基因测序路在何方——专访LifeTechnologies销售总监柴映爽
近年来,基因测序技术飞速发展,使得几十个甚至上百个基因的测序能够在几天之内完成,测序的成本也下降到普通百姓可以承受的范围,这使得基因测序的临床应用成为可能。在临床研究方面,外显子组甚至全基因组的基因测序大大加速了疾病分子标志物的寻找,使得多种疾病病因的诊断与分型与以往相比更加精确,在用药时也能更有针对性,实现靶向治疗。由于疾病分子标志物的明确,越来越多的药物市场得到细化,药物与分子诊断方法同时报批、获批在美国已经成为一种趋势,相信也很快会在中国发展起来。 分子诊断技术的发展 利用对人体DNA分子的鉴定来辅助诊断的技术(分子诊断技术)在上个世纪就已经出现了,比如,FISH等核酸杂交技术已经可以进行染色体和基因水平的分析。上世纪90年代,定量PCR技术的兴起大大加快了突变鉴定的速度,可以进行DNA上单个位点突变的鉴定,被广泛应用于临床。本世纪初,人类基因组草图绘制的完成标志着第一代基因测序技术的成熟,对一个或几个基因的测序开......阅读全文
-Science:宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来,对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
基因测序格局初定,得技术者得天下
据统计,中国每4秒就有一个1个新生儿出生,对应这个数字,中国孕妇是一个十分庞大的群体。多年前,为了防止新生儿出生缺陷,准妈妈们选择羊水穿刺的方式进行产前检查,但是这种方式准确率较低,且存在10%的流产风险,这令不少家庭望而却步,而如今依托于基因检测技术的无痛产检得到越来越多人的追捧。 目前将
基因测序技术未来40年的发展展望
1977年,Science的两篇论文描述了第一种用于确定DNA片段中化学碱基顺序方法。而在这些文章发表之前,分子生物学家已经能够排列片段。四十年过去了,如今,DNA测序技术正以惊人的速度向前发展。在过去十年中,高通量测序技术使数据生成呈指数级增长态势。 由此产生的大量数据在基础生物学领域的应用已经产
关于新型基因检测技术—基因测序的应用领域介绍
英国伦敦大学学院和美国罗格斯大学的联合研究团队,将基因测序技术和超级计算机技术相结合,试图探索解决这一命题。研究人员把艾滋病(HIV)蛋白酶分子作为对象,酶在不同人体中形状略有不同,尤其是在蛋白质活动区,在那里酶完成切片并构成了下一个病毒,进而形成特定的病毒基因序列。如果知道了酶的形状,就可以找
Nature:新技术超越基因测序,揭示“癌中之王”致病基因
德国慕尼黑工业的研究人员利用一项新技术鉴别出了基因测序难以辨认的癌症病因,揭示出了大量从前未知的胰腺癌基因。其有望推动对于这一目前仍知之甚少的疾病的研究。相关论文发表在12月8日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。 胰腺癌是恶性度高、预后差的一种肿瘤,在过去的40年里患者
关于新型基因检测技术—基因测序的发展前景介绍
2015年3月9日,罗氏、基础医学以及其他很多癌症研究人员都认为从数据角度分析癌症是最终战胜这种可怕疾病的理想方式。根据罗氏和基础医学签署的协议,罗氏可以访问基础医学的数据库。他们的数据库收录了3.5万名癌症患者的肿瘤DNA序列,以及这些患者服用的药物和药物在遏制癌症方面产生的功效等信息。 D
基因测序简介
测序技术迄今为止已发展了三代,测序技术有4个指标:读长、成本、准确度、通量。 成本、准确度这两项指标都很好理解,成本下降使得单个人类基因组的花费已经从2001年的1亿美元下降到了1000美元以下。准确度则是测序结果的准确程度,例如二代测序的solid可以达到99.9%,而唯一投入实用的三代测序
基因测序仪
原理编辑abi prism 310型基因分析仪采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法),因此通过单引物pcr测序反应,DNA测序仪生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料
蚕豆基因测序!
蚕豆的基因组终于被测序了,它拥有130亿个碱基,超过了人类基因组的4倍。这项研究最近发表在《自然》杂志上。这一非凡的技术壮举对于培育具有最佳营养成分和可持续生产的豆子的目标具有重要意义。由英国雷丁大学、丹麦奥胡斯大学和芬兰赫尔辛基大学领导的一个来自欧洲和澳大利亚的研究小组合作进行了这项广泛的测序工作
基因测序原理
基因是位于DNA上的,其测序的原理是一样的DNA测序的方法有很多种.目前最常见的是双脱氧终止法了.在测序用的缓冲液中含有四种dNTP及聚合酶.测序时分成四个反应,每个反应除上述成分外分别加入2,3-双脱氧的A,C,G,T核苷三磷酸(称为ddATP,ddCTP,ddGTP,ddTTP),然后进行聚合反
基因测序定义
基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。 基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术是下一个改变世界的技术
DNA测序的测序技术
高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以
关于新型基因检测技术—基因测序的主要功能介绍
基因测序只是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。 基因测序广为人知的还有针对唐氏综合征筛查的无创产前基因检测。只需要采集孕妇的外周血,通过对血液中游离DNA(包括胎儿游离DNA)进行测序,并将测序结果进行生物学分析,从而得出胎儿是否患有染色体数目异常的疾病,包
Nature子刊发布重磅测序技术:基因组和转录组平行测序
四月二十七日的Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术,G&T-seq(Genome and Transcriptome Sequencing)。该技术能够实现大规模的DNA和RNA平行测序,同时展现单个细胞的基因组序列和基因活性。 研究人员用G&T-seq对220个小鼠
从“基因测序仪”观“测序行业”!
基因测序仪:基因测序“皇冠上的明珠” 基因测序仪是测序产业链的起点也是关键环节,它为整个中下游测序服务提供最基本的测序支撑,同时也是壁垒最高的部分,处于基因测序产业价值链顶端。基因测序仪对于基因产业的重要性,如同发动机之于汽车行业,芯片之于电子通信行业,可谓是基因测序“皇冠上的明珠”。 到目前为
基因测序里到底还有哪些技术“结”需解?
质量强国,但是分子诊断产品的质量标准化难以明了? 单分子测序技术/基因芯片等在临床阶段的应用尚有探索前景? 基因芯片在液体活检中如何更好应用? 外泌体,非编码RNA,DNA甲基化等生物标志物尚需研究? 2018年5月26-27日在武汉光谷科技会展中心举行的“第四届中国先进分子诊断技术与应
第一代基因测序技术的应用
第一代测序技术既可以用于测定DNA序列,也可以用于测定DNA分子的片段长度。其中基于片段分析的微卫星(STR)分析是现代法庭DNA鉴定的核心技术。 人类基因组的测序正是基于第一代基因测序技术完成的。Sanger测序这种直接测序方法具有高度的准确性和简单、快捷等特点。目前,依然对于一些临床上小样
基因测序新贵在ZL诉讼期间发布新技术
面对启迪公司的诉讼,牛津纳米孔技术公司表示,这种名为CsgG的微小孔隙是其新设备的基础。 首创了一种名为纳米孔测序的新DNA分析技术的英国牛津纳米孔技术公司,对其产品的核心部分一直守口如瓶。不过,紧随一项来自测序行业巨头——启迪公司的ZL侵权诉讼,该公司揭示了驱动其最新设备的东
美用新技术完成炭疽基因组测序
美国乔治亚理工学院科学家使用一种称为RNA测序的新技术,描绘出了炭疽芽孢杆菌的基因表达。公布在最新一期《细菌学》杂志网络版上的此项研究成果,标志着任何细菌转录(细菌表达不同基因时产生的完整信使RNA集合)自此可被全面定义,并为研究细菌如何调控基因表达提供了更多细节。 乔治亚理工学院光电系统
什么是第三代基因测序技术
第三代基因测序技术即基于纳米孔的单分子读取技术 在纳米孔测序技术中,DNA分子依靠核酸外切酶以一次一个碱基的速度通过小孔。这个酶能清楚地区分出4个DNA碱基编码:A、C、G、T,也可以检测出该碱基是否被甲基化,一个单孔能在大约70天左右测定一个完整的基因序列。 纳米孔技术不需要荧光标记物并且很可能不
基因测序新贵在ZL诉讼期间发布新技术
首创了一种名为纳米孔测序的新DNA分析技术的英国牛津纳米孔技术公司,对其产品的核心部分一直守口如瓶。不过,紧随一项来自测序行业巨头——启迪公司的ZL侵权诉讼,该公司揭示了驱动其最新设备的东西,即一种看上去巧妙避开了启迪公司挑战的细菌孔。 同此前方法相比,纳米孔测序在分析DNA方面更加便捷和廉价
最新测序技术能用单个细胞分析基因组
美国物理学家组织网9月18日报道,最近,来自美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校、克雷格·文特尔研究院和Illumina公司的科学家对现代基因测序算法进行了改良,只需从一个细菌细胞中提取的DNA(脱氧核糖核酸)就可组装成接近完整的基因组,准确率达到90%,而传统的测序方法至少需要10亿个
第三代基因测序仪技术原理
在分子生物学研究中,基因的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前(2009年)用于测序的技术主要有Sanger等。发明的双脱氧链末端终止法。Sanger法是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,产生A,T,C,G四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电
Nature-Methods:针对LncRNAs的新型精准基因测序技术
现在有一种新的基因测序技术-“捕获测序'(CaptureSeq),能使我们以更高的分辨率去探索人类基因组。它优于现有的基因测序技术,能精确捕捉测量许多具体的活性基因样品(即使基因的表达时间仅按分钟水平计算)。这个技术对癌症研究具有革命性的影响。在实际应用中,可用于包括许血液肿瘤的诊断。这篇文章由
第三代基因测序仪技术原理
在分子生物学研究中,基因的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。用于测序的技术主要有Sanger等。发明的双脱氧链末端终止法。Sanger法是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,产生A,T,C,G四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从
科学家分享基因测序技术研发成果
临床类 杜克大学分子遗传学教授David Goldstein David Goldstein提出运用精准医学治疗神经系统疾病。Goldstein专注于几个癫痫患者大规模研究的课题,其中包括一项对超过350个患病的儿童及其父母进行测序来发现新突变的项目。尽管许多发现的突变属罕见突变,但是它
第一代基因测序技术的原理
化学裂解法,其基本原理是特定化学试剂可对碱基进行特异性修饰,在修饰碱基处(5’或3’)打断磷酸二酯键将一个DNA片段的5’端磷酸基做放射性标记,再分别采用不同的化学方法修饰和裂解特定碱基,从而产生一系列长度不一而5’端被标记的DNA片段,这些以特定碱基结尾的片段通过凝胶电泳分离,再经放射自显影,
DNA测序技术的测序规律
生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸
DNA测序技术的测序原理
化学修饰法测序原理化学试剂处理末段DNA片段,造成碱基的特异性切割,产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物,经凝胶电泳分离。化学切割反应:包括碱基的修饰,修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物
从被基因测序拯救的儿童案例-看测序技术的商业化趋势
第一例被基因测序拯救的儿童Nic Volker是世界上第一例被基因测序拯救的人,他喜欢瑜伽、巨轮卡车、游泳、乡村音乐和西部歌曲。 “每次跌倒我都爬起来。” 这句话对于将满11岁的Nic来说具有特殊的意义:他患有癫痫症,这会使他毫无预兆地失去肌肉张力,往往一天有100次之多。如果发作时他站着,