“超级增强子”调控关键基因科学家为其编目录
据物理学家组织网10月10日报道，最近，美国怀特黑德生物医学研究所科学家发现了一套称为“超级增强子”的基因调控器，能控制、影响人类和小鼠的大量细胞型。研究人员指出，超级增强子富集在基因组的变异区，而这些变异区与多种疾病谱系密切相关，所以它们最终可能在疾病诊断与治疗方面发挥重要作用。相关论文在线发表于当天的《细胞》杂志网站上。 今年4月，该研究所的理查德·杨首次在《细胞》杂志上发表了关于超级增强子的研究。论文称，虽然基因控制元素的整体数量可能达数百万之多，但只有几百个超级增强子控制着关键基因，赋予每个细胞本身独特的属性和功能。当时杨曾表示，他的发现主要建立在胚胎干细胞研究的基础上，有助于解决所有人类细胞的调控线路问题。最近的研究则向这一目标迈进了一大步：为近百种人类细胞和组织内的超级增强子编制了一份目录。 “我们已经从几个细胞跨越到大范围的人类细胞型，据此编制了这一目录，其他生物医学研究团体也能获得这一资源。”杨说......阅读全文
“超级增强子”调控关键基因－科学家为其编目录
据物理学家组织网10月10日报道，最近，美国怀特黑德生物医学研究所科学家发现了一套称为“超级增强子”的基因调控器，能控制、影响人类和小鼠的大量细胞型。研究人员指出，超级增强子富集在基因组的变异区，而这些变异区与多种疾病谱系密切相关，所以它们最终可能在疾病诊断与治疗方面发挥重要作用。相关论文在线发
Cell：两项研究聚焦“超级增强子”
近日，麻省理工白头研究所和哈佛丹娜法伯癌症研究所以及冷泉港实验室这三家知名的研究机构的科学家惊讶地发现，一组称作“超级增强子”( super-enhancer)的强有力基因调控子，它们控制了细胞的状态和特性。相关两个研究论文刊登在了近期出版的《细胞》(Cell)杂志上。 研究发现，健康
－如何关闭原癌基因MYC，靶向“超级控制因子”？
参考1月26日发表在神级期刊CA Cancer J Clin的《2015年中国癌症统计数据》一文，2015年中国约有429.2万名新诊断的浸润性肿瘤病例，也就是说平均每天约1万2千名中国人被诊断出患有癌症。 各种内外因，包括环境、饮食、遗传、免疫等多种因素，可能以协同或序贯的方式引起细胞非致死
拟南芥超级增强子鉴定与功能验证研究获进展
近日，东北地理所农田有害生物控制学科组孟凡立研究员团队与美国密歇根州立大学（Michigan State University）Jiming Jiang团队和英国约翰英纳斯中心（John Innes Centre）Anne Osbourn团队合作，在国际权威SCI期刊PROCEEDINGS OF
干细胞牛人Cell子刊探讨癌症与“垃圾”DNA
来自Whitehead生物医学研究所、Dana-Farber癌症研究所的研究人员，在一项研究中揭示出了称作为超级增强子（super-enhancers）的基因控制元件是如何作为功能部件将多个信号通路集中于一些关键基因处以及调节转录活性的。 这项研究工作表明，这些基因控制元件为一些信号通路提供了
研究可视化观察增强子和启动子的动态运动控制基因活性
尽管密集地排列在细胞核中，但储存我们遗传信息的染色体总是处于运动状态。这使得染色体的特定区域能够被接触到，从而激活一些基因。在一项新的研究中，来自奥地利科技学院、美国普林斯顿大学和法国巴斯德研究所的研究人员可视化观察这一动态过程，并对DNA的物理特性提出了新的见解。相关研究结果发表在2023年6
研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性
CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一种用来控制基因表达的DNA化学修饰，而我们对DNA甲基化在基因组不同区域的具体功能，在疾病、发育过程中所扮演的具体角色，以及控制基因表达的详细机理，直到今天并没有全面详细的认知。 2019年8月15日，美国Whitehead研究所Rudolf Jae
一种新的分子方法让癌细胞放慢了生长速度
德国Hopp儿童癌症中心是由德国海德堡大学附属医院和德国癌症研究中心（DKFZ）共同创建的，近期这一癌症中心的研究人员研发了一种新的分子方法，能用于治疗以往难以治疗的儿童脑癌形式：室管膜瘤（ependymoma）。这一研究成果公布在12月20日的Nature杂志上。 室管膜瘤是第三大最常见的儿
科学家尝试破解基因增强子之谜
基因可能是细胞核中的主角，但如果没有强有力的配角阵容，它们也将永远无法发光。随着DNA调控剂（增强子）的延展，将帮助基因在正确的时间和位置启动。尽管研究人员像狗仔队追踪好莱坞明星一样详细调查了基因，增强子依然身处幕后，其工作原理仍然成谜。不过，近日举行的遗传学会议可能将改变现状：研究人员描述了
Cell子刊：谁在推动干细胞的分化
美国凯斯西储大学的科学家们发现了多能干细胞分化的关键推手，这一突破性成果为干细胞的临床应用提供了宝贵的新线索，文章于六月五日发表在Cell旗下的Cell Stem Cell杂志上。 多能干细胞能够分化成为多种不同的细胞类型，具有修复机体损伤治疗疾病的巨大潜力。这项研究的两位资深作者，凯斯西储大
增强子的增强子的特点作用
① 具有远距离效应。② 无方向性。③ 顺式调节。④ 无物种和基因的特异性。⑤ 具有组织特异性。⑥ 有相位性。⑦ 有的增强子可以对外部信号产生反应。增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定，而能有很大的变动;[2]它能在两个方向产生相互作用。一个增强
西北农林科大等破译维持干细胞“多能性”的核心
哺乳动物多能性相关超级增强子的进化模型。论文作者供图 西北农林科技大学动物医学院华进联教授团队等成功破译维持干细胞“多能性”的核心，鉴定出三个在胎盘哺乳动物中高度保守的超级增强子（SE-SOX2、SE-PIM1、SE-FGFR1）。其相关成果《胎盘动物超级增强子维持干细胞多能性》9月26日
干细胞顶尖科学家Cell－Stem－Cell最新综述
来自伦敦国王学院干细胞与再生医学中心的Fiona Watt教授是国际肿瘤和干细胞研究领域的权威专家，她曾任国际干细胞研究协会（ISSCR）主席，Wellcome Trust干细胞研究中心(CSCR)执行主席，以及英国剑桥大学癌症研究中心(CRUK-CRI)主席。Watt教授主要研究领域包括正常表
武汉大学发现一个新的结直肠癌的致癌转录因子
结直肠癌是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一。近日，武汉大学生命科学学院的一项最新研究成果，揭示了一个新的结直肠癌的致癌转录因子，为结直肠癌的研究提供了重要的表观基因组数据和新的关键调控因子，相关论文近日在线发表于《自然—通讯》。 据介绍，目前关于结直肠癌的多组学研究广泛集中在基因组学和转
新研究揭示猪肌纤维类型分化及转化机制
7月1日，华南农业大学教授吴珍芳团队首次揭示了不同代谢类型猪骨骼肌的染色质空间构象及其介导的调控差异，通过整合表观基因组学与三维基因组学分析并结合分子实验，阐明了超级增强子调控肌纤维类型分化与转化的分子机制。相关成果发表于《自然-通讯》（Nature Communications）。研究对象及高通量
eLife：癌基因总闸与超强抗癌小鼠
将一个与不同类型癌症相关的调节区域移除，小鼠对肿瘤的形成产生了巨大的抵抗力！ 我们每个细胞内都有接近2万个基因，这些基因是维系我们身体和生存的说明书。在细胞生命周期的某个时间点上，只有部分基因需要保持活跃，每个基因的活性一直处于动态的调节状态，使细胞响应环境变化。 增强子是控制基因活性的分子
华大基因：挖掘基因测序的“超级金矿”
日前公布的2012年度深圳市科学技术奖拟奖名单上，奖金高达100万元的“市长奖”拟颁给一个37岁的年轻人;去年底，英国《自然》杂志评选出2012年科学界年度十大人物，他又是唯一入选的中国人。这个年轻人，就是华大基因研究院院长王俊。 他所在的深圳华大基因，没有享受到任何财政拨款，却坐上了《自
eRNA与Super－Enhancer－RNA在转录调控中扮演的角色
增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件，能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录，产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具
两篇Cell子刊：对干细胞分化的全新认识
全世界对干细胞研究寄予了厚望，希望它们能够给医疗领域带来一场革命。要充分挖掘干细胞的潜力，就得先理解它们的发育调控机制。现在，科学家们在这一方面找到了新的线索。 干细胞能够发育成为具有不同功能的特化细胞。对于那些与特定细胞死亡有关的疾病来说（例如帕金森症或糖尿病），人们可以利用干细胞的再生能力
Nat－Genet：新方法揭示基因“增强子”的工作机理
来自日本理化研究所（RIKEN）综合医学科学中心和肿瘤分子研究所(IFOM)的研究人员与京都大学、卡罗林斯卡研究所和DNAFORM的合作者一起开发出了一种被称为NET-CAGE的新技术，揭示了基因组中被称为增强子的非编码基因的结构，增强子可以激活特定基因的功能。基因组的这些部分曾经被认为是不重要
增强子的定义
增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
增强子的分类
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类:①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性,只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下,才能发挥其功能。②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如,金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录,又可受类固醇激素、锌、镉
复旦大学Cell发布表观遗传重要发现
来自复旦大学、哈佛医学院的研究人员在新研究中揭示，由RACK7/KDM5C复合物充当增强子“刹车”，抑制了增强子过度激活。这一重要的研究发现发布在4月7日的《细胞》（Cell）杂志上。 复旦大学的蓝斐(Fei Lan)教授与施扬(Yang Shi)教授是这篇论文的共同通讯作者。蓝斐教授的主要科
基因组学大牛Science发布癌症重大成果
Whitehead研究所的科学家们发现，称作为“隔绝邻域”的环状染色质结构遭到破坏可以激活能够推动侵袭性肿瘤生长的癌基因。这一研究发现对于癌症诊断及治疗均具有重大的意义。相关论文发布在《科学》(science)杂志上。 领导这一研究的是Whitehead生物医学研究所的Richard A Yo
Nature发布大规模癌症表观基因组研究成果
科学家们鉴别出了有可能生成第4亚型髓母细胞瘤的细胞。新研究发现为这种最常见的脑肿瘤亚型开发出更有效的靶向疗法清除了一个障碍。他们的研究结果发布在1月27日的《自然》（Nature）杂志上。 圣犹大儿童研究医院发育神经生物学系的Paul Northcott，德国癌症研究中心(DKFZ)的Stef
改造自身基因将催生“超级人类”？
据报道，前美国国家航空航天局（NASA）研究员Zayner自行设计了一套基因疗法，试图通过注射去除抑制自己左臂肌肉发育的蛋白质，获得超强臂力。有媒体称，这是全球首例正式公开的基因改造人案例。Zayner表示，他相信，随着基因工程技术的推广普及，人类将演变为新的物种。 “绿巨人、金刚狼这些超级英
Nature：功能强大的“超级基因”
燕尾蝶通过翅膀的复杂图案、颜色和结构进行拟态。日前，芝加哥大学的科学家们指出，这一复杂的机制受到doublesex的单基因调控，文章于三月五日发表在Nature杂志上。众所周知，doublesex是控制昆虫性别分化的关键基因，而这项研究表明该基因还具有控制拟态的强大功能。 “传统观点认为
控制基因敲除法
【探针技术用于检测由siRNA介导的基因调制】 为了研究基因功能，科学家们常常会有针对性地关断某些特定的基因。 而要验证这种基因沉默的有效性, 就需要运用适当的具特异性的检测方法。理想的检测方法不仅要测量准确, 而且还要能让细胞保持完好无损。 利用诸如RNA(核糖核酸)技
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作，首次报道了植物中的增强子转录，初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》（Genome Biology）。 增强子是一种40
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作，首次报道了植物中的增强子转录，初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》（Genome Biology）。 增强子是一种40