NatureMethods:单细胞RNAseq方法的比较

随着大家对单细胞转录组分析的兴趣日益增加,开展单细胞RNA-seq的方法也在不断涌现。近日,斯坦福大学的研究人员比较了市场上各种单细胞RNA扩增方法,以系统评估单细胞RNA-seq方法的灵敏度和准确性。他们的研究结果发表在《Nature Methods》在线版上。 目前,整个转录组的高通量测序(RNA-seq)已广泛用于各种组织的基因表达分析。然而,人们开展单细胞转录组分析的愿望也越来越强烈,这是因为有些细胞量少珍贵,不足以开展传统的RNA-seq,也有人希望对异质群体中的细胞亚群开展分析。过去的基因表达“平均值”已不再能满足人们的需求。 近年来,开展单细胞RNA-seq的各种方法时有报道,但关于这些方法的通量和性能还存在一些问题。比如说,性能主要是通过灵敏度和精确性来评估的。然而,为了评估测定方法的有效性,还应当评估准确性,即测量值与真实值之间有多接近。 为此,斯坦福大学生物工程系的Stephen R......阅读全文

布鲁克与景杰生物联合-推动前沿单细胞蛋白质组学研究

分析测试百科网讯 2021年10月14日,在第十一届中国蛋白质组学大会召开期间,为推动单细胞蛋白质组学的发展,拓展单细胞研究的视野,布鲁克和景杰生物联合举办了“单细胞蛋白质组学专题卫星会”,并在线上进行了直播。卫星会现场布鲁克.道尔顿中国区经理何磊先生布鲁克.道尔顿中国区经理何磊先生首先致欢迎辞,他

单细胞蛋白质组学:让细胞个体研究更加精细

    细胞是生命活动的基本单元。对细胞的精确认知是理解细胞在生理和病理过程中功能的先决条件。    在组织、器官或个体中,细胞具有非常大的异质性,而传统的研究手段针对大量细胞进行分析,得到的是大量细胞的平均结果,无法区分不同细胞个体对于大量样品结果的具体贡献值,从而忽视或掩盖了单细胞的个体差异,不

肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能

  近年来,随着测序技术的迅猛发展,单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年,单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测,都是在大量细胞宏观水平上,对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上,对其遗传物质进行检测,从

杆状病毒表达系统用于表达单一非融合蛋白的转染质粒

  由于外加的多角体蛋白或其它的氨基酸可能对外源蛋白的生物活性或细胞定位产生影响,所以用于表达非融合型蛋白的转移载体被广泛应用。几种不同的策略被用于设计高水平表达非融合蛋白的转移载体:  (1)如pAcRP[5]系列等,都在多角体基因启动子启始密码ATG上游引入一个单一的限制性多克隆位点;  (2)

单细胞分析色谱仪分类方法

单细胞分析色谱仪种类有多种。1、按流动相物理状态可分:气相单细胞分析色谱仪和液相单细胞分析色谱仪。2、按洗脱方式可分:等度洗脱单细胞分析色谱仪和梯度洗脱单细胞分析色谱仪。3、按产地可分:国产单细胞分析色谱仪和进口单细胞分析色谱仪。4、按分离规模可分:微型单细胞分析色谱仪、小型单细胞分析色谱仪和大型单

单细胞RNA性能分析新方法

  人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教

高通量单细胞技术获得新突破

  人类肠道是一件了不起的事情。每周,肠道都会再生一层新的内皮细胞,脱落的表面面积相当于一个小型公寓,并用新的细胞进行修复。几十年来,研究人员已经知道,负责这一改头换面行为的是肠道干细胞,但是直到今年,美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne

低成本单细胞分析新型“移动”设备

  近年来人们发现研究单细胞如何影响疾病和治疗反应的潜力越来越大,但是由于缺乏富于成本效益和便于操作的仪器,现阶段单细胞分析的应用发展尚比较受限。  新年伊始,纽约基因组研究中心和纽约大学2月23日在《Nature Communications》发表文章,向我们介绍了一款3D打印便携式低成本微流控单

解析古老的单细胞基因组

  单细胞的古细菌用肉眼根本看不到,甚至在使用显微镜时,也必须特别用心才能观察到它们。近日由丹麦奥尔胡斯大学地质微生物学中心领导的一个国际研究人员小组,却成功地从海底淤泥中获得了四个古细菌细胞,并绘制出了每个细胞的基因组图谱。这一突破性研究成果发表在著名的《自然》(Nature)杂志上。   “直

Nature子刊报道单细胞技术突破

  人类肠道是一件了不起的事情。每周,肠道都会再生一层新的内皮细胞,脱落的表面面积相当于一个小型公寓,并用新的细胞进行修复。几十年来,研究人员已经知道,负责这一改头换面行为的是肠道干细胞,但是直到今年,美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne

单细胞RNA性能分析新方法

  人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教

Nature重建单细胞的生命史

  研究人员开发出了一些新方法来追溯单个细胞的生命史,揭示它们在受精卵中的起源。通过检测健康细胞中人类基因组拷贝,他们构建出了从早期胚胎一路发育成为成体器官的组成部分每个细胞的图像。这项研究发表在6月29日的《自然》(Nature)杂志上。  在个体的生命过程中,机体内所有的细胞都会产生体细胞突变,

Science:单细胞分析?并行测序技术可以

  近日,一项发表于国际杂志Science上的研究论文中,来自美国的研究者描述了一种新型的大规模并行技术,通过利用新一代测序技术来在单细胞水平上实现对基因表达的监测;研究者表示,单细胞分析对于理解人类造血系统的必要性及重要性不断凸显,如果没有这种分析的话,来自少许细胞的大量表达改变就和来自许多细胞的

PRL:单细胞生物记忆揭示智慧起源

科学家在多头绒泡菌身上发现了原始的学习和记忆能力(图片来源:EYE OF SCIENCE/SPL) 学习和记忆能力是智慧的根本。日本科学家的一项最新研究,首次在一种原生质粘菌(protoplasmic slime,单细胞生物,但具有多个细胞核)中发现了记忆能力和神经活动性。该研究成果有望揭示智

-GEN报告重磅解析单细胞分析技术

  本期GEN Market & Tech Analysis报告的重点是单细胞分析(Single Cell Analysis ,SCA)市场。  SCA的应用涉及多个的领域,包括癌症、神经科学等。目前,SCA主要应用于生命科学的研究领域,但报告认为,在未来的5-7年,SCA将对诊

治疗单细胞综合症的简介

  西医药治疗无特殊治疗,一般为对症治疗.  (1)高热时补液,退热.  (2)咽部,扁桃体继发感染时选用青霉素治疗.  (3)并发咽部及喉头水肿,神经系统症状,血小板减少性紫癜,心肌炎时,应用肾上腺皮质激素治疗.

观察单细胞分裂过程用什么

从一个受精卵发育成多种功能的胚胎,细胞要经过上千次分裂和复杂的排列重组。据物理学家组织网6月3日报道,霍华德·休斯医学研究院珍妮莉娅法姆研究学院开发出一种最新的成像技术,能以前所未有的速度和精确度看到这一过程,让人们能追踪胚胎成形时每个细胞在几天甚至几小时内的变化。相关论文发表在6月3日出版的《自然

美实验揭示单细胞变多细胞过程

  从单细胞生物到多细胞体这一过渡是怎么发生的?据美国物理学家组织网1月16日报道,5亿多年前,地球表面的单细胞生物开始形成多细胞簇,最终变成了植物和动物。美国明尼苏达大学研究人员在实验室用普通的啤酒酵母菌复制了这一关键进化步骤,演示了这一过渡的发生过程。相关论文发表在近期出版的《美国国家科学院院刊

单细胞分离使工艺过程更加简单

 单细胞分离法是一种从待分离的材料中直接分离单个细胞进行培养获得纯培养的方法。该法在显微镜下操作,对于体积较大的微生物,可以用毛细管提取微生物个体;对较小的细胞或孢子,可以用显微针、钩、环等挑取以获得单细胞;也可将适当稀释后的样品制成小液滴,在显微镜下选取只含有一个细胞的液滴培养。  细胞分离的手段

单细胞生物的生物学特征

  第一个单细胞生物出现在35亿年前。单细胞生物在整个动物界中属最低等最原始的动物。包括所有古细菌和真细菌和很多原生生物。根据旧的分类法有很多动物,植物和真菌多是多细胞生物。变形虫算作单细胞动物,它的一些种类却算作粘菌,带鞭毛的鞭毛虫如眼虫有时被归为单细胞藻类或者是单细胞动物。新的分类法中,所有的真

《自然—方法学》年度方法:单细胞测序

  2014年1月《自然—方法学》(Nature Methods)上发表年度特别报道,将“单细胞测序”(Singled out for sequencing)的应用列为2013年度最重要的方法学进展。   近几年来,基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展,其成果有望为一些重

如何实现高通量的单细胞分选?

 单细胞分选通过集成基于介电的单细胞捕获释放和电磁阀吸吮技术,实现了高速流动状态下单细胞的捕获、采集、释放和分选,通量达~60个细胞/分钟。    为了进一步提高通量,研究人员提出,单细胞经液滴包裹后,通过耦合介电可实现高通量分选。  首先,液滴表面凸/凹的形状会产生透镜效应,影响激光聚焦,降低空间

Nature-methods发布单细胞测序新技术

  来自瑞典Ludwig癌症研究所及Karolinska研究所的研究人员,在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)杂志上报告了一项获得重大改良的新技术,可以利用它来分析单细胞中的基因表达——这一性能与从基础研究到未来癌症诊断的一切事物均存在关联。   资深作者Ri

单细胞分析揭示癌症异质性

  2013年度基因组生物学大会(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美国纽约冷泉港实验室召开。这是基因组学领域最大的会议之一,吸引了多个著名研究所的大牛参加。会议主题包括高通量基因组学和遗传学、复杂性状的遗传学、功能和癌症基因组学、计算基因组学、进化基因组学以

Single-Cell-PCR-单细胞PCR实验技术

Single Cell PCR(Protocol provided by Carolyn Troeger)Cell picking c Axiovert 100/Zeiss, extended glass capillary/Drummond, Broomall and a micromanipul

单细胞铺板的三种手法

  单细胞铺板手法一:均匀单层。要铺成那种很均匀的单层细胞,手法如下:    1,细胞板子先加入一定量(一般是总量培养基的1/5)的培养基,放入孵箱中放置10-20min。    2,在滴入细胞时,细胞板子与通风橱有一定的角度,沿着板壁的孔边缘滴入。    3,滴入后,呈“8”字方法摇晃5-8

单细胞蛋白的营养特性的介绍

  单细胞蛋白质饲料由于原料及生产工艺不同,其营养成分组成变化较大,一般风干制品含粗蛋白质在50%以上。因为这类蛋白质是由多个独立生存的单细胞构成,所以富含多种酶系。动物对其消化率高。例如,猪对啤酒酵母的消化率可达92%,对木糖酵母的消化率可达88%。必需氨基酸组成和利用率与优质豆饼相似。单细胞生物

《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱

  来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个

微藻:单细胞植物的大学问

   微藻是一类古老的低等植物,在陆地、淡水湖泊、海洋分布广泛。微藻种类繁多,截至21世纪初已发现的藻类有三万余种,其中微小类群就占了70%,即两万余种。  中科院水生生物研究所(以下简称水生所)研究员、国家开发投资公司微藻生物科技中心主任、“千人计划”专家胡强主要从事藻类生物学、生物技术与生物能源

单细胞测序需要准备什么再去测序

DNA测序的测序原理: DNA测序是指分析特定DNA片段的碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。