昆明植物所在嗜盐古菌质粒研究中取得新进展
古菌是生活在极端自然环境(如高温、低温、强酸、强碱、高压、厌氧或高盐)的一类特殊微生物。嗜盐古菌是古菌域真古菌界中的一个重要类群，主要分布于各种高盐环境，在医药和化工等方面具有应用前景。嗜盐古菌质粒研究为更好地开发利用嗜盐古菌资源和揭示高盐环境基因水平转移奠定基础。 中国科学院昆明植物研究所研究员杨祝良指导的博士生陈绍兴等从29株嗜盐古菌中分离到一新型质粒，命名为pHRDV1。在对该质粒进行了基因组测序的基础上，开展了生物信息学预测分析和分子遗传学特征鉴定研究。研究结果表明，该质粒的基因组大小为13053 bp，共有19个开放阅读框，并组成了两个头对头转录方向的操纵子结构;生物学软件所预测出的双复制区中的一个具有复制起始活性;不可思议的是，在其基因组上具有三个类似于嗜盐古菌多形病毒特征性蛋白基因;依据该特征，该质粒可归为嗜盐古菌多形病毒II型，但该质粒又具有该型病毒不具备的复制蛋白基因;此外，在质粒基因组上，还具有......阅读全文
科学家揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
中国科学院上海免疫与感染研究所研究员王程远团队、美国罗格斯大学教授理查德·艾布赖特团队及科罗拉多州立大学托马斯·圣唐杰洛团队合作，解析了古菌转录终止因子（FttA）依赖型转录终止复合物的三维结构，揭示了FttA介导古菌RNA聚合酶转录终止的分子机制，为进一步理解古菌转录终止及古菌转录-翻译偶联质量控
科学家揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
中国科学院上海免疫与感染研究所研究员王程远团队、美国罗格斯大学教授理查德·艾布赖特团队及科罗拉多州立大学托马斯·圣唐杰洛团队合作，解析了古菌转录终止因子（FttA）依赖型转录终止复合物的三维结构，揭示了FttA介导古菌RNA聚合酶转录终止的分子机制，为进一步理解古菌转录终止及古菌转录-翻译偶联质量控
新研究证实真菌对全球海洋碳循环贡献远超古菌
上海海洋大学教授费德里科·巴尔塔和博士后伊娃·布雷耶领衔的国际团队，首次精确量化了海洋真菌的碳储存能力，证实真菌对全球海洋碳循环的贡献远超古菌，颠覆了细菌和古菌是海洋碳循环主要推手的传统观点。5月23日，相关研究发表于《细胞》。 研究团队集成生物标志物、细胞壁钙荧光染色、酶联荧光原位杂交CAR
细菌耐药机理及其耐药细菌的检测与临床
全球面临主要耐药问题 ? MRS(Methicilln-Resistant Stapylococci) 耐甲氧西林葡萄球菌包括MRSA，MRSE等。 ? VIA(Vancomycin-Intermediate Staphyococcus Aurus) 万古霉素中介的金葡菌 ? VRE(Vanc
古脊椎所发表关于古基因组解读现代人的演化之路主题评论
“何以为人”——如何定义人类自身及理解人之为人的独特性，是复杂而艰巨的问题。遗传学的兴起和发展为我们从生物学角度理解现代人的由来和独特性提供了新视角——20多年前，第一例人类基因组的测序观察到现代人与黑猩猩的基因差异和分歧时间；“人类基因组计划”的完成揭开现代人广泛的基因多样性；早期现代人和灭绝古人
古脊椎所发表关于古基因组解读现代人的演化之路主题评论
“何以为人”——如何定义人类自身及理解人之为人的独特性，是复杂而艰巨的问题。遗传学的兴起和发展为我们从生物学角度理解现代人的由来和独特性提供了新视角——20多年前，第一例人类基因组的测序观察到现代人与黑猩猩的基因差异和分歧时间；“人类基因组计划”的完成揭开现代人广泛的基因多样性；早期现代人和灭绝
CHFR基因的接哦古特点和主要作用
该基因编码一种E3泛素蛋白连接酶，维持调控细胞周期进入有丝分裂的前相检查点，因此可能在细胞周期进展和肿瘤发生中起关键作用编码的蛋白质具有一个N末端叉头相关结构域、一个中央无名指结构域和一个富含半胱氨酸的C末端区域。已经描述了编码不同蛋白质亚型的选择性剪接转录变体。
古基因组研究引发伦理学激辩
来自克洛维斯文化的人类使用的工具是非常有特色的石制矛头和杆状的骨头器具。 约1.26万年前，一名男婴的遗骸按宗教仪式被葬在美国蒙大拿州。如今，这副遗骸揭秘了一支美洲最早人群，即克洛维斯文化的起源。 对这名男婴的基因组测序发表在最新一期《自然》杂志上。研究表明，如今跨越南北美洲的
原核生物的染色体类型
细菌和古细菌通常具有单个环状染色体，但染色体大小存在显著变异。大多数细菌染色体的大小从13万个碱基对到1400万个碱基对不等 。疏螺旋体属的螺旋体是个例外，仅含有单一线性染色体。序列结构与真核生物相比，原核染色体含有更少的基于序列的结构。细菌通常具有一个复制起点，而一些古菌含有多个复制起点 。原核生
关于原核生物的基本内容
细菌和古细菌通常具有单个环状染色体，但染色体大小存在显著变异。大多数细菌染色体的大小从13万个碱基对到 1400 万个碱基对不等 。疏螺旋体属的螺旋体是个例外，仅含有单一线性染色体。 序列结构 与真核生物相比，原核染色体含有更少的基于序列的结构。细菌通常具有一个复制起点，而一些古菌含有多个复
中国科学家首次揭示古菌中假尿嘧啶全局图谱
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518082.shtm
研究揭示盘古古菌的生态功能和共生生活方式
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495154.shtm
《常见细菌与古菌系统分类鉴定手册》出版发行
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512417.shtm近日，在国家科学技术学术著作出版基金资助下，由中国科学院微生物研究所研究员东秀珠、中国科学院微生物研究所正高级工程师周宇光、广东省科学院微生物研究所研究员朱红惠等编著的《常见细菌与古
Science子刊：在深海中，病毒对古生菌进行大屠杀
根据一项新的研究，在深海沉积物的微生物群体中，古生菌（archaea, 也译作古细菌）遭受的病毒感染频率通常是细菌的两倍，尽管后者更加丰富。考虑到深海生态系统的巨大规模，这一结果表明古生菌-病毒关系可能是全球生物地球化学循环的主要促进者。相关研究结果发表在2016年10月12日那期Science
质粒
Extrachromosomal Elements-Plasmids (Michael Blaber)What's plasmid? Find answer here. It provides background information on the features of plasmid
南海海洋所揭示质粒上毒素/抗毒素系统新功能
近日，中国科学院南海海洋研究所研究员王晓雪团队在《美国科学院院刊》（PNAS）上，在线发表了题为《接合型质粒编码的毒素/抗毒素系统PrpT/PrpA直接调控质粒拷贝数》的论文，系统阐述了质粒编码的毒素/抗毒素系统调控质粒复制功能的发现和作用机制。 质粒是存在于细菌染色体之外，具有独立复制能力
《自然》文章盘点关于基因“剪刀”的五大谜题
它是个非常了不起的工具。我想知道这个系统从头到尾如何工作。 Francisco Mojica并非第一个看见CRISPR的人，但他可能是第一个为它着迷的人。他还记得1992年当他首次瞥见可能引发一场生物技术革命的这个微生物免疫系统的那一天。他在评估地中海嗜盐菌的基因测序数据，注意到14个不寻常的
《自然》文章盘点关于基因“剪刀”的五大谜题
原核生物利用CRISPR-Cas抵抗在细胞上形成图中结构的病毒。 它是个非常了不起的工具。我想知道这个系统从头到尾如何工作。Francisco Mojica并非第一个看见CRISPR的人，但他可能是第一个为它着迷的人。他还记得1992年当他首次瞥见可能引发一场生物技术革命的这个微生物免疫系统的那一天
使目的基因稳定表达为什么要借助质粒
（1）转化是指目的基因进人受体细胞内，并在受体细胞内维持稳定和表达的过程，图中①～④表示该过程．（2）①启动子是一段特殊结构的DNA片段，位于基因的首端，它是RNA聚合酶识别和结合的部位，有了它才能驱动基因转录出mRNA，最终获得所需要的蛋白质．②图中看出，tms基因能够编码生长素，tmr基因能够编
古基因组洞察现代人的史前史
过去十年里，古DNA研究领域日益兴盛，并在古人类样本的全基因组数据测序方面取得前所未有的成功。大多数研究将目光聚焦于古代人类，包括与现今某个或多个人群有密切联系的现代人，亦有如尼安德特人等已灭绝古人类。 来自不同时间和地点的古代人类的基因组数据不断涌现，随之带来的是从时间和空间上大规模研究人类
古基因组告诉你玛雅人如何祭祀
德国马普学会的科学家通过分析64个古代个体的DNA，窥见了玛雅古城奇琴伊察埋葬仪式的更多细节，这些个体可能是在超过500年的时间跨度中被献祭的对象。研究表明地下储藏室中发现的许多个体彼此都有密切的亲缘关系，还展示了玛雅地区延续至今的基因传承。相关研究6月12日发表于《自然》。位于墨西哥尤卡坦州的古城
古基因组有助查明澳大利亚土著起源
澳大利亚土著居民的遗体或许将能重回家园。研究人员使用古老DNA测序技术鉴定了这些“暂居博物馆”的遗骸，以确定其起源。 近日发表在《科学进展》杂志的一篇论文中，研究人员表示，他们可以精确地将古澳大利亚土著遗骸的DNA与来自同一地理区域的现代居民的DNA进行比对。这可能使博物馆里成百上千的澳大利亚
普鲁兰酶的特性和应用
普鲁兰酶又称茁霉多糖酶，属解枝酶，分解α-1,6-葡萄糖苷键。嗜热古菌Thermococcus sp. HJ21产胞外高温普鲁兰酶，最适温度95 ℃，酶活力在100 ℃、2 h仍有50%以上活力。通过PCR技术克隆了此酶基因。温泉中厌氧芽胞杆菌属Anoxy bacillus sp. p28克隆到普鲁
外国学者研究发现土卫二有古菌或微生物
如果冰冷的土卫二和人们推测的相符，则某些微生物可以利用二氧化碳和氢气生长并产生甲烷。除此之外，研究人员认为土卫二岩核内发生的地化反应或能给这些微生物的生长提供充足氢气。相关论文2月28日刊登于《自然—通讯》。土卫二岩核内的反应或能为微生物生长提供氢气。图片来源：美国宇航局 土卫二是人们搜索潜在
上海药物所报道抗万古霉素耐药菌候选药物
近日，中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室院士庄文颖及博士曾昭清在吉林、河南和湖北等地的大蚕蛾科昆虫虫茧上，发现一种肉座菌目真菌——茧壳菌Cocoonihabitus sinensis。 茧壳菌具有肉质子实体但不形成子座，子囊壳或疏或密地排列在虫茧残体上；长柱形子囊顶端加厚，通过狭窄
上海药物所报道抗万古霉素耐药菌候选药物
2017年12月15日，中国科学院上海药物研究所黄蔚课题组与蓝乐夫课题组在ACS期刊《医药化学杂志》（Journal of Medicinal Chemistry）发表了题为“Extra sugar on vancomycin: new analogues for combating multi
细菌耐药性的产生机制及检测方法
一、细菌耐药性和产生机制1、细菌耐药性的概念：细菌的耐药性是指致病微生物对于抗菌药物作用的耐受性和对抗性。它是抗菌药物、细菌本身及环境共同作用的结果。它可分为天然耐药和获得性耐药，前者通过染色体DNA突变而致，后者大多是由质粒、噬菌体及其他遗传物质携带外来DNA片段导致的耐药性的产生。 2、细菌耐药
肠球菌的耐药特点及药敏试验方法
肠球菌是临床较常见的一类。据近些年的报道，肠球菌已成为医院感染中重要的病原菌，危害性越来越大。肠球菌往往对抗生素耐药或高度耐药，能否准确检出耐药菌株对抗感染治疗的成败十分重要。针对肠球菌的药敏试验方法，国外进行了相当多的研究，确定了一整套科学的方案。以下将有关问题作简要介绍。 一、临床常见的
酵母菌基因克隆实验
实验材料 酵母菌实验步骤 1. 用含LEU 2作为选择标志的酵母菌DNA文库转化lea 2 cdc 101-1酵母菌株，在23℃培养，依据插入片段的大小，筛选2 000~20 000个Leu+转化体。 2. 影印平板转化体，将其转印到预热的选择性平板，并于37℃培养筛选互补温感突变的表型。过
高耐庆大霉素肠球菌耐药性接合转移试验的方法探讨
肠球菌是医院感染的重要病原菌 [1] ，对多种抗菌药产生耐药性，而且耐药菌株不断增加，接合转移是导致肠球菌庆大霉素等耐药基因转移、耐药性播散的重要原因，深入研究接合转移试验有助于了解肠球菌耐药性的产生机理。我们研究了不同培养基和不同转移方法对肠球菌质粒转移试验结果的影响，并对接