NatureMethods:新方法测定基因组中的足印

科学家们发明一种新方法,可以在活体中测量蛋白质在整个线虫基因组中的占有量,新成果发表在日前在线出版的《自然·方法学》期刊上。新技术将提供基因被调控的新细节。 这种方法背后的思想很简单:捆绑着蛋白质的基因组DNA被脱氧核糖核酸屏蔽,脱氧核糖核酸是一种消化DNA的酶,产生出一个完整无缺的DNA片断。在所对应的捆绑区域,这个DNA片断就是蛋白质的足印。这个足印的序列提示出蛋白质的捆绑序列,因此常用于鉴别调控蛋白质。 应用脱氧核糖核酸酶Ⅰ大规模平行测序技术,John Stamatoyannopoulos和同事将这种方法放大,应用于基因组水平。他们系统化地绘制了线虫基因组中的所有足印,并用新的蛋白质模型对这些数据进行分析。结果,他们绘制出在整个线虫DNA中的所有调控蛋白质的复杂地图。 新技术可应用于所有基因组已被测出的有机体,也有助于科学家们深入了解基因组调控的详细方式。......阅读全文

基因测定方法系谱分析法

在早期的人类遗传学研究中,基因所属染色体的测定一般都通过系谱分析进行。由于女子有两个X染色体,男子有一个X染色体和一个Y染色体,Y染色体上不存在和X染色体相应的等位基因(也就是说对于 X连锁基因来讲,男子是半合体)。因此男性患者的X连锁致病基因必然来自母亲,以后又必定传给女儿。这种遗传方式称为交叉遗

基因测定方法系谱分析法

非整倍体测交法可以用来测定基因属于哪一个常染色体。用常染色体隐性突变型纯合体(a/a)和野生型二倍体(+/+)杂交,再用子一代杂合体(a/+)和隐性亲本回交,在它们的子代中表型是野生型的和表型是突变型的各占50%(见孟德尔定律)。杂交 a/a × +/+↓回交 a/+  ×  a/a↓回交子代 a/

拟南芥转基因植株PCs含量的测定

实验概要本实验测定了转基因拟南芥总谷胱甘肽(GSH)含量、非蛋白巯基(NPT)含量。主要试剂200 uM CdSO4,5% sulfosalicylic acid(含6. 3 mM diethylenetriaminepentaacetic acid ),Co-enzyme working

首次测定玉米蛇基因组序列

  在现有的5000种哺乳动物中,有超过100种已经进行了基因组测序,但是,只有9种爬行动物(在10000个物种当中)的基因组对科学界来说是可用的。最近,瑞士日内瓦大学(UNIGE)的一个研究小组,构建了一个大的数据库,其中就包括一种爬行动物——玉米蛇的新基因组测序,这种蛇越来越多地被用来了解爬行动

乙肝HBV基因分型检测定义

乙肝HBV基因分型检测是基因扩增检测实验室(PCR实验室)进行的一项检查,是通过取自患者血液及其他体液、细胞中提取的HBVDNA进行检测的技术。提取出来的HBVDNA经过扩增基因信息后,通过特定设备对乙肝患者细胞中的HBVDNA分字进行分子信息检测,分析它所含有各种基因型的情况,从而使患者了解自己对

北京基因组所等开发通过外周血检测乳腺癌的新方法

  近日,中国科学院北京基因组研究所研究员方向东等在Briefings in Bioinformatics 发表题为Platform-independent approach for cancer detection from gene expression profiles of peripher

两种新方法能增强基因编辑精准度可避免“脱靶效应”

  美国科学家发现,较短的向导核糖核酸和Cas9核酸内切酶二聚体均能提高基因编辑技术精准度,可对基因组进行更加准确的编辑和修饰。相关结果近期发表于《人类基因疗法》杂志上。  多种细菌和古细菌中存在很多成簇的、规律间隔的短回文重复核糖核酸序列(CRISPR)和CRISPR相关基因(Cas genes)

Science:一种能有效区分细胞中新旧基因转录物的新方法

  近日,一项刊登在国际杂志Science上的研究报告中,来自胡布勒支研究所等机构的科学家们通过研究开发了一种新方法,来评估基因转录物的产生和降解是如何被调节的,研究者发现,细胞能利用不同的策略来控制转录物拷贝的数量,其是细胞正常发挥功能不可或缺的。图片来源:Nicolas Battich,Hubr

澳科学用基因组测序技术研究提升牛类健康新方法

  “高大上”的基因测序技术,在实际生产生活中其实也可用于畜牧业——譬如说用来增加牛类的产肉和产奶效率。14日,英国《自然-遗传学》杂志在线发表的一篇论文中,澳大利亚遗传学家们汇报了234头牛的完整DNA序列。这些“调查对象”所具有的品种内部遗传多样性,可以帮助畜牧业更好、更直接地选择健康的牛。  

科学家掌握了识别CRISPR基因编辑造成的靶标外损伤新方法

  自从CRISPR基因组编辑技术问世以来,它已经显示出了治疗许多棘手疾病的巨大希望。然而,科学家们一直在努力确定与治疗有关的细胞类型的潜在非靶向效应,这仍然是临床转化的主要障碍。现在,Gladstone研究所和创新基因组学研究所(IGI)的一组科学家与AstraZeneca合作开发了一种可靠的方法

澳科学用基因组测序技术研究提升牛类健康新方法

  “高大上”的基因测序技术,在实际生产生活中其实也可用于畜牧业——譬如说用来增加牛类的产肉和产奶效率。14日,英国《自然-遗传学》杂志在线发表的一篇论文中,澳大利亚遗传学家们汇报了234头牛的完整DNA序列。这些“调查对象”所具有的品种内部遗传多样性,可以帮助畜牧业更好、更直接地选择健康的牛。  

上海生科院提出高效新方法定位具进化优势的基因突变

  8月18日,国际学术期刊Molecular Biology and Evolution 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所博士生汪敏先的最新研究论文Detecting Recent Positive Selection with High Accuracy and Relia

新方法对人类基因组进行有效地单碱基编辑

  近日,来自格莱斯顿研究院的研究团队开发了一项新技术,可以对人类基因组进行单碱基编辑。这不仅增强了目前在干细胞中模拟疾病的能力,也为基因治疗新途径提供了基础。   相关研究论文发表在《自然方法学》(Nature Methods)上。其中提出如何有效并且精确地捕获罕见致病突变,以及如何修

新方法——让CRISPR基因组编辑技术的准确性提高50倍

  在一项新的研究中,来自美国杜克大学的研究人员开发出一种方法,可将CRISPR基因组编辑技术的准确性平均提高50倍。他们认为它可以很容易地扩展到这种基因编辑技术的不断扩大的其他形式。这种方法给用于识别待编辑的DNA序列的向导RNA(gRNA)添加一条短尾巴。这条增加的尾巴折叠回来进行自我结合,从而

检测谷胱甘肽新方法

谷胱甘肽(glutathiose,r-glutamyl cysteingl +glycine,GSH)是一种含γ-酰胺键和巯基的三肽,由谷氨酸、半胱氨酸及甘氨酸组成。存在于几乎身体的每一个细胞。谷胱甘肽能帮助保持正常的免疫系统的功能,并具有抗氧化作用和整合解毒作用,半胱氨酸上的巯基为其活性基团(

检测谷胱甘肽新方法

  谷胱甘肽(glutathiose,r-glutamyl cysteingl +glycine,GSH)是一种含γ-酰胺键和巯基的三肽,由谷氨酸、半胱氨酸及甘氨酸组成。存在于几乎身体的每一个细胞。谷胱甘肽能帮助保持正常的免疫系统的功能,并具有抗氧化作用和整合解毒作用,半胱氨酸上的巯基为其活性基团(

确定远古物品年龄新方法-白颜料所含碳酸铅年代可测定

  英国《通讯·化学》杂志近日发表一项研究报告称,法国科学家提供了一种新方法,通过直接测定碳酸铅年代,来确定古希腊和古埃及时期物质的年龄。研究人员表示,考古学家或将能借助这一方法,判断远古艺术品和化妆品的年代。  碳酸铅为无机化合物,在自然界中,碳酸铅以白铅矿的形式存在,性状是白色粉末状,斜方晶系,

科学家开发出测定生物学年龄新方法-或能预测健康风险

  人们往往会以不同的方式衰老,近日,一项刊登在国际杂志eLife上的研究报告中,来自瑞典卡罗琳学院的研究人员通过研究开发了一种测定生物年龄的新方法,其或能帮助有效预测个体的健康风险;生物学年龄是科学家们用来预测健康风险的一个指标,通过结合不同的标志物就能增强相关性的研究,特别重要的标志物就是机体的

Cell:科学家们开发出更精准、更高通量的分析基因新方法

  西班牙卡洛斯三世心血管研究中心的科学家找到一个新方法来产生和研究基因嵌合体。在这些基因嵌合体中,相同组织可以含有不同的已知基因型的细胞群,能够允许研究这些基因型在细胞行为中的差异。发表在8月10日Cell上的新方法将允许任何研究人员在脊椎动物模型中诱导多谱系基因嵌合体,如小鼠和斑马鱼。  用多谱

新方法可校正CRISPR筛选的癌症基因依赖性数据中的假阳性

  在一项新的研究中,布罗德癌症依赖性图谱(Broad Cancer Dependency Map)团队将来自342种癌细胞系的基于CRISPR的数据添加到他们不断增加的癌症基因依赖性目录中,并且提供一种新的方法来确保这些数据的准确性。相关研究结果于2017年10月30日在线发表在Nature Ge

科学家建立基于NGS的快速鉴定工业用基因和病原的新方法

   德国弗朗霍夫界面工程与生物技术研究所(IGB)通过采用“下一代测序(Next-Generation Sequencing ,NGS)” 这一DNA高通量测序技术,建立了一种可以快速、准确鉴定工业用微生物基因和病原菌的方法,并在2015年10月 6日-8日汉诺威生物技术展(Biotechnica

Science:一种发现人类基因组中结构变异的新方法

  自从20多年前首次对人类基因组进行测序以来,对人类基因组的研究几乎完全依赖于单一的参考基因组,并与其他基因组进行比较,以确定遗传变异。科学家们早就认识到,单一参考基因组不能代表人类的多样性,而且使用它给这些研究带来普遍的偏差。如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学圣克鲁兹分校和田纳西大学等研究

转基因作物叶片蛋白浓度测定有“妙招”

    随着转基因技术的快速发展,很多转基因产品也迅速进入到人类的生活中。为了维护消费者的食品安全,很多国家都会要求进行转基因作物叶片蛋白浓度测定。目前最常用的方法还属试剂盒法,它能快速提取植物叶片中的转基因成分,整个测定过程只需十分钟左右即可完成,在很多检测机构都非常实用。    很多人可能会觉得

科学家首次完成蜈蚣基因序列测定

  日前,科学家完成了蜈蚣的基因组测序的测定。结果表明,它们的基因数量比人类大约少三分之一。科学家以生活在西北欧沿海的一种常见蜈蚣物种作为测序对象。参与该项研究的106名科学家来自10多个国家和地区。  研究表明,蜈蚣的基因组大小是人类基因组的十分之一,含有的基因数量是人类的三分之二,共1.5万个,

《科学》:衣藻基因组基本测定完成

 通过100余位科学家的努力,衣藻(一种单细胞土生藻类)的基因组已经基本测定完成。在10月12日的《科学》杂志上,研究人员发表了他们对莱氏衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)基因组的分析报告。研究人员在衣藻基因组中发现了动植物早期进化的线索,尤其是在光合作用和鞭毛进化方面。

白菜甘蓝油菜全基因组序列测定

   由中国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目取得阶段性重大成果,获得了白菜全基因组的精细图,甘蓝和油菜全基因组的框架图。   研究表明,白菜、甘蓝和油菜的基因组大小分别约为5亿、6.5亿和11亿个碱基对,白菜和甘蓝含有的基因总数目分别约4.2万和4.5万个,油菜基因覆盖度85%以上。该

一种新方法能在数分钟内测定机体免疫细胞的反应

近日,一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究报告中,来自蒂宾根大学(Universitaet Tübingen)的科学家们通过研究开发了一种简便快速的方法来快速评价T细胞的功能,T细胞是一种能帮助有效抵御外界病原体和肿

地质地球所等测定地质样品SrNd同位素比值新方法

  87Sr/86Sr和143Nd/144Nd比值被广泛应用于地球化学示踪和岩石学研究中。为获取准确的87Sr/86Sr和143Nd/144Nd比值,传统方法需要通过两步离子交换技术分离出纯净的Sr和Nd,再采用热电离质谱仪(TIMS)进行测试。即首先将溶解后的样品溶液通过

蚜虫核基因EF1-alpha基因序列测定及系统发育分析

实验概要核基因含有更加丰富的遗传信息,生物的性状基本上是由核基因决定的,用适当的核基因研究昆虫的系统发育,结果更有可能真实地反映昆虫的进化历史。本研究采用DNA序列分析法,对三种蚜虫的核基因EF-1 alpha进行比较,通过系统发育树分析了它们的系统进化。这一结果结合三种蚜虫的mtDNA的C

Science医学:减肥新方法

  哈佛大学的科学家们有可能为那些努力与肥胖做斗争的人带来新希望   在与麻省总医院的研究人员协作开展的一项新研究中,他们发现小鼠在接受胃旁路手术(gastric bypass surgery)后,肠道微生物发生了显著的改变。将这些微生物转移到无菌小鼠体内可导致它们体重快速减少。这项研究发布在