NatureMethods：单细胞RNAseq方法的比较
随着大家对单细胞转录组分析的兴趣日益增加，开展单细胞RNA-seq的方法也在不断涌现。近日，斯坦福大学的研究人员比较了市场上各种单细胞RNA扩增方法，以系统评估单细胞RNA-seq方法的灵敏度和准确性。他们的研究结果发表在《Nature Methods》在线版上。 目前，整个转录组的高通量测序(RNA-seq)已广泛用于各种组织的基因表达分析。然而，人们开展单细胞转录组分析的愿望也越来越强烈，这是因为有些细胞量少珍贵，不足以开展传统的RNA-seq，也有人希望对异质群体中的细胞亚群开展分析。过去的基因表达“平均值”已不再能满足人们的需求。 近年来，开展单细胞RNA-seq的各种方法时有报道，但关于这些方法的通量和性能还存在一些问题。比如说，性能主要是通过灵敏度和精确性来评估的。然而，为了评估测定方法的有效性，还应当评估准确性，即测量值与真实值之间有多接近。 为此，斯坦福大学生物工程系的Stephen R......阅读全文
Atlas™cDNA表达距阵(Expression－Array)
AtlasTM cDNA表达距阵(Expression Array)同时对588种/1176种关键基因做全景表达图谱分析同时对大量已知基因的表达进行大规模高通量(High-htroughput)分析检测关键基因在细胞关键功能中的角色只需简单的杂交步骤就在数年前，核酸矩阵技术只能在资金雄厚的大实验室开
新颖的融合蛋白表达系统
研究者们在分离到某一基因后，要对其编码蛋白质进行研究最理所当然的工作就是表达——即：有目的性地合成外源基因产物。在重组DNA技术的发展早期，人们认为在基因的前面有一个强启动子和一个起始密码子就足以在大肠杆菌中获得很好的表达。随后，认识到获得有效的翻译所需的条件要复杂得多，除了要有强启动子和起始密码
TLP基因的表达模式分析
实验概要本实验对水稻、拟南芥及杨树的TLP基因表达模式进行了分析，为进一步研明植物中TLP基因的功能奠定基础。实验步骤1. 水稻TLP基因的RT-PCR分析 1) 植物材料选取水稻的根、茎、叶、花和种子的新鲜组织用于RNA的提取。水稻材料采集后，用液氮速冻，以保证RNA不被降解，然后冻存于-70
造血干细胞的表达
荧光标记单参数检测造血干细胞（CD34-FITC） 荧光标记双参数检测造血干细胞 荧光标记三参数检测造血干细胞（ProCOUNT法） 实验步骤
关于siRNA表达框架的介绍
siRNA表达框架（siRNA expression cassettes，SECs）是一种由PCR得到的siRNA表达模版，包括一个RNA pol Ⅲ启动子，一段发夹结构siRNA，一个RNA pol Ⅲ终止位点，能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。和siRNA表达载体不同的是，SE
基因表达调控的主要表现
基因表达调控主要表现在以下几个方面：①转录水平上的调控；②mRNA加工、成熟水平上的调控；③翻译水平上的调控；
个体基因表达度的概念
中文名称表达度英文名称expressivity定 义个体基因表达的变化程度。同一基因型的不同个体在性状或疾病的表现程度上的差异。可以因环境因子的差异、其他基因的影响或者个体遗传背景的不同等引起。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
诱导型表达的定义
某些基因在通常情况下不表达或表达程度很低，但在诱导物（如代谢产物）的作用下，该基因的表达被启动或增强。
同种异形基因表达的定义
中文名称同种异形基因表达英文名称allotopic gene expression定 义同一种属生物的不同个体间基因表达的差异，这是等位基因变异造成的，结果使同一蛋白质产物在不同个体间有所差异。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
表达序列标签的应用原理
EST是从一个随机选择的cDNA克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA部分序列，代表一个完整基因的一小部分，在数据库中其长度一般从20到7000bp不等，平均长度为360±120bp 。EST来源于一定环境下一个组织总mRNA所构建的cDNA文库，因此EST也能说明该组织中各基因的表达水
表达序列标签的作用表现
⑴ 用于构建基因组的遗传图谱与物理图谱；⑵ 作为探针用于放射性杂交；⑶ 用于定位克隆；⑷ 借以寻找新的基因；⑸ 作为分子标记；⑹ 用于研究生物群体多态性；⑺ 用于研究基因的功能；⑻ 有助于药物的开发、品种的改良；⑼ 促进基因芯片的发展等方面。正是因为EST 表现出了这些巨大潜能，使其得到了充分的利用
表达筛选的定义和方法
中文名称表达筛选英文名称expression screening定 义(1)通过基因表达对组织、细胞或个体进行的筛选。(2)通过所用载体内含抗生素抗性基因、报道基因等的表达去筛选转化子的方法。(3)通过自身或融合表达的蛋白质的某种特性(如绿色荧光蛋白)进行筛选的方法。应用学科生物化学与分子生物学（
基因表达调控定义是什么
基因表达调控的意义一方面是使生物体适应环境的不断变化，维持其生存的需要。从低等生物到人体各种生物在处于环境变化，如营养、温度、渗透压改变时，能够对环境信号作出反应，改变各种自身基因表达速率，调整体内参与相应功能的蛋白质的种类、数量，改变代谢状况／-以适应环境需要。另一方面是保证多细胞生物进行正常地分
体内无细胞DNA的表达
对于一些由缺乏三种特定蛋白质的基因突变引起的疾病（如Leber先天性黑蒙和血友病），直接的想法是将能够表达相关蛋白质的基因“播种”到体内，而不是“种”到基因组中，但在细胞质中自由表达。最典型的例子是几种批准的病毒转染基因疗法（如FDA批准的用于治疗遗传性眼病的基因药物“Luxturna”）。这种方法
关于蛋白表达系统的概述
蛋白表达是指用模式生物如细菌、酵母、动物细胞或者植物细胞表达外源基因蛋白的一种分子生物学技术。在基因工程技术中占有核心地位。 蛋白表达系统是指由宿主、外源基因、载体和辅助成分组成的体系。通过这个体系可以实现外源基因在宿主中表达的目的。一般由以下几个部分组成： 1、宿主。表达蛋白的生物体。可以
造血干细胞的表达
荧光标记单参数检测造血干细胞（CD34-FITC） 荧光标记双参数检测造血干细胞 荧光标记三参数检测造血干细胞（ProCOUNT法） 实验步骤
痘苗病毒系统基因表达实验
重组痘苗病毒（VTF7-3）感染后的脂质体转染 两种重组痘苗病毒共感染细胞 实验方法原理 本方案从构建外源基因位于 PT7 和 T7 终止子之间的质
蛋白表达整体解决方案
重组蛋白是应用基因重组技术，获得连接有可以翻译成目的蛋白的基因片段的重组载体，之后将其转入可以表达目的蛋白的宿主细胞从而表达特定的重组蛋白分子。当前重组蛋白的生产主要有四大系统：原核表达系统：常用的大肠杆菌蛋白表达；真核表达系统如酵母；哺乳动物细胞蛋白表达（常用的细胞CHO，HEK293）及昆虫细胞
表达序列标签图的定义
中文名称表达序列标签图英文名称expressed sequence tag map定 义标明表达序列标签在基因组上位置的物理图。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
表达载体的概念和应用
生物学中，基因工程的基本操作，表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等)，使目的基因能够表达的载体。如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨
表达谱基因芯片实验
表达谱基因芯片可应用于：（1）疾病诊断；（2）新药开发；（3）环境保护。实验方法原理按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。在一定条件下，载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互补的核酸片段杂交。如果把样品中的核酸片段进行标记，在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号
研究称环境影响基因表达
随环境改变“脾气”的小蜜蜂 几年前，美国伊利诺斯大学阿巴纳香槟分校昆虫学系的吉恩·E·鲁滨逊教授，请墨西哥南部的伙伴帮他捕获了1000只新生的小蜜蜂——500只性情温和的意大利蜜蜂和500只生性凶猛的非洲蜜蜂。这两个蜜蜂亚种在基因上相似得几乎难以分辨，但后者却在领地防御上厉害很多。 鲁滨逊
基因表达系列分析实验（SAGE）
实验材料感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · Cl仪器、耗材微量离心
关于基因表达的概念简介
基因表达（gene expression）是指将来自基因的遗传信息合成功能性基因产物的过程。基因表达产物通常是蛋白质，所有已知的生命，都利用基因表达来合成生命的大分子。 基因表达产物通常是蛋白质，但是非蛋白质编码基因如转移RNA（tRNA）或小核RNA（snRNA）基因的表达产物是功能性RNA
siRNA表达载体的技术特点
多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶Ⅲ启动子（pol Ⅲ）中的一种，操纵一段小的发夹RNA（short hairpin RNA，shRNA）在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol Ⅲ启动子是由于它可以在哺乳动物细胞中表
细胞的分化与基因表达
细胞分化是个体发育过程中细胞之间产生稳定差异的过程。所以，细胞分化是指同源细胞通过分裂，发生形态、结构与功能特征稳定差异的过程。细胞分化的实质是基因选择性表达的结果，在个体发育过程中基因按照一定程序相继激活的现象，称为基因的差次表达（differential expression）或顺序表达（Seq
差异基因表达的定义
中文名称差异基因表达英文名称differential gene express定 义在细胞分化过程中某些奢侈基因表达的结果生成一种类型的分化细胞，另一组奢侈基因表达的结果导致出现另一类型的分化细胞的现象。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞分化与发育（二级学科）
双荧光素luc不表达
双荧光素luc不表达有多种原因，实验过程中的每一个步骤都可能导致双荧光素luc不表达。如果目的基因载体没有成功转移到受体细胞，或者受体细胞没有成活，以及实验过程中出现其他物质抑制了双荧光素luc的表达等等，都有可能导致双荧光素luc不表达。基于荧光素酶（Luciferase）的发光原理，形成了双荧光
Teton表达调控系统介绍
1992年Goseen等人成功的利用原核基因调控元件构建了四环素（tetracycline,Tet）真核细胞基因调控表达系统。目前，此系统已被广泛应用于基因功能和基因治疗领域的研究。 1、四环素调控表达系统的基本原理 Tet调控表达系统通过诱导药物（如Tet）改变调控蛋白的构象，从而达到调控目标蛋白
siRNA表达框架的技术特点
siRNA表达框架（siRNA expression cassettes，SECs）是一种由PCR得到的siRNA表达模版，包括一个RNA pol Ⅲ启动子，一段发夹结构siRNA，一个RNA pol Ⅲ终止位点，能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。和siRNA表达载体不同的是，SECs