宁波大学SciRep解析癌相关ceRNAs

来自宁波大学医学院的研究人员,针对胃癌中长链非编码RNA(lncRNAs)相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)展开了调查,研究结果发布在8月15日的《Scientific Reports》杂志上。 宁波大学医学院的郭俊明(Junming Guo)教授是这篇论文的通讯作者。郭教授的主要研究方向是肿瘤分子诊断、非编码RNA与肿瘤。 MicroRNAs (miRNAs)在基因表达调控中发挥着重要的作用。每个miRNAs或许都可以抑制多达数百种的转录物,而每一种转录物或许也是多个miRNAs的靶标。它们的调控网络参与了包括发育、癌发生和肿瘤转移等各种生物学过程。 数年前Salmena和同事们提出了一种ceRNA假说。这一假说描述了由miRNAs介导的一个复杂的转录后调控网络:通过共享一个或多个 miRNA反应元件(MREs),一些蛋白质编码RNAs和非编码RNAs竞争结合miR......阅读全文

非编码RNA调控的新的胃癌促癌基因

   近日,重庆医科大学药学院肖斌教授团队与陆军军医大学(原第三军医大学)国家免疫生物制品工程技术研究中心邹全明教授团队在肿瘤学领域权威杂志《Oncogene》(JCR 1区)在线发表了题为“The miR-29c-KIAA1199 axis regulates gastric cancer mig

长链非编码RNAs介导的表观遗传调控基础

  近日,中国科学院昆明动物研究所李家立、胡新天和郑永唐课题组与中国科学技术大学生命科学学院汪香婷课题组、武汉生命之美生物科技公司合作,揭示了长链非编码RNAs在灵长类大脑发育和老化过程中表达动态变化和作用。该研究成果以Annotation and cluster analysis of spati

太赫兹片上可编码超构调控芯片进展

  在国家自然科学基金项目(批准号:61931006、61921002、U20A20212)等资助下,电子科技大学张雅鑫教授团队与中国电子科技集团公司第十三研究所专用集成电路国家级重点实验室冯志红研究员团队合作在太赫兹片上可编码超构调控芯片研究方面取得进展。最新研究成果以“基于多通道微扰场的可编码数

解读重要表观调控因子:保护端粒的非编码RNAs

  在2008年,西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的Maria A. Blasco博士领导的端粒和端粒酶研究组是世上首个发现TERRAs的团队。这是一段非编码端粒RNAs,属于染色质端粒的一部分。从那时起,该团队就致力于研究这些序列有什么作用。  最近他们在《Nature Communicatio

科学家解析致病菌中新型转录调控的分子机制

铜绿假单胞菌是条件性致病菌,危害人类身体健康。近日,在铜绿假单胞菌中报道了一个新型的转录因子SutA(survival under transition A)。SutA对于维持细菌厌氧条件下的基因转录至关重要。SutA突变会造成各种缺陷的表型,例如,生物膜形成能力降低、致病毒力下降等。生化和遗传数据

上海生科院在玉米胚乳储存蛋白基因转录调控中取得进展

  7月29日,《遗传学》(Genetics)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所巫永睿研究组题为Divergent Transactivation of Maize Zein Storage Genes by the Transcription Factors Opaque

转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究

Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a

遗传发育所发现调控拟南芥分枝和种子角果发育的转录因子

  Dof转录因子家族是一类植物特有的转录因子家族,它们参与调控了多种生长发育过程。在以前的研究中发现,大豆GmDOF4和GmDOF11可提高种子的脂肪酸含量并增加种子千粒重。本研究筛选了在拟南芥种子/花中高表达的Dof转录因子AtDOF4.2并进一步研究其功能。   AtDOF4.

增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示

广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作,首次报道了植物中的增强子转录,初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》(Genome Biology)。 增强子是一种40

同济大学康九红:lncRNAs如何精确调控干细胞基因转录

  来自同济大学生命科学与技术学院的研究人员发表了题为 “LincRNA-1614 coordinates Sox2/PRC2 mediated repression of developmental genes in pluripotency maintenance”的研究成果。着重揭示了多能干细

数学院等调控网络数学建模揭示干细胞分化关键转录因子

  近期,国际学术期刊《细胞-干细胞》(Cell Stem Cell)在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学科研人员合作的干细胞分化的基因调控网络建模成果。这一成果提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画转录因子和调控元件结合调控下游基因表达的数学模型,构建了描绘细胞状态转

转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究

  Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a pl

关于真核生物的基因调控—真核基因的转录分类介绍

  几乎所有的真核生物的 mRNA都有一个5′帽端,但并不是所有基因的mRNA都有3′多聚A尾部,也不是所有基因的mRNA都必须经过拼接。根据这后两种加工过程的有无和复杂程度,可将真核基因的转录单位分为两大类型:一类是简单的只编码产生一种蛋白质的基因,另一类是复杂的编码两种或更多种蛋白质的转录单位。

生化与细胞所揭示酵母转录中介复合物调控端粒机制

  真核生物的端粒(Telomere)对于保证染色体正常复制以及维持基因组的稳定性有重要作用,也是研究基因组中异染色质(Heterochromatin)结构的重要模型。   9月19日,Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所周金秋研

版纳园研究揭示转录因子WRKY57调控拟南芥干旱耐受能力

  干旱是限制农作物产量和品质的重要环境因子之一,但是植物对干旱耐受性的潜在分子机制却仍不清楚。据报道,WRKY转录因子在植物适应非生物胁迫过程中起着重要的作用。WRKY蛋白质是一个转录调控因子大家族,在拟南芥中有74个成员,大量研究证实,WRKY基因家族各成员参与调控植物的抗逆反应及其信号转导途径

水稻双重活性转录因子可调控细胞死亡和抗病性

  近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队首次报道植物bZIP类型转录因子APIP5具有结合DNA和RNA的双重活性,在转录和转录后水平调控水稻细胞死亡和防御反应的新机制。研究论文发表于Nucleic Acids Research(《核酸研究》)。  稻瘟菌侵染引起的稻

增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示

广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作,首次报道了植物中的增强子转录,初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》(Genome Biology)。 增强子是一种40

斑马鱼全脑转录图谱揭示神经元表型分子调控规则

  12月13日,eLife在线发表题为The landscape of regulatory genes in brain-wide neuronal phenotypes of a vertebrate brain的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、神经

遗传发育所解析茉莉酸调控植物免疫的转录重编程机理

  茉莉酸是来源于不饱和脂肪酸的植物免疫激素,其生物合成途径和化学结构与高等动物中的免疫激素前列腺素有极高的类似性。在受到机械伤害、咀嚼式昆虫和死体营养型病原菌的侵害时,植物激活茉莉酸信号通路,启动并级联放大茉莉酸介导的转录重编程,从而产生有效的防御反应。但目前对茉莉酸激活植物免疫转录重编程的机理所

m6A修饰新功能——调控染色质状态和转录活性

m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所韩大力和同济

转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究

  Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a pl

遗传发育所解析茉莉酸调控植物免疫的转录重编程机理

  茉莉酸是来源于不饱和脂肪酸的植物免疫激素,其生物合成途径和化学结构与高等动物中的免疫激素前列腺素有极高的类似性。在受到机械伤害、咀嚼式昆虫和死体营养型病原菌的侵害时,植物激活茉莉酸信号通路,启动并级联放大茉莉酸介导的转录重编程,从而产生有效的防御反应。但目前对茉莉酸激活植物免疫转录重编程的机理所

Nature:CRISPRa截然不同的非编码调控序列分析技术

  来自加州大学旧金山分校的一组研究人员修改了现有的基因编辑CRISPR技术,用以来寻找增强子,他们的方法并不是编辑增强子,令其发挥作用,而是利用一种称为CRISPRa(CRISPR activation)的工具,搜寻影响T细胞免疫细胞发育的一种基因的增强子。这项研究发现将有助于解析自身免疫疾病,如

上海药物所发现非编码MiRNA全新分子调控机制

  MicroRNAs(MiRNAs)是近年来RNA生物学领域中的重大发现。它是一类平均长度只有22个核苷酸的小分子非编码RNA。在人类中表达的MiRNA 有一千多种,人体中60%的基因都可能被其调节。MiRNA 对靶基因的调节参与了个体发育、细胞分化与增殖、凋亡等一系列生物学过程,在肿瘤、代谢紊乱

研究发现长非编码RNA调控学习记忆新机制

  4月30日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志以研究论文形式发表了中国科学技术大学刘强研究组题为Activity dependent LoNA Regulates Translation by Coordinating rRNA Transcription and

长非编码RNA调控癌基因MYC表达的综述文章

  8月7日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲受邀在国际学术期刊Current Opinion in Genetics & Development 发表题为The long noncoding RNA regulation at the MYC locus 的综述论

研究揭示RNA甲基化调控Rloop形成及转录终止机制

  R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高

研究发现自然杀伤细胞促进胚胎发育的转录调控新机制

  中国科学技术大学免疫学研究所教授魏海明、傅斌清和田志刚课题组合作研究发现,蜕膜自然杀伤细胞(NK细胞)高表达转录因子PBX1,能够增强生长因子转录,促进胚胎发育;NK 细胞 PBX1 功能异常与不明原因复发性流产病因存在相关性。研究成果于4月1日以PBX1 Expression in Uteri

最新进展:胰岛素基因转录调控通路进化取得进展

  5月25日,Nature Communications以Evidence from oyster suggests an ancient role for pdx in regulating insulin gene expression in animals为题,在线报道了中国科学院海洋研究所

上海生科院发现转录中介体在表观遗传学调控新功能

  生命对遗传密码的解读遵循“中心法则”,首先是细胞能够对基因中的遗传密码进行“阅读理解”,即将DNA分子“转录”产生RNA分子,进而将RNA分子“翻译”为蛋白质,才能实施各种生命活动。在控制基因“转录”的众多因子中,有一种重要的蛋白复合物叫“中介体”。中介体复合物担当了转录因子与基础转录机器之间的