营养所揭示SRSF10调控mRNA选择性剪接的新机制

1月18日,Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所研究员冯英组的最新研究进展:Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reveals position-dependent splicing modulation,该研究基于高通量转录组测序(RNA-seq)技术结合生物信息分析,首次揭示了选择性剪接蛋白SRSF10在细胞内调节的靶底物以及其调控mRNA选择性剪接的机制。 近年来,随着二代测序技术的飞速发展,测序已成为研究基因组和转录组的重要手段之一。高通量转录组测序技术(RNA-seq)可用于检测基因表达差异、融合基因、未知或稀有转录本、以及mRNA选择性剪接等研究领域。 SRSF10是经典的SR蛋白家族成员之一,已有研究表明,SRSF10......阅读全文

选择性蛋白尿

  选择性蛋白尿是临床医学检验技士需要了解的知识,现医学|教育网整理相关知识如下:   选择性蛋白尿:由于肾小球滤过膜损伤后,使血浆蛋白滤过,以清蛋白为主,并有少量小分子量蛋白,尿中无大分子量的蛋白,称选择性蛋白尿,多见于小儿肾病综合症。

​区域选择性的概念

区域选择性;regioselectivity:在有机反应中,同一反应物可以给出两种或两种以上的结构异构的产物,其中一种产物的量远优于其他产物,是这种反应的特性称为区域选择性。

何为电极选择性系数

电极选择性系数是指产生相同响应信号时选自行离子的浓度与干扰离子浓度的比值。从理论上讲离子选择性电极只对特定的一种离子产生电位响应,其他共存离子不产生干扰。但在实际应用中人们发现,共存离子对离子选择性电极的测定,或多或少都会产生干扰现象。例如用玻璃电极测定溶液pH值时,在pH>10以后,电极对Na+

化学选择性的概念

化学选择性;chemoselectivity:有机化合物分子中含有2个或多个相同或不相同的官能团时,其中之一的官能团可与某试剂发生反应,而其他的不反应。这种官能团之间的反应性能的差异,称为化学选择性。例如巴豆醛分子中的碳碳双键与醛基都可被还原剂还原,但用硼氢化钠(NaBH4)作还原剂时,只还原醛基而

离子选择性电极定义

  离子选择性电极是一类利用膜电势测定溶液中离子的活度或浓度的电化学传感器,当它和含待测离子的溶液接触时,在它的敏感膜和溶液的相界面上产生与该离子活度直接有关的膜电势。离子选择性电极也称膜电极,这类电极有一层特殊的电极膜,电极膜对特定的离子具有选择性响应,电极膜的电位与待测离子含量之间的关系符合能斯

立体选择性的定义

中文名称立体选择性英文名称stereoselectivity定  义在化学反应中,一种立体异构体比另一种立体异构体优先发生作用的化学特性。一些酶具有立体选择性,如L-氨基酸氧化酶仅催化L-氨基酸而不作用于D-氨基酸。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)

立体选择性的概念

立体选择性;stereoselectivity:在有机反应中,同一反应物可以生成不等量的两个立体异构体,其中一个立体异构体的量远优于另一立体异构体时,则称此反应具有立体选择性。

离子选择性电极简介

离子选择性电极(ISEs)是以敏感膜为基础的电化学传感器,这层膜是使电极对特定离子有选择性响应的元件。根据膜的材料不同可将离子选择性电极分为4种:• 玻璃膜(如Na+或pH)• 固态膜(如Pb2+)• 聚合体膜(如K+)• 气体渗透膜(如CO2)电极置于溶液内时膜上会形成一电势差。当样品内待测离子的

离子选择性电极简史

  1906年由R.克里默最早研究的,随后由德国的F.哈伯等人制成的测量pH值的玻璃电极是第一种离子选择性电极。1934年B.伦吉尔等观察到含氧化铝或三氧化二硼的玻璃电极对钠也有响应。50年代末,G.艾森曼等制成了对氢离子以外的其他阳离子有能斯脱响应的玻璃电极。1936年H.J.C.坦德罗观察了萤石

聚合酶链反应剪接的原理和应用

中文名称聚合酶链反应剪接英文名称PCR splicing定  义利用聚合酶链反应进行基因剪接以删除DNA中一段特定序列的方法。系设计两组引物,先分别扩增拟删除序列上下游两侧的序列,再用上游序列5′端引物和下游序列3′端引物用PCR反应进行连接。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二

西湖大学在次要剪接体领域再获突破

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519140.shtm3月15日,《科学》以“完全组装的次要剪接体与U12型内含子结合的结构基础”为题,在线发表了剪接体结构与机理研究的一项重大突破,这一研究成果来自西湖大学特聘研究员万蕊雪团队和结构生物学

遗传发育所在大豆可变剪接研究中取得进展

  作为一种重要的基因转录后调控机制,可变剪接在真核生物中普遍发生,在基因表达和功能多样性调控中起着重要的作用。不同物种、同一物种的不同组织以及不同基因家族的可变剪接在形式和比例上都存在差异,然而,决定这些差异的因素还尚不为人知。   中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜课题组通过对来自大豆不同

哺乳动物细胞体外剪接分析实验

实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。实验材料 前体 mRNA 底物试剂、试剂盒 ATP CP 混合物HEPES-KOH聚乙烯醇

次要剪接体:不次要的生命“剪辑师”

   如果把微观生命活动比作一部电影,那么这部精密而复杂的“影片”就是由无数蛋白质各司其职上演的,它们影响着生命体的健康。而“指挥”这些蛋白质、让它们执行各种功能的,就是基因。而在基因塑造生命的过程中,有个隐秘而伟大的遗传“剪辑师”——次要剪接体。  1.每一次剪接,都关乎细胞“命运”  剪接体的故

西湖大学在次要剪接体领域再获突破

  3月15日,《科学》以“完全组装的次要剪接体与U12型内含子结合的结构基础”为题,在线发表了剪接体结构与机理研究的一项重大突破,这一研究成果来自西湖大学特聘研究员万蕊雪团队和结构生物学讲席教授施一公团队,第一作者是西湖大学副研究员白蕊。  完全组装的次要剪接体的三维结构。课题组供图  如果说,每

酵母前体mRNA剪接提取物实验(一)

实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。实验材料 tRNAUTPRNA 聚合酶试剂、试剂盒 YPTris-HCl ETDASD

次要剪接体:不次要的生命“剪辑师”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/496757.shtm 如果把微观生命活动比作一部电影,那么这部精密而复杂的“影片”就是由无数蛋白质各司其职上演的,它们影响着生命体的健康。而“指挥”这些蛋白质、让它们执行各种功能的,就是基因。而在基因

酵母前体mRNA剪接提取物实验(二)

(12) RNA 洗脱缓冲液:20 mmol/L Tris-HCl ( pH 7.6),0.5 mol/L NaCl,10 mmol/L EDTA,2% ( V/V ) 苯酚(Tris EDTA 或 NaAc-EDTA 平衡),4°C 保存。(13) 7.5 moI/L 乙酸铵(NH4Ac):用 0

tRAS(转录组可变剪接调控深度分析)

本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程,对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化;根据对照和实验组,系统分析您样品中所蕴藏的可变剪接调控规律,中肯分析所揭示出的重要科学规律;让您快速“发现”所关注的生物学,医学和农业问题的答案。 我们

酵母前体mRNA剪接提取物实验(一)

实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。 实验材料 tRNAUTPRNA 聚合酶 试剂、试剂盒 YPT

肺癌细胞中异常剪接的关键调控因子

  Pre-mRNA可变剪接是一种增加基因组多样性和调控基因表达的重要机制。在肿瘤的发生发展过程中,许多剪接事件发生异常变化。然而,我们并不清楚这些异常剪接事件是如何产生的,异常剪接产物对肿瘤细胞的生物学功能产生什么影响。肺癌是最常见的恶性肿瘤之一,在全球范围是癌症相关致死的头号杀手。由于缺乏有效的

哺乳动物细胞体外剪接分析实验

            实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。

内含肽的应用剪接调控以作为药物“开关”

含肽作为药物靶标的研究于内含肽这种可调控的作用机制,Bonnanl51为,通过改变剪接结构域上、下游的序列,自主设蛋白质内含肽,可以调控蛋白质的剪接。因为包含内含肽的前体蛋白无活性的,所以那些能阻断剪接的化学物质将具有重要的药用价值。由于目前在动物和人体正常新陈代谢中没有发现内含肽的报道,作为药靶标

哺乳动物细胞体外剪接分析实验

剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S10

选择性脑冷却的定义

中文名称选择性脑冷却英文名称selective brain cooling定  义恒温动物适应高温环境,大脑局部或整个温度降低,使之低于动脉血的温度。应用学科生态学(一级学科),生理生态学(二级学科)

离子选择性电极如何使用

将离子选择性电极(指示电极)和参比电极插入试液可以组成测定各种离子活度的电池.具体有1.标准曲线法2.标准加入法

离子选择性电极结构测量

  离子选择性电极(见彩图)的基本结构见图。电极的敏感膜固定在电极管的顶端,管内装有内充溶液,其中插入内参比电极(通常为Ag│AgCl电极),内充溶液的作用在于保持膜内表面和内参比电极电势的稳定。  离子选择性电极是一个半电池(气敏电极例外),它的电势不能单独测量,而必须和适时的外参比电极组成完整的

嗜盐菌选择性琼脂

成分  蛋白胨            20g  氯化钠            40g  琼脂             17g  0.01%结晶紫溶液       5mL  蒸馏水            1000mL  pH8.7制法  除结晶紫和琼脂外,其他按上述成分配好,校正pH。加入琼脂,加热溶

选择性脑冷却的定义

中文名称选择性脑冷却英文名称selective brain cooling定  义恒温动物适应高温环境,大脑局部或整个温度降低,使之低于动脉血的温度。应用学科生态学(一级学科),生理生态学(二级学科)

离子选择性电极的应用

  离子选择性电极是一种简单、迅速、能用于有色和混浊溶液的非破坏性分析工具,它不要求复杂的仪器,可以分辨不同离子的存在形式,能测量少到几微升的样品,所以十分适用于野外分析和现场自动连续监测。与其他分析方法相比,它在阴离子分析方面特别具有竞争能力。电极对活度产生响应这一点也有特殊意义,使它不但可用作络