深海来源链霉菌次级代谢产物合成潜力挖掘研究获进展
高压、高盐及低温的深海环境曾被认为是生命的荒漠。随着海洋科学技术的发展,人们对深海的探索能力日益增强,发现了深海(甚至万米深的马里亚拉海沟)也有微生物的生命活动,并从深海沉积物样品中分离鉴定了多个种属的放线菌。基因组测序表明,一些深海来源的放线菌基因组中还蕴藏着许多次级代谢产物合成基因簇,但大部分基因簇通常不表达,因此,其代谢产物潜力还有待深入挖掘。近年来,基因组挖掘技术、转录组挖掘技术、蛋白质组学技术的发展以及这些技术的组合,已经成功激活了部分生物合成基因簇,获得了相应产物的化学结构。尽管如此,传统意义上的改变菌株培养条件的方法仍是激活“沉默”基因簇的一种有效方法。 中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室在过去十年内,依托基金委的南海开放航次和印度洋航次,已经积累了大量深海来源的可培养放线菌。研究人员对一株深海来源的链霉菌SCSIO 03032进行了系统的次级代谢产物生产潜力的挖掘,从该株链霉菌中共分......阅读全文
关于鞘磷脂的代谢产物介绍
鞘磷脂是细胞膜的主要组成成分,其代谢产物如神经酰胺(ceramide, Cer)、鞘氨醇(sphingosine, Sph)、1-磷酸鞘氨醇(sphingosine-1-phosphate, S1P)是具有生物活性的信号分子,可作为第一和(或)第二信使调控细胞的生命活动,如细胞的生长、分化、衰老
微生物发酵代谢产物途径中间产物的测定方法
先经分离纯化得到你测纯物质(≥95%),再进行质谱、核磁、同位素等的检测,打出图谱,然后再进行解谱,空间结构的话还需要一些的反应!很复杂!
什么是合成代谢?
由于生物合成导致分子更大、结构更复杂的物质产生,这个过程需要消耗自由能,能量通常由腺苷三磷酸(ATP)直接提供。合成代谢和分解代谢是代谢过程的两个方面,二者同时进行。分解代谢生成的ATP可供合成代谢使用,合成代谢的构件分子也常来自分解代谢的中间产物。和分解代谢相反,合成代谢是从少数种类的构件出发,合
植物次生代谢中萜类的代谢产物与功能
在次生代谢中异戊二烯焦磷酸酯代谢产生的萜类物质,是植物进化到较高层次的表现。此代谢已经使四批科学家获得诺贝尔奖,这一事实就很说明问题。萜类在自然界分布广泛、种类繁多大约有1万多种。萜类可保护植物细胞膜、产生多种内源激素、保护植物免受强光的伤害、萜类中的信号物质和化感物质在植物防御系统中起到关键作
链霉菌属的致病性介绍
大部分(超过500种)链霉菌是非致病的污染菌或定植菌。但索马里链霉菌例外,该菌可引起足菌肿病,偶尔引起侵袭性感染。其他菌种很少引起疾病。灰色链霉菌(也称圆环链霉菌)是从人体标本中最常分离的菌种,但认为其是偶尔引起感染的病原菌;更为人熟知的,它是链霉素的原始来源。分离菌株通常只鉴定到属水平(如果要
链霉菌属的特征和培养介绍
放线菌目中的一个大属。菌丝纤细、无隔、多核、分枝,革兰氏阳性,菌丝体发达,分化成基内菌丝和气生菌丝,后者成熟后发育成孢子丝,其形态多样(直、波曲、螺旋、轮生),可裂生大量分生孢子进行散播、繁殖。菌落小而致密、干而不透明,幼时表面光滑、边缘整齐、颜色单调、不易挑起,继而发展成绒毛状、表面起粉、色泽
关于天蓝色链霉菌的简介
天蓝色链霉菌是生产三分之二用于医药的天然抗生素以及共9000余种具生物活性物质的链霉菌大家族中的一员。其为革兰氏阳性,土壤链霉菌。 用于分类学研究,以及作为异源表达的模式菌株。 属名:Streptomyces 种名:coelicolor 具体用途:分类学研究。 培养基:331 培养温
天蓝色链霉菌的基因特征
天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)基因组,也是迄今最大的微生物基因组的测序工作,该基因组中蕴藏着令人惊奇而又大有前途的基因组特征。科学家们力图将该细菌转化成更佳的药物开发工具。 天蓝色链霉菌是生产三分之二用于医药的天然抗生素以及共9000余种具生物活性物质的链霉菌大
链霉菌属的基本信息介绍
链霉菌属(streptomyces),是最高等的放线菌。有发育良好的分枝菌丝,菌丝无横隔,分化为营养菌丝、气生菌丝、65孢子丝。营养菌丝又名基内菌丝,色浅,较细,具有吸收营养和排泄代谢废物的功能;气生菌丝是颜色较深,直径较粗的分枝菌丝;气生菌丝成熟分化成孢子丝,孢子丝再形成分生孢子。孢子丝和孢子
关于弗氏链霉菌的基本介绍
弗氏链霉菌气丝落英淡粉色或粉色。基丝无色或微黄色。在大部分培养基内无可溶色素。克氏合成1号琼脂:气丝荷花白色。 蔗糖硝酸盐琼脂:基丝麦芽糖黄色。可溶色素无或微黄色。葡糖天冬素琼脂:气丝落英淡粉色。基丝微黄色。高氏合成1号琼脂:气丝荷花白色、浅粉色。基丝淡黄色。淀粉合成琼脂:气丝微白色。基丝无色
海洋天然产物Shishijimicin-A的全合成
近期,美国莱斯大学(Rice University)化学系教授,当今有机全合成大神K. C. Nicolaou在JACS上报道了一种稀有的海洋天然产物Shishijimicin A的第一例全合成,为新型抗癌药物的研发打下了基础。 Shishijimicin A是一种稀有的海洋天然产物,具有极
新机理实现天然产物药物合成效率与产量双突破
链霉菌是生产天然产物药物的重要细胞工厂,超过2/3的抗生素来源于链霉菌。近日,中国农业科学院植物保护研究所微生物天然产物农药创新任务在《国际生物大分子杂志》(International Journal of Biological Macromolecules)上发表研究论文。该研究鉴定了一个保守的全
基于液滴微流控的链霉菌高通量筛选技术平台面世
链霉菌是重要的工业微生物,可以生产蛋白、小分子药物等高附加值产品。工业生产中,常用随机诱变手段产生大量的链霉菌突变库,但缺乏与之相适配的高通量筛选手段用以获得目标突变株。已报道的基于流式细胞分选的方法只能对链霉菌的原生质体或孢子进行筛选,由于抗生素等次级代谢产物多产生于菌丝发酵的平台期,因而原生
发根农杆菌用于生产次生代谢产物
利用植物细胞培养技术生产次生代谢物真正实现商品化生产的还为数甚少,其主要原因在于植物细胞生长缓慢,有些还需要激素维持,次生代谢物含量太低,以及生产能力不稳定等,因而工业化生产的成本太高。发根能合成植物特征的次生代谢产物,而且其含量往往比植物的含量还高,尤其是它的稳定性和生长迅速的特点是工业化生产
藻类及其代谢产物对水质的影响
受城市污水排放和农田径流的影响,大量氮、磷等营养成分排入水体,致使水体富营养化,藻类过量繁殖。特别是我国南方地区的一些湖泊和水库水,由于阳光充足、温度较高,藻类成为主要问题。 水中藻类严重影响给水处理效果,主要表现在以下几方面:藻类一般带负电,具有较高的稳定性,难于混凝;藻类比重小,沉
细菌的分解代谢产物有哪些
细菌除能分解糖和蛋白质外,对一些有机物和无机物也可分解利用。各种细菌产生的酶不同,其代谢的基质不同,代谢的产物也不一样。(1)对其他有机物的分解:如变形杆菌具有尿素酶,可以水解尿素,产生氨。乙型副伤寒沙门菌和变形杆菌都具有脱硫氢基作用,使含硫氨基酸(胱氨酸)分解成氨和H2S。(2)对其他无机物的分解
计算机辅助鉴定药物代谢产物
随着分析仪器的发展,单个代谢样品中即可检测到成千甚至上万个化合物,如此庞大的数据亟需无监督的自动化鉴定过程。计算机的引入有效解决了大数据处理难题,同时加速了无标准谱图化合物的解析过程,在一定程度上实现了药物代谢产物的自动化鉴定。计算机辅助鉴定方法多种多样,根据其工作原理,现分为化学结构数据库基础上的
转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a pl
转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a
链霉菌亮氨酰tRNA合成酶识别两类亮氨酸tRNA的分子机理
国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新研究成果:LeuRS can leucylate type I and type II tRNALeus in Streptomyce
腺嘌呤的合成代谢
腺嘌呤合成代谢包括从头合成途径和补救合成途径。从头合成途径主要在肝脏,以磷酸核糖、天冬氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺、一碳单位为原料。嘌呤核苷酸是在磷酸核糖分子基础上逐步合成的,不是首先单独合成嘌呤碱然后再与磷酸核糖结合的。嘌呤核苷酸的补救合成主要是体内某些组织器官如脑、骨髓等缺乏从头合成嘌呤核苷酸的酶系,
丝氨酸的合成代谢
L-丝氨酸合成代谢,此指大肠杆菌。 起始物葡萄糖经糖酵解(EMP)途径中的3-磷酸甘油酸(3-Phosphoglycerate,3-PG)进入L-丝氨酸分支途径;在L-丝氨酸分支途径中,3-PG经磷酸甘油酸脱氢酶(SerA)催化合成3-磷酸-羟基丙酮酸(3-phosphonooxypyruvate,
单链-cDNA-的合成实验
本方案利用的是总RNA,因为如果使用18SrRNA作内对照,在后续实验中就不能使用带poly(A)的RNA。并且必须用DNA酶处理RNA,以去除所有污染的基因组DNA。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10X
单链-cDNA-的合成实验
一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液(去除 RNA 酶的双蒸水,100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液MMLV 逆转录酶(100~200U/ul)SUPERaseIN
单链-cDNA-的合成实验
实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液(去除 RNA 酶的双蒸水,100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液
转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a pl
Immunity:石榴的代谢产物可增强抗癌能力
结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)是全世界范围内发病率第三的癌症,每年新增发病人数近200万(仅次于乳腺癌和肺癌),每年导致的死亡人数接近100万(仅次于肺癌)。大约每25个人就有1人会在其一生中患上结直肠癌。 而在我国,结直肠癌年发病人数仅次于肝癌,2020年新增56万结
科研人员发布新型代谢产物鉴定工具
近日,中国科学院上海药物研究所与中国科学技术大学杭州高等研究院合作,发布代谢产物鉴定工具DMetFinder。药物及先导化合物在体内外的代谢过程往往十分复杂。传统解析依赖人工经验,耗时费力,还可能遗漏低丰度或非经典代谢物。DMetFinder为这些难题提供了新的解决方案。该工具融合余弦相似度算法、同
细菌代谢产物的观察实验——色素产生试验
实验方法原理有些细菌能产生色素,可作为鉴别某些细菌的根据。实验步骤将金黄色葡萄球菌及绿脓杆菌分别划线接种于琼脂平板上,置37 ℃温箱培养24 小时后,取出观察两菌所产生的色素。金黄色葡萄球菌的色素仅使菌落呈金黄色,属脂溶性色素;绿脓杆菌的色素则弥散至培养基中,使整个培养物呈现绿色,属水溶性色素。
细菌代谢产物的观察实验_糖发酵试验
细菌的代谢产物大致可分为三类:一为可供鉴别细菌的产物;二为与细菌致病性有关的产物;三为可供治疗用的代谢产物。实验方法原理由于各种细菌具有不同的酶,故分解糖类的能力不同,分解糖类后的终末产物亦不一致,例如肠道非致病菌一般均有乳糖酶,能分解乳糖产酸(乳酸,甲酸,乙酸等),尚有甲酸脱氢酶。能将甲酸进一步分