宁波大学SciRep解析癌相关ceRNAs

来自宁波大学医学院的研究人员,针对胃癌中长链非编码RNA(lncRNAs)相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)展开了调查,研究结果发布在8月15日的《Scientific Reports》杂志上。 宁波大学医学院的郭俊明(Junming Guo)教授是这篇论文的通讯作者。郭教授的主要研究方向是肿瘤分子诊断、非编码RNA与肿瘤。 MicroRNAs (miRNAs)在基因表达调控中发挥着重要的作用。每个miRNAs或许都可以抑制多达数百种的转录物,而每一种转录物或许也是多个miRNAs的靶标。它们的调控网络参与了包括发育、癌发生和肿瘤转移等各种生物学过程。 数年前Salmena和同事们提出了一种ceRNA假说。这一假说描述了由miRNAs介导的一个复杂的转录后调控网络:通过共享一个或多个 miRNA反应元件(MREs),一些蛋白质编码RNAs和非编码RNAs竞争结合miR......阅读全文

植生生态所揭示水稻转录因子MADS29调控种子发育的分子机制

  近日,《植物细胞》(The Plant Cell)杂志在线发表了中科院上海生命科学研究院植生生态所植物分子遗传国家重点实验室薛红卫研究组的最新研究成果——转录因子MADS29调控水稻种子发育中母体组织的降解(2012. 10.1105/tpc.111.094854)。 

上海生科院首次揭示一条新lncRNA调控MYC转录的新机制

  3月25日,国际学术期刊《细胞研究》(Cell Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-ran

国农科院烟草所解析果胶质多糖脱甲酯化的转录调控机制

  近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能基因组创新团队在植物细胞壁果胶质甲酯化调控研究中取得新进展,解析了果胶质多糖脱甲酯化的转录调控机制,为果胶去甲酯化的调控机制及种皮粘液质形成的转录调控网络提供了创新性的观点。相关研究成果发表在《植物生理》(Plant Physiology)上。  果胶质多糖

南海海洋所构建马氏珠母贝遗传图谱并发现转录调控因子

  马氏珠母贝是一种具有较大经济价值的海水养殖贝类和生产珍珠的主要母贝,也是国际上研究生物矿化机制的良好实验材料。对马氏珠母贝性状分子遗传基础和重要基因功能进行解析,将有助于推动其遗传改良技术的发展和品种创制。  近日获悉,中国科学院南海海洋研究所何毛贤研究团队利用RAD高通量SNP分型技术,构建了

研究发现转录后剪接特异性调控叶肉细胞光响应及光形态建成

光是重要的环境信号,是植物进行光合作用的能量来源,参与调控植物各个阶段的生长发育过程,如种子萌发、幼苗形态建成、叶片发育、茎的伸长与生长、向光性、气孔与叶绿体运动、开花、昼夜节律及避荫反应等。植物幼苗破土见光后,光信号迅速启动,发生光形态建成,即下胚轴生长受到抑制、子叶张开并变绿以进行光合作用。这是

研究发现调控植物抗铝毒转录因子STOP1稳定性的机制

  12月17日,国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组完成的题为F-box protein RAE1 regulates the stability of the aluminum-res

利用ssDRIPseqRNA揭示甲基化调控Rloop形成及转录终止机制

  R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高

研究人员揭示组织驻留与肿瘤浸润CD8+-T细胞转录调控机制

  2019年9月17日,梅奥诊所(Mayo Clinic)的孙杰团队在Immunity 期刊上发表了题为“The transcription factor Bhlhe40 programs mitochondrial regulation of resident CD8+ T cell fitne

海洋所等在胰岛素基因转录调控通路进化研究中取得进展

  5月25日,Nature Communications以Evidence from oyster suggests an ancient role for pdx in regulating insulin gene expression in animals为题,在线报道了中国科学院海洋研究所

遗传所童依平组|硝酸盐诱导的NAC转录因子调控硝化反应..

遗传所童依平组|硝酸盐诱导的NAC转录因子调控硝化反应增产小麦通告:今日起,原“imOmics精华速递”改版为“旭月活体研究通讯”,简称“旭月通讯”,每周一期。除介绍最新的NMT文献外,还有实验设计、设备操作、数据分析、文章撰写、审稿答疑......更多干货,等你来撩。NISC文献编号:C2015-

研究人员揭示组织驻留与肿瘤浸润CD8+-T细胞转录调控机制

  2019年9月17日,梅奥诊所(Mayo Clinic)的孙杰团队在Immunity 期刊上发表了题为“The transcription factor Bhlhe40 programs mitochondrial regulation of resident CD8+ T cell fitne

揭秘ARF4转录因子的功能,为调控草莓早开花提供思路

  草莓(Fragaria×ananassa Duch.)属于蔷薇科草莓属,是经济价值较高的小浆果。近年来我国草莓生产发展迅速,目前,中国草莓栽培面积和产量均居世界第一。草莓开花的早晚直接影响草莓果实上市时间,较早上市的果实往往具有较高的价格。因此,开花是草莓生产的关键环节,直接影响草莓生产的经济效

中国农科院构建出首个玉米全节间时空特异转录调控网络

CYP90D1(ZmD1)调控玉米节间发育和茎秆长度。中国农科院供图近日,中国农业科学院生物技术研究所玉米功能基因组团队和作物代谢调控与营养强化团队合作研究,构建出首个玉米全节间时空特异转录调控网络,发掘和解析了关键基因CYP90D1调控玉米节间发育的分子机制,揭示了调控玉米节间发育的基因表达新模式

中科院:蛋白质能以“表面活性剂”方式调控基因转录

  4月24日,中国科学院生物物理研究所张宏课题组在Developmental Cell杂志在线发表论文,揭示了转录因子凝聚体界面参与调控下游基因转录起始的过程,并发现细胞内多种蛋白因子能够以协同表面活性剂的方式调控转录因子凝聚体的界面性质及转录活性。  近年来,人们发现在细胞内存在一类无膜细胞器,

发现bHLH121与bHLH-IVc转录因子共同调控植物缺铁响应信号

  铁作为植物生长发育所必需的微量元素之一,在植物的生命活动中发挥了重要的生理功能。铁是过渡态金属离子,通过Fe2+与Fe3+的转换参与电子传递链中的氧化还原反应。铁也是许多酶的辅助因子,参与植物的光合作用、呼吸作用、叶绿素的生物合成、DNA的合成、植物固氮及植物激素合成等过程。植物从土壤中获得矿质

Cell重要发现:调控免疫的lncRNA

  由麻省大学医学院Katherine A. Fitzgerald领导的研究小组证实,一种长链非编码RNA lincRNA-EPS发挥转录刹车作用限制了炎症。这一重要的研究发现发布在6月16日的《细胞》(Cell)杂志上。  细胞类型特异性的调控回路以复杂、动态和短暂调节的方式控制着基因表达。了解这

我国科学家发现长非编码RNA对细胞核仁功能的调控机制

图. SLERT的加工产生以及其与DDX21环、RNA聚合酶Pol I的相互作用机制  在国家自然科学基金重大研究计划项目(项目编号:91440202,91540115)等资助下,中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组取得重要研究进展,揭示了长非编码RNA SLERT 在细胞核仁功能和RN

Cell惊人发现:谁说非编码RNA不编码?

  来自德克萨斯大学西南医学中心的Eric Olson和同事们在分析梳理肌肉特异性的长链非编码RNAs(lncRNAs)以了解它们的功能时,发现了一种在骨骼肌中特异性表达的lncRNA。尽管这一RNA以往被归类为是非编码RNA,它的序列中包含的一小段却看上去好像一个编码区域。这一研究发现发布在《细胞

关于体外转录的转录条件介绍

  转录模板必须满足:  1. 在基因组全长克隆过程中,在正向引物5‘末端添加T7启动子序列;  2. 以T7启动子作为体外转录启动子,在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高;  3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。

利用CRISPR研究基因组“暗物质”

  超过98%的人类基因组由非编码基因组成。这些非编码基因被称为基因组的“暗物质”,它们能调控编码基因的表达,从而影响人类健康和疾病进程。自从人类基因组序列被公开发表以来,科学家们努力解析基因中的功能元件,包括非编码调节区——参与转录调节的顺式调节区和非编码RNA(ncRNA)。转录因子在整个基因组

基因转录因子的相关介绍

  转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点

北林大构建木质素生物合成遗传互作调控网络

  北京林业大学高精尖林木分子育种创新团队开展杨树木质素生物合成通路遗传调控网络的解析工作,通过大规模鉴定木质素合成通路中具有调控作用的小核糖核酸、长链非编码核糖核酸与转录因子,构建了木质素生物合成遗传互作调控网络。研究成果近日发表于《植物生物技术》。  该研究以我国毛白杨优异种质资源群体为材料,利

宁波大学Sci-Rep解析癌相关ceRNAs

  来自宁波大学医学院的研究人员,针对胃癌中长链非编码RNA(lncRNAs)相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)展开了调查,研究结果发布在8月15日的《Scientific Reports》杂志上。  宁波大学医学院的郭俊明(Junming Guo

中国科学家Nature子刊发布lincRNA研究重要发现

  来自香港中文大学、中国科学院广州生物医药与健康研究院的研究人员证实,一种叫做Linc-YY1的lincRNA分子通过与转录因子YY1互作,促进了成肌分化和肌肉再生。这一研究发现发布在12月11日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  香港中文大学的王华婷(Huat

中国学者Cell子刊揭示基因组“暗物质”中环状RNA新分子

  9月27日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表了中科院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物学所杨力组的最新合作研究论文,发现来源于基因内含子区域的环形RNA新分子,揭示其成环机制及在基因转录调控中的重要功能。   众所周知,人类基因组中存在大量被称为基因组

EGR3基因的结构特点及主要作用

该基因编码一个转录调控因子,属于c2h2型锌指蛋白的egr家族。它是一种由有丝分裂刺激诱导的即刻早期生长反应基因。由该基因编码的蛋白质参与了控制生物节律的基因转录调控。它还可能在多种过程中发挥作用,包括肌肉发育、淋巴细胞发育、内皮细胞生长和迁移以及神经元发育选择性剪接导致编码不同亚型的多个转录变体。

陈玲玲课题组等发表长非编码RNA功能及调控机制综述论文

  近期,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员陈玲玲课题组等在Nature Review Molecular Cell Biology上,在线发表了题为Gene regulation by long non-coding RNAs and its biological functions的综述文

中山大学RNA团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库

  中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库,系统鉴定RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。  Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚

中国科大在长链非编码RNA调控肿瘤形成研究中取得进展

  7月1日,中国科学技术大学生命科学学院教授梅一德研究组在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上在线发表题为Long noncoding RNA EMS connects c-Myc to cell cycle control and tumorigenesis的研究论文。  c-Myc作为促癌蛋白

研究揭示轴突富集长非编码RNA调控轴突生长的分子机制

  近期,Cell Reports在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员鲍岚课题组的最新研究进展——Axon-enriched lincRNA ALAE is required for axon elongation via regulation of lo