NatureMethods：新方法测定基因组中的足印
科学家们发明一种新方法，可以在活体中测量蛋白质在整个线虫基因组中的占有量，新成果发表在日前在线出版的《自然·方法学》期刊上。新技术将提供基因被调控的新细节。 这种方法背后的思想很简单：捆绑着蛋白质的基因组DNA被脱氧核糖核酸屏蔽，脱氧核糖核酸是一种消化DNA的酶，产生出一个完整无缺的DNA片断。在所对应的捆绑区域，这个DNA片断就是蛋白质的足印。这个足印的序列提示出蛋白质的捆绑序列，因此常用于鉴别调控蛋白质。 应用脱氧核糖核酸酶Ⅰ大规模平行测序技术，John Stamatoyannopoulos和同事将这种方法放大，应用于基因组水平。他们系统化地绘制了线虫基因组中的所有足印，并用新的蛋白质模型对这些数据进行分析。结果，他们绘制出在整个线虫DNA中的所有调控蛋白质的复杂地图。 新技术可应用于所有基因组已被测出的有机体，也有助于科学家们深入了解基因组调控的详细方式。......阅读全文
Nat－Struct－－Mol－Biol：鉴别出激活肿瘤抑制基因表达的新方法
近日，一项刊登在国际杂志Nature Structural and Molecular Biology上的研究报告中，来自伦敦大学学院的科学家们通过研究发现了一种新方法能重新激活肿瘤抑制基因，相关研究结果有望帮助开发出治疗癌症的新型靶向性疗法。图片来源：National Institutes o
北大魏文胜课题组：提高基因敲除效率的新方法
基因组编辑技术，可让科学家们能够在各种哺乳动物细胞系中实现基因敲除。然而，用一种典型的方法，以一种及时的方式，完全破坏一个靶基因，在技术上是具有挑战性的。为了提高产生可靠基因组修饰的效率，北京大学生命科学学院魏文胜课题组，设计了一种方法，其使用一个线性供体片段，该片段包含一个报告系统。结合一种不
北大魏文胜课题组：提高基因敲除效率的新方法
基因组编辑技术，可让科学家们能够在各种哺乳动物细胞系中实现基因敲除。然而，用一种典型的方法，以一种及时的方式，完全破坏一个靶基因，在技术上是具有挑战性的。为了提高产生可靠基因组修饰的效率，北京大学生命科学学院魏文胜课题组，设计了一种方法，其使用一个线性供体片段，该片段包含一个报告系统。结合一种不依赖
农杆菌瞬时表达CRISPR编辑基因和快速筛选突变植株新方法
最近，美国康涅狄格大学和南京农业大学李义教授团队在Horticulture Research发表了题为“A method for the production and expedient screening of CRISPR/Cas9-mediated non-transgenic mutan
新方法破解高杂合物种单倍型基因组组装难题
近日，南京农业大学梨工程技术研究中心教授张绍铃团队在《基因组研究》在线发表最新研究成果。该研究将单花粉原生质体分离的新方法与单细胞DNA扩增技术相结合，并采用“条形码”生物信息学策略整合了12个花粉细胞的单倍体特征序列数据，从而开发出一种高杂合物种单倍型基因组组装的新方法。 论文通讯作者张绍铃
新方法可实现多环境数据的全基因组关联分析
全基因组关联分析是在自然群体中将标记基因型与复杂性状表型关联以挖掘复杂性状基因的方法，在动物、植物、林木和人类遗传中广泛应用。近日，华中农业大学植物科学技术学院教授章元明团队在植物学领域期刊额《分子植物》（Molecular Plant）上发表了研究论文，报道了全基因组关联分析方法学研究的突破性
农杆菌瞬时表达CRISPR编辑基因和快速筛选突变植株新方法
最近，美国康涅狄格大学和南京农业大学李义教授团队在Horticulture Research发表了题为“A method for the production and expedient screening of CRISPR/Cas9-mediated non-transgenic mutan
农杆菌瞬时表达CRISPR编辑基因和快速筛选突变植株新方法
最近，美国康涅狄格大学和南京农业大学李义教授团队在Horticulture Research发表了题为“A method for the production and expedient screening of CRISPR/Cas9-mediated non-transgenic mutan
基因测定方法连锁群法
利用近着丝粒距离基因的定位法 如果某一染色体上有一个离着丝粒距离较近的已知基因，另外有一个基因同样离着丝粒很近，可是不知道它是否属于同一染色体。把这样两个突变型品系进行杂交，如果这两个基因属于同一染色体，它们之间的重组频率不应超过两者的着丝粒距离之和；如果它们不属于同一染色体，那么它们的重组频率应
基因测定方法假连锁法
相互易位杂合体只有在减数分裂过程中通过交互离开所形成的平衡配子才能够存活，并使非同源染色体上的基因显示假连锁现象（见染色体畸变)。所以把带有属于已知染色体的标记基因的相互易位品系作为测交品系和一个突变型品系杂交，如果发现这一突变基因经常和标记基因的野生型等位基因相连锁，就可以判定突变基因一定在相互易
基因测定的方法同线法
同线法如果一个细胞得到或丢失一条染色体则将同时得到或失去这条染色体上的全部基因。如果其中某些基因是已知的，而另一连锁关系未知的基因恰恰和上述基因同时得到或失去，便可以判定后一基因和前一基因属于同一连锁群（表2)。这一原理曾广泛应用于人的基因定位。仙台病毒或聚乙二醇能促使人的体细胞和啮齿类动物的体细胞
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据，解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一，如PAML等方法，都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展，众多物种的基因组
科学家开发基因组组装质量评估和改进的新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510636.shtm
研究人员提出基因组结构变异检测和分型新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据，解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一，如PAML等方法，都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展，众多物种的基因组
美发明清理DNA新方法－轻松破译古人类基因秘密
一种新技术使破译古人类DNA成本更低 研究者已经从5300年前的人类遗骸“冰人奥茨”身上提取了基因组，还将尼安德特人的DNA进行了测序，至此人们可能会认为已经能够把古人类的整个遗传代码完整地排列出来了。但是，这些研究使用的样本都是“完美的样本”，它们基本上深藏于冻结的土壤、冰雪或寒冷的洞穴中，
Caliper微流体芯片技术成为评估基因组DNA质量的新方法
随着疾病和药物治疗在遗传水平上的研究越来越普遍，高质量基因组DNA的有效性及评估其质量的方法是必不可少的。在一些研究中，比如下一代测序和分子诊断，保证基因组DNA的完整性(有大片段的分布并没有降解)是得到高质量结果的决定性步骤。 目前，琼脂糖凝胶通常被用于直观的分析基因组DNA的质量。这些
测定线粒体基因表达怎么做
亲缘鉴定是否可以用线粒体？首先你要知道什么是线粒体，其次你要了解线粒体是怎么遗传的，应该初中就会讲。那么结论是线粒体用于母系。。。就是外孙女－妈妈－外婆－外婆的妈妈。只要来自同一个母亲就可以用。但是线粒体的检测目前没有一个标准，就是所选取的检测区域存在者争议，所以可以做为一个参考。
基因测定的方法假连锁法
假连锁法相互易位杂合体只有在减数分裂过程中通过交互离开所形成的平衡配子才能够存活，并使非同源染色体上的基因显示假连锁现象（见染色体畸变)。所以把带有属于已知染色体的标记基因的相互易位品系作为测交品系和一个突变型品系杂交，如果发现这一突变基因经常和标记基因的野生型等位基因相连锁，就可以判定突变基因一定
基因测定的方法连锁群法
连锁群法利用近着丝粒距离基因的定位法 如果某一染色体上有一个离着丝粒距离较近的已知基因，另外有一个基因同样离着丝粒很近，可是不知道它是否属于同一染色体。把这样两个突变型品系进行杂交，如果这两个基因属于同一染色体，它们之间的重组频率不应超过两者的着丝粒距离之和；如果它们不属于同一染色体，那么它们的重
《自然》：葡萄基因组测定完成
葡萄成为人类完成基因测序的第一种水果作物和第四种开花植物 一项由法国科学家领导的最新研究捍卫了法国作为“葡萄酒之都”的荣誉，他们完整测定了一种葡萄的基因组。葡萄也由此成为人类完成基因测序的第一种水果作物和第四种开花植物（其它3种分别是小麦、拟南芥和白杨木），这有望加深科学家对开花植物进化过程的理解
基因测定方法直接观察法
易位（见染色体畸变)使染色体上的基因改变连锁关系，所以易位可以用来进行基因定位。如果易位所涉及的染色体是可以被识别的，那就更有利于定位工作。如果在遗传学分析中发现某两个连锁群的连锁关系都发生了改变，同时在显微镜下又可以辨认出有两个染色体发生了相互易位，那么就可以知道两个连锁群和两个染色体的对应关系。
基因测定方法单元化定位法
在构窠曲霉这一类真菌的准性生殖过程中，杂合二倍体细胞在有丝分裂时常随机地丢失它的染色体。染色体在多次有丝分裂过程中逐条丢失而使二倍体细胞终于转变为单倍体细胞的过程称为单元化。如果一对染色体中带有显性的野生型基因的染色体丢失了，那么同源染色体上隐性基因的性状便得以表现。此外，通过体细胞交换也可以从杂合
研究发现锆石水含量和氧同位素同时测定新方法
水是地球演化的重要介质。名义上无水矿物中的水含量对岩石矿物的物理化学性质有深刻影响，是重要的地球化学指标，氧同位素对矿物本身以及水的来源也具有重要指示意义。这两个指标的同时测试，不仅能拓展仪器功能，使大型二次离子质谱（SIMS）仪器的使用效率提升一倍，还可避免因地质样品中广泛存在的不均匀性而导致
山东发布新方法填补国内测定低浓度颗粒物的空白
“《山东省固定污染源废气低浓度颗粒物的测定重量法》（以下简称 《重量法》）的发布实施，填补了国内测定固定污染源废气中颗粒物浓度＜50mg/m3的方法空白，为执行最高允许颗粒物排放浓度限值10 mg/m3以下提供了判别监测方法标准。”山东省环保厅副厅长谢锋告诉记者。 据了解，《重量法》日前已由山
检测谷胱甘肽新方法
谷胱甘肽(glutathiose,r-glutamyl cysteingl +glycine,GSH)是一种含γ-酰胺键和巯基的三肽，由谷氨酸、半胱氨酸及甘氨酸组成。存在于几乎身体的每一个细胞。谷胱甘肽能帮助保持正常的免疫系统的功能，并具有抗氧化作用和整合解毒作用，半胱氨酸上的巯基为其活性基团（
检测谷胱甘肽新方法
谷胱甘肽(glutathiose,r-glutamyl cysteingl +glycine,GSH)是一种含γ-酰胺键和巯基的三肽，由谷氨酸、半胱氨酸及甘氨酸组成。存在于几乎身体的每一个细胞。谷胱甘肽能帮助保持正常的免疫系统的功能，并具有抗氧化作用和整合解毒作用，半胱氨酸上的巯基为其活性基团（
澳科学用基因组测序技术研究提升牛类健康新方法
“高大上”的基因测序技术，在实际生产生活中其实也可用于畜牧业——譬如说用来增加牛类的产肉和产奶效率。14日，英国《自然-遗传学》杂志在线发表的一篇论文中，澳大利亚遗传学家们汇报了234头牛的完整DNA序列。这些“调查对象”所具有的品种内部遗传多样性，可以帮助畜牧业更好、更直接地选择健康的牛。
新方法对人类基因组进行有效地单碱基编辑
近日，来自格莱斯顿研究院的研究团队开发了一项新技术，可以对人类基因组进行单碱基编辑。这不仅增强了目前在干细胞中模拟疾病的能力，也为基因治疗新途径提供了基础。 相关研究论文发表在《自然方法学》(Nature Methods)上。其中提出如何有效并且精确地捕获罕见致病突变，以及如何修
上海生科院提出高效新方法定位具进化优势的基因突变
8月18日，国际学术期刊Molecular Biology and Evolution 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所博士生汪敏先的最新研究论文Detecting Recent Positive Selection with High Accuracy and Relia