首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位,共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱,为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源,也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。植物的所有组织、器官中都富含蛋白质,它是构成细胞和生物体结构的物质,能够以酶等形式参与细胞的化学反应,也是细胞膜的组成成分。可以说,蛋白质是农作物体内实现各种生物学功能的主要“执行者”,因此,构建全景定量蛋白质组图谱对阐释植物的生长发育、逆境响应及代谢调控等方面具有重要意义。然而,一直以来,由于蛋白质组技术的覆盖度和精度不够,科学家对农作物定量蛋白质组以及对蛋白质表达的调控机制的理解仍不够深入。由此,科研人员利用质谱等最新技术,量化了水稻内主要组织中超过15000个基因的蛋白质水平,鉴定了8964个蛋白质,并为另外7077个蛋白编码基因提供了蛋白质水平证据,从而绘制出了水稻全景定量蛋白......阅读全文
首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位,共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱,为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源,也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。植物的所有组织、器官中都富含蛋白质,它是构成细胞和生
首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位,共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱,为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源,也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。 植物的所有组织、器官中都富含蛋白质,它是构成
首个大豆全景定量蛋白质组图谱发布
近日,中国农业科学院生物技术研究所联合多家单位,绘制出大豆全景定量蛋白质组图谱,揭示了RNA甲基化在调控大豆蛋白表达量中的作用,并利用蛋白质组数据挖掘出调控大豆发育的新表观因子MTBa。相关研究成果发表在《细胞—基因组学》(Cell Genomics)上大豆基因组数据尽管可以提供大量信息,但不足以阐
杭师大沈波组:水稻叶片衰老相关定量蛋白质组学分析
水稻是重要的粮食作物之一,随着人口的增长,人类对大米的需求不断增加。为确保粮食安全,提高水稻生产成为人类的首要任务之一。但是,水稻籽粒的产量往往受到叶片衰老的严重影响。例如,梁优培9号(LYP9)超级杂交稻具有较高的抗病性优势,但对衰老较敏感,常导致水稻产量下降。因此,了解水稻叶片的衰老机制将有
科学家揭示水稻根单细胞异质性和分化全景图
中国科学院分子植物科学卓越创新中心王佳伟研究组系统揭示了水稻根单细胞异质性,描绘了水稻根表皮细胞和基本组织细胞的分化轨迹,明确了在根尖干细胞分化过程中基因表达与基因染色质可及性的相关性,并同时阐明了单子叶植物水稻和双子叶植物拟南芥在根尖细胞类型上的进化保守性。该研究成果4月6日在线发表于《自然—
定量蛋白质组学的诞生
在现代研究技术,如荧光显微镜,流式细胞仪和蛋白质芯片技术中,抗体仍然扮演着非常重要的角色。但依赖于抗体的蛋白质检测存在一些缺点,其中最大的限制就是,抗体的可用性和质量差别很大。一些大规模项目,比如人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas),Antibodypedia,以及美国NIH
定量蛋白质组学方法分类
1 背景和意义从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能模块和路径,监控疾病的生物标志物,这些研究都
Cell子刊:人类基因组复制的蛋白全景图
复制体是一种重要的蛋白复合体,是机体内的DNA复制机器。现在,科学家们利用新技术,对参与DNA复制的蛋白进行了综合分析,解析了复制体的具体成分。文章发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。 DNA复制是细胞分裂前的必要步骤,也是绝大多数化疗药物的作用靶标,这些药物通过破坏D
《自然》:人类癌症的致癌全景图
用于新型癌症治疗方法的临床试验设计,一般来说都是集中在肿瘤起源所在的组织,然而近期由纪念斯隆-凯特琳癌症中心的研究人员完成的一项研究则发现了一种新的方法:基于基因组标记进行研究,而不是针对机体器官组织进行研究。 这一研究成果公布在9月26日的Nature Genetics杂志上,同时还
定量蛋白质组学方法分类介绍
【蛋白研究系列专题】-4丨定量蛋白质组学方法,您值得拥有 1 背景和意义 从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下
定量蛋白质组学的研究内容
1.蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。 2.翻译后修饰:很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化,糖基化,酶原激活等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式,因此对蛋白质翻译后修饰的研究对
破译蛋白质组-打开生命“解剖图”
据新一期英国《自然》杂志报道,人类蛋白质组组织前主席约翰·伯杰龙发起一项大规模的破译人类蛋白质组计划,目标是花费约10年时间将人体所有蛋白质归类并描绘出它们的特性,并揭示它们在细胞中所处的位置以及每种蛋白质与其他哪些蛋白质存在相互作用。 早在上世纪90年代,科学家就已经启动了基因组计划,并经过1
定量蛋白质组学的技术发展
以质谱为基础的定向蛋白质组学研究领域的发展历程并不短,早在上个世纪70年,三重四极杆质谱仪就已经出现,并在80年代首次在发表的文章中,证明可以被用来检测肽段。 过去几年间,更广泛的范围内定向质谱技术的应用迅速攀升,而且新方法,新工具,新资源和新一代方法,也令更多研究领域的科学家们能利用到这项技
安捷伦科技资助定量蛋白质组学研究
安捷伦科技通过都柏林国立大学 Newman 奖学金计划 资助定量蛋白质组学研究 2010 年 5 月 12 日,加利福尼亚州圣克拉拉市和爱尔兰都柏林市 — 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)和都柏林国立大学(University College Dublin, UCD)今日宣布 Ben
定量蛋白质组学的优势有哪些?
质谱方法比抗体方法更先进的一个原因,就是已经开发出了一种新的定向分析技术,比生产一个新的抗体要快得多,并大大减少了检测特异性方面的问题(抗体方法存在交叉反应的问题)。 虽然抗体方法在低丰度蛋白的检测方面更加灵敏,但是质谱技术的一个明显优势就是能在单个实验中检测多种蛋白,比如说,系统生物学研究人
夏光:“污染防治攻坚战”全景图
党的十九大将坚决打好污染防治攻坚战作为决胜全面建成小康社会的三大攻坚战之一。这是一项非同寻常的部署,说明污染防治在当前国家经济社会发展全局中具有非常重要的影响,同时又面临较大的难度,必须赋予其特殊地位,做出特殊安排。 打好污染防治攻坚战,就是要在特定的时间内,集中强大的力量,努力攻克一批生态环
“普朗克”卫星绘出首幅宇宙辐射全景图
在7月5日于意大利都灵市举行的一场新闻发布会上,欧洲空间局(ESA)公布了由去年发射的普朗克探测卫星拍摄的首幅宇宙微波辐射的全景图。它将有助于科学家了解宇宙大爆炸后各种天体的形成过程。天文学家根据它提供的数据,可以更好地了解宇宙的起源及其现在的运行方式。 欧航局当天发表公报说,
中国天眼成果频出-附中国天眼全景图
12月19日拍摄的“中国天眼”全景(维护保养期间摄,无人机照片)。新华社记者 欧东衢 摄 20日上午,2021年度FAST运行和发展中心年终总结会在贵州省平塘县中国天眼(FAST)观测基地举行。 据了解,目前利用FAST望远镜观测产生的科学成果不断涌现。FAST已发现509颗脉冲星,是世界上所有
定量蛋白质组表达谱分析技术iTRAQ/TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签,通过特异性 标记多肽的
定量定性蛋白质组学新工具亮相ASMS
赛默飞世尔科技在ASMS 2010展示定量定性蛋白质组学工具 美国犹他州盐湖城(2010年5月25日)– 全球服务科学领域的领导者赛默飞世尔科技,今日公布了其在蛋白质组学工具方面的重大进步,并表示这些进步将推动定量和定性蛋白质组学研究取得突破性的进展。这些新产品与赛默飞世尔科技其它的试剂和耗材
定量蛋白质组表达谱分析技术——iTRAQ/TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签,通过特异性 标
蛋白质组学几种定量方法的案例解读
上期分享的蛋白组学内容,是不是有些小伙伴还绕在云里雾里呀?这次,小编用实例说话,帮您梳理清楚。 一、Label-free定量 Label-free定量,顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理,只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化
“鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术
1999年,Yates研究组提出“鸟枪法”(shotgun),其基本技术路线是针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物,然后对肽混合物进行多维毛细管液相色谱分离和串联质谱分析以及数据库检索,从而确定蛋白质的种类,可同时鉴定成百上千种蛋白质。他们把这种思路称
Aebersold研究组发布用于全蛋白质组的高通量定量方法
瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员领导的一个研究小组,已制定了一个质谱工作流,用于对整个蛋白质组进行高通量的绝对定量。 据ETH的研究者、该研究的领头人Ruedi Aebersold说,对于多种形态,该技术实现了目标蛋白质组的重现性定量,提供用于
科学家建立卡波氏肉瘤组织中KSHV基因组表观遗传全景图
1月24日,国际学术期刊PLOS Pathogens 发表了中国科学院上海巴斯德研究所蓝柯研究组题为Epigenetic landscape of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus genome in classic Kaposi's
中国制造全景图:谁在成长,谁在成熟,谁在衰退
任何行业都会经历萌芽、成长、成熟、衰退四个阶段,一家企业可以在不同的行业之间跃迁,但一个行业很难逆生长。不同阶段的行业有不同的投资机会,萌芽期行业投资要注重风险管理,成长期行业投资看重研发投入和商业模式及目标,成熟期行业投资在于龙头,衰退期行业投资在于提高产能利用率和运营效率的行业。企业的价值不是一
中国制造全景图:谁在成长,谁在成熟,谁在衰退
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蛋白质组学几种定量方法的案例解读(三)
经典案例题目:Proteome-wide Mapping of Cholesterol-Interacting Proteins in Mammalian Cells(采用甾醇探针结合SILAC定量技术在哺乳动物细胞中分析胆固醇-蛋白质相互作用)期刊:Nat Methods主要技术:SILAC定量文
蛋白质组学几种定量方法的案例解读(二)
经典案例题目:A tumour suppressor network relying on the polyamine-hypusine axis(一种基于多胺Hypusine轴(Polyamine-hypusine axis)的新型肿瘤抑制网络)期刊:Nature主要技术:iTRAQ定量文章摘要: