NatureMethods：单细胞RNAseq方法的比较
随着大家对单细胞转录组分析的兴趣日益增加，开展单细胞RNA-seq的方法也在不断涌现。近日，斯坦福大学的研究人员比较了市场上各种单细胞RNA扩增方法，以系统评估单细胞RNA-seq方法的灵敏度和准确性。他们的研究结果发表在《Nature Methods》在线版上。 目前，整个转录组的高通量测序(RNA-seq)已广泛用于各种组织的基因表达分析。然而，人们开展单细胞转录组分析的愿望也越来越强烈，这是因为有些细胞量少珍贵，不足以开展传统的RNA-seq，也有人希望对异质群体中的细胞亚群开展分析。过去的基因表达“平均值”已不再能满足人们的需求。 近年来，开展单细胞RNA-seq的各种方法时有报道，但关于这些方法的通量和性能还存在一些问题。比如说，性能主要是通过灵敏度和精确性来评估的。然而，为了评估测定方法的有效性，还应当评估准确性，即测量值与真实值之间有多接近。 为此，斯坦福大学生物工程系的Stephen R......阅读全文
单细胞测序基准数据集的建立流程是怎样的？
以下是建立单细胞测序基准数据集的一般流程： 1. 研究目标确定 - 明确建立数据集的目的，例如评估特定分析方法、研究特定疾病或细胞类型等。 2. 样本收集 - 从多个来源获取具有代表性的样本，包括不同组织、个体、疾病状态等。遵循伦理和法律规定进行样本采集。 3. 实验设计
华大基因再出手－单细胞转录组学测序技术的系统分析
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-seq)是在单细胞水平对转录组（mRNA）进行测序的一项新技术，可发现细胞群体中真正起作用的细胞，特别适合对高度异质性的干细胞、肿瘤细胞及胚胎发育早期的细胞群体进行研究，认识细胞分子机制和基因调控网络。单细胞RNA-seq技术需要在测序前制备文库
单细胞分选方式利弊以及难易程度介绍
单细胞分选是对细胞（或微粒）的物理、生理、生化、免疫、遗传、分子生物学性状及功能状态等进行定性或定量检测的一种现代细胞分析技术。 如果对通量要求较高，同时目标细胞有适宜的荧光标记，可利用流式细胞仪完成分选。经荧光染色或标记的单细胞悬液，被高压压入流动室内，在鞘液的包裹和推动下，细胞被排成单列，以
Nature－Methods－|－朝思暮想：单细胞蛋白质组测序之梦
近期，Nature Methods 杂志技术编辑Vivien Marx发表文章 A dream of single-cell proteomics，探讨了单细胞蛋白组学的发展，提出了该技术有可能会面对的问题和潜在解决方案。单细胞蛋白质组测序的梦想并不遥远（Credit: S. Larochell
单细胞测序技术的缺点有哪些？
单细胞测序技术存在以下一些缺点： 1. 成本较高：包括实验设备、试剂和数据分析等方面的费用相对较高，限制了其在大规模研究中的广泛应用。 2. 技术难度：实验操作流程较为复杂，对操作人员的技术要求较高，容易出现操作失误导致数据质量下降。 3. 数据量大且复杂：产生的数据量巨大，数据分析和处理具有
分子诊断前沿科技概述
按照常规分类，分子诊断技术主要分为两大类：核酸检测以及生物芯片。核酸检测技术具体包括聚合酶链式反应技术（PCR）、荧光原位杂交技术（FISH）以及基因测序技术；生物芯片主要包括基因芯片和蛋白芯片技术。同时，分子诊断设备已越来越向数字化、自动化、高通量转型，基于杂交的检测技术逐渐被数字 PCR、下一代
多肽制备
固相多肽合成就是不断地在固相载体上加入α-氨基和侧链基团被保护的氨基酸。FMOC基团是用来保护α-氨基中的N的，去除保护基团后，再加入第二个氨基酸。产生的多肽通过一个连接臂将C端连接在树脂上，它可以被裂解下来。通常情况下，在多肽从树脂上裂解下来的同时去除侧链保护基团，一般采用哌啶去 FMOC保护基团
制备TLC
制备TLCTLC还可用于少量如100毫克左右的化合物的分离，此时混合物样品不是“点”在板上，而是涂抹在TLC板上且高于洗脱剂液面上的位置，形成一条水平的样品带。然后如同展开小型TLC板一样将制备TLC板展开并晾干，然后将每条携带不同化合物的色带从板上分别刮下，并用合适的溶剂萃取洗涤（如二氯甲烷）并过
抗原制备
不管是制备单抗还是多抗，抗原的设计与制备都是一个非常重要的问题，设计或者制备得不好的抗原有可能完全不能免疫出抗体来。一个良好的抗原必须具体的条件：（1）分子足够大。对于多肽或蛋白质类的抗原来说，一个抗原决定簇（又叫表位，epitope），通常由6-8个氨基酸残基组成。而平均每5-10kD才有一个表位
强强合作研发针对晚期肝脏疾病的细胞治疗方案
2020年2月20日，全球领先的单细胞分离系统提供商美国Namocell公司与Takara Bio及HepaTx联合宣布三方合作研发针对晚期肝脏疾病的细胞治疗方案，将HepaTx研发的可发育成肝脏细胞的脂肪组织内干细胞，首先利用Namocell专有的单细胞分离仪进行分离，然后用Takara Bi
三方合作研发针对晚期肝脏疾病的细胞治疗方案
2020年2月20日，全球领先的单细胞分离系统提供商美国Namocell公司与Takara Bio及HepaTx联合宣布三方合作研发针对晚期肝脏疾病的细胞治疗方案，将HepaTx研发的可发育成肝脏细胞的脂肪组织内干细胞，首先利用Namocell专有的单细胞分离仪进行分离，然后用Takara Bi
6634.5万－广州健康院再次公布一批政府采购意向
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院再次公布一批政府采购意向，涉及流式细胞分选仪、共聚焦显微镜等多项生命科学领域仪器设备，总预算达6634.5万元，预计采购时间为6月至7月。具体信息如下：序号项目名称需求概况预算金额（万元）预计采购时间1流式细胞分选仪结合流式细胞技术与细胞分选功能的生物技术，根
华东理工大学肿瘤抑制蛋白p53原位成像研究获进展
华东理工大学教授龙亿涛小组在单细胞内p53蛋白原位成像检测研究领域取得新进展，相关研究在线发表于《德国应用化学》。 p53是一种肿瘤抑制蛋白，具有反式激活功能和广谱的肿瘤抑制作用。在肿瘤细胞内，p53蛋白通常会发生变异，干扰细胞的正常生长调控机制。“p53蛋白一直是近年来生命科学领域的研究热点
多项技术助力肿瘤原位成像
华东理工大学教授龙亿涛小组在单细胞内p53蛋白原位成像检测研究领域取得新进展，相关研究在线发表于《德国应用化学》。 p53是一种肿瘤抑制蛋白，具有反式激活功能和广谱的肿瘤抑制作用。在肿瘤细胞内，p53蛋白通常会发生变异，干扰细胞的正常生长调控机制。“p53蛋白一直是近年来生命科学领域的研究热点
做免疫荧光如何看蛋白是在细胞核表达还是胞浆表达
复染细胞核，常规用过的是DAPI进行细胞核复染（蓝色）。目的是为了鉴别目的蛋白的位置是胞核表达，还是胞质表达或胞膜表达。一般来讲，如果是胞核表达，会和蓝色的细胞核颜色重叠；胞质或胞膜表达则不会重合，单独看目的蛋白的表达，会看到有个黑色的空洞的，尤其细胞图像更为明显。从楼主的图片看，貌似是在胞核表达（
单细胞测序数据分析中的应用案例
以下是一些深度学习方法在单细胞测序数据分析中的应用案例： 1. 细胞类型分类 - 研究人员使用深度学习算法，如卷积神经网络（CNN），对单细胞测序数据进行分析，以准确地识别和分类不同的细胞类型。例如，通过训练模型学习不同细胞类型的基因表达特征，从而能够对新的单细胞数据进行快速准确的分类。
基于单细胞测序绘制肿瘤微环境相关细胞代谢图谱
肿瘤作为一个异常复杂的“生态系统”，不同类型的肿瘤细胞与非肿瘤细胞共同构成了肿瘤微环境。肿瘤存在肿瘤间异质性和肿瘤内异质性，可以说肿瘤内每种细胞都存在于不同的微环境中，每种细胞都可能有不同的代谢状态。由于异质性，肿瘤细胞会通过改变自身代谢模式（即“代谢重编程”）来适应不同的微环境，以满足其对能量
什么是制备与半制备液相
制备与半制备主要是指待制备样品的量来区别，1克以上是制备级别，100毫克到1克之间是半制备级别
半制备色谱和制备色谱的区别
1.制备与半制备的差异是流速与色谱柱；半制备一般会选择直径为10mm的色谱柱；而制备选择的是直径为20的色谱柱；同样，流速也会相应提升，半制备的流速一般为1.0ml/min，而制备一般会设置为8ml/min。液相色谱仪有分析型以及制备型，分析型一般用来分析多个化学成分，可以进行定性以及定量，而制备型
制备电泳实验——等电聚焦制备电泳
实验方法原理等电聚焦制备电泳是一种非变性制备技术。由于等电聚焦电泳技术的特点，因而是一种理想的制备方法。试剂、试剂盒电极液两性电解质Ultrodex实验步骤一、液体介质垂直柱状蔗糖密度梯度等电聚焦是原瑞典 LKB 公司早期用于制备和分析目的的等电聚焦方法。载体两性电解质在蔗糖密度梯度柱中形成 pH
人工制备抗体制备方法有哪些
抗体在疾病的诊断和免疫防治中的重要作用，使人们对抗体的需求越来越大。人工制备抗体是大量获得抗体的重要途径。早年人工制备抗体的方法主要是以相应抗原免疫动物，获得抗血清。由于抗原常常含有多种不同的抗原表位，加之所获得的抗血清也未经免疫纯化，因此，获得的抗血清实际上是含多种抗体的混合物，即多克隆抗体(po
SCIENCE－ADVANCES：单细胞Western揭秘胚胎发育异质性
近日，美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家，利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES（IF：12.804）发表文章：Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope
SCIENCE－ADVANCES：单细胞Western揭秘胚胎发育异质性
近日，美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家，利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES（IF：12.804）发表文章：Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope
SCIENCE－ADVANCES：单细胞Western揭秘胚胎发育异质性
近日，美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家，利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES（IF：12.804）发表文章：Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope
单细胞蛋白质定量技术解析干细胞异质性
干细胞是具有自我更新和多向分化潜能的未分化细胞。体内或体外研究表明, 干细胞具有表型及功能的异质性, 这一特性也决定了其不同的分化和再生能力。越来越多的证据表明, 干细胞自我更新及分化的分子机制以及与干细胞功能失调的相关疾病的产生都是在单细胞水平发生的, 基于异质性的干细胞群体的研究结果
StrataQuest定量分析方法：探索胞内原生生物与宿主细胞...1
StrataQuest定量分析方法：探索胞内原生生物与宿主细胞的关系探究宿主-病原体相互作用的特点是研究微生物与免疫学方向学科的重要方法。宿主细胞吞噬病原体后其表征将会改变。利用实时PCR仪或者ELISA的技术，测量与基因编码蛋白相关的行为是消除病原体还是免疫逃逸。多数研究都利用主要宿主细胞或者细胞
我国科学家绘制出脊髓损伤时空动态图谱
7月18日，《发育细胞》（Developmental Cell）在线发表了中国科学院上海有机化学研究所研究员方燕姗团队、中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员彭广敦团队和暨南大学副研究员李昂团队合作最新成果。他们成功绘制出脊髓损伤后原位基因表达和细胞互作的时空动态图谱，为脊髓损伤的治疗提供了新视角
我国科学家绘制出脊髓损伤时空动态图谱
7月18日，《发育细胞》（Developmental Cell）在线发表了中国科学院上海有机化学研究所研究员方燕姗团队、中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员彭广敦团队和暨南大学副研究员李昂团队合作最新成果。他们成功绘制出脊髓损伤后原位基因表达和细胞互作的时空动态图谱，为脊髓损伤的治疗提供了新
单细胞分析技术标准化实验流程手册分享
一、实验目的本实验流程旨在对单细胞进行分离、捕获、标记和分析，以获取单个细胞的基因表达、蛋白质表达或其他生物分子信息，为细胞生物学、医学研究和临床诊断等提供准确和可重复的数据。二、实验材料和设备样本：细胞悬液（如组织解离后的细胞、血液细胞等）试剂细胞解离试剂细胞活性检测试剂（如台盼蓝）单细胞捕获试剂
突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法，使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》（Nature Methods）上的实验方案，可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速，被广泛用于研究细胞间的基因表达谱（转录组）