浙大Nature子刊解析RNA剪切调控
近日来自浙江大学生命科学学院的研究人员在新研究中揭示了一个与Dscam互斥剪切有关RNA结构性基因座控制区域(locus control region),相关论文“An RNA architectural locus control region involved in Dscam mutually exclusive splicing”发表在12月4日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 这篇文章的通讯作者是浙江大学生命科学院生物技术系金勇丰(Yongfeng Jin)教授,其主要研究方向为RNA加工编辑研究,RNA作用的新功能和机制以及I型糖尿病口服疫苗研究。在NSMB,RNA,MBE等国内外著名学术期刊发表学术论文50余篇。 可变剪接是产生蛋白质和功能的多样性的重要途径,对细胞分化和发育以及疾病发生等至关重要。人类高达95%以上的基因是可变剪接的。这种可变剪接产生......阅读全文
浙大Nature子刊解析RNA剪切调控
近日来自浙江大学生命科学学院的研究人员在新研究中揭示了一个与Dscam互斥剪切有关RNA结构性基因座控制区域(locus control region),相关论文“An RNA architectural locus control region involved in Dscam mu
Nature:通过分析外显子发现与糖尿病相关的罕见DNA突变
近日,Nature上发表了一篇有关于2型糖尿病的大规模调查研究。该研究是目前为止最大规模的外显子测序。最终,研究人员确定了四个影响糖尿病风险的罕见变异基因。这些数据表明,未来可能还会发现数百个基因。 本次研究团队——牛津大学糖尿病医学教授、麻省总医院糖尿病科主任、哈佛医学院医学教授、及罗德研究
日本研究人员提出预测糖尿病新方法
日本一个研究小组日前发表论文说,在血糖测试之外加做糖化血红蛋白(HbA1c)测试,综合两项测试结果能比单独进行其中一项测试更准确地预测糖尿病。 来自日本筑波大学等机构的研究人员在新一期英国《柳叶刀》杂志网络版上刊登论文说,他们对6241人进行了为期5年的跟踪研究。研究对象包括46
德国研究人员发现:空气污染可能诱发糖尿病?
德国研究人员发现,城市交通引起的空气污染可能令儿童产生胰岛素抵抗的风险增加,致使成年后容易罹患糖尿病。 德国环境卫生研究中心的这项研究涉及397名10岁儿童。研究人员采集他们的血样,检测血糖和胰岛素水平,同时收集有关他们居住地空气污染程度的数据。 综合考虑研究对象的
研究人员发现减少糖尿病认知损伤新机制
记者从西北农林科技大学获悉,该校食品学院刘学波教授团队联合国内外多个专家团队,近日在国际著名期刊《自然·通讯》上在线发表其最新研究成果,首次揭示了间歇性禁食模式在改善2型糖尿病及相关脑认知损伤作用中的新机制。 刘学波教授团队基于脑—肠轴理论体系,立足“间歇性禁食作为一种膳食调节模式,对改善慢性
外显子应用机理
应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接测序技术检测68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外显子。
什么是外显子?
断裂基因中的编码序列。外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分。它在剪接(Splicing)后会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。
研究人员称每天喝酸奶可降低患糖尿病风险
据台湾“联合新闻网”报道,美国研究人员表示,每天喝两汤匙、大约28克的酸奶,就可以减少两成罹患第二型糖尿病的机会。 哈佛大学公共卫生学院资深研究员组织实施三个长期研究。这些研究一共涵盖了20万名男女,时间达30年。这些人一开始都没有糖尿病。30年后,逾1.5万人得了糖尿病。 研究团队进一
美国研究人员:芒果或可预防肥胖症和糖尿病
研究人员发现,吃芒果或可防止高脂肪饮食造成肠道有益细菌损失,进而预防II型糖尿病。 美国俄克拉荷马州立大学科学家选取60只小鼠做实验,将它们分为4组,给其中一些小鼠的饮食中添加芒果。12周的实验结束后,研究人员发现,饮食中添加芒果的小鼠所损失的有益肠道细菌最少。进食高脂肪饮食通常会造成这些细菌
外显子插入的定义
中文名称外显子插入英文名称exon insertion定 义一个或者多个外显子从一个基因参入到另一个基因中去的现象。其结果是使剪接更有多样性,造成可读框移动,出现翻译终止密码子而使蛋白质合成中止或产生新的蛋白质。是进化中出现新事物的一个源泉。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控
外显子混编的功能
即新的基因是由原来的基因打断后的断片混编而成的,或者是由编码蛋白质结构域的基因片段混编而成。这种基因片段可能就是外显子,因此称为外显子混编。
外显子捕获与扩增
实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3 COS-7 细胞 载体 pBluescriptⅡ 大肠杆菌 DH5α
外显子的基因反应
剪接方式并不是唯一的(参看替代剪接),所以外显子只能在成体mRNA中被看出。即使是使用生物信息学方法,要精确预测外显子的位置也是非常困难的,外显子的识别及其拼接都是难题。 真核生物的基因,其线性表达被内含子阻断,这就是所谓的断裂基因(英语splitgene),该现象的发现者RichardJ.Robe
外显子跳读的概念
中文名称外显子跳读英文名称exon skipping定 义跳过一个或多个外显子剪接为成熟的mRNA,是mRNA剪接多样性中的一种主要方式。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
外显子重复的定义
中文名称外显子重复英文名称exon duplication定 义(1)一个基因内部产生一个或者多个外显子的复制拷贝。(2)两分子同种前体RNA进行反式剪接时,成熟RNA分子上出现重复的外显子序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
什么叫跨外显子
这是针对逆转录pcr而言,所谓的跨外显子就是一个引物(比如上游引物)、出现在两个外显子交界,那么做RT-PCR时,dna 由于2个外显子被内含子隔开,引物就不会起作用了
研究人员或发现I型糖尿病最早生物标记物
一项最新研究表明,美国科学家或许发现了I型糖尿病最早的生物标志物。这一发现将可以帮助延缓该疾病的发病时间。 I型糖尿病,多发生在儿童和青少年,是一种由于免疫系统破坏胰腺中β细胞,造成胰岛素绝对不足的自身免疫性疾病。而且I型糖尿病发病隐匿,待确诊时,该疾病已潜伏发作一段时间了。如何早期发现高风险
我国研究人员取得突破:1型糖尿病进程有望被逆转
复旦大学附属华山医院内分泌科王庆华教授科研团队在1型糖尿病研究上获关键性突破。研究人员发现,胰岛β细胞分泌的γ-氨基丁酸可预防和逆转实验鼠1型糖尿病。该项科研成果近日发表在国际权威学术期刊美国科学院院刊(PNAS)上。 γ-氨基丁酸是大脑内一种重要的神经递质,其在胰腺
日研究人员用转基因猪探究糖尿病及并发症
日本研究人员日前利用转基因技术在猪身上再现了糖尿病及视网膜病和肾衰竭等并发症。在大型哺乳动物身上再现这些疾病,将有助于研究引起并发症的机制及相应的治疗方法。 据《日本经济新闻》5月29日报道,人体内可降低血糖值的胰岛素分泌不足会导致糖尿病。高血糖使血管和神经受损从而产生并发症,严重时会导致失明
研究人员利用人诱导性多能干细胞抗击糖尿病
糖尿病正在逐渐成为现代最大的健康挑战之一。根据世界卫生组织(WHO)的统计,每10人中就有一人患有糖尿病,而且根据最新的公开数据,这种疾病病是2016年160万人死亡的直接原因。自那以后,世界卫生组织已将糖尿病与癌症、呼吸系统疾病和心血管疾病一起指定为全球卫生当局要处理的四大重点非传染性疾病。
丹麦研究人员发现治疗1型糖尿病胰岛素的方法
丹麦哥本哈根大学发布消息称,其研究人员发现了胰岛素细胞是如何形成的。图片来源于网络 这一发现可能实现重新编程干细胞来产生胰岛素,新方法有助于以更低的成本、更有效地从人类干细胞中制造产生胰岛素的β细胞。 研究项目成功识别了指示小鼠祖细胞变成管道和稍后形成生产胰岛素β细胞的信号。研究人员可以将
丹麦研究人员发现治疗1型糖尿病胰岛素的方法
丹麦哥本哈根大学发布消息称,其研究人员发现了胰岛素细胞是如何形成的,这一发现可能实现重新编程干细胞来产生胰岛素。新方法有助于以更低的成本、更有效地从人类干细胞中制造产生胰岛素的β细胞。 研究项目成功识别了指示小鼠祖细胞变成管道和稍后形成生产胰岛素β细胞的信号。研究人员可以将这类技术转化到人类干
外显子的操作步骤介绍
⑴基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕捉序列”下游的克隆位点上。 ⑵将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviralpackagingcellline)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成为反转
外显子捕获的操作步骤
(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。(2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成
外显子捕获与扩增2
阶段 3:mRNA 的提取材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。DEPC 处理水乙醇NaCl(5mol/L)酚酚:氯仿无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)SDS(5%m/V)TMK 缓冲液10 mmol/LTris-HCl(pH7.5)10 mmol/LKCl1 mmol/LMgCl2Triton X
外显子捕获的操作步骤
(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。(2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成
外显子捕获与扩增(二)
材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)酶及缓冲液胰酶-EDTA 溶液核酸与寡核苷酸DNA用于转染的质粒 DNA 制备见本方案阶段 1, 步骤 10~12。用作对照的质粒载体(步骤 3)培养基含 10% 热灭活胎牛血清的 Dulbecco's modified
外显子捕获与扩增1
本方案以哺乳动物穿梭载体 pSPL3 为例,描述了外显子扩增的方法,内容分为以下五个阶段。阶段 1: 文库的构建; 阶段 2: 电穿孔法将文库转染 COS-7 细胞; 阶段 3:mRNA 的提取; 阶段 4: 反转录 PCR; 阶段 5: 克隆分析。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:
关于外显子混编的介绍
当两个转座子被同一转座酶识别而整合到染色体的临近位置时,则它们之间的DNA将变得易于被转座酶作用而转座。如果它们之间的DNA中含有外显子,则该外显子将被切离,并可能插入另一基因之中。这种效应称为外显子混编。 即新的基因是由原来的基因打断后的断片混编而成的,或者是由编码蛋白质结构域的基因片段混编
关于外显子捕获的简介
外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接