全基因组测序的竹亚科及生物学性状的比较基因组学研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，约有12000种，是水稻、小麦、玉米等人类粮食和牲畜饲料的主要来源，也为人类提供了加工淀粉、制糖、酿酒、造纸、编织和建筑等方面的重要原料。同时，禾本科又是植物遗传学和基因组学研究的模式类群。竹亚科（竹子）是禾本科的12个亚科之一，与早熟禾亚科、稻亚科组成BOP支系，是该科适应森林生境的一个主要分支。竹类植物多数种类植株高大、生长迅速，营养生长周期长达几十年，最长可达120年，且开花后即成片死亡。竹子作为“木质化的禾草”（woody grass）和独特开花性状而备受关注，但由于研究难度大，一直是禾本科研究的一个薄弱环节。竹亚科具有丰富的物种多样性，约有1500种，包括以染色体基数为12、不同倍性的四个分支，即二倍体的草本竹类（2n=20-24）、四倍体的温带木本竹类（2n=46-48）、四倍体的新热带木本竹类（2n=40-48），以及六倍体的旧热带木本竹类(2n=70-72)。然而，木本竹类......阅读全文
全基因组测序的竹亚科及生物学性状的比较基因组学研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，约有12000种，是水稻、小麦、玉米等人类粮食和牲畜饲料的主要来源，也为人类提供了加工淀粉、制糖、酿酒、造纸、编织和建筑等方面的重要原料。同时，禾本科又是植物遗传学和基因组学研究的模式类群。竹亚科（竹子）是禾本科的12个亚科之一，与早熟禾亚科、稻亚科组成BOP
解码“基因组学之父”桑格：测序，测序，测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’，他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础，彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天，65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验，转身走出实验室，宣布自己正式退休。那一年是1983
－Science：宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来，对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
昆明植物所完成六种木本竹子叶绿体基因组全序列的测定
竹亚科（Bambusoideae）隶属于禾本科（Poaceae），全世界共分布有一千余种。木本竹子因种类数目多，形态性状复杂多变及多年生一次性开花等原因而成为系统发育学研究难点。随着新一代测序技术的兴起，系统发育基因组学为解决这类困难类群的系统发育关系带来了曙光。 中国科学院昆明植物研究所李德
宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组
来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。 由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。 宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术，并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增
云南省禾本科种质资源与基因组学省创新团队通过认定
6月6日，由云南省科技厅主持，邀请有关专家，对“中国科学院昆明植物研究所禾本科种质资源与基因组学省创新团队”进行认定，经专家组认真审查有关认定资料，听取了团队带头人李德铢的工作汇报。 专家组认为，该创新团队通过三年的实施培养，建立了有国际影响力的禾本科植物的比较功能基因组学与进化基因组学研
测序技术发展过快？基因组学千万大奖告吹
X奖基金会近日决定取消了奖金高达1000万美元的基因组学Archon X奖(Archon Genomics X Prize)，因为基因组测序成本的直线下降已使得竞争毫无意义。 X奖基金会的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了关闭竞赛的决定。他表示，这是因为如今
昆明植物所竹亚科青篱竹族的系统发育和进化研究获进展
竹亚科青篱竹族 (Arundinarieae) 约有32属600种，既包括了全球经济价值最高的竹种如毛竹，也包括了箭竹、方竹、冷箭竹等国宝大熊猫赖以生存的主食竹种，分布于亚洲、非洲和北美温带和亚热带地区，东亚是该族的现代分布中心。青篱竹族具有多样化的形态特征，比如，地下茎包括单轴型、合轴型和复轴
采用新一代测序法的宏基因组学研究
直到不久之前，宏基因组学研究还因为高费用、低流通量以及在应用Sanger-方法克隆步骤中出现的结果不准确而受到限制。而今借助于新一代序列测定方法即可获得宏基因组样品全面的图像。宏基因组学研究（metagenomics）是指研究一种复杂微生物群体在其生命空间的全部基因信息。研究的主要目的在于刻画
新一代测序将如何改变法医基因组学
Bruce Budowle博士是北德克萨斯大学健康科学中心(UNTHSC)应用遗传学研究所的执行主任。自2009年成立以来，该研究所集中了一大批致力于完善遗传学方法的知名科学家，以增强几个研究领域，包括法医DNA。在UNTHSC的法医科学项目(全美只有14个)
昆明植物所利用第二代测序仪测定铁竹线粒体基因组
同动物的线粒体基因组相比，植物的线粒体基因组有着十分独特的进化方式，如具有较大的基因组、极低的分子进化速率和相对较频繁的基因组结构上的变异等特性。目前，植物线粒体基因组大都通过传统的Sanger法进行测序，需要耗费大量的人力和物力，严重限制了植物线粒体基因组的测序，进而导致对其独特进化方式的研究
三代测序的DNA提取和宏基因组学分析（一）
改进的人类肠道微生物组的高分子量DNA提取，纳米孔测序和宏基因组学装配Improved high-molecular-weight DNA extraction,nanopore sequencing and metagenomicassembly from the human gut microb
三代测序的DNA提取和宏基因组学分析（二）
优势与局限这种DNA提取方法已被优化用于从人类粪便样本中提取高分子量(HMW)DNA，但也已在模拟微生物群落和细菌分离株上得到验证。我们希望该方案可以适用于其他样品类型，尽管可能需要对裂解前和裂解后步骤进行修改以解释特定于样品的制备和污染物清除的问题是必要的。机械裂解方法（如珠子击打）仍然是连续裂解
“葫芦科作物功能基因组学”获国家杰青基金资助
日前，国家自然科学基金委员会正式公布了2022年国家杰出青年科学基金资助立项，青岛农业大学园艺学院教授张忠华“葫芦科作物功能基因组学”项目获国家自然科学基金杰出青年科学基金资助。这实现了青岛农业大学自主培养国家级科技人才队伍的重大突破。张忠华，现任青岛农业大学园艺学院院长，国家杰出青年科学基金获得者
基因组学分析揭示
英国《自然》杂志18日在线公开的一篇基因组学论文显示，来自西伯利亚阿尔泰山脉东部尼安德特人的祖先，和现代人祖先的相遇与交融繁殖可能比原先认为的更早。已有证据显示，尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向现代人贡献了遗传物质。这项新研究还显示，大约在10万年前，现代人和尼安德特人之间
横断山高山竹类的快速辐射演化和物种多样性的形成机制
高山竹类是竹亚科青篱竹族（温带木本竹类）一个独特的分支，包括箭竹属（Fargesia）、玉山竹属（Yushania）、筱竹属（Thamnocalamus）、香竹属（Chimonocalamus）、冷箭竹属（Sarocalamus，即“alpine Bashania”），以及Bergbambos，
澳大利亚CSIRO机构与中科院将在植物基因组学进行合作
据GenomeWeb记者报道，2011年3月10日—澳大利亚联邦科学与工业研究组织（CSIRO）今天宣布，将在下周与中科院共同探索在植物基因组研究上的合作计划。 这项研究合作，将重点放在水稻和小麦农作物上。水稻和小麦将同玉米一并成为在世界上种植最广泛的三大农作物；来自两个研
昆明植物所揭示竹类植物生活史转变和物种多样化遗传机制
多倍化或称基因组加倍是植物演化史上的永恒主题，广泛发生于被子植物（有花植物）的各个演化阶段，特别是在与重要地史和气候事件相关的演化节点上，并伴随着整个被子植物和诸多大科大属的兴起。然而，在亚基因组水平上，关于多倍化如何促进植物适应性演化以及物种多样性形成的认识仍然不足。现有研究集中在新近（五百万年内
美印药物基因组学与癌症基因组学检测商业化
美国Companiondx实验室拟与健康信息技术服务商Enable Healthcare合作，向医生推广药物基因组学检测；印度癌症医学公司HCG宣布建立一个新的肿瘤基因中心，旨在下代测序技术能够帮助定位肿瘤，从而提高化疗和放疗的效率和响应率 美国药物基因组学检测商业化 Companiondx实验
台风“山竹”“温比亚”因过于“凶残”被除名
记者2月27日从中国气象局获悉，正在召开的台风委员会第51次会议上，台风“山竹”“温比亚”被正式除名。 据介绍，1997年在香港举行的台风委员会第30次会议决定，西北太平洋和南海的热带气旋采用具有亚洲风格的名字命名，分别由世界气象组织所属亚太地区的柬埔寨、中国、朝鲜、中国香港、日本、老挝、中国
新的DNA测序技术将促进对基因结构和功能的探索
今天在此间开幕的“二00七年国际基因组学大会”透露，新近问世的DNA测序法已经在基因组研究中得到了广泛的应用，使基因表达的精确度达到数字化,揭示了染色质组蛋白的新功能。 全世界二百多位专家学者，在为期四天的会上将交流新近问世的DNA测序技术的最新进展，探讨基因组学和基因测序技术在生命科学研究
Science专题：癌症基因组学
在2001年完成人类基因组测序后，许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近，越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向，测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异，以
药物基因组学的定义
药物基因组学(pharmacogenomics),又称基因组药物学或基因组药理学,是药理学的一个分支,定义为在基因组学的基础上,通过将基因表达或单核苷酸的多态性与药物的疗效或毒性联系起来,研究药物如何由于遗传变异而产生不同的作用。
毒理基因组学的定义
毒理基因组学(toxicogenomics)是从多基因、全基因组水平研究毒物作用与基因表达的相互影响。其研究内容主要包括3个方面:促进环境应激原与疾病易感性关系的理解、阐明毒性分子机制、筛选和确认与疾病和毒物暴露相关的生物标志物(biomarkers)。
华大智造宣布超高通量基因测序仪落地南澳基因组学中心
2023年4月27日，华大智造宣布超高通量基因测序仪DNBSEQ-T7落地南澳基因组学中心（SAGC），该中心将基于DNBSEQ-T7测序平台开展各项科学研究，助力全面推动澳大利亚基因组学研究发展和成果转化。 南澳基因组学中心成立于2020年7月，是国际领先的基因组学中心之一，致力于支持整个澳洲及
Oxford－Nanopore便携式高通量测序仪，打开基因组学新市场
Oxford Nanopore Technologies（“Oxford Nanopore”）推出PromethION 2（“P2”）Solo测序仪，这是全球可及性最高的高通量测序设备，有可能大大提高针对人类遗传学和其他更大数据集的准确、快速和负担得起的测序的可及性。 P2 Solo是市场上唯
基因组所参加国际基因组ENCODE计划取得系列研究成果
近日，国际科学界宣布“DNA元素百科全书”(简称ENCODE)计划获得了迄今最详细的人类基因组分析数据，并以30余篇论文的形式同时发表在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI学术期刊上。ENCODE被认为是继“人类基
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划，那时用的方法叫做双脱氧终止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中，DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸）来作为原料，但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的，但与普通PCR不同，它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
科学家揭示木本竹类独特性状演化之谜
“竹子开花，立马搬家”——我国一些地区传言，竹子开花之后不就后死亡，预示着坏事发生。从科学的角度来看，传言不攻自破。竹子分为木本竹类和草本竹类，只有木本竹类开花后死亡。木本竹类茎秆高大，木质化程度高、营养生长几十甚至上百年，最长的可达120年，之后才开花死亡。相比之下，草本竹类一般仅几十厘米高，木质
Verogen基于NGS新一代测序技术的法医基因组学解决方案...
Verogen基于NGS新一代测序技术的法医基因组学解决方案的应用NGS新一代测序技术VS传统CE测序技术在过去的30年中，法医DNA检测一直依赖于CE毛细管电泳测序技术进行片段长度多态性的检测。然而CE测序技术具有检测位点少、样品消耗量大、不能检测线粒体DNA等缺点，当DNA样本量有限时，法医分析