NatureMethods:单细胞RNAseq方法的比较

随着大家对单细胞转录组分析的兴趣日益增加,开展单细胞RNA-seq的方法也在不断涌现。近日,斯坦福大学的研究人员比较了市场上各种单细胞RNA扩增方法,以系统评估单细胞RNA-seq方法的灵敏度和准确性。他们的研究结果发表在《Nature Methods》在线版上。 目前,整个转录组的高通量测序(RNA-seq)已广泛用于各种组织的基因表达分析。然而,人们开展单细胞转录组分析的愿望也越来越强烈,这是因为有些细胞量少珍贵,不足以开展传统的RNA-seq,也有人希望对异质群体中的细胞亚群开展分析。过去的基因表达“平均值”已不再能满足人们的需求。 近年来,开展单细胞RNA-seq的各种方法时有报道,但关于这些方法的通量和性能还存在一些问题。比如说,性能主要是通过灵敏度和精确性来评估的。然而,为了评估测定方法的有效性,还应当评估准确性,即测量值与真实值之间有多接近。 为此,斯坦福大学生物工程系的Stephen R......阅读全文

单细胞蛋白质的用途

  ①用作食品有些单细胞蛋白质,特别是用农产品培养生长的酵母菌菌体可用作食品(必要时要先经过处理)。  ②用作饲料用单细胞蛋白质作为饲料,可以节约粮食,促进畜牧业发展。  ③用作其他从单细胞蛋 白质中可提取许多有用之物,如辅酶A,细胞色素C和辅酶I等医药产品,如酵母浸出汁等生物试剂。

单细胞在医学领域的应用

单细胞在医学领域有着广泛而重要的应用,包括但不限于以下几个方面:  1. 疾病诊断    - 肿瘤诊断:通过分析肿瘤组织中的单细胞,可以更精确地了解肿瘤细胞的异质性,区分不同亚型的肿瘤细胞,有助于肿瘤的早期诊断、分型和预后评估。例如,在乳腺癌中,单细胞分析可以识别出具有不同转移潜能的肿瘤细胞。

Namocell单细胞铺板基本工作原理

单细胞铺板新选择传统的细胞铺板一般采用手动的有限稀释法来进行,这种方法在需要的操作简单,只需要普通的排枪就能实现,但是效果却很不理想。主要体现在:一致性差,有效孔比例低下,耗费时间等。近年来,单抗药物的开发领域又被推上了一个新的高度,越来越多的公司都纷纷投入到这个热潮当中,随之而来的相关法规的要求也

漫谈单细胞测序及其临床应用

一、概述随着现代生物学的发展,细胞群体的研究已不再能满足科研需求。单细胞测序解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。单细胞测序正在成为科研热点。二、单细胞测序倍受青睐的原因人们最初以为一个细胞类群是均质的(即各细胞都是

单细胞测序技术的技术特点

单细胞测序技术是一种在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行高通量测序分析的技术。  它具有以下几个重要特点和优势:  1. 揭示细胞异质性:能够发现细胞群体中不同细胞之间的细微差异,识别罕见细胞类型和细胞的不同状态。 2. 深入了解细胞发育和分化:追踪细胞从干细胞到成熟细胞的发育轨迹,揭

单细胞分析技术的应用前景

单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景:在医学领域:疾病的早期诊断:能够在疾病症状出现之前检测到细胞层面的细微变化,实现超早期诊断。例如,在癌症的萌芽阶段,识别出具有恶变倾向的单个细胞,大幅提高患者的生存率。精准医疗:根据患者肿瘤细胞的单细胞特征,为其定制个性化的治疗方案,包括选择最有效的药物和

单细胞凝胶电泳标准操作

实验原理在细胞核中,DNA是环状附着在核基质上,细胞裂解过程中,核基质被溶解、抽提,DNA的结构则未发生变化。如果DNA链上存在缺口,则使DNA超螺旋变的松弛,DNA环向外展,同时由于暴露了阴电荷,在电场力的作用下,松动的DNA环向阳极迁移,但是由于这种松动的DNA环一端仍附着于核DNA,其迁移距离

单细胞生物的大智慧

  地球上绝大多数物种是单细胞生物。它们大多隐居在这个星球不为人知的角落里,籍籍无名。但生命是如此的奇妙,总会有一些看似简单的生物,向我们展示着它们无与伦比的能力,一种生命的力量。有的微生物十分强壮;有的微生物能够一睡万年;有的微生物则可在极端环境中茁壮成长,尽管其他大多数生命在这种环境下会刹那间凋

单细胞生物对社会的影响

单细胞生物对社会产生了多方面的重要影响:食品和工业生产:酵母是一种常见的单细胞生物,在食品工业中用于发酵制作面包、啤酒、葡萄酒等。例如,面包制作中酵母的发酵作用使面团膨胀,赋予面包松软的口感。某些单细胞藻类可用于生产生物燃料,如微藻通过光合作用将二氧化碳转化为油脂,这些油脂可以加工成生物柴油。环境保

基因筛查进入单细胞时代

  遗传筛选是生物学中最有力的工具,它可以阐明复杂的生物过程。最近四项研究已经开发了一个新的遗传分析方法,通过使用单个细胞作为微观实验室,测定扰动。这些研究开发了CROP-seq、PERTURB-seq和CRISP-seq技术,克服了现有基因筛查方法的局限性,并且可以分析一些原本无法分析的样本。  

结肠癌亚型单细胞分析

  一项由新加坡(通讯作者Shyam Prabhakar和Iain Beehuat Tan)、印度、美国(通讯作者Paul Robson)三国共同开展的计算基因组学项目,鉴定了11种结肠癌肿瘤和附近临近的非癌细胞的细胞组成。为更有针对性的结肠癌诊断和治疗开启了一扇门。  来自杰克逊实验室的科学家,本

单细胞技术分类及应用(一)

2019年10月22日,Biogen与日本Eisai宣布,经与FDA协商,计划于2020年初向FDA提交Aducanumab治疗阿尔兹海默症(AD)的上市申请。如果获批,Aducanumab将成为首个逆转疾病进展的AD药物。从技术角度看,Aducanumab也将有可能成为首个单B细胞测序来源的抗体药

单细胞蛋白的简介和分类

  单细胞蛋白,也叫微生物蛋白,它是用许多工农业废料及石油废料人工培养的微生物菌体。因而,单细胞蛋白不是一种纯蛋白质,而是由蛋白质、脂肪、碳水化合物、核酸及不是蛋白质的含氮化合物、维生素和无机化合物等混合物组成的细胞质团。单细胞蛋白中重要的是酵母蛋白、细菌蛋白和藻类蛋白,它们的化学组成中一般以蛋白质

单细胞培养的基本介绍

  单细胞培养(single cell culture)是指从植物器官、愈伤组织或悬浮培养物中游离出单个细胞,在无菌条件下,进行体外生长、发育的技术。人们分离和培养植物单细胞的设想和实践都比较早,但成功地进行单细胞培养是随着更有效的培养基的发展以及从愈伤组织悬浮培养物分离单细胞的专门技术的建立才实现

单细胞的概念及研究意义

单细胞是指单个的细胞,它是生物体结构和功能的基本单位。单细胞的研究具有重要意义:在技术层面,单细胞分析技术包括单细胞测序等,能够揭示单个细胞的基因表达、蛋白质组学、代谢组学等信息。在生物学层面:细胞异质性研究:可以帮助了解细胞之间的差异,发现新的细胞类型和细胞状态。发育生物学:追踪细胞在发育过程中的

单细胞的分离方法有哪些

一、悬浮细胞的分离方法:利用离心方法对细胞进行分离。二、实体组织材料的细胞分离方法:对于实体组织材料,由于细胞间结合紧密,为了使组织中的细胞充分分散,形成细胞悬液,可采用机械分散法( 物理裂解)和消化分离法。

常见的单细胞生物有那些?

常见的单细胞生物包括细菌、蓝藻、支原体、衣原体、放线菌等原核生物,以及酵母菌、草履虫、变形虫、衣藻等真核生物。单细胞生物在生态系统中也发挥着重要的作用:它们是生态系统中的生产者、消费者和分解者。例如,一些藻类是生产者,通过光合作用为其他生物提供有机物和氧气;一些细菌是分解者,能够分解有机物,促进物质

新型单细胞谱系追踪技术问世

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院彭广敦研究团队开发出新型单细胞谱系示踪技术(DuTracer)。这一技术通过巧妙结合CRISPR-Cas9和Cas12a两种基因编辑工具,提升了细胞谱系追踪的精度和深度,为解析胚胎发育、器官再生和疾病机制提供了新工具。相关研究成果发表在《细胞报告》(Cell

单细胞技术分类及应用(二)

什么是OEP呢?OEP的前身是2018年诺贝尔物理学奖获得者之一的Ashkin发明的Optical Tweeszer(OET)光镊技术,其原理是利用单个激光束通过高倍的显微物镜聚焦形成光阱,微观粒子受光压而束缚在光阱处,使用皮牛级别的力操纵和移动陷入光阱的微观粒子。这项技术在生物学上为单细胞

解读单细胞RNAseq技术

  多年来,跟踪一个单细胞的转录组,超出了我们的能力。但是现在,时代已经变了,新的单细胞RNA-seq方法,可以分析大量的细胞及它们的命运。  我们都参加过大型生日派对:在拥挤的房间里,与许多人聊天、吃饭和庆祝。但是,试想你并不知道寿星是谁,只是像一个局外者看待这个派对。你可能会觉得整个事件看起来与

单细胞在医药领域的应用

单细胞在医药领域的应用非常广泛,以下为您详细介绍:疾病机制研究神经退行性疾病:如阿尔茨海默病、帕金森病等。通过单细胞分析,可以了解不同类型神经细胞的基因表达变化、蛋白质组学特征以及细胞间通讯的异常,从而揭示疾病的发病机制。心血管疾病:研究心肌细胞、内皮细胞、平滑肌细胞等在疾病状态下的基因表达和功能改

单细胞分离技术的方法比较

单细胞分离技术:流式细胞分选术(Flow Cytometry Sorting):通过细胞表面标志物的特异性抗体标记细胞,利用流体力学和激光技术,对细胞进行快速、准确的分离和分选。激光捕获显微切割技术(Laser Capture Microdissection,LCM):利用激光束从组织切片中精确地切

单细胞测序技术在细胞呼吸研究进展

单细胞测序技术在细胞呼吸研究中面临以下一些挑战:数据复杂性和分析难度:单细胞测序会产生大量复杂的数据,需要复杂的生物信息学分析方法和专业知识来解读,从海量数据中准确识别与细胞呼吸相关的有意义信息并非易事。技术误差和噪声:包括样本制备、细胞捕获、核酸扩增等过程中可能引入技术偏差和噪声,影响数据的准确性

流式细胞术原理与应用详解

研究实验中,我们常常用到一个高大上的仪器――流式细胞仪,而与之相对应的就是流式细胞术,可是大家对它们都了解多少呢?今天小编就带着大家好好地认识一下~流式细胞术流式细胞术(flow cytometry,FCM)是利用流式细胞仪对于处在快速直线流动状态中的细胞或生物颗粒同时进行多参数、快速定量分析和分选

布鲁克与景杰生物联合-推动前沿单细胞蛋白质组学研究

分析测试百科网讯 2021年10月14日,在第十一届中国蛋白质组学大会召开期间,为推动单细胞蛋白质组学的发展,拓展单细胞研究的视野,布鲁克和景杰生物联合举办了“单细胞蛋白质组学专题卫星会”,并在线上进行了直播。卫星会现场布鲁克.道尔顿中国区经理何磊先生布鲁克.道尔顿中国区经理何磊先生首先致欢迎辞,他

DNMT3A突变相关白血病发病的分子机制及治疗靶点新发现

  来自上海交通大学医学院附属瑞金医院、上海血液学研究所的研究人员证实,在小鼠造血系统中条件性敲入DNA甲基转移酶3A(Dnmt3a)R878H突变基因,可诱发急性髓系白血病(Acute myeloid leukemia,AML),mTOR通路异常活化可能是潜在的治疗靶点。《美国科学院院刊》(PNA

单细胞蛋白质组学:让细胞个体研究更加精细

    细胞是生命活动的基本单元。对细胞的精确认知是理解细胞在生理和病理过程中功能的先决条件。    在组织、器官或个体中,细胞具有非常大的异质性,而传统的研究手段针对大量细胞进行分析,得到的是大量细胞的平均结果,无法区分不同细胞个体对于大量样品结果的具体贡献值,从而忽视或掩盖了单细胞的个体差异,不

单细胞分析技术的优势和局限性有哪些?

单细胞分析技术具有以下显著的优势:优势:揭示细胞异质性:能够深入了解细胞群体中单个细胞之间的差异,发现稀有细胞类型和细胞的不同状态。精准解析细胞功能:准确分析每个细胞的基因表达、蛋白质水平等,从而更精确地定义细胞的功能和特性。追踪细胞发育和分化:有助于追溯细胞在发育过程中的谱系和分化路径,揭示细胞命

基因表达过程中哪些因素与基因表达组织特异性有关

基因表达(geneexpression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。差别基因表达(differentialgeneexpression)指细胞分化过程中,奢侈基因按一定顺序表

肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能

  近年来,随着测序技术的迅猛发展,单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年,单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测,都是在大量细胞宏观水平上,对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上,对其遗传物质进行检测,从