宁波大学SciRep解析癌相关ceRNAs
来自宁波大学医学院的研究人员,针对胃癌中长链非编码RNA（lncRNAs）相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)展开了调查，研究结果发布在8月15日的《Scientific Reports》杂志上。 宁波大学医学院的郭俊明（Junming Guo）教授是这篇论文的通讯作者。郭教授的主要研究方向是肿瘤分子诊断、非编码RNA与肿瘤。 MicroRNAs (miRNAs)在基因表达调控中发挥着重要的作用。每个miRNAs或许都可以抑制多达数百种的转录物，而每一种转录物或许也是多个miRNAs的靶标。它们的调控网络参与了包括发育、癌发生和肿瘤转移等各种生物学过程。 数年前Salmena和同事们提出了一种ceRNA假说。这一假说描述了由miRNAs介导的一个复杂的转录后调控网络：通过共享一个或多个 miRNA反应元件(MREs),一些蛋白质编码RNAs和非编码RNAs竞争结合miR......阅读全文
Cell:发现长非编码RNA对细胞核仁功能的重要调控机制
5月5日，国际学术期刊《细胞》（Cell）杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新研究成果：SLERT regulates DDX21-rings associated with Pol I transcription，该成果揭示了长非
长非编码RNA的又一重要功能：调控学习记忆
中国科学技术大学的研究人员发表了题为“Activity dependent LoNA Regulates Translation by Coordinating rRNA Transcription and Methylation”，首次发现并命名了长非编码RNA LoNA，揭示了LoNA通过
非编码RNA调控仿刺参肠道再生和皂苷合成研究获进展
非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色，然而在棘皮动物中相关研究较缺乏。中国科学院海洋研究所研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析，揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制，以及它们在海参肠道再生和皂苷合成等生物学过程中的重要作用。相关
非编码RNA调控仿刺参肠道再生和皂苷合成研究获进展
非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色，然而在棘皮动物中相关研究较缺乏。中国科学院海洋研究所研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析，揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制，以及它们在海参肠道再生和皂苷合成等生物学过程中的重要作用。
中科大《PNAS》获长非编码RNA调控肿瘤耐药新发现
11月26日，中国科学技术大学生命科学与医学部、中国科学院天然免疫与慢性疾病重点实验室和合肥微尺度物质科学国家研究中心教授吴缅研究组与澳大利亚纽卡斯尔大学研究员金雷合作，在国际学术期刊《美国国家科学院院刊》（PNAS）上在线发表题为Dual functions for OVAAL in init
清华大学首席科学家Cell－Stem－Cell发布lncRNA重要发现
来自清华大学、中科院动物研究所的研究人员揭示，在多能细胞中Divergent lncRNAs调控了基因表达和谱系分化。这一重要的研究发现发布在3月17日的《细胞干细胞》（Cell Stem Cell）杂志上。 清华大学973项目首席科学家沈晓骅(Xiaohua Shen)是这篇论文的通讯作者。
陈玲玲研究员Cell－Res解析癌相关lncRNA
报道 来自中科院上海生命科学研究院、第二军医大学的研究人员在新研究中证实，人类结直肠癌特异性的CCAT1-L lncRNA调控了MYC基因位点的远程染色质相互作用。这一研究发现在线发表在3月25日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 论文的通讯作者是中科院上海生命科学院
基因表达调控的基本规律是什么
过表达，即表达过度，当基因表达（转录）的严格控制被打乱时，基因可能不恰当被“关闭”，或以高速度进行转录。高速转录导致大量mRNA产生，大量蛋白质（protein）产物出现。在RNA聚合酶的催化下，以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录。在双链DNA中，作为转录模板的链称为模板链或反义链；而不作为转
专家指南：如何研究基因调控（一）
随着基因组学研究的深入，人们已经不再满足于了解基因的功能，而是对基因调控表现出愈加浓厚的兴趣。现在，我们知道，DNA甲基化和组蛋白修饰可调控基因，microRNA和非编码RNA也可以。基因调控的研究工具也越来越多，包括RNA-seq、ChIP-seq、ChIP-chip等。究竟该采用哪种方法来测定m
Nature子刊：四十年前旧假说获得新证
大约四到六百万年前，人类与黑猩猩从进化树上分支开来。科学家们认为，基因调控序列的突变，在这一进化过程中起主要作用。现在，康奈尔大学的一项新研究，为这一理论提供了进一步的证据，文章发表在Nature Genetics杂志上。 人类和黑猩猩的蛋白差异很小，相似度超过99%。大约四十年前，科
操纵子的功能介绍
操纵子包含一个或以上的结构基因,这个结构基因会被转录成为一个多基因性的mRNA。一个单一的mRNA分子会为多于一个蛋白质编码。在结构基因上游的是启动子序列,能给核糖核酸聚合酶(RNA聚合酶)提供结合位点及引发转录。在启动子附近的是一组DNA称为操纵基因。操纵子亦会包含调控基因,如阻遏基因能为调控蛋白
操纵子作为转录的基元介绍
操纵子包含一个或以上的结构基因，这个结构基因会被转录成为一个多基因性的mRNA。一个单一的mRNA分子会为多于一个蛋白质编码。在结构基因上游的是启动子序列，能给核糖核酸聚合酶（RNA聚合酶）提供结合位点及引发转录。在启动子附近的是一组DNA称为操纵基因。操纵子亦会包含调控基因，如阻遏基因能为调控
数学院等在基因调控网络建模研究中获进展
近日，国际学术期刊《美国科学院院刊》（PNAS）在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学、清华大学等单位的科研人员合作的基因调控网络建模的研究成果，提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画顺式调控元件和反式调控元件相互作用的数学模型，将基因调控网络的建模研究从编码基因推进
PNAS:基因调控网络建模研究获进展
近日，国际学术期刊《美国科学院院刊》（PNAS）在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学、清华大学等单位的科研人员合作的基因调控网络建模的研究成果，提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画顺式调控元件和反式调控元件相互作用的数学模型，将基因调控网络的建模研究从编码基因推进
高通量解析骨质疏松非编码易感变异被揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517668.shtm西安交通大学生命科学与技术学院杨铁林教授团队开发了一个增强子调控网络打分方法，鉴定了33个显著富集的转录因子，并发现这些转录因子显著富集到转录激活和骨代谢相关分子通路。近日该研究成果发
PNAS惊人发现：基因转录成双对
DNA转录是指根据DNA模板生成信使RNA用于蛋白质合成的过程。现在Whitehead研究所的科学家发现，编码蛋白的DNA在开始转录时会同时启动一个逆向转录程序，生成相应的长非编码RNA（lncRNA）。而且，在干细胞分化为其他类型细胞的过程中，成对mRNA 和lncRNA的转录是相协调的。这一
真核生物和原核生物的基因结构分别是怎样的
原核与真核生物基因结构都包括编码区和非编码区。但是原核生物的编码区是连续的，全部都可以转录出mRNA,编码出蛋白质。而真核基因的编码区是不连续的，又分为外显子和内含子，外显子能够转录出mRNA,编码出蛋白质，而内含子则不可以。因此真核基因的非编码序列包括非编码区的所有序列以及编码区里面的内含子。另外
PNAS：昼夜节律基因表达
一项研究发现，昼夜节律钟对基因转录的节奏影响可能比此前认为的更加广泛。昼夜节律钟驱动着包括睡眠、体温和激素水平在内的生物过程，研究提示这些过程可能是受到昼夜节律控制的基因转录的调控。 John B. Hogenesch及其同事使用RNA测序以及DNA微阵列确定这种昼夜节律钟调控着小鼠器官的有节
揭示CpG岛结合蛋白BEND3调控分化中二价基因转录的功能
2月10日，中国科学院生物物理研究所朱冰课题组与许瑞明课题组合作，在《科学》（Science）上，在线发表了题为Highly enriched BEND3 prevents bivalent genes from premature activation during differentiati
我国学者揭示调控HIV1的转录与潜伏的宿主蛋白SAFB1
近日，国际学术期刊J Biol Chem在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所王建华课题组研究论文“Scaffold attachment factor B suppresses HIV-1 infection of CD4+ cells by preventing binding of RNA
上海药物所等发现去泛素化酶USP21调控Nanog转录因子机制
Nanog是胚胎干细胞全能性维持和重编程过程中至关重要的核心转录因子。最近的研究提示泛素化修饰系统在干细胞干性维持和分化中有重要作用。Nanog的稳定性的维持同时受泛素化和去泛素化的调控，如泛素连接酶FBXW8可以促进Nanog的泛素化降解进而诱导细胞分化。然而，Nanog的去泛素化酶及其调控机
同济大学教授最新文章：癌症与长链非编码RNA
同济大学生命科学与技术学院的研究人员发表了题为“HULC cooperates with MALAT1 to aggravate liver cancer stem cells growth through telomere repeat-binding factor 2”的文章，长链非编码RNA－
《Cell》：lncRNAs开辟增强子生物学新时代
长链非编码RNAs(long noncoding RNAs ，LncRNAs)是在真核生物中发现的一类长度大于200个核苷酸、没有长阅读框架、但往往具有mRNA结构特征的RNA。LncRNAs在基因组中存在普遍的转录现象，但较之编码蛋白质的基因，往往表达水平比较低。LncRNAs自身的表达水
关于转录因子的转录抑制区的介绍
也是转录因子调控表达的重要位点，但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种：1）与启动子的调控位点结合，阻止其它转录因子的结合；2）作用于其它转录因子，抑制其它因子的作用；3）通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。 转录因子必须在核内作用，才能起到调控表达的目的。因此，转录因子上的核
科学家揭示RNA聚合酶III转录起始动态过程
复旦大学研究员徐彦辉、青年研究员陈曦子团队，重建了人源RNA聚合酶Pol III转录起始的完整动态过程，揭示了转录因子与聚合酶催化活性协同驱动Pol III由转录起始向延伸过渡的分子机制，为理解真核短链非编码RNA合成的调控提供了关键结构基础。6月4日，相关研究发表于《自然》。RNA聚合酶（RNAP
上海生科院发现长非编码RNA对细胞核仁功能重要调控机制
5月5日，国际学术期刊《细胞》（Cell）杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新研究成果：SLERT regulates DDX21-rings associated with Pol I transcription，该成果揭示了长非
eLife：首次发现促癌非编码RNA因子—LAST
中国科学技术大学吴缅教授研究组发现一条受c-Myc转录激活的长非编码RNA。 中国科学技术大学吴缅教授研究组发表了题为“LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA
国际知名学者综述：LncRNA分类
美国St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授，是基因组学与系统生物学领域具有重要国际影响的专家，长期从事系统生物学和基因组功能方面的研究，其发现人类基因组能够产生大量的有功能作用的非编码RNA，在概念层次上重新定义了“基因”，这一发现被Science选为最
关于真核生物的基因调控—DNA重排的介绍
改变基因组中有关基因顺序结构的基因调控方式。哺乳动物的免疫球蛋白的可变区与恒定区的顺序分别由不同的基因片段编码。它们处于同一染色体上但是相距较远，中间还有一些编码连接区的DNA顺序。在产生抗体的浆细胞成熟过程中，这三个序列通过染色体重排而成为一个完整的转录单位。由于可变区基因片段为数众多，而且不
LncRNA：从“转录噪声”到科研高地的逆袭
2002年日本学者Okazaki在对小鼠cDNA文库进行测序时，第一次发现并鉴定了一类较长的转录产物，并将其命名为长链非编码RNA，也就是我们所知的LncRNA。然而在这种非编码RNA被发现后的很长时间里，由于它不参与蛋白质的编码，当时认为不具有生物学功能，科学家们都普遍认为lncRNA仅仅是基