时才有效。例如,镰刀状红细胞贫血是因β珠蛋白基因的第6个寡码子由GAG变成GTG,从而导致所编码氨基酸由酪氨
氨基酸与蛋白质是什么关系?
氨基酸和蛋白质之间存在着基本的构成与功能关系。 氨基酸是蛋白质的基本构成单元。蛋白质是由20种标准氨基酸通过肽键连接而形成的高分子链状结构。每个氨基酸分子包含一个中心的碳原子,附着着一个氢原子、一个氨基(-NH2)、一个羧基(-COOH)和一个特定的侧链(R基)。不同的氨基酸具有不同的R基,这
蛋白鉴定方法之氨基酸组分分析
1977年首次作为鉴定蛋白质的一种工具,是一种独特的“脚印”技术。 利用蛋白质异质性的氨基酸组分特征,成为一种独立于序列的属性,不同于肽质量或序列标签。 Latter首次表明氨基酸组分的数据能用于从2-DE凝胶上鉴定蛋白质。 通过放射标记的氨基酸来测定蛋白质的组分,或者将蛋白质印迹到PVDF膜上
蛋白质、氨基酸分解产物试验检查作用
蛋白质、氨基酸分解产物试验是对细菌的新陈代谢产物进行分析并对细菌代谢特点进行分类。蛋白质、氨基酸分解产物试验对于有头痛、恶心、呕吐症状不减,颈强直、嗜睡并伴有脑膜刺激征等乙型副伤寒杆菌症状表现的病人意义重大。
卵黄蛋白质和氨基酸的利用
卵黄蛋白质来自VtgA,完全分裂产生氨基酸。这种模式是通过分析斑马鱼胚胎和成鱼组织及鲚鱼胚胎中ctlsa、 ctlsb及ctlsc基因表达得以识别。在鳞鱼中,组织蛋白酶原L(Ctsl)异构体最可能涉及卵黄蛋白质水解。天冬氨酸蛋白酶组织蛋白酶D(Csd)的活动似乎通常涉及脊椎动物卵黄蛋白质的降解,尤其
蛋白质-氨基酸分解产物试验的简介
蛋白质、氨基酸分解产物试验是对细菌的新陈代谢产物进行分析并对细菌代谢特点进行分类。菌的代谢通路包括合成与分解两大类。细菌的合成代谢与真核细菌类似,但其分解代谢因细菌酶系统的不同,差异甚大。分解代谢可伴有ATP及其他形式能量的产生。
基于氨基酸组成的蛋白质预测软件
根据组成蛋白质的20种氨基酸的物理和化学性质可以辨析电泳等实验中的未知蛋白质,也可以分析已知蛋白质的物化性质。ExPASy工具包包涵的程序:http://www.expasy.ch/tools/AACompIdent:与把氨基酸序列在SWISS-PROT库中搜索不同,AACompIdent工具利用未
蛋白质分子中氨基酸的连接方式
在蛋白质分子中,氨基酸之间是以肽键(peptide bond)相连的。肽键就是一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合形成的键。 氨基酸之间通过肽键联结起来的化合物称为肽(peptide)。两个氨基酸形成的肽叫二肽,三个氨基酸形成的肽叫三肽……,十个氨基酸形成的肽叫十肽,一般将十
卵黄蛋白质和氨基酸的利用
卵黄蛋白质来自VtgA,完全分裂产生氨基酸。这种模式是通过分析斑马鱼胚胎和成鱼组织及鲚鱼胚胎中ctlsa、 ctlsb及ctlsc基因表达得以识别。在鳞鱼中,组织蛋白酶原L(Ctsl)异构体最可能涉及卵黄蛋白质水解。天冬氨酸蛋白酶组织蛋白酶D(Csd)的活动似乎通常涉及脊椎动物卵黄蛋白质的降解,尤其
靶蛋白的放射标记实验—酵母和细菌蛋白质代谢放射标记
实验材料细胞仪器、耗材基本培养基实验步骤1. 接种细胞于只含有必需氨基酸和辅因子的已知成分的基本培养基,于合适温度中度振荡培养过夜。2. 用新鲜的基本培养基稀释培养物,继续温育至 107 细胞/ml (酵母)或对数期中期(细菌)。3. 5000 g 室温离心 10 分钟收集细胞,用无硫酸盐基本培养基
蛋白质突变“导致病毒传播”
一项新的研究表明,齐昆古尼亚病毒的一个简单的蛋白质突变可以让它适应新的蚊子宿主,并传播到更多地区。 美国德克萨斯大学医学分校进行的研究发现,该病毒外壳蛋白质的单个氨基酸突变可以帮助它适应新的蚊子宿主白纹伊蚊(Aedes albopictus)。这项发现发表在了上周(12月7日)的《公共科学图书馆·
突变按照蛋白质结构改变分类
按照蛋白质结构改变分类移码突变任何不能被3整除的插入或缺失引起的突变称为移码突变。由于密码子的三联体性质,插入或缺失破坏了阅读框或密码子的分组,从而导致与野生型完全不同的翻译 。缺失或插入发生位置在序列中越靠前,引起的蛋白质变化越明显。相反,任何可被3整除的插入或缺失引起的突变称为框内突变。同义突
细胞自噬关键蛋白突变可延寿
或是哺乳动物“抵抗”老化的有效机制 据英国《自然》杂志5月30日在线发表的一项老化学最新成果,美国科学家团队开展的小鼠实验显示,一种对细胞自噬过程至关重要的蛋白质发生突变后,可延长小鼠的健康期限和寿命。研究人员认为,其或是延长哺乳动物寿命的一种有效机制。 衰老被认为是生理功能的逐渐退化现象,
Nature子刊:首次实现蛋白质重要氨基酸个体水平遗传筛选
图片来源于网络 CRISPR/Cas9基因编辑系统利用Cas9核酸内切酶结合sgRNA对靶DNA进行切割,诱发DNA进行非同源末端连接(Non-homologous End Joining,NHEJ)或同源重组(Homology-directed repair,HDR)损伤修复机制,进而实现靶基因
一组蛋白激酶是潜在抗癌靶点
最近,由伦敦大学玛丽皇后学院(QMUL)和Francis Crick学院带领的一项研究表明,一组蛋白激酶在胚胎发育中起着重要的作用,甚至可能是一个潜在的癌症药物靶点。延伸阅读:PNAS:蛋白激酶颠覆性新发现。 这项研究结果发表在最新一期的《Cell Reports》,第一次描述了在小鼠中敲除整
PDPN蛋白有望成为脑胶质瘤潜在治疗靶点
北京市神经外科研究所神经分子病理室、首都医科大学附属北京天坛医院神经外科曾凡博士等一项研究发现,PDPN蛋白在脑胶质瘤的发生、进展过程中发挥了重要作用,可作为患者预后判断的重要指标及分子治疗的潜在靶点。这项研究为脑胶质瘤的治疗提供了新思路。相关研究论文日前刊发在《中华神经外科杂志》上。 Pod
以G蛋白偶联受体为靶点的多肽药物研发
G蛋白偶联受体(G Protein-Coupled Receptors, GPCRs)是人体内最大的一类蛋白家族。GPCR广泛参与生理过程的调控,与多种疾病相关,且结构上有结合口袋,是很好的成药位点。目前已有超过475种以GPCR为靶点的药物获批上市,销售额占整体药物市场的27%。 GPCR是
PDPN蛋白有望成为脑胶质瘤潜在治疗靶点
中国网健康讯 北京市神经外科研究所神经分子病理室、首都医科大学附属北京天坛医院神经外科曾凡博士等一项研究发现,PDPN蛋白在脑胶质瘤的发生、进展过程中发挥了重要作用,可作为患者预后判断的重要指标及分子治疗的潜在靶点。这项研究为脑胶质瘤的治疗提供了新思路。相关研究论文日前刊发在《中华神经外科杂志》
“人造精子”技术实现蛋白质重要氨基酸个体水平遗传筛选
10月1日,国际学术期刊《自然-细胞生物学》(Nature Cell Biology)在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所李劲松和陈勇研究组的最新合作研究成果“CRISPR–Cas9-mediated base-editing screening in mice identif