《自然.通讯》发表华中农业大学水稻表型组学团对成果

2014年10月8日,《自然•通讯》(Nature Communications)发表了我校作物遗传改良国家重点实验室水稻表型组研究团队和华中科技大学生物医学光子学研究中心最新研究成果,题为“结合高通量表型测量技术和全基因组关联分析技术促进水稻遗传结构解析”(Combining high-throughput phenotyping and genome-wide association studies to reveal natural genetic variation in rice)。我校杨万能副教授、郭子龙博士生、黄成龙老师、段凌凤老师、陈国兴副教授为共同第一作者,熊立仲教授为共同通讯作者。 随着高通量测序技术和植物功能基因组学快速发展,传统的作物表型检测手段已成为植物基础生物学研究包括遗传、生理、基因功能研究等的主要限制因素。为了解决这一瓶颈,本研发团队研制了一种全生育期高通量水稻表型测量平台,可以自动提取水稻......阅读全文

植物表型研究文章TOP10(一)

鸡年接近尾声,各行各业都已经做了各种年度盘点,小编也不能免俗,以影响因子和引用次数为标准,将近五年跟植物表型研究相关的文章,做了盘点,列出了植物表型研究文章的TOP10 ,从微观表型到宏观表型,从实验室表型到田间表型,从基因型到表型,赶紧一睹为快吧。 TOP 10● 植物表型组学数据中动态数量性状位

香港中文大学破解水稻基因G蛋白-提升水稻抗病害能力

  据香港《大公报》报道,稻米也要提升抗逆力,香港中文大学的生命科学学院研究团队,与中国农业大学合作,首次破解水稻基因中“YchF类G蛋白”结构及功能,揭破水稻其中一项抗病害及对抗不良生长环境的能力。领导研究团队的教授林汉明表示,团队将会进一步研究G蛋白的运作机制,希望将有关发现实用化。   中大农

解析OsOR的生物学功能和作用机制

  类胡萝卜素作为植物中重要的色素,是维他命A合成的前体物质,也是某些重要植物激素,如脱落酸(ABA)和独脚金内酯(SL)的前体物质。Orange (Or)基因是在天然突变的菜头呈橘黄色的花椰菜中发现的,其作为调控类胡萝卜素累积的重要因子在双子叶植物中已见报道;然而,对于单子叶植物水稻的OsOR基因

基因检测临床应用中的难题:基因型表型关联重要性

  新一代测序技术的出现,使得基因组数据以及新基因突变的发现呈现爆炸式增长。基因组学研究所面临的挑战不再是单纯的数据产生,而是数据的解读。基因组学的信息如果不能和临床、表型的数据关联,就不能很好地解释复杂的基因变异以及生物学相关问题。  与大多数研究不同,临床表型信息的收集,必须考虑临床医疗环境的约

植物表型研究文章TOP10(三)

TOP 4● 高通量表型和全基因组关联分析:研究揭示水稻的自然遗传变异(Nat Commun,2014)通过使用高通量测序技术对植物基因组学的研究迅速发展,传统的植物表型测试已远远落后。此文的作者开发了一个高通量水稻表型测定设施(HRPF),用于监测水稻生育期的13个传统农艺性状和2个新定义的性状。

聚合基础免疫关键基因和抗病基因,培育水稻新种质

近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队在《科学通报(英文版)》(Science Bulletin)在线发表论文。该研究创新性地将植物基础免疫关键基因和抗病基因进行聚合,培育出广谱抗病水稻新材料,为作物抗病分子育种开辟了新路径。植物基础免疫反应表现对多种病原菌的广谱抗性,

基因融合被证明是水稻新基因产生的重要机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481624.shtm 科技日报讯 (记者赵汉斌)新基因是生物表型进化和物种形成的动力和源泉。记者近日从中国科学院昆明植物研究所获悉,研究人员近期研究发现,基因融合是水稻及其近缘种新基因产生的重要机制,

破译水稻“沉默密码”挖掘育种新潜力

近日,中国农业科学院作物科学研究所野生稻保护与利用创新研究组联合国内外科研团队系统解析了水稻长链非编码RNA的多组学特征与表型效应,揭示了其驱动表型变异与育种潜力。相关研究成果发表在《细胞研究》(Cell Research)上。水稻长链非编码RNA多组学解析与功能验证研究概览。中国农科院供图水稻基因

研究证实无融合生殖杂交水稻的遗传稳定性

  近日,中国水稻研究所基因组编辑及无融合生殖创新团队将无融合生殖杂交水稻材料繁殖至第4代,从植株表型、基因组、甲基化、转录组和亚基因组转录等层面比较了不同世代克隆材料,证实了无融合生殖杂交稻在不同世代间的遗传稳定性,为未来人工无融合生殖体系在作物中应用奠定了理论基础。相关研究成果在线发表在《植物通

打破育种瓶颈,实现优异性状“鱼与熊掌”兼得

水稻育种专家常常会碰到一些头疼的问题:穗子大了穗数变少、能抗病的不高产、高产了不优质……优异性状相生相克,“鱼与熊掌”难以兼得。近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋院士团队揭示了水稻产量核心要素穗重和穗数之间相互制约的分子机制,为突破这一育种瓶颈提供了新的遗传资源与研究思路。相关成果4月21

植物表型分析系统—植物表型的名词解释

  “植物表型是指能够反映植物细胞、组织、器官、植株和群体的结构及功能特征的物理、生理和生化性质,其本质实际是植物基因图谱的时序三维表达及其地域分异特征和代际演进规律”。这是目前所见最精辟的定义。  那么什么是高通量植物表型的?高通量植物表型技术是从器官、个体到群体水平上高通量、自动化获取产量、抗性

遗传发育所开发水稻分子育种整合组学知识库

  10月18日,中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室梁承志研究组开发的分子育种整合组学知识库水稻子库在线发表于学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。文章题目为MBKbase for rice: an integrated omics knowl

Cell:新研究揭示人类5000多个必需基因表型图谱

  在一项新的研究中,来自美国怀特海德研究所和布罗德研究所的研究人员利用一种新颖的、集合的、基于成像的筛选方法系统性地评估了5000多个人类必需基因的功能。  他们的分析利用CRISPR/Cas9来敲除基因活性,并形成了一种首创的资源,能够通过空间和时间分辨率了解和可视化观察基因在一系列细胞过程中的

中国科学家成功克隆水稻增产基因

  中国科学家在新一期英国《自然·遗传学》杂志上报告说,他们成功克隆了一个可帮助水稻增产的关键基因,该基因能使水稻向秆壮穗大的理想株型发展,在高产育种中具有重要应用前景。   中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋院士和中国农业科学院中国水稻研究所钱前研究员等组成的科研团队取得了这一突破性进展。李家

比“滥种”转基因水稻更严重的

  这几年每隔一段时间媒体就会炒作一番湖北“滥种”转基因水稻,这回因为央视号称对此做了调查,号称在武汉超市买到的大米5袋有3袋是抗虫转基因大米,却不告诉观众转基因大米其实是安全的,于是引起社会恐慌。湖北政府也罕见地雷厉风行,销毁了当地10多亩转基因水稻,于是引起更大的社会恐慌。连我一位久不联系的中学

日本研究气象数据如何影响水稻基因

  将气温、降水量等气象数据输入电脑程序,就能推算出水稻稻叶中发挥机能的约1.72万个基因的表达状况,这是日本一个研究小组的最新研究成果。它将有助于人们更有针对性地改良水稻品种。   这是日本农业生物资源研究所等机构进行的一项研究,研究人员选择了日本两种较为常见的水稻品种“日本晴”和“农林8号”,

日研究气象数据如何影响水稻基因

  将气温、降水量等气象数据输入电脑程序,就能推算出水稻稻叶中发挥机能的约1.72万个基因的表达状况,这是日本一个研究小组的最新研究成果。它将有助于人们更有针对性地改良水稻品种。   这是日本农业生物资源研究所等机构进行的一项研究,研究人员选择了日本两种较为常见的水稻品种“日本晴”和“农林8号”,

南方农村报:转基因水稻该不该种

  2009年8月,中国科学院院士、华中农业大学教授张启发牵头研发的“华恢1号”和“Bt汕优63”率先获得我国第一张转基因水稻生物安全证书,让中国转基因水稻商业化种植迈出了关键一步。但今年全国“两会”期间,100多名学者联名上书全国人大,“要求立即停止转基因水稻和玉米商业化生产问题”;随后

Nature:新型转基因水稻既高产又环保

  水稻是全球超过半数人口的主要能量来源,对于人类的粮食安全有着举足轻重的影响。然而,水稻的生长过程每年会释放超过一亿吨甲烷气体,贡献了全球17%的甲烷(温室气体)的释放量。来自中国福建农科院、中国湖南农业大学、瑞典农业大学和美国太平洋西北国家实验室的联合课题组近期在《Nature》刊文称,通过转基

基因新发现让水稻好吃又高产

  我国研究人员近来发现了一个可以同时影响水稻品质和产量的关键功能基因GW8,将它应用到新品种水稻的培育中,有望让水稻变得好吃又高产。相关成果6月24日由英国《自然—遗传学》杂志在线发表。   该成果由中科院遗传与发育生物学研究所研究员傅向东、华南农业大学教授张桂权和中国水稻研究所研究员钱前组成的

袁隆平团队成员回应转基因水稻研究

  日前,有媒体报道“杂交水稻之父”袁隆平在接受采访时称,自己正在将玉米的碳四基因转到水稻上面来,提高光合效率,提高产量;他还认为转基因是今后的发展方向,不能一概而论。这一消息引起社会关注。   1月3日,新华社记者就此采访了袁隆平先生的弟子、杂交水稻国家重点实验室首席科学家邓启云。邓启云表示,由

北大教授用CRISPR技术定点改造水稻基因

  长期以来,科学家们一直想按照人类的设计定点改造特定基因以提高水稻的产量和质量,但定点基因改造技术在水稻等植物中一直没有突破。   CRISPR-Cas 系统定点突变水稻基因   北京大学生命科学学院的瞿礼嘉教授实验室利用最新的CRISPR-Cas系统成功地实现了对水稻特定基因的定点突变,效率

烟草和水稻叶绿体cpDNA基因组成特点

1.基因组由两个反向重复序列(IR)和一个短单拷贝序列(short single copy sequence, SSC)及一个长单拷贝序列(long single copy sequence, LSC)组成;2.IRA和IRB长各10-24Kb,编码相同,方向相反。3.cpDNA启动子和原核生物的相

4个LBD基因控制水稻和小麦生长

长穗偃麦草LBD蛋白质三级结构预测                                        长穗偃麦草LBD基因家族特征结构域   长穗偃麦草LBD保守基序(左)与基因结构(右) 长穗偃麦草LBD基因的共线性分析    图片均由论文作者提供  

发现未知!水稻基因变异的秘密被揭晓!

  5月28日,全球顶尖学术期刊Cell在线发布了我校国家重点实验室、水稻研究所李仕贵与钦鹏教授团队联合中科院遗传与发育生物学研究所梁承志研究员团队完成的题为“Pan-genome analysis of 33 genetically diverse rice accessions reveals

烟草和水稻cpDNA基因组成及特点

烟草和水稻(Oryza sativa)叶绿体全序列分析表明cpDNA基因组成有以下特点:1.基因组由两个反向重复序列(IR)和一个短单拷贝序列(short single copy sequence, SSC)及一个长单拷贝序列(long single copy sequence, LSC)组成;2.

植物表型研究文章TOP10(二)

TOP 7● 动态根系生长和结构在养分限制条件下的反应(Biotechnol. Adv. ,2014)通过简单介绍现有和正在开发的从实验室到田间的根表型定量分析技术,从田间部分根剖面的量化到整个根系的三维重建。 最后,此文讨论这些方法如何能够并且应该与建模紧密相关以探索根本的现象。不同植物根系的量化

周口师范学院从小桐子中克隆出基因提高水稻抗倒伏能力

  近日,周口师范学院河南省作物分子育种与生物反应器重点实验室唐跃辉博士带领团队,从小桐子中克隆获得了影响水稻株高和响应盐胁迫的基因,能够提高水稻抗倒伏的能力。该研究成果在线发表于《植物科学前沿》。  唐跃辉研究团队从小桐子中克隆获得了一个AP2/ERF家族基因,命名为JcDREB2,拟南芥原生质体

新研究可大幅提高杂交水稻全基因组选择预测精度

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505572.shtm水稻是人类重要的粮食作物之一,水稻杂交种的产量高于常规自交系品种,但由于杂交稻存在显性等非加性效应,稻米品质的遗传改良比自交稻更具挑战性。湖南农业大学植物保护学院副教授李兰芝团队联合美

剪接体功能研究取得新突破

在国家自然科学基金等项目的资助下,广东省科学院南繁种业研究所教授王振宇、副研究员顾进宝团队联合海南波莲生物有限公司副研究员安保光,在剪接体功能研究方面取得新突破:基因编辑技术揭示水稻OsSm基因家族的作用。相关成果近日发表于《植物杂志》(The Plant Journal)。水稻SM基因突变体的发育