新剪切模式揭示两千多种新蛋白

十多年前,人们就已经完成了对人类和小鼠基因组的测序,现在每个人都可以通过数据库使用这些信息。然而,人类和小鼠的蛋白质列表还未完成,最近研究人员还在一种新剪切模式的基础上,发现了两千多种新的哺乳动物蛋白。数据库中列有编码这些蛋白的核苷酸序列,只不过人们原先认为它们没有得到翻译。 “我们在研究蛋白时发现了一种奇怪的剪切模式,”文章的资深作者,澳大利亚国立大学的Aude Fahrer说。“于是我们就想看看还有多少类似的蛋白。” 他在研究参与染色体装配的Ncaph2蛋白时发现,其编码基因的一种剪切方式,使一个外显子缺少了17bp。这种剪切没有删除完整的密码子,应该会使阅读框发生位移,最终无法翻译成为蛋白。事实上数据库中的确列出了这样的选择性剪切,并将其注释为无法翻译。 然而Fahrer的研究团队发现,另有一个起始密码子和选择性剪切阅读框,令选择性剪切的蛋白得以翻译。研究人员指出,此前只报道过三例类似的蛋白异构体......阅读全文

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(六)

( 18 ) 当移动鼠标到两个链接的蛋白点之一上时,与这个点链接的每个点的十字标记的颜色都变成橙色 (在另一块胶上有一个匹配的蛋白点)。当鼠标点到这些点中的一个时,只有包括在同一个网络中的点显示橙色( 图 23-12)。你可以通过声明一个新的关系,确认这些数据,这样就可以扩大点的网络。( 1

HBFP数据库:人类体液蛋白质组研究又添一利器

  人体体液是疾病相关蛋白的丰富来源,这些蛋白质从全身的病理组织中分泌或泄漏,许多可通过非侵入性方法获得。近些年来,研究者通过检查体液蛋白质组发现大量生物标志物,通过创新的高通量技术,现代蛋白质组学研究已经成功地在各种体液(如血浆、血清、唾液和尿液)中鉴定出大量蛋白质,成果显著。吉林大学教育部符号计

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(三)

2. 质谱鉴定命令单个蛋白质点可能被命名为几个名称或代码,如检测点数、匹配数、采集数等。因此,用一个质谱图去关联一个适当的蛋白点没有多大意义。为了避免错误, PROTICdb 的工作流程之一是生成一个携带单一的,送去做质谱鉴定的蛋白点质谱仪 ID 的文件 ( 相当于一个命令)。质谱仪就可以将

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(五)

( 10 ) 鼠标左键点击同一个点(342 号)(见注释 20) ,激活蛋白点信息框。蛋白点的数据按以下 4 个条目排列:概要、关系、鉴定和量化。每个条目对应的信息可被不断充实。其中鉴定包括质谱的详细数据。( 11 ) 开发鉴定、质谱详细数据和下一个子目录。从质谱数据分析得到了每个匹配结果,首先得到

2014年富兰克林奖揭晓-蛋白质数据库主任Berman博士获奖

          2014年3月10日,Bioinformatics.org主席Jeff Bizzaro宣布,来自罗格斯大学,新泽西州州立大学Helen M. Berman博士获得2014年“本杰明•富兰克林奖”,以表彰其在生命科学领域数据共享所做的努力。   自2002年以来,本杰明•富兰

Ruedi小组用QTRAP开发出全球首个定量蛋白质组数据库

苏黎世理工学院借助AB SCIEX的QTRAP技术研发成功全球首个蛋白质组学MRM Atlas 基于质谱的在线数据库加速蛋白质分析   福斯特市,加利福尼亚—2010年10月4日,生命科学分析技术的全球领导者AB SCIEX公司,今天宣布瑞士联邦理工学院(苏黎世理工学院,ETH)与西雅

蛋白合成交流之如何从数据库找合适的化合物?

体系相关A:http://biocomp.chem.uw.edu.pl/CABSdock/这个网站的结果怎么比较啊?答:我还没用过呢,只是在网上搜索到的。你那计算完了,有什么结果啊?A:答:没有打分之类的东西?A:只给了结果,但没看到这样排序的依据。答:应该是最上面的是最合适的,那你下载下来就可以用

刹车皮抗剪切拉力试验机

汽车刹车片检测是重要的一种装备,需要用到专业的测试仪器,电子拉力试验机应用是十分广泛,汽车刹车片专用抗剪切力试验机是电子拉力试验机的其中一种仪器。 什么是剪切力强度? 剪切强度试验用于测定材料的剪切强度。它测量的是材料断裂前可以承受的zui大剪切应力。剪切的常用单位是基于剪切边缘面积的兆帕 (p

管线式高剪切分散乳化原理

  管线式高剪切分散乳化原理 :管线式高剪切分散乳化就是高效、快速、均匀地将一个相或多个相(液体、固体、气体)进入到另一互不相溶的连续相(通常液体)的过程。而在通常情 况下各个相是互不相溶的。当外部能量输入时,两种物料重组成为均一相。由于转子高速旋转所产生的高切线速度和高频机械效应带来的强劲动能,使

金属剪切触屏拉力测试仪

对于金属材料,大家应该不陌生,到处可检测这金属材料,当然金属材料种类也有很多种,可分为这些:金属材料通常分为黑色金属、有色金属和特种金属材料。金属测试是很有必要的检测:金属材料的延伸率和断面收缩率愈大,表示该材料的塑性愈好,即材料能承受较大的塑性变形而不破坏。一般把延伸率大于百分之五的金属材料称为塑

电脑剪切力试验机介绍

剪切是在一对相距很近、大小相同、指向相反的产品横向外力(即平行于作用面的力)作用下,材料的横截面沿该外力作用方向发生的相对错动变形现象。能够使材料产生剪切变形的力称为剪切力。发生剪切变形的截面称为剪切面。判断是否“剪切”的关键是材料的横截面是否发生相对错动。因此,菜刀切菜不是剪切现象(因蔬菜的横截面

管线式高剪切分散乳化原理

  管线式高剪切分散乳化原理 :管线式高剪切分散乳化就是高效、快速、均匀地将一个相或多个相(液体、固体、气体)进入到另一互不相溶的连续相(通常液体)的过程。而在通常情 况下各个相是互不相溶的。当外部能量输入时,两种物料重组成为均一相。由于转子高速旋转所产生的高切线速度和高频机械效应带来的强劲动能,使

高剪切乳化机的选型要点

  1、明确使用设备所需达到的效果和目的  2、详细了解并掌握研究物料的性质(包括物理、化学性质)  3、根据物料对设备的搅拌机进行选型  4、再次确定设备的操作参数及结构设计  5、综合考虑设备的成本

高剪切均质机未来的发展趋势

主要由柱塞泵以及与其组合的泵体和均质阀组成。柱塞泵的作用是将一定粘度的液态物料吸入泵体,并对物料加压。调压装置是使物料在特定的压力下通过均质阀。"均质"是指物料在均质阀中发生的细化和均匀混和的加工过程。    具体说来,柱塞泵以0.25-0.5米/秒的低速将原始物料吸入,通过与均质阀连接的调压装置对

高剪切乳化机的维护保养

  高剪切乳化技术具有的混合、粉碎、分散、乳化等功能,对于SBS、SBR等高分子弹性材料有特别显著的粉碎效果,能有效解决各类物料的粉碎、乳化难题,取代了传统的胶体磨设备。与传统的生产工艺相比,具有能耗低、生产成本低、产品质量高、超细化四大优势。适用于常压、真空、正压工况下工作。它具有运转稳定、噪音小

管线式高剪切分散乳化原理

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冲击剪切试验机都有哪些特点?

QJLC-8冲击剪切试验机主要测试材料的抗冲击能力,即通过一定质量的锤头在一定的高度自由下落对试样进行冲击,通过高速率同步采集锤头对试样冲击接触后的数据,分析试样的抗冲击能力及试样的损坏和断裂状态。冲击剪切试验机产品特点:1、高度可以通过软件自由设置。2、锤头高度调节通过高精密滚珠丝杠进行传动,精度

高剪切乳化机工作过程

  1、在高速旋转的转子产生的离心力作用下,图中的物料从工作头的上进料区域同时从轴向吸入工作腔。  2、强劲的离心力将物料从径向甩入定、转子之间狭窄精密的间隙中。同时受到离心挤压、撞击等作用力,使物料初步分散乳化。  3、在高速旋转的转子外端产生至少15m/s以上的线速度,最高可至40m/s,并形成

高剪切乳化机的维护保养

  高剪切乳化技术具有的混合、粉碎、分散、乳化等功能,对于SBS、SBR等高分子弹性材料有特别显著的粉碎效果,能有效解决各类物料的粉碎、乳化难题,取代了传统的胶体磨设备。与传统的生产工艺相比,具有能耗低、生产成本低、产品质量高、超细化四大优势。适用于常压、真空、正压工况下工作。它具有运转稳定、噪音小

浙大Nature子刊解析RNA剪切调控

  近日来自浙江大学生命科学学院的研究人员在新研究中揭示了一个与Dscam互斥剪切有关RNA结构性基因座控制区域(locus control region),相关论文“An RNA architectural locus control region involved in Dscam mu

管线式高剪切分散乳化原理

  管线式高剪切分散乳化原理 :管线式高剪切分散乳化就是高效、快速、均匀地将一个相或多个相(液体、固体、气体)进入到另一互不相溶的连续相(通常液体)的过程。而在通常情 况下各个相是互不相溶的。当外部能量输入时,两种物料重组成为均一相。由于转子高速旋转所产生的高切线速度和高频机械效应带来的强劲动能,使

剪切模量和损失模量的区别

剪切模量和损失模量的区别?剪切模量是指材料在剪切力作用下,剪切应力与应变的比值,反应材料抵抗切应变的能力。储存模量又称为弹性模量,是指材料在发生形变时,由于弹性(可逆)形变而储存能量的大小,反映材料弹性大小;这两个定义咋一看,感觉是差不多,其实不是,这里面还要考虑到一个聚合物类物质的损耗模量,高分子

剪切诱导血小板聚集及其机理研究

导言       在动脉血栓性疾病的病理过程中,血小板活化是重要的始动因素。有许多物质,如凝血酶、肾上腺素等可导致血小板的活化和聚集。近年来研究发现,血流中单纯的高剪切应力也可以诱导血小板聚集。这不但对于存在高剪切应力的血管,如小动脉,动脉痉挛和动脉硬化造成的局部狭窄区的血栓形成有特别重要的意义

剪切模量和损失模量的区别

剪切模量和损失模量的区别?剪切模量是指材料在剪切力作用下,剪切应力与应变的比值,反应材料抵抗切应变的能力。储存模量又称为弹性模量,是指材料在发生形变时,由于弹性(可逆)形变而储存能量的大小,反映材料弹性大小;这两个定义咋一看,感觉是差不多,其实不是,这里面还要考虑到一个聚合物类物质的损耗模量,高分子

动态剪切流变仪操作注意事项

动态剪切流变仪操作注意事项1、实验室或现场测试工作结束后,,必须清洗设备,避免设备污损。由此引起的设备损坏将导致设备保修条款失效。2、测试过程中,水管连接必须可靠,避免漏水。3、严禁粗暴作业,设备安装调试时,必须严格按照操作规范和正确步骤进行。4、发现无法解决的故障应立即通知厂家,由专门技术人员指导

挤出机高剪切挤出技术要点

  高剪切挤出机挤出最常见的问题不是排气孔冒料,而是由给料段与压缩段剪切热过高,导致物料在排气孔出现挂料“粘壁”症状。开机一段时间,型坯出现黄线,难以正常生产。  因此应尽降低该两段设定温度,减少外供热量或调整配方,适量增加润滑剂或减少加工助剂。如果效果不显著或配方润滑剂与加工助剂的变化导致型材质量

高剪切乳化机的工作原理

   高剪切乳化机是通过转子高速平稳的旋转,构成高频、激烈的圆周切线速度、角向速度等归纳动能效能;    在定子的效果下,定、转子合理狭隘的空隙中构成激烈、往复的液力剪切、冲突、离心揉捏、液流磕碰等归纳效应,物料在容器中循环往复以上作业进程,结尾取得商品。    高剪切乳化机作业进程:   

核酸数据库的概念

中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定  义DNA、RNA序列的资料库,主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性,如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级

GenBank数据库概述(三)

结构: 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划,另外也可以访问分子模型数据库(MMDB)和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB:分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库,结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook

GenBank数据库概述(四)

NCBI站点地图---其他基因组数据介绍:1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 :把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起,包括序列,图谱,和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序:小鼠基因组计划的测序进展,HTG序列contigs(可以用大小和染色体号来浏览)由