军科院：小RNA测序鉴定微生物病原体
最近，研究人员利用小RNA（small RNA，sRNA）深度测序鉴定miRNA在植物和动物基因表达过程中转录和后转录的调控功能，该技术也是植物和无脊椎动物中发现病毒的有效策略。由于小RNA片段中可能含有来自所有RNA分子的RNA代谢物，如rRNAs，tRNAs，mRNA，snRNA，snoRNA等，那么利用sRNA测序数据就有可能作为一种通用策略来鉴定除了病毒外的多种微生物，包括原核生物和真核生物病原体。为验证这一猜想，军科院微生物流行病研究所曹务春所长和童贻刚教授领衔团队对野外捕获的虱子和蚊子的sRNA测序数据进行了深入解读*，成果发表在近期的PLoS ONE上。 在这项研究中，研究人员首先对野外捕获的虱子和蚊子进行sRNA测序（测序工作由联川生物承担完成），将深度测序得到的clean reads与NCBI核酸集合（非冗余核酸数据库）进行Blastn比对。然后将比对的结果进行了in-house Python scrip......阅读全文
二代测序的焦磷酸测序，合成法测序，连接法测序和离子半导体测序原理
不同的二代测序平台的区别主要体现在测序反应的技术上，这些差别可以分为4类： 焦磷酸测序，合成法测序，连接法测序和离子半导体测序。焦磷酸测序 在焦磷酸测序中，测序反应通过每个核苷酸结合过程中释放的焦磷酸来调控。释放的焦磷酸参与了一系列化学反应从而导致链光的产生。发出的光由记录基因蔟相应序列的相
简述DNA测序的测序规律
生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组寡核苷酸都有固定的起点，但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。 由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等，因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物，这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。 在可以区分长度仅
DNA测序仪pcr测序反应
pcr测序反应 (1) 取0.2ml的pcr管，用记号笔编号，将管插在颗粒冰中，按下表加试剂： 所加试剂 测定模板管 标准对照管 bigdye mix 1μl 1μl 待测的质粒dna 1μl － pgem-3zf (+) 双链dna － 1μl 待测dna的正向引物 1μl －
DNA测序技术的测序规律
生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组寡核苷酸都有固定的起点，但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等，因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物，这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸
DNA测序的测序原理介绍
化学修饰法测序原理 化学试剂处理末段DNA片段，造成碱基的特异性切割，产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物，经凝胶电泳分离。化学切割反应：包括碱基的修饰，修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。 Sanger法测序的原理 就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定
DNA测序——自动测序法
DNA测序可用于：（1）测定未知序列；（2）确定重组DNA的方向与结构；（3）对突变进行定位和鉴定比较研究。实验方法原理ABI PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪)，采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法)，因此通过单
DNA测序的测序目的
确定重组DNA的方向与结构，对突变进行定位、鉴定和比较研究。
DNA测序仪：454测序仪
454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展，科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破：首先是解决了高通量测序问题；其次它简 化了样品准备步骤，将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了；最后， 它缩小了
DNA测序技术的测序原理
化学修饰法测序原理化学试剂处理末段DNA片段，造成碱基的特异性切割，产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物，经凝胶电泳分离。化学切割反应：包括碱基的修饰，修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物
蓝藻的生物毒性研究
图1. 实验室条件下进行蓝藻的培养。 由蓝绿藻类原核生物所产生的具有生物活性的次级物质，日渐成为制药业感兴趣的原料，但与此同时，其潜在的生物毒性可能对环境和食品产生危害，关于它们的鉴定工作亦非轻而易举之事。 蓝绿藻类原核生物（通常亦称蓝藻）指的是具有光合活性的细菌，主要生长于海洋
全基因组测序的竹亚科及生物学性状的比较基因组学研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，约有12000种，是水稻、小麦、玉米等人类粮食和牲畜饲料的主要来源，也为人类提供了加工淀粉、制糖、酿酒、造纸、编织和建筑等方面的重要原料。同时，禾本科又是植物遗传学和基因组学研究的模式类群。竹亚科（竹子）是禾本科的12个亚科之一，与早熟禾亚科、稻亚科组成BOP
时空分辨单细胞测序技术的研究热点有哪些？
时空分辨单细胞测序技术的研究热点包括以下几个方面：技术改进与创新提高时空分辨率，实现更精细的细胞定位和更短时间间隔的动态监测。开发新的标记和成像方法，以提高检测的准确性和灵敏度。多组学整合结合转录组、表观基因组、蛋白质组等多组学数据，全面揭示细胞的时空特性。疾病机制研究深入探究肿瘤发生、发展和转移过
小个头大内涵的单细胞测序研究盘点
近几年来，基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展，其成果有望为一些重要的生物学问题提供新的解决方案。测序君盘点了2015年的单细胞测序研究成果，供大家查阅。《Science》：瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们的单细胞测序研究。该研究生成了有关皮质细胞类型以及细胞内活化基因的详细图谱。研究小组利
中丹将联合开展大麦染色体测序研究
丹麦嘉士伯实验室和中国深圳华大基因科技服务有限公司(简称华大科技)11月15日宣布，双方将联合开展大麦6号染色体测序研究，旨在为培育大麦新品种提供有价值的资源。 基因组测序是当今世界快速育种科技的核心工作，有助于挖掘有利的遗传突变，加速农作物育种改良。但大麦基因组非常复杂，测序工作挑战不小
IntegraGen为巴斯德研究所提供高通量测序服务
IntegraGen公司今天宣布与巴斯德研究所达成合作协议，在微生物学领域开展高通量测序。 根据协议细则，IntegraGen公司将为法国国家参考中心与巴斯德研究所微生物基因组文库提供测序服务。另外，IntegraGen公司也将开发一款新型管理软件以供巴斯德研究所内部使用。 合作双方表示，该
王泽峰研究员发布RNA测序重要成果
细胞周期的推进很大程度上依赖于周期性基因表达。王泽峰（Zefeng Wang）研究员领导北卡罗来纳大学的研究团队，绘制了细胞周期的高分辨率转录组图谱，揭示了周期性基因与癌症之间的新关联。这项重要的研究成果于七月一日发表在Cell Research杂志上。王泽峰研究员2015年将实验室移到中国上海
多种测序技术研究卵巢癌可塑性
一项对卵巢癌中遗传突变的最新研究表明，在卵巢癌原发肿瘤和转移病灶中都存在一个前所未有水平的遗传变异。这项研究显示了干预治疗的新途径，表明多个疾病部位的取样和测序可能是有效的打靶治疗所必需的。这项研究发表在11月12日的Genome Research杂志上。 卵巢癌是卵巢肿瘤的一种恶性肿
Sanger研究所测序3,000种危险细菌
对于人类而言，细菌扮演着多重角色，有时是亲密的伙伴，有时是致命的敌人。英国著名的Wellcome Sanger研究所近日与Pacific Biosciences（PacBio）合作，测序了3,000多种细菌的基因组，其中包括一些世界上最危险的细菌。 这些细菌是由英国国家菌种保藏中心（NCTC
蛋白上游研究之Sanger测序技术的发展史
DNA测序技术是分子生物学研究中最常用的技术，它的出现极大地推动了生物学的发展。成熟的DNA测序技术始于20世纪70年代中期。1977年Maxam和Gilbert报道了通过化学降解测定DNA序列的方法。同一时期，Sanger发明了双脱氧链终止法。20世纪90年代初出现的荧光自动测序技术将DNA测序带
单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例
以下是一些单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例： **案例一：乳腺癌** 研究人员利用单细胞测序技术对乳腺癌肿瘤组织进行分析，发现了不同亚型乳腺癌细胞之间的基因表达差异和肿瘤细胞的异质性。他们鉴定出了具有干细胞特性的肿瘤细胞亚群，这些细胞可能与肿瘤的复发和耐药性有关。这为开发更有针对性的治疗
2018年8月NCS测序前沿研究一览
行将结束的8月，Nature、Cell、Science杂志有哪些前沿研究的重大发现或新闻呢？以下为您精选几篇供快速浏览。 1 基因组和转录组的演变能够改变癌细胞的药物反应 —Genetic and transcriptional evolution alters cancer cell l
Science：三项鸟类全基因组测序研究
目前，一个国际科学家小组完成了一项迄今为止最大的动物全基因组研究。为了构建鸟类的生命树，研究小组测定、组装和比较了48种鸟类的全基因组，这些鸟包括鸵鸟、蜂鸟、乌鸦、鸭、猎鹰、鹦鹉、鹤、朱鹭、啄木鸟和鹰，囊括了现代鸟类的所有主要分支。作为鸟类系统基因组学财团（由来自20个国家80家机构的200多名
国际研究小组完成多细胞团藻基因组测序
德国比勒费尔德大学7月9日报告说，一个国际研究小组最近完成了对最简单的多细胞生物团藻的基因组测序。科研人员希望以此帮助探寻单细胞生物向多细胞生物演变的奥秘。 单细胞生物怎么能演变为多细胞生物乃至人这样高度复杂的生物，一直是生物研究的重要课题。一个由德国、美国、加拿大和日本科研人员组成
谢晓亮：从单细胞研究到高通量测序
2011年7月第八期《自然—方法学》刊登了Monya Baker撰写的一篇人物特写，详细介绍了在当期发表的论文 “Fluorogenic DNA sequencing in PDMS microreactors”的主要作者哈佛大学谢晓亮教授的高通量测序技术。全文翻译如下： 在科学界，
国产测序仪在农业育种研究上首开先例
11月23日我司与深圳市农业科技促进中心及深圳市朗诚实业有限公司共建的“深圳农业基因科技应用中心”正式成立并召开第一次工作会议，会议确定了中心名称，管理体制及章程、短中期任务及中心未来发展方向。 目前双方共同搭建的高通量分子育种技术平台已正式启动，双方合作的应用服务项目之一农业
单细胞转录组测序研究热点和发文锦囊
从Top50期刊2000余篇文献统计： 在刚刚发布的“十四五”规划中，“基因与生物技术”作为前沿科技攻关领域之一。而在这个领域，近年来最具里程碑的技术突破必然不能忽略“单细胞转录组测序”。本文通过对PubMed数据库中Top50期刊的共计2357篇单细胞转录组测序的引文进行数据分析，帮助读者了
多篇文章解读近期测序领域重要研究成果！
如今，科学家们应用测序技术在多项研究领域都取得了显著的成果，那么近期他们又取得了哪些成果呢？本文中，小编就对相关研究结果进行整理，分享给大家！ 【1】Science：便携式DNA测序仪在检测病毒疫情中大显身手 doi：10.1126/science.aau9343 在一项新的研究中，来自美
Science发表有里程碑意义的RNA测序研究
全基因组关联研究（GWAS）鉴定了数百个心血管代谢疾病（CMD）的风险位点。这些DNA位点大多位于非编码区域，但人们对相应的基因调控机制还知之甚少。西奈山伊坎医学院的研究人员对六百名冠心病患者的不同组织进行了基因分型和RNA测序。 “通过分析多个组织的基因表达数据，我们鉴定了在单一组织起作用的
Y染色体完整测序或改善细菌DNA研究
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507607.shtm
新一代测序技术为生物制药开启新路径
新一代测序技术现在越来越多使用在新兴生物药的开发和疫苗生产上。目前药物研发部门使用的各种高通量技术，例如基因芯片、代谢组学建模、酵母双杂、蛋白质组学、高通量化学筛选、电子杂交定位，有望被新一代测序技术替代或作为补充。 随着微生物基因组信息逐渐增多，新一代测序技术在抗细菌和抗病毒药物