宁波大学SciRep解析癌相关ceRNAs
来自宁波大学医学院的研究人员,针对胃癌中长链非编码RNA（lncRNAs）相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)展开了调查，研究结果发布在8月15日的《Scientific Reports》杂志上。 宁波大学医学院的郭俊明（Junming Guo）教授是这篇论文的通讯作者。郭教授的主要研究方向是肿瘤分子诊断、非编码RNA与肿瘤。 MicroRNAs (miRNAs)在基因表达调控中发挥着重要的作用。每个miRNAs或许都可以抑制多达数百种的转录物，而每一种转录物或许也是多个miRNAs的靶标。它们的调控网络参与了包括发育、癌发生和肿瘤转移等各种生物学过程。 数年前Salmena和同事们提出了一种ceRNA假说。这一假说描述了由miRNAs介导的一个复杂的转录后调控网络：通过共享一个或多个 miRNA反应元件(MREs),一些蛋白质编码RNAs和非编码RNAs竞争结合miR......阅读全文
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究（三）
5. PHB与HIRA复合体共同作用控制着IDH的表达研究者随后探究了PHB，HIRA对IDH-a-KG代谢通路的影响。研究发现，PHB，HIRA缺失导致了IDH表达显著减低，并伴随着细胞内α酮戊二酸的显著降低。而α酮戊二酸对于hESC干性的自我维持具有重要的作用。6. PHB和HIRA共同调控H3
效应性Treg细胞分化的转录调控研究中取得进展
调节性T细胞(Treg)是具有免疫抑制功能的T细胞，其主要的功能是抑制效应T细胞介导的免疫反应及维持机体的免疫耐受。效应性Treg只占次级淋巴器官和外周循环Treg细胞的较少一部分，大多数分布于各种组织脏器，效应性Treg是一群已经接受过抗原刺激、活化程度比较高且具有较强的免疫抑制功能的Treg
转录因子调控番茄碱代谢合成新机制获解析
甾体生物碱（SA）及其糖基化形式（SGA）是广泛存在于茄科植物中一类特殊的代谢产物，对植物病原菌和草食动物具有防御作用。迄今为止，在番茄中检测到近百种甾体类生物碱，其中α-番茄碱（α-tomatine）是茄科植物的叶片、花蕾和果实中最主要的一种SGA。在番茄成熟过程中，有毒的生物碱及其糖基化产物由一
遗传发育所鉴定出小麦穗发育的转录调控因子
小麦是重要的粮食作物之一。小麦的产量主要由亩穗数、千粒重和穗粒数决定。穗型结构影响小麦的小穗数、穗粒数和产量，是育种改良地重要的选择性状。挖掘小麦穗发育重要调控因子与解析分子调控机制，对小麦穗型的分子设计与精准改良、突破产量瓶颈具有重要意义。由于小麦功能基因组学发展较晚，穗发育关键基因挖掘及作用
雄穗和果穗发育提前的转录调控变化获揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/491056.shtm 近日，华南农业大学生命科学学院、岭南现代农业科学与技术广东省实验室王海洋课题组与中国农业科学院生物技术研究所合作，解析了玉米响应模拟密植条件下雄穗和果穗发育提前的转录调控变化，
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究（二）
3. PHB与HIRA复合体相互作用为了研究清楚PHB在hESC中如何发挥作用，研究者采用IP和MS的技术发现除了线粒体的一些相关蛋白外，HIRA也与PHB相互作用。进一步研究发现，PHB结构域介导了PHB与HIRA的结合。由于HIRA复合体的成员还有UBN1和CABIN1，研究者继续研究了PHB
Nature－Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制
m6A是目前已知的真核细胞mRNA上最常见的一类化学修饰，其建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶（writer）、结合蛋白（reader）以及去甲基化酶（eraser）的动态可逆调控。研究表明，m6A能够通过调节mRNA的剪接、出核、稳定性以及翻译等生命周期活动，参与调控机体的诸多生理或病理进程，包
全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制（一）
2月7日，加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序，结合后续的功能机制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制！该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Circ
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究（一）
ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞，在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而，hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚，妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此，对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。研究思路 研究结果
全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制（二）
3. 环状RNA的差异表达与前列腺癌的进展有关研究者对144个前列腺癌进行了聚类分析，与线性RNA相比，环状RNA最强模式与它们在每个样本中的总体丰度相一致。另外，极端circRNA分布的患者的预后明显较circRNA分布稳定的患者差，同时极端circRNA index组也与更高的转移发生率
效应性Treg细胞分化的转录调控研究中取得进展
调节性T细胞(Treg)是具有免疫抑制功能的T细胞，其主要的功能是抑制效应T细胞介导的免疫反应及维持机体的免疫耐受。效应性Treg只占次级淋巴器官和外周循环Treg细胞的较少一部分，大多数分布于各种组织脏器，效应性Treg是一群已经接受过抗原刺激、活化程度比较高且具有较强的免疫抑制功能的Treg
eRNA与Super－Enhancer－RNA在转录调控中扮演的角色
增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件，能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录，产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具
非编码RNA－Nfi调控水稻固氮酶活性
近日，生物所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性，为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。该成果发表在最新一期的经典微生物学杂志《应用环境微生物学（Applied and Environmental Micro
非编码RNA的调控作用研究计划项目指南
基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制重大研究计划2016年度项目指南 非编码RNA是由基因组转录产生的一类不同于mRNA的遗传信息分子。对真核细胞中非编码RNA及其基因的发掘和功能研究，有可能揭示一个由非编码RNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络，从不同于蛋白质编码基因的角度注释和
进化分析揭示编码区和非编码区RNA编辑的功能调控效应
2017年3月，国际知名学术期刊PLOS Genetics在线发表了斯坦福大学Jin Billy Li课题组和中山大学生命科学学院张锐课题组共同研究的题为“Evolutionary analysis reveals regulatory and functional landscape of c
连接非编码突变和肿瘤基因表达的转录组全网络
肿瘤基因组中充满了非编码突变，这些突变对肿瘤的影响研究还不是很清晰。加州大学圣地亚戈分校的科学家Wei Zhang and Ana Bojorquez-Gomez，Trey Ideker，在最近国际顶级期刊Nature Genetics发表文章 A global transcriptiona
转录体分析找到调控神经退化的基因和讯息传递路径
神经元大规模消失是正常神经系统发育中的一个重要过程，然而，神经退化性病变也有相同的特征，例如阿兹海默症，帕金森氏症，亨丁顿氏症和肌萎缩性侧索硬化症等。虽然在不同的神经退化性疾病中，触发这些神经死亡的分子机制是不同的，但这些疾病以及发育性调节神经元死亡所引起的下游神经细胞凋亡过程是共通的。为了理解
杨树次生木质部发育转录调控新机制获揭示
近日，林木遗传育种国家重点实验室（东北林业大学）李伟研究组在《新植物学家》（New Phytologist）上在线发表研究论文。该研究发现了调控杨树次生木质部发育的“PtrMYB074-PtrWRKY19-PtrbHLH186”分子模块，揭示了木材形成过程中转录因子（TF）TF-DNA和TF-TF相
研究揭示转录因子MYC2调控玉米抗虫响应机制
茉莉酸是重要的植物激素，在植物响应昆虫取食的过程中发挥着重要的作用，而MYC2是茉莉酸信号转导途径中关键的转录因子。近日，中国科学院昆明植物研究所研究员吴建强团队通过遗传学、生物化学、分子生物学和生物信息学手段，确定了玉米MYC2在茉莉酸介导的抗虫防御响应过程中的功能。该研究在线发表在《植物学报》。
中科院植物所发现果实成熟的转录后调控机制
日前，中科院植物所研究员田世平小组的一项研究为解析果实成熟和抗病反应的转录后调控机制提供了依据。相关成果在线发表于《基因组生物学》杂志。 研究人员对液泡加工酶编码基因SlVPE3在番茄果实成熟中的功能进行了研究。通过RNAi技术沉默SlVPE3后，发现番茄果实成熟期明显推迟，且果实对病原菌更敏
罗克明等发现调控杨树抗病性关键转录因子
者从中科院西北高原生物研究所获悉，该所研究员罗克明等人与其他单位合作，得到了可显著提高杨树对溃疡病抗性的PtrWRKY89转录因子。该成果近日在线发表于《实验植物学杂志》。 据介绍，WRKY转录因子是一类广泛存在于植物中的转录因子家族，其广泛参与了植物胁迫反应、木质素形成、种子萌发等各种生理过
植物园在淫羊藿类黄酮合成途径的转录调控研究
淫羊藿，作为我国传统中草药之一，已有两千多年的历史，始载于《神农本草经》，具有补肾壮阳、强筋健骨、祛风除湿的功效。研究表明淫羊藿药用植物中的主要活性成分是类黄酮化合物，特别是C8-异戊烯黄酮醇苷类化合物，例如淫羊藿苷、淫羊藿素、朝藿定C等。另外，淫羊藿属植物因其具有奇特的花型、丰富多彩的花色及叶
刘勋成等研究揭示植物光响应基因转录调控机理
近日，中科院华南植物园的一项研究揭示了植物光响应基因转录调控新机理，为农作物高产育种提供了重要的理论基础。相关研究发表在《植物细胞》上。 在高等植物中，光敏色素通过与一类bHLH转录因子——光敏色素互作蛋白(PIFs)相互作用、传递光的信号从而影响植物的生长发育。然而，对光敏色素互作蛋白如
Cell》重磅！全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制！
2月7日，加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序，结合后续的功能机制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制！该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
《Cell》重磅！全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制
2月7日，加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序，结合后续的功能机制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制！该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
非编码RNA调控骨骼肌发育研究取得进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508336.shtm骨骼肌约占成年动物体重的45%～60%，是维持动物运动和代谢功能的重要组织。经济动物骨骼肌纤维的数量和质量直接影响了产肉能力和肉品质，决定了动物的经济价值。动物肌纤维数量在胚胎期基本固
Nature－Med：遗传编码纳米颗粒可远程遥控调控血糖
为了阐明生理活动的过程，时序性调节基因表达和细胞功能的工具是极其珍贵的，甚至具有一定的临床治疗应用前景。最近一篇研究论文报道了一种新型的通过低频无线电波或磁场远程遥控的遗传编码系统。 首先利用绿色荧光蛋白标记的铁蛋白的重链和轻链融合，在细胞胞内部形成以氧化铁为核心的铁蛋白纳米颗粒。那么这个铁蛋
生物所揭示非编码RNA协同调控固氮机制
近日，中国农业科学院生物技术研究所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性，为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。相关研究成果在线发表于《应用环境微生物学（Applied and Environmental Mic
非编码RNA的调控作用机制研究计划项目指南
非编码RNA是由基因组转录产生的一类不同于mRNA的遗传信息分子。对真核细胞中非编码RNA及其基因的发掘和功能研究，有可能揭示一个由非编码RNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络，从不同于蛋白质编码基因的角度注释和阐明基因组的结构与功能，深入阐明生命活动的本质和规律。 一、科学目标 本重大
非编码RNA调控作用机制重大研究计划项目申报
关于发布“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2014年度项目指南的通告 国科金发计〔2014〕59号 国家自然科学基金委员会现发布重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”2014年度项目指南，请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事