宁波大学SciRep解析癌相关ceRNAs
来自宁波大学医学院的研究人员,针对胃癌中长链非编码RNA(lncRNAs)相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)展开了调查,研究结果发布在8月15日的《Scientific Reports》杂志上。 宁波大学医学院的郭俊明(Junming Guo)教授是这篇论文的通讯作者。郭教授的主要研究方向是肿瘤分子诊断、非编码RNA与肿瘤。 MicroRNAs (miRNAs)在基因表达调控中发挥着重要的作用。每个miRNAs或许都可以抑制多达数百种的转录物,而每一种转录物或许也是多个miRNAs的靶标。它们的调控网络参与了包括发育、癌发生和肿瘤转移等各种生物学过程。 数年前Salmena和同事们提出了一种ceRNA假说。这一假说描述了由miRNAs介导的一个复杂的转录后调控网络:通过共享一个或多个 miRNA反应元件(MREs),一些蛋白质编码RNAs和非编码RNAs竞争结合miR......阅读全文
营养所研究揭示胰岛素转录和分泌调控的新机制
近日,国际期刊Diabetes 在线发表了中科院上海生命科学研究院营养所翟琦巍研究组的研究论文WldS enhances insulin transcription and secretion via a SIRT1-dependent pathway and improves
上海生科院发现转录中介体在表观遗传学调控新功能
生命对遗传密码的解读遵循“中心法则”,首先是细胞能够对基因中的遗传密码进行“阅读理解”,即将DNA分子“转录”产生RNA分子,进而将RNA分子“翻译”为蛋白质,才能实施各种生命活动。在控制基因“转录”的众多因子中,有一种重要的蛋白复合物叫“中介体”。中介体复合物担当了转录因子与基础转录机器之间的
版纳植物园转录调控因子Alfinlike基因家族研究获进展
通过比较基因组学,在基因组层次上研究特定基因家族的进化,进而揭示其变化的原因和机制,已成为目前进化生物学关注的热点问题。中科院西双版纳热带植物园生态进化生物学研究组研究人员利用模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)及其近缘物种琴叶拟南芥(A. lyrata)和小盐芥(Th
中国热科院揭示木薯块根淀粉代谢转录协调调控的分子机制
近日,中国热科院生物所功能基因组与分子育种研究团队在木薯块根淀粉代谢转录协调调控方面取得重要进展。研究结果揭示了碳水化合物相关途径/基因的协调调控对淀粉木薯和糖木薯淀粉积累差异的重要贡献,为薯类作物淀粉遗传改良提供了重要理论支撑。木薯是一种重要的淀粉块根作物,为全球食品和非食品工业提供了重要原材料。
烟草转录调控因子WRKY基因家族基因功能分析取得进展
大量研究工作证实,植物WRKY基因家族的主要生物学功能是调控植物抗病反应及其信号转导途径的建立。WRKY转录调控因子在植物的抗病性方面,如抗病毒、抗细菌、抗机械伤害等方面参与了植物对逆境的应答反应,对高盐、干旱、高温、低温等非生物逆境因子的抗性也具有重要作用,这些对于一生保持原地不
南京大学、北大Cell子刊揭示转录后调控新机制
来自南京大学、北京大学医学部的研究人员证实,在心脏发育过程中RHAU介导了对Nkx2-5的转录后调控。这一研究发现发布在10月15日的《Cell Reports》杂志上。 南京大学的杨中州(Zhongzhou Yang)教授和北京大学医学部的王文恭(Wengong Wang)教授是这篇论文的共
最新进展:胰岛素基因转录调控通路进化取得进展
5月25日,Nature Communications以Evidence from oyster suggests an ancient role for pdx in regulating insulin gene expression in animals为题,在线报道了中国科学院海洋研究所
揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性
文章导读 m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院
中国科学家揭示热纤梭菌转录调控因子新机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510487.shtm
NAT-NEUROSCI转录组+蛋白组联合揭示microRNA调控靶点功能机制
基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时,miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是,miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能,该研究构建了miR-137 KO动物,并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神经功
研究揭示RNA甲基化调控Rloop形成及转录终止机制
R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高
揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所
揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制
结直肠癌是常见恶性肿瘤之一,是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展,但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想,我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。 近年来,随着宏基因组测序等研究手段的不断进展,人们发现肠道菌群能广泛
华南植物园关于植物转录起始调控机制的研究获进展
转录复合体将DNA转录为RNA,是遗传信息由细胞核向细胞质转递的基础。由于核小体与基因组的紧密结合,转录复合体需克服核小体障碍进而确保功能基因的表达。染色质重塑复合体(Chromatin Remodeler)被认为在转录过程中发挥了重要作用。这类蛋白复合体能通过水解ATP来调控核小体的组成和分布
研究发现调控杨树生长发育及耐盐性的转录因子
近日,山西农业大学林学院林木分子遗传育种创新工作室在《经济作物和产品》(Industrial Crops and Products)接连发表了两项研究成果。研究发现,热休克因子PagHSF4和乙烯响应因子ERF194,在介导杨树发育过程、环境胁迫适应等方面发挥着重要作用。 植物由于自身生长的固
长非编码RNA调控炎症小体组装激活研究中取得进展
4月3日,中国科学技术大学教授吴缅研究组在国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上在线发表题为The lncRNA Neat1 promotes activation of inflammasomes in macrophages 的研究论文。 在固有免疫反
曹雪涛团队再发Nature——揭示新型非编码RNA调控网络
先天性免疫反应可保护宿主免受病原体感染,并向病原体施加进化压力,以减弱这些反应并确保其存活和复制的策略。这些不断变化的压力导致了跨宿主-病原体相互作用的先天性免疫稳态的复杂机制,但尚未得到全面了解。尤其是,更好地了解控制宿主与病原体相互作用并促进入侵病原体清除或逃逸的调节剂,可以确定传染病和慢性
“非编码RNA调控作用”重大研究计划2015项目指南
国家自然科学基金委员会现发布重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”2015年度项目指南,请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事项申报。 附件:“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2015年度项目指南 国家自然科学基金委员会
我国学者揭示长链非编码RNA顺式调控基因表达的新模式
国际学术期刊Cell Stem Cell(《细胞·干细胞》)于近日在线发表了清华大学医学院沈晓骅研究组的最新研究成果“Divergent lncRNAs regulate gene expression and lineage differentiation in pluripotent cel
为什么没有任何转录功能的“有义链”却被称为“编码链”?
“有义链”即非模板链,也叫编码链。因为编码链的序列与转录本RNA的序列基本相同,只是编码链上的T在相应转录本上为U,由于转录本RNA编码基因表达的蛋白质产物,DNA的这条链也由此命名为编码链。编码链又称为有义链;模板链又称为反义链。
带你走进神秘的长链非编码RNA
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究
转录中介体调控干细胞不对称分裂和根形态建成的机理
多细胞生物的器官发生和生长发育依赖于干细胞的不对称分裂。与动物干细胞类似,植物干细胞的不对称分裂和特性维持通常由少数几个核心转录因子控制。因此,核心转录因子如何与RNA聚合酶II通用转录机器“密切沟通”从而实现对靶标基因时空特异性表达的精确控制是发育生物学领域的一个重大问题。 在模式植物拟南芥
由染色质调控的基因隐秘转录参与哺乳动物干细胞衰老
细胞老化有其独特而明显的分子表型特征,但其诱导机制尚不完全清楚,基因隐秘转录 (cryptic transcription) 便是其中之一。基因隐秘转录现象是指基因在某些突变体中或应激情况下,开始从本应该被抑制的下游“类启动子 (promoter-like) ”区域起始转录,并产生与基因原功能不
生化与细胞所揭示转录因子KLF4调控早期T细胞分化定向
11月22日,Cell Research在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所刘小龙研究组的研究成果Downregulation of the transcription factor KLF4 is required for the lineage commitment
遗传发育所发现免疫受体蛋白直接参与抗病转录调控新机制
植物受病原菌侵染后的抗病或感病反应往往伴随细胞内转录重编程,但是免疫受体蛋白激活后如何参与细胞的转录调控、通过哪些直接或间接的下游的组分参与转录调控在国际上报道很少。之前的研究表明,大麦白粉病免疫受体蛋白MLA在细胞核内介导抗病反应(Bai et al., 2012,PLoS pathoge
中科院在致瘤疱疹病毒转录调控机理研究中取得进展
2015年5月,中国科学院生物物理研究所邓红雨课题组在病毒学权威期刊Journal of Virology上发表了最新研究报告,报告了其在疱疹病毒MHV-68裂解期“分子开关”蛋白RTA(Replication and Transcription Activator)激活病毒早期基因O
华中科技大学Nature子刊发布转录调控新方法
来自华中科技大学、伊利诺伊大学香槟分校的研究人员证实,通过机械力诱导直接拉伸染色质可上调转录。这项研究发布在8月22日的Nature Materials杂志上。 华中科技大学生命学院的汪宁(Ning Wang)教授,与伊利诺伊大学香槟分校的Andrew S. Belmont是这篇论文的共同通讯
“基因转录中止与蛋白质翻译新调控机制”等2个项目立项
教育部、中科院: 为贯彻落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020年)》的部署,经研究,决定批准国家重大科学研究计划“基因转录中止与蛋白质翻译新调控机制”等2个项目立项。 根据国家科技计划管理的统一安排,这批项目将于2013年7月启动实施。请有关单位按照国家重点基础研
遗传发育所等发现基础转录因子可以特异调控脂类代谢
脂肪是生物体主要的能量储存形式,脂肪能量代谢与多种人类重大疾病(肥胖、糖尿病、癌症等)密切相关。细胞内的脂肪主要储存在脂滴(Lipid Droplet)中。脂滴的大小和动态调控与细胞的功能和代谢状态息息相关。前人的研究在不同模式系统中发现了许多影响脂类储存和脂滴动态变化的分子机制,但是人们对脂类
生物物理所揭示致瘤疱疹病毒转录调控及病毒复制机理
2015年5月,病毒学期刊Journal of Virology 以“亮点文章”形式发表了中国科学院生物物理研究所邓红雨课题组题为Murine Gammaherpesvirus 68 ORF48 Is an RTA-Responsive Gene Product and Functions in