昆明植物所在嗜盐古菌质粒研究中取得新进展
古菌是生活在极端自然环境(如高温、低温、强酸、强碱、高压、厌氧或高盐)的一类特殊微生物。嗜盐古菌是古菌域真古菌界中的一个重要类群,主要分布于各种高盐环境,在医药和化工等方面具有应用前景。嗜盐古菌质粒研究为更好地开发利用嗜盐古菌资源和揭示高盐环境基因水平转移奠定基础。 中国科学院昆明植物研究所研究员杨祝良指导的博士生陈绍兴等从29株嗜盐古菌中分离到一新型质粒,命名为pHRDV1。在对该质粒进行了基因组测序的基础上,开展了生物信息学预测分析和分子遗传学特征鉴定研究。研究结果表明,该质粒的基因组大小为13053 bp,共有19个开放阅读框,并组成了两个头对头转录方向的操纵子结构;生物学软件所预测出的双复制区中的一个具有复制起始活性;不可思议的是,在其基因组上具有三个类似于嗜盐古菌多形病毒特征性蛋白基因;依据该特征,该质粒可归为嗜盐古菌多形病毒II型,但该质粒又具有该型病毒不具备的复制蛋白基因;此外,在质粒基因组上,还具有......阅读全文
裸质粒载体在基因治疗药物中的应用
基因治疗药物研发概况 基因治疗是二十世纪九十年代发展起来的一种全新的疾病治疗模式,是通过载体将外源基因导入靶细胞,以纠正或改善致病基因所产生的缺陷,达到治疗疾病的目的。根据“Gene Therapy Clinical Trials Worldwide”的统计,至2017年11月,全球范围共
质粒作为基因工程的载体应具备那些条件
目前所用的载体有细菌的质粒(如大肠杆菌质粒)、噬菌体或病毒,更多的是经过人工改造的一些载体.用于分子克隆的载体都应具备下述条件: ① 在细胞内能自主复制,即具有复制原点,可以使所携带的外源DNA在受体细胞内忠实地复制; ② 有适宜的限制酶切位点.最好是对多种限制酶有单一切点,且酶切位点不在复制原点内
裸质粒载体在基因治疗药物中的应用
基因治疗药物研发概况 基因治疗是二十世纪九十年代发展起来的一种全新的疾病治疗模式,是通过载体将外源基因导入靶细胞,以纠正或改善致病基因所产生的缺陷,达到治疗疾病的目的。根据“Gene Therapy Clinical Trials Worldwide”的统计,至2017年11月,全球范围共
裸质粒载体在基因治疗药物中的应用
基因治疗是二十世纪九十年代发展起来的一种全新的疾病治疗模式,是通过载体将外源基因导入靶细胞,以纠正或改善致病基因所产生的缺陷,达到治疗疾病的目的。根据“Gene Therapy Clinical Trials Worldwide”的统计,至2017年11月,全球范围共开展了2597个临床试验,主
关于肠球菌的耐药性介绍
肠球菌由于其细胞壁坚厚,对许多抗生素表现为固有耐药。其耐药性包括固有耐药、获得性耐药2种。肠球菌对青霉素敏感性较差,对头孢菌素类耐药。肠球菌对青霉素耐药的主要机制为细菌产生一种特殊的青霉素结合蛋白(PBP5),后者与青霉素的亲和力减低,从而导致耐药。此种耐药以屎肠球菌多见。青霉素不能致肠球菌自溶
用古基因组探究现代人的演化之路
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518275.shtm人类基因组测序观察到现代人与黑猩猩的基因差异和“分家时间”,“人类基因组计划”揭开了现代人广泛的基因多样性,早期现代人和灭绝古人类基因组的发现为理解过去人类迁徙和演化提供新见解……近年
古基因组结束拉帕努伊人“生态自杀”争议
拉帕努伊岛(也被称为复活节岛)是世界上最孤独的有人居住的地方之一,其考古记录吸引了许多人的想象力,其中包括被称为“摩艾”的标志性巨石雕像。对拉帕努伊岛的广泛研究产生了两个突出的争论。首先,拉帕努伊人的历史被描述为一个资源过度开发的警告故事,最终导致了人口的大规模崩溃——“生态自杀”理论。其次,在与欧
古基因组揭示欧洲人或有3个祖先
在中东人将农业带到欧洲大陆之前,这里曾是狩猎采集者的天下。图片来源:Getty Images 本报讯 最新发布的来自欧洲的十几个早期人类定居者的基因组序列表明,这块大陆曾经是一个大熔炉,其中褐色眼睛的农民在这里遇到了蓝眼睛的狩猎采集者。 这项最新的研究显示,现今的欧洲人可以将其祖先追
古基因组结束拉帕努伊人“生态自杀”争议
拉帕努伊岛(也被称为复活节岛)是世界上最孤独的有人居住的地方之一,其考古记录吸引了许多人的想象力,其中包括被称为“摩艾”的标志性巨石雕像。对拉帕努伊岛的广泛研究产生了两个突出的争论。首先,拉帕努伊人的历史被描述为一个资源过度开发的警告故事,最终导致了人口的大规模崩溃——“生态自杀”理论。其次,在与欧
古麦今用-现代小麦找回丢失的遗传基因
记者18日从中国农业科学院深圳农业基因组研究所获悉,6月17日23时,《自然》刊登了该所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)研究员程时锋团队联合英国约翰·英纳斯中心等国内外多家优势单位完成的最新研究成果。该研究构建了目前最全面的小麦群体基因组变异图谱、表型组变异图谱,打通了小麦从基因组解
研究发现氨氧化古菌在硝态氮流失中发挥更大作用
我国现有红壤缓坡地(6~15°)2.1×107hm2,是我国发展粮食和亚热带经济作物及果、林、草的重要基地。湘北红壤丘岗区是我国南方红壤丘陵区农林符合生态系统的典型模块,以农田、果园、灌木丛、森林为主要土地利用类型。以往研究发现,高强度耕作,大量氮肥使用,加上每年5-8月,不均匀、高强度的降雨,
北大西洋深海古菌:从原核到真核的桥梁
科学家们普遍认为,20亿年前,单细胞结构简单的原核生物产生了结构更加复杂精细的真核生物。最终,这些真核生物不断发展,形成了今天丰富的生物种类,比如真菌,植物,还有我们这样的动物。然而,从原核到真核,这个转变的具体细节仍然无法得知。 如今,科学家们在《Nature》刊文,宣布在北大西洋海底发现了
南京土壤所氨氧化古菌功能多样性研究取得新进展
地球上的高等动物和植物通常存在一定的地理分异规律,如谚语中常说的“一方水土养一方人”,但长期以来由于技术手段的限制,土壤微生物的地理分异规律及其功能意义却不甚清楚。 最近,中国科学院南京土壤研究所贾仲君课题组与何园球团队合作发现,酸性土壤中(pH4.9)存在一种活性氨氧化古菌,与该古菌亲缘关
近地层臭氧浓度升高对稻田产甲烷古菌影响研究获进展
全球气候变化会影响土壤微生物所驱动的地球化学循环过程;而后者又会反过来进一步影响全球气候的变化。产甲烷古菌是稻田生态系统代表性微生物,负责稻田甲烷的生成。稻田产甲烷古菌对全球气候变化中的大气二氧化碳浓度升高、全球增温效应的响应已多有报道,但对全球气候变化中另一个重要组成部分,近地层臭氧浓度升高的
质粒转化
[ 基本原理 ] 将质粒 DNA 导入细菌的过程称为转化( Transformation )。此感受态细菌细胞在 CaCl 2 低渗溶液中膨胀为球状(感受态细菌的制备,见前)。质粒 DNA 与 CaCl 2 形成抗 DNase 羟基 - 磷酸钙复合物黏附于细菌表面,经 42℃ 短时间热冲
质粒提取
一、导论已经提出过许多方法用于从细菌中提纯质粒DNA,这些方法都含有以下3个步骤:细菌培养物的生长。细菌的收获和裂解质粒DNA的纯化。(一)细菌培养物的生长从琼脂平板上挑取一个单菌落,接种到培养物中(有含有行当抗生素的液体培养基中生长),然后从中纯化质粒,质粒的提纯几乎总是如此。现在使用的许多质粒载
质粒提取
一、导论已经提出过许多方法用于从细菌中提纯质粒DNA,这些方法都含有以下3个步骤:细菌培养物的生长。细菌的收获和裂解质粒DNA的纯化。(一)细菌培养物的生长从琼脂平板上挑取一个单菌落,接种到培养物中(有含有行当抗生素的液体培养基中生长),然后从中纯化质粒,质粒的提纯几乎总是如此。现在使用的许多质粒载
关于耐药细菌的常见种类介绍
由于抗菌药物的广泛使用,全球耐药情况非常严峻,应该说所有细菌都已经有耐药现象发现,对抗菌药物完全敏感的细菌几乎不存在了,但根据耐药的严重程度,可以称为超级耐药细菌的主要有: (1)耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)。 (2)耐万古霉素肠球菌(VRE)。 (3)耐万古霉素葡萄球菌(VRSA
质粒DNA提取时质粒为何会丢失
中稳定存在,经多次转接后有可能造成质粒丢失。因此不要频繁转接,每次接种时应接种单菌落。另外,检查筛选 用
BMC-Biology:含Cas酶的新型转座子
转座子是一种可移动的遗传元件,能够在基因组的不同位点之间跳跃,这种DNA片段广泛存在于自然界的各种生物中。近日,科学家们在细菌和古生菌中发现了一类新型的转座子,这种转座子不仅含有Cas内切酶的编码基因,还依赖这种酶整合到新的基因组区域。 细菌一直在与病毒或入侵核酸(质粒)进行斗争,为此它们演化
母亲基因影响孩子肠道菌群
最近,加州大学(UC)戴维斯分校的研究人员发现一个基因——该基因在一些母亲当中是不活跃的,可产生母乳糖影响其婴儿肠道菌群的发展。产生的这种糖,被称为“secretors”不能被婴儿消化,而是滋养出生后不久婴儿肠道中定植的特定细菌。延伸阅读:基因和饮食哪个对肠道菌群影响更大? 称为“non-se
细菌感染的分子生物学检测技术
(一)常用的分子生物学技术1.核酸杂交 常用的杂交技术有:斑点杂交、southern印迹、原位杂交、Northern印迹等。探针的种类有全染色体DNA探针、染色体克隆片段DNA探针、质粒DNA探针、rRNA基因探针、寡核苷酸探针等医`学教育网搜集整理。2.核酸扩增技术 核酸扩增技术是分子生物学中最具
暗物质粒子“袭击”人体-或将导致基因突变
据媒体报道,科学家通过计算发现每一分钟都有暗物质粒子击中人体,如果两个粒子在人体内发生湮灭,那么就有可能导致不利的基因突变发生。暗物质作为宇宙中最为神秘的领域之一一直是宇宙学家关注的重点,其最大的特点是无法被直接观测到,但科学家发现它们的存在是其产生了明显的引力效应,并体现在星系与星系
细菌耐药趋势与抗感染治疗的若干问题
近几年来,细菌耐药趋势日趋严峻,成为医学界倍受关注的问题。具有重要临床意义的耐药菌有青霉素耐药肺炎链球菌、甲氧西林耐药葡萄球菌、万古霉素耐药肠球菌、β内酰胺类抗生素耐药革兰氏阴性杆菌。上述耐药菌不仅呈逐年增多趋势,且常为多重耐药菌,致使该类菌所致感染的治疗成为临床上的难题,对感染患者的健康和生命直接
分子克隆实验载体DNA的选择
①质粒:质粒是细菌染色体外遗传因子,DNA呈环状,大小为1-200千碱基对(kb)。在细胞中以游离超螺旋状存在,很容易制备。质粒DNA可通过转化引入寄主菌。在细胞中有两种状态,一是“紧密型”;二是“松弛型”。此外还应具有分子量小,易转化,有一至多个选择标记的特点。质粒型载体一般只能携带10kb以下的
中国七年耐药监测回顾
中国7年耐药监测虽然采用的方法、监测的范围、目的和主持单位不尽相同,但均对中国感染性疾病常见的致病菌的分布和耐药趋势勾画出一幅具有中国特色的耐药图。本文对我国7年耐药监测中主要的致病菌的耐药机制及体外试验支持的用药方案作一回顾。一.葡萄球菌:葡萄球菌的主要耐药问题是耐苯唑西林(MRS),包括金黄色葡
研究揭示蕨类植物古多倍化事件和基因保留历史
藓类植物,作为陆地植物早期演化中的重要分支,在陆地植物的演化谱系中占有重要位置,但是学界对该类群本身演化历史的研究有限。此前,科学家研究对植物基因组发现,古多倍化事件广泛存在于种子植物和蕨类植物类群中,且此类事件多伴随植物类群的迅速扩张和对古气候剧烈变化的适应。然而,在过去四亿多年的演化历史中,
生物物理所揭示古菌中假尿嘧啶分布和合成的全局图谱
假尿嘧啶修饰是RNA中频率最高的修饰之一,存在于rRNA、tRNA、snRNA和mRNA等RNA中,能影响它们的结构和功能。假尿嘧啶是由属于六大家族的假尿嘧啶合成酶转化RNA上的尿嘧啶而来。其中属于TruB家族的Cbf5是个特殊的假尿嘧啶合成酶,它和其他三个蛋白质以及H/ACA RNA结合形成复
研究发现古菌和细菌的第四种互赢共生机制
地球深处,既没有阳光也没有氧气,却生存着这个星球上最古老的生命体——拥有奇特生活习性的古菌。 在这些单细胞微生物中,产甲烷古菌备受关注,因为它们能产生天然气的主要成分甲烷。 神秘古菌究竟如何产生甲烷?农业农村部成都沼气科学研究所(以下简称沼气所)研究员承磊和日本国立海洋研究开发机构等团队合作
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus arueus,MRSA) 金黄色葡萄球菌是一种常见病菌,但如果它发生变异而对抗生素甲氧西林产生耐药性,其引起的感染就难以治疗。因此,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌常被称为“超级细菌”。 MRSA是20