NatureMethods：单细胞RNAseq方法的比较
随着大家对单细胞转录组分析的兴趣日益增加，开展单细胞RNA-seq的方法也在不断涌现。近日，斯坦福大学的研究人员比较了市场上各种单细胞RNA扩增方法，以系统评估单细胞RNA-seq方法的灵敏度和准确性。他们的研究结果发表在《Nature Methods》在线版上。 目前，整个转录组的高通量测序(RNA-seq)已广泛用于各种组织的基因表达分析。然而，人们开展单细胞转录组分析的愿望也越来越强烈，这是因为有些细胞量少珍贵，不足以开展传统的RNA-seq，也有人希望对异质群体中的细胞亚群开展分析。过去的基因表达“平均值”已不再能满足人们的需求。 近年来，开展单细胞RNA-seq的各种方法时有报道，但关于这些方法的通量和性能还存在一些问题。比如说，性能主要是通过灵敏度和精确性来评估的。然而，为了评估测定方法的有效性，还应当评估准确性，即测量值与真实值之间有多接近。 为此，斯坦福大学生物工程系的Stephen R......阅读全文
CHO细胞表达体系及其特点
子生物学、分子免疫学等学科的发展使基因工程疫苗具有越来越重要的地位。在基因工程疫苗研究的动物细胞表达系统中，最具代表性的就是中国仓鼠卵巢细胞(Chinese Hamster Ovary，CHO)。它是用来表达外源蛋白最多也最成功的一类细胞。本文就 CHO细胞表达系统在疫苗研制中的应用做一综述。C
关于表达载体的组成介绍
常用细菌质粒进行构建，构建过程中运用限制性核酸内切酶切割出与目的基因相合的末端（多为黏性末端，也有平末端），采用DNA连接酶连接，导入生物体实现表达。标记基因可帮助识别质粒并检测是否成功整合到染色体DNA中。 表达载体（Expression vectors）就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表
细胞的分化与基因表达
细胞分化是个体发育过程中细胞之间产生稳定差异的过程。所以，细胞分化是指同源细胞通过分裂，发生形态、结构与功能特征稳定差异的过程。细胞分化的实质是基因选择性表达的结果，在个体发育过程中基因按照一定程序相继激活的现象，称为基因的差次表达（differential expression）或顺序表达（Seq
基因表达快速分析新技术
实验概要介绍了一种新的基因表达快速分析技术-MPSS 技术的基本原理、技术路线及其优点和应用。实验原理MPSS技术是利用限制性内切酶和荧光检测知识,发展出的一种辨认和测定细胞每一个cDNA 克隆片段末端16～20bp序列的方法,从而查明细胞内所有基因的表达情况。MPSS 分析系统大体可划分为三大部分
同种异形基因表达的定义
中文名称同种异形基因表达英文名称allotopic gene expression定 义同一种属生物的不同个体间基因表达的差异，这是等位基因变异造成的，结果使同一蛋白质产物在不同个体间有所差异。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
Cell：基因表达分析的反思
在最新一期（10月26日）的《细胞》（Cell）杂志上，来自怀特黑德研究所的研究人员报告称在生成和注释来自全基因表达（global gene expression）分析的数据时所采用的一种常用假设可以造成当前广泛的生物学研究中关于基因活性与细胞行为的结论出现严重错误。 怀特黑德研究所成员Richa
Teton表达调控系统介绍
1992年Goseen等人成功的利用原核基因调控元件构建了四环素（tetracycline,Tet）真核细胞基因调控表达系统。目前，此系统已被广泛应用于基因功能和基因治疗领域的研究。 1、四环素调控表达系统的基本原理 Tet调控表达系统通过诱导药物（如Tet）改变调控蛋白的构象，从而达到调控目标蛋白
lncRNA表达与RNA的延伸
LncRNA的火热研究已经有几年的时间了，关于lncRNA总归是有说不完的话题。目前对lncRNA的基础分析都已形成了一定的模式。然后，今年来lncRNA的相关文章依然如雨后春笋。 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RN
双荧光素luc不表达
双荧光素luc不表达有多种原因，实验过程中的每一个步骤都可能导致双荧光素luc不表达。如果目的基因载体没有成功转移到受体细胞，或者受体细胞没有成活，以及实验过程中出现其他物质抑制了双荧光素luc的表达等等，都有可能导致双荧光素luc不表达。基于荧光素酶（Luciferase）的发光原理，形成了双荧光
生物艺术：“随机”的造物表达
基因，在艺术家的眼中，褪去了科学赋予其固有的硬壳，从内而外地打破了不同物种之间高低等级的界限，真正自由地融合，表达出生命本真的意义。 在近期举办的“中国当代艺术收藏系列展 李山”中，60只2米高的“蜻蜓人”翱翔在展览入口的上空。这些蜻蜓人是以李山自己的身体为模型，在基因层面上，将靠近人类头部和
基因表达调控定义是什么
基因表达调控的意义一方面是使生物体适应环境的不断变化，维持其生存的需要。从低等生物到人体各种生物在处于环境变化，如营养、温度、渗透压改变时，能够对环境信号作出反应，改变各种自身基因表达速率，调整体内参与相应功能的蛋白质的种类、数量，改变代谢状况／-以适应环境需要。另一方面是保证多细胞生物进行正常地分
膜蛋白的表达相关介绍
常用于重组膜蛋白的表达系统有真核表达系统、原核表达系统和近些年来发展的无细胞表达系统。其中以大肠杆菌（E.coli）为代表的原核表达系统因为操作简单、成本相对低廉、遗传背景清楚、方便同位素标记，以及有大量可利用的表达载体和宿主菌株等原因，是当下获取重组膜蛋白的最主要途径。对于一些膜蛋白而言，采用
异位表达的定义和分类
自然状态下细胞内大多数基因表达都有组织特异性和诱导表达性,人为操纵外源基因的导入和表达称之为异位表达( ectopic expression) 。功能性外源基因的异位表达势必对细胞造成一定的影响,这种影响可以是多方面的,随基因的功能和细胞类型的不同而不同。
表达蛋白的分离与纯化
[实验原理]大肠杆菌表达蛋白以可溶和不溶两种形式存在，需要不同的纯化策略。现在，许多蛋白质正在被发现而事先并不知道它们的功能，这些自然需要将蛋白质分离出来后，进行进一步的研究来获得。分析蛋白质的方法学现已极大的简化和改进。必须承认，蛋白质纯化比起DNA克隆和操作来是更具有艺术性的，尽管DNA序列具有
差异基因表达的定义
中文名称差异基因表达英文名称differential gene express定 义在细胞分化过程中某些奢侈基因表达的结果生成一种类型的分化细胞，另一组奢侈基因表达的结果导致出现另一类型的分化细胞的现象。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞分化与发育（二级学科）
造血干细胞的表达
荧光标记单参数检测造血干细胞（CD34-FITC） 荧光标记双参数检测造血干细胞 荧光标记三参数检测造血干细胞（ProCOUNT法） 实验步骤
表达载体的概念和应用
生物学中，基因工程的基本操作，表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等)，使目的基因能够表达的载体。如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨
外源基因的诱导表达
1．目的了解外源基因在原核细胞中表达的特点和方法。2．原理外源基因克隆在含有lac启动子的表达系统中。先让宿主菌生长，lac I产生的阻遏蛋白与lac操纵基因结合抑制下游的外源基因转录。向培养基中加入诱导物IPTG（异丙基硫代-b-D-半乳糖），解除抑制使外源基因大量表达。表达的蛋白可经SDS-
关于酵母表达系统的概述
酵母表达系统作为一种后起的外源蛋白表达系统，由于兼具原核以及真核表达系统的优点，正在基因工程领域中得到日益广泛的应用，应用此系统可高水平表达蛋白，且具有翻译后修饰功能，故被认可为一种表达大规模蛋白的强有力的工具。
重组毕赤酵母的表达
实验概要本文介绍了重组毕赤酵母目的基因表达的方法及条件，为毕赤酵母表达因素给予指导，但对于任何表达系统，最优化条件因表达蛋白的特征而不同。实验步骤1. Mut 胞内或分泌表达：为检测表达条件是否有效，可培养GS115β-gal (Mut )(胞内表达-半乳糖苷酶)。亲代载体转化GS115 或KM71
基因表达的调控模式介绍
转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合位点,具有调
基因表达的系列分析实验
实验材料 玻璃及塑料器皿 试剂、试剂盒 溶液与缓冲液 引物
什么是基因的差异表达？
差异表达不仅有助于阐明生命的奥秘,而且还能为基因诊断与治疗提供重要的理论依据。近几年来,差异表达基因克隆技术不断完善与发展,已成为研究肿瘤和疾病等相关基因的重要手段。
关于瞬时表达的优点介绍
①简单快速。转化基因可在转化的一周内进行分析，避免了组织培养等繁杂过程； ②表达水平高。当单链的T-DNA进入植物细胞后，许多未整合到植物基因组中的游离外源基因同样可以表达。 ③安全有效。不受植物生长发育过程的影响，不产生可遗传的后代，结果可靠直观，不存在基因漂移的风险。常用基因枪转化和农杆
基因表达调控的主要表现
基因表达调控主要表现在以下几个方面：①转录水平上的调控；②mRNA加工、成熟水平上的调控；③翻译水平上的调控；
表达筛选的定义和方法
中文名称表达筛选英文名称expression screening定 义(1)通过基因表达对组织、细胞或个体进行的筛选。(2)通过所用载体内含抗生素抗性基因、报道基因等的表达去筛选转化子的方法。(3)通过自身或融合表达的蛋白质的某种特性(如绿色荧光蛋白)进行筛选的方法。应用学科生物化学与分子生物学（
简述葡糖激酶的表达调节
人体GK基因位于第7号染色体短臂,存在两个启动子,分别是: ①上游神经内分泌启动子,驱动胰腺、大脑、垂体和肠道内分泌细胞中GK的表达； ②下游肝启动子,控制肝脏中GK的表达。在胰岛细胞中,GK的表达主要依赖于葡萄糖。葡萄糖对GK的影响主要发生在GK转录后,葡萄糖浓度升高可使细胞内GK蛋白表达
PNAS：昼夜节律基因表达
一项研究发现，昼夜节律钟对基因转录的节奏影响可能比此前认为的更加广泛。昼夜节律钟驱动着包括睡眠、体温和激素水平在内的生物过程，研究提示这些过程可能是受到昼夜节律控制的基因转录的调控。 John B. Hogenesch及其同事使用RNA测序以及DNA微阵列确定这种昼夜节律钟调控着小鼠器官的有节
基因表达的转录机制介绍
转录过程由RNA聚合酶（RNAP）进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。 基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”（产生RNA转录物的模板）和“编码链”（含有转录本序列的
个体基因表达度的概念
中文名称表达度英文名称expressivity定 义个体基因表达的变化程度。同一基因型的不同个体在性状或疾病的表现程度上的差异。可以因环境因子的差异、其他基因的影响或者个体遗传背景的不同等引起。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）