水稻全生命周期时空细胞图谱绘制成功
在7日于海南省三亚市举行的崖州湾“揭榜挂帅”联合攻关成果新闻发布会暨水稻时空组学学术研讨会上，被称为“南繁硅谷第一张生命底图”的水稻最新研究成果发布。据悉，该研究由崖州湾实验室联合海南省种业实验室、华大生命科学研究院等12家科研机构协作完成，首次构建了覆盖水稻从种子萌发到开花结实全过程的三维时空细胞图谱，并整合了基因组、细胞发育阶段与空间转录组信息，为在个体尺度上理解植物发育提供了重要基础。相关论文于6日在线发表于国际学术期刊《细胞》。 记者了解到，该研究以粳稻品种“中花11”为材料，整合华大自主研发的Stereo-seq时空组学技术、DNBelab C4单细胞建库平台、T7高通量基因测序仪和人工智能分析，并结合高质量T2T基因组，建立了覆盖10类器官或组织、61个发育阶段的图谱。研究团队获取了超85万个高质量细胞核的数据，以及超34万个空间数据单元，注释出119种细胞类型和133个细胞亚型。这张图谱可以理解为一份带有时间......阅读全文
水稻全生命周期时空细胞图谱绘制成功
在7日于海南省三亚市举行的崖州湾“揭榜挂帅”联合攻关成果新闻发布会暨水稻时空组学学术研讨会上，被称为“南繁硅谷第一张生命底图”的水稻最新研究成果发布。据悉，该研究由崖州湾实验室联合海南省种业实验室、华大生命科学研究院等12家科研机构协作完成，首次构建了覆盖水稻从种子萌发到开花结实全过程的三维时空
水稻多器官单细胞多组学图谱问世
记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉，该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构，构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱，系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用，有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。 单细胞组学是近年来生命科学
首个棉花纤维起始发育单细胞时空组学图谱发布
近日，中国农业科学院棉花研究所乡村振兴科技创新团队牵头构建了首个结合单细胞转录组、空间转录组及空间代谢组的棉花纤维起始发育图谱。利用该图谱可以识别关键基因的表达模式及其与代谢途径的关系，深入剖析纤维发育过程中的核心调控机制。相关研究成果发表在《自然通讯（Nature Communications）》
科学家绘制水稻幼苗根叶单细胞转录图谱
中国科学院遗传与发育生物学研究所钱文峰研究组应用单细胞转录组测序技术，获得了水稻幼苗叶和根超过20万个单细胞的转录组信息，利用细胞类型标记基因和原位杂交技术，对每个细胞的身份进行了鉴定，构建了水稻幼苗叶和根的单细胞转录图谱。相关结果近日发表于《遗传学和基因组学期刊》。水稻幼苗叶和根的单细胞转录组
科学家绘制水稻幼苗根叶单细胞转录图谱
水稻幼苗叶和根的单细胞转录组二维UMAP图与组织解剖图 图片来源：钱文峰等 中国科学院遗传与发育生物学研究所钱文峰研究组应用单细胞转录组测序技术，获得了水稻幼苗叶和根超过20万个单细胞的转录组信息，利用细胞类型标记基因和原位杂交技术，对每个细胞的身份进行了鉴定，构建了水稻幼苗叶和根的单细胞转录
小鼠肺发育时空分子图谱绘制成功
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员彭广敦团队同合作者运用高通量空间转录组技术，绘制出小鼠胚胎期主要阶段到出生后P0天的时空分子图谱，从而揭示了肺发育过程中的复杂调控机制。相关成果发表于《科学通报》（Science Bulletin）。哺乳动物肺的功能发育是一个复杂的过程，它依赖于多种细胞
科学家建立首个人类肢体发育的单细胞时空图谱
中山大学中山医学院教授张宏波团队与英国Sanger 研究所教授Sarah Teichmann团队合作，研究建立了首个人类肢体发育的单细胞时空图谱并解析关键调控机制。12月6日，相关成果在线发表于Nature。 “我们基于单细胞转录组学和空间转录组学技术建立的首个人类肢体发育单细胞图谱，解析了从
人脑多区域时空发育转录组图谱获解析
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514996.shtm
人脑多区域时空发育转录组图谱获解析
科学家通过单细胞和时空转录组研究，首次解析迄今为止跨时间点最广（GW6-GW23）、面积最大（最大4cm x 3cm）的人脑多区域时空发育转录组图谱，为解码人脑发育及区域特化研究提供了新见解。日前，相关研究成果发表在《细胞》上。 脑是人类最复杂和神秘的器官。解剖学上，脑可以被划分为不同的区域，
农科院生物所研究团队绘制水稻根组织单细胞图谱
近日，中国农业科学院生物技术研究所谷晓峰团队和合作者绘制了单子叶模式植物水稻首个根组织单细胞分辨率转录组图谱，为研究植物细胞类型特化、功能和进化提供了新的途径。相关结果发表在国际学术期刊《分子植物（Molecular Plant）》上。 在植物整个生命过程中，根尖在不断地分化发育，形成的根系从
科学家解析人脑发育时空图谱及规律
作为人类最复杂的器官，脑在解剖学上被划分为不同的区域，包括端脑【主要由新皮层（Cor）构成】、间脑（Dien）、中脑（Mid）和小脑（Cere）等。这些不同脑区具有特殊的输入输出连接，发挥不同的功能。在人脑发育过程中，通过内在基因程序产生了复杂的细胞类型。在这些细胞类型中，有些已有明确的特征，但
我国科学家绘制出脊髓损伤时空动态图谱
7月18日，《发育细胞》（Developmental Cell）在线发表了中国科学院上海有机化学研究所研究员方燕姗团队、中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员彭广敦团队和暨南大学副研究员李昂团队合作最新成果。他们成功绘制出脊髓损伤后原位基因表达和细胞互作的时空动态图谱，为脊髓损伤的治疗提供了新视角
我国科学家绘制出脊髓损伤时空动态图谱
7月18日，《发育细胞》（Developmental Cell）在线发表了中国科学院上海有机化学研究所研究员方燕姗团队、中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员彭广敦团队和暨南大学副研究员李昂团队合作最新成果。他们成功绘制出脊髓损伤后原位基因表达和细胞互作的时空动态图谱，为脊髓损伤的治疗提供了新
高清肝脏时空图谱出炉！揭示肝再生机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/4/521203.shtm在过度熬夜、吸烟喝酒、高糖高盐饮食等不良习惯日渐常态化的现代生活中，肝脏疾病也呈现出日益严峻的态势。作为人体的“化工厂”，肝脏除了解毒功能外，还具备代谢、合成、消化、免疫等多种功能。肝
我研究团队主导构建小鼠肝脏高精度时空图谱
4月16日，深圳华大生命科学研究院研究团队利用自研时空组学技术和单细胞转录组测序技术，构建出小鼠肝脏高精度时空图谱。这一图谱，分别揭示小鼠肝脏稳态的空间分子特征，以及肝部分切除、胆汁淤积损伤与修复过程中的复杂分子机制。两项研究以不同角度解析了肝脏损伤与再生复杂机制，有望为肝脏疾病治疗、肝脏再生与移植
科学家成功绘制鼠脑出血后时空分子图谱
脑出血，指非外伤引起的大脑血管破裂造成血液流出，是病死率最高的脑血管疾病，大多数患者无法完全恢复功能独立。由于脑出血的病理机制复杂且缺乏精准干预靶点，至今尚无特异性治疗手段。记者从华大生命科学研究院了解到，近日，该院联合郑州大学、瑞典卡罗林斯卡学院及哥德堡大学，利用时空组学技术Stereo-seq，
细胞分化的时空性介绍
同源细胞一旦进入分化，因其所有细胞所处空间位置不同，环境也不尽一致，因此出现形态上的差异和机能上的特化，因而会形成类型不同的细胞，这种现象称为分化的时空性。在不同的发育阶段，一个细胞可以有不同的形态和功能，这是时间上的分化。单细胞生物只有时间上的分化，多细胞生物不仅有时间上的分化，而且还有空间上的分
简述细胞分化的时空性
同源细胞一旦进入分化，因其所有细胞所处空间位置不同，环境也不尽一致，因此出现形态上的差异和机能上的特化，因而会形成类型不同的细胞，这种现象称为分化的时空性。在不同的发育阶段，一个细胞可以有不同的形态和功能，这是时间上的分化。单细胞生物只有时间上的分化，多细胞生物不仅有时间上的分化，而且还有空间上
首个万份水稻群体变异图谱发布
近日，中国农业科学院基因组研究所联合海南三亚崖州湾实验室、中国水稻研究所和河南大学等单位在《核酸研究》上在线发表了全球首个万份水稻群体变异图谱。 水稻是世界上最重要的粮食作物之一，其自然变异是基因改良和现代育种的重要遗传基础，因此广泛挖掘水稻种质群体中的丰富变异具有重要意义。近年来，稀有变异对
首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位，共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱，为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源，也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。 植物的所有组织、器官中都富含蛋白质，它是构成
首个万份水稻群体变异图谱发布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510525.shtm
首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位，共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱，为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源，也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。植物的所有组织、器官中都富含蛋白质，它是构成细胞和生
脑也能再生？《科学》封面现首个脑再生时空图谱
2022年9月2日，华大生命科学研究院主导完成的首个蝾螈脑再生时空图谱以背靠背封面文章的形式发表于国际顶级学术期刊《科学》，这也是全球首个脑再生时空图谱。 研究团队基于华大时空组学Stereo-seq技术，系统解析并比较了蝾螈脑发育和再生过程，找到了蝾螈脑再生过程中的关键神经干细胞亚群，描绘了此
什么是细胞分化的时空性？
同源细胞一旦进入分化，因其所有细胞所处空间位置不同，环境也不尽一致，因此出现形态上的差异和机能上的特化，因而会形成类型不同的细胞，这种现象称为分化的时空性。在不同的发育阶段，一个细胞可以有不同的形态和功能，这是时间上的分化。单细胞生物只有时间上的分化，多细胞生物不仅有时间上的分化，而且还有空间上的分
构建水稻基因组倒位变异图谱
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内多家单位发布了迄今为止最大的水稻群体水平倒位变异图谱，并挖掘获得了新的水稻耐热优异等位基因，该研究对水稻育种改良具有重要意义。相关研究成果发表在《科学通报（Science Bulletin）》上。 水稻中的基因组倒位变异是指染色体上的DNA序列发
“透视”肝脏：中国科学家构建小鼠肝脏高精度时空图谱
·首次成功构建了小鼠肝脏的高精度时空图谱，探索了肝脏的空间分子特征与损伤修复中的分子机制，为未来肝脏疾病的治疗提供了新思路。在所有的器官中，肝脏可能是最“神秘”的一个。它不仅是最大的实体器官，包含最多的血液，具备器官中最强的再生能力，还担负着代谢、合成、消化、免疫等多种功能。古代人曾认为肝代表着欲望
Nature：中科院团队合作获得小鼠胚胎早期时空转录图谱
在小鼠胚胎的植入后发育期间，早期外胚层中的内细胞团的后代从幼稚状态转变为多能状态。同时，形成胚层并指定细胞谱系，从而建立胚胎发生的蓝图。命运映射和谱系分析研究表明，胚胎层不同区域的细胞在原肠胚形成期间获得位置特异性细胞命运。在基本身体计划形成之前，细胞命运的区域化-其机制有助于理解胚胎编程和基于
《自然》发布重要单细胞RNA图谱：首张小肠细胞图谱
我们肠道上皮是人体内多样性最高，最具活力的组织之一, 作为机体与外界的主要界面之一，组成了一个细胞的生态系统。为了更好地理解这些复杂的组织及其功能，还有影响它的疾病，麻省理工学院、哈佛大学和麻省总医院研究人员领导的一个研究团队通过分析从小鼠肠道或肠道类器官中取样的5.3万多个单独的细胞，完成了一
亚热带生态所发现水稻根际酶活性时空动态稳定机制
由中国科学院亚热带农业生态研究所研究员吴金水领衔的农业生态过程方向研究团队近日于水稻根际酶活时空动态稳定机制及其对温度和水稻生长的响应研究取得新进展。 根际是土壤微生物活动最为重要的“热区”，是土壤-微生物-植物根系之间互相作用关系最为密集的区域。尽管根际的生物化学过程非常活跃，但持续高效的物
追踪细胞时空变化助力精准医学发展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516615.shtm