上海交大破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱

近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破,《Nature Communications》在线发表了由德林教授研究小组的最新进展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences》。 DNA作为生命的遗传物质,是生命科学领域的研究焦点之一。由碳、氢、氧、氮和磷五种元素所构成的四种核苷酸序列编码着自然界生物的遗传现象。对DNA结构和功能的每一次全新认知,都是生命科学发展的里程碑。课题组所属邓子新研究团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰-磷硫酰化修饰。这一现象被国际同行公认为“迄今为止在DNA骨架上发现的第一个天然修饰”,是目前在DNA骨架上发现的第六种元素。多年来,围绕这一现象的探索已逐步形成了一个全新的研究领域,是对DNA......阅读全文

CCDC84的周期性乙酰化修饰以及对中心粒数量的控制

  中心体是动物细胞主要的微管组织中心,该细胞结构由一对中心粒以及包围在其周围的中心粒外周物质组成。在细胞周期运行过程中,中心粒的复制(或组装)只在S期与DNA的复制同步进行,而且在每个已经存在的中心粒的近端只能组装一个子中心粒,但机制尚不明确【1】。中心体的数目或结构异常会影响有丝分裂纺锤体的组装

研究证明增强子活性的维持不依赖H3K27乙酰化修饰

  2月21日,Genome Biology 在线发表了中国科学院生物物理研究所朱冰课题组的研究论文“Histone H3K27 acetylation is dispensable for enhancer activity in mouse embryonic stem cells”。组蛋白H3

DNA修饰ARID2基因信号通路介绍

该基因编码一个富含AT的相互作用域(ARID)的DNA结合蛋白家族成员。 ARID家族的成员在胚胎模式,细胞谱系基因调控,细胞周期控制,转录调控和染色质结构修饰中发挥作用。 该蛋白作为多溴和BRG1相关因子或PBAF(SWI / SNF-B)染色质重塑复合物的亚基,通过核受体促进配体依赖性转录激活。

基因编辑技术成功精确修饰人类T细胞

  美国加州大学旧金山分校的研究小组利用基因编辑技术CRISPR/Cas9精确修饰了人类T细胞。由于T细胞在人体免疫系统中作用十分重要,这一研究成果将为治疗糖尿病、艾滋病及癌症等提供全新的手段。  CRISPR/Cas9是最新出现的一种由RNA指导的Cas9核酸酶对靶向基因进行编辑的技术。新的方法能

DNA修饰SMARCB1基因信号通路介绍

SMARCB1基因编码的蛋白是ATP依赖性染色质调节复合物SWI/SNF的核心亚基,参与基因的表观修饰和转录调控。SMARCB1基因突变与神经鞘瘤的发生相关,其作为抑癌基因可以诱导细胞G1停滞、抑制染色体非整倍性等,发挥肿瘤抑制的作用。

DNA修饰CHD2基因信号通路介绍

CHD家族蛋白的特征是存在染色质(染色质组织修饰剂)结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。

DNA修饰TOP2A基因信号通路介绍

这个基因编码一种DNA拓扑异构酶,这种酶在转录过程中控制和改变DNA的拓扑状态。这种核酶参与诸如染色体凝聚、染色单体分离以及DNA转录和复制过程中发生的扭转应力的减轻等过程。它催化双链DNA的两条链的瞬间断裂和重新结合,使双链彼此穿过,从而改变DNA的拓扑结构。这种酶有两种形式,可能是基因复制事件的

DNA修饰MED12基因信号通路介绍

转录的启动部分受称为预启动复合物的大型蛋白质装配的控制。 这种预启动复合体的一个组成部分是一个称为Mediator的1.2 MDa蛋白聚集体。 该介体组分与包含该基因编码的蛋白质,介体复合物亚基12(MED12)以及MED13,CDK8激酶和细胞周期蛋白C的CDK8亚复合体结合。 和重新激发率。 M

美绘出DNA一修饰因子基因图谱

  据美国物理学家组织网7月21日报道,美国科学家已经首次绘制出了人体胚胎干细胞内一个名为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)的修饰因子的全基因图谱。科学家们表示,5hmC在一些被打开或激活的基因内出现的频率非常高,最新研究将有助于癌症的控制。研究论文发表在最新一期《基因组生物学》杂志上。

DNA修饰MEN1基因信号通路介绍

这个基因编码脑膜,一种与多发性内分泌肿瘤1型综合征相关的假定的肿瘤抑制因子。体外研究表明,脑膜定位于细胞核,具有两种功能性核定位信号,并通过JUND抑制转录激活,但这种蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上检测到两条信息,但未对较大的信息进行描述。选择性剪接导致多个转录变体。

关于组蛋白修饰—基因调控的基本介绍

  基因表达是一个受多因素调控的复杂过程.组蛋白是染色体基本结构-核小体中的重要组成部分,其N-末端氨基酸残基可发生乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、多聚ADP糖基化等多种共价修饰作用.组蛋白的修饰可通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性,从而改变染色质的疏松或凝集状态,或通过影响其它转录因子与结构基因启

DNA修饰EP300基因信号通路介绍

该基因编码腺病毒E1A相关的细胞p300转录辅激活蛋白。作为组蛋白乙酰转移酶,通过染色质重塑调节转录,在细胞增殖和分化过程中起重要作用。通过与磷酸化CREB蛋白特异性结合来介导cAMP基因调控。该基因也被鉴定为HIF1A(缺氧诱导因子1α)的共激活物,因此在缺氧诱导基因如VEGF的刺激中起到作用。这

DNA修饰SMARCD1基因信号通路介绍

该基因编码的蛋白质是SWI / SNF蛋白质家族的成员,其成员具有解旋酶和ATPase活性,被认为可以通过改变那些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。 编码的蛋白质是大型ATP依赖的染色质重塑复合体SNF / SWI的一部分,并且与酵母Swp73蛋白具有序列相似性。 已经发现该基因的两个编码不

DNA修饰EWSR1基因信号通路介绍

该基因编码一种多功能蛋白,参与多种细胞过程,包括基因表达、细胞信号传导、RNA加工和转运。该蛋白包括一个N末端转录激活域和一个C末端RNA结合域。该基因与编码转录因子的各种基因之间的染色体易位导致参与肿瘤发生的嵌合蛋白的产生。这些嵌合蛋白通常由该蛋白的N末端转录激活域与转录因子蛋白的C末端DNA结合

细菌的限制修饰系统包含哪些基因?

细菌的限制修饰系统包含三个连锁基因:(1)hsd R:编码限制性核酸内切酶(2)hsd M:编码限制性甲基化酶(3)hsd S:编码限制性酶和甲基化酶的协同表达

DNA修饰ERCC2基因信号通路介绍

核苷酸切除修复途径是修复DNA损伤的机制。该基因编码的蛋白参与转录偶联核苷酸切除修复,是基础转录因子btf2/tfiih复合物的一个不可分割的成员。该基因产物具有ATP依赖性DNA解旋酶活性,属于解旋酶的RAD3/XPD亚家族。这种基因的缺陷可导致三种不同的疾病,即癌症易发综合征着色性干皮病互补组D

DNA修饰TAF1基因信号通路介绍

rna聚合酶ii启动转录需要70多种多肽的活性。协调这些活动的蛋白质是基础转录因子tfiid,它与核心启动子结合以正确定位聚合酶,充当组装其余转录复合物的支架,并充当调控信号的通道。tfiid由tata结合蛋白(tbp)和一组进化上保守的蛋白质(tbp相关因子或taf)组成。tafs可能参与基础转录

基因修饰让玉米无壳且美味

   本报讯 科学家表示,今天的玉米之所以长成现在的样子是因为该作物的基因发生了一种小变化。大约在距今9000年前,墨西哥人利用野生墨西哥类蜀黍培育出了玉米,那时的玉米粒被一层坚硬的外壳包裹着,使其不适宜人类食用。数十年来,科学家一直在研究野生苞谷如何生长成现在人们食用的玉米。  现在,一项遗传学领

基因修饰让玉米无壳且美味

   科学家表示,今天的玉米之所以长成现在的样子是因为该作物的基因发生了一种小变化。大约在距今9000年前,墨西哥人利用野生墨西哥类蜀黍培育出了玉米,那时的玉米粒被一层坚硬的外壳包裹着,使其不适宜人类食用。数十年来,科学家一直在研究野生苞谷如何生长成现在人们食用的玉米。  现在,一项遗传学领域的新研

m5C-RNA修饰靶基因验证

技术简介 RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络的有力工具。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP-Seq将RIP技

吉林大学Cell子刊发表表观遗传学研究成果

  高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。染色质的结构和动态受到组蛋白表观遗传学修饰的调控,比如最近发现的组蛋白赖氨酸巴豆酰化。这种组蛋白修饰在基因表达、DNA损伤应答等重要的细胞过程中起到了关键性

上海生科院发现组蛋白去乙酰化在小鼠神经诱导中的作用

  4月23日,国际学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组的最新研究成果Histone deacetylation promotes mouse neural induction by restricting N

关于多肽链的一级结构加工修饰介绍

  ⑴N端甲酰蛋氨酸或蛋氨酸的切除:N端甲酰蛋氨酸是多肽链合成的起始氨基酸,必须在多肽链折迭成一定的空间结构之前被切除。  其过程是:  ① 去甲酰化;  ② 去蛋氨酰基。  ⑵氨基酸的修饰:由专一性的酶催化进行修饰,包括糖基化、羟基化、磷酸化、甲酰化等。  ⑶二硫键的形成:由专一性的氧化酶催化,将

许瑞明课题组Nature子刊解析Sir3转录沉默新机制

  8月11日,Nature structural & Molecular Biology 在线发表了中科院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室许瑞明课题组的最新研究成果。该文章题为Nα-acetylated Sir3 stabilizes the conformation of a nu

豆蔻酰化的定义

中文名称豆蔻酰化英文名称myristoylation定  义学名:十四酰化。豆蔻酸作为酰化基团进行的酰化作用。是真核生物蛋白质的一种修饰形式,发生在多肽链N端的甘氨酸残基上。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),脂质(二级学科)

什么是酰化反应

酰化反应或称(酰基化反应),为有机化学中,氢或者其它基团被酰基取代的反应,而提供酰基的化合物,称为酰化剂。 酰化反应可用下列通式表示:RCOZ+SH → RCOS+HZ 通式中RCOZ为酰化剂,Z代表OCOR,OH,ORˊ等;SH为被酰化物,S代表RO 、R″NH、Ar等。

基因沉寂的作用

这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化

基因沉寂的作用

这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化

关于基因沉寂的作用介绍

  这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲

基因沉寂的作用

这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化