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北京基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库

DNA甲基化是一个重要的表观遗传标记,在胚胎早期发育过程中起到至关重要的作用,不同物种所采用的机制亦各不相同。因而,整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功能分析,可帮助更多研究人员深入探析不同物种在早期发育时期的DNA甲基化差异,并揭示其DNA甲基化重编程过程与机制。 中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室章张研究组、刘江研究组以及所级中心信息室组成的开发团队,在研究所高性能计算平台和大数据存储平台的有力支撑下,共同开发完成“基于高通量测序的单碱基精度DNA甲基化重编程数据库MethBank”,该成果于2014年10月在国际生物信息学领域期刊Nucleic Acids Research 在线发表。 MethBank是面向多种模式生物配子和早期胚胎多个不同发育时期的DNA甲基化组重编程数据库,整合的数据包括甲基化水平、差异甲基化区域、CpG岛甲基化水平等,全部是全基因组单碱基精度的D......阅读全文

作物基因组学研究进展

  摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组

多囊卵巢综合征病人基因组的DNA甲基化免疫沉淀反应分析

  多囊卵巢综合征(Polycystic ovary syndrome, PCOS)是一种复杂的、病因不明的疾病,最新研究结果表明,胰岛素耐受(insulin resistance , IR)在PCOS的发生过程中起了重要的作用。本研究主要致力于探究IR在PCOS发生过程中的分子机制,运用基因组DN

多囊卵巢综合征病人基因组的DNA甲基化免疫沉淀反应分析

多囊卵巢综合征(Polycystic ovary syndrome, PCOS)是一种复杂的、病因不明的疾病,最新研究结果表明,胰岛素耐受(insulin resistance , IR)在PCOS的发生过程中起了重要的作用。本研究主要致力于探究IR在PCOS发生过程中的分子机制,运用基因组

多囊卵巢综合征病人基因组DNA甲基化免疫沉淀反应分析

  多囊卵巢综合征(Polycystic ovary syndrome, PCOS)是一种复杂的、病因不明的疾病,最新研究结果表明,胰岛素耐受(insulin resistance , IR)在PCOS的发生过程中起了重要的作用。本研究主要致力于探究IR在PCOS发生过程中的分子机制,运用基

2020年环状RNA高分文章怎么发?

  环状RNA作为最新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,

2020年环状RNA高分文章怎么发?

  环状RNA作为最新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,

刚刚,国家科学技术奖提名工作常见问答

(2019年12月10日制, 2020年1月2日更新)   编制说明:根据近期电话咨询情况,我办对常见问题进行如下解答。解答内容仅供参考,最终解释以文件原文表述内容为准。本问答将根据实际情况不定期更新。2020年度新规定将在文中标注(新)。  本问答转载必须注明转载自国家科学技术奖励工作办公室,否则

一文了解国家科学技术奖提名工作常见问题

  最新发布:国家科学技术奖提名工作常见问答  国家科学技术奖提名工作常见问答  (2019年12月10日制)  编制说明:根据近期电话咨询情况,我办对常见问题进行如下解答。解答内容仅供参考,最终解释以文件原文表述内容为准。本问答将根据实际情况不定期更新。2020年度新规定将在文中标注(新)。  【

你想知道的都在这里!国家科学技术奖提名工作9大类53问

国家科学技术奖提名工作常见问答(2019年12月10日制)  编制说明:根据近期电话咨询情况,我办对常见问题进行如下解答。解答内容仅供参考,最终解释以文件原文表述内容为准。本问答将根据实际情况不定期更新。2020年度新规定将在文中标注(新)。  【有关术语】  (1)专用项目:涉及国防、国家安全等保

蛋白质组学实用分析技术一览

分析其实也属于技术的一部分,且在蛋白质组学研究中显得尤为重要,因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的,而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性,因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。

揭示Y染色体上LncRNA TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移

  前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作为男性发病率第二的癌症,严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控,且目前缺乏相关机制方面的深入研究,治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展,使研究PCa相关分子标志物基因和作用机制成为可能。目前,已有报道指出许多明星Ln

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用

  表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用

  文章导读   表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M

北京基因组所生命与健康大数据研究获进展

  与健康大数据研究成果,包括生命组学数据资源建设成果(D14-20)、实时定量PCR内参基因知识库——ICG(Internal Control Genes;D121-126),甲基化数据库Methbank升级版(D288-295)以及基因组序列变异库——GVM(Genome Variation M

近五年我国近红外光谱分析技术研究与应用进展

  摘 要  评述了近五年来( 2014 ~ 2018) 我国近红外光谱分析技术的研究与应用进展,内容涉及方法研究、软硬件研发、应用特点和趋势等方面,并对今后我国近红外光谱技术的发展方向进行了展望。引用文献97篇。  关键词:  近红外光谱; 化学计量学; 便携式分析; 在线分析;  综述中图分类号

2019年中国学者86篇Cell,Nature及Science文章汇总

  2019年上半年很快就结束了,iNature盘点了中国学者在Cell,Nature及Science发表的成果,我们发现总共有86篇(截至2019年6月24日),具体介绍如下:  4-6月发表的文章  【1】2019年6月21日,西北工业大学王文,中科院昆明动物研究所/BGI 张国捷及丹麦哥本哈根

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

青年长江学者论文“404” 学位论文都删了

  在南京大学社会学院网站上,这位教授的个人成果页面目前只张贴着英文论著目录,没有任何中文论文。这对一位本土的人文社科学者来说,是非常少见的情形。梁莹的一些论文与别人论文存在大面积雷同  但梁莹事实上著述颇丰,仅所能查到的,以她为第一或第二作者的中文文献就超过了120篇。  不过在过去几年里,她的这

青年长江学者论文“404” 学位论文都删了

   在南京大学社会学院网站上,这位教授的个人成果页面目前只张贴着英文论著目录,没有任何中文论文。这对一位本土的人文社科学者来说,是非常少见的情形。  但梁莹事实上著述颇丰,仅中国青年报记者所能查到的,以她为第一或第二作者的中文文献就超过了120篇。  不过在过去几年里,她的这些学术成果陆续被从网上

固相微萃取-质谱法鉴别海南黄花梨木与越南黄花梨木

海南黄花梨(dalbergia odorifera)学名为降香黄檀[1, 2], 原产地中国海南岛吊罗山, 为国家二级保护植物[3], 是一种名贵红木[4, 5], 在观赏、药用和家具制造中具有重要地位[6]。越南黄花梨(dalbergia spp)为黄檀属中的一个树种[7],

我科学家PNAS:测序诊断癌症的强大工具

  最近,来自香港中文大学的研究人员,通过分析血浆DNA中的甲基化序列,能够检测到癌症患 者的肝肿瘤和淋巴瘤,以及孕妇胎盘中的遗传异常。他们使用已知的组织甲基化图谱,能够识别循环DNA的组织起源,从而使其成为一种强大的工具,用于筛选、 癌症检测和治疗监测。这项研究是由几个机构的研究人员合作,由香港中

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析 6

应用WGS正在成为NGS中最广泛的应用。通过该技术并且结合生物学应用,研究人员可以获得基因组信息中最值得注意的信息73。举例来说,2012年,Ellis等报道了基因与乳腺癌患者芳香酶抑制剂(aromatase inhibitor)治疗法之间的关联。他们指出突变,后果与诊断之间的关联,同样还有

微创DNA甲基化检测可有效识别至少四种常见癌

  中美研究人员26日说,DNA甲基化标记作为一种全新的微创检测方式,只需检测少量组织即可获得足量的DNA用于分析,且至少可以有效识别结直肠癌、肺癌、乳腺癌和肝癌四种常见恶性肿瘤。  这项工作由美国加州大学圣迭戈分校张康教授与中国第四军医大学西京医院郝晓柯教授及中山大学徐瑞华教授等人合作完成,相关论

检测DNA甲基化识别四种常见癌

  中美研究人员26日说,DNA甲基化标记作为一种全新的微创检测方式,只需检测少量组织即可获得足量的DNA用于分析,且至少可以有效识别结直肠癌、肺癌、乳腺癌和肝癌4种常见恶性肿瘤。   这项工作由美国加州大学圣迭戈分校张康教授与中国第四军医大学西京医院郝晓柯教授及中山大学徐瑞华教授等人合作完成,相

DNA甲基化:诊断癌症的强大工具

  最近,来自香港中文大学的研究人员,通过分析血浆DNA中的甲基化序列,能够检测到癌症患者的肝肿瘤和淋巴瘤,以及孕妇胎盘中的遗传异常。他们使用已知的组织甲基化图谱,能够识别循环DNA的组织起源,从而使其成为一种强大的工具,用于筛选、癌症检测和治疗监测。这项研究是由几个机构的研究人员合作,由香港中文大

《化学药物亚硝胺类杂质研究技术指导原则》征求意见发布

  近日,FDA 公布了连续三个雷尼替丁的召回公告,亚硝胺杂质问题又推到了风口上。1月10日,国家药监局发布了《化学药物中亚硝胺类杂质研究技术指导原则(征求意见稿)》。  对于亚硝胺类杂质,国家药监局终于发布了相关的技术指导原则征求意见,征求意见对于亚硝胺类杂质的限度,有二种计算方法,并进行了举例:

如何在《Nature》杂志上发表文章

 一、前言   David Swinbanks    我们很高兴地看到,近年来在《Nature》杂志上发表论文的中国研究人员的数量一直在增加。1999年,《Nature》杂志发表了11篇来自中国的论文,其领域包括神经生物学、化学和古生物学等。这一数字几乎是我们1997年发表的来自中国的论文数量的

姚建年院士:中国化学给世界带来诸多惊喜

       国家自然科学基金委员会副主任 中国化学会理事长 中国科学院院士 姚建年  改革开放30年来,与国内各行各业一样,我国的化学科学研究获得了全方位发展,步入了高速发展时期,无论在基础、应用基础研究还是成果转化、实现产业化

ABO联盟第五十期圆桌会议:聚焦临床质谱

  2017年8月18日,由ABO联盟主办,中国医学装备协会临床质谱学组、北京毅新博创生物科技有限公司协办的“2017年北京临床质谱高端论坛-——暨ABO联盟第五十期圆桌会”在北京河南大厦召开。本次会议就临床质谱在微生物鉴定、核酸鉴定、蛋白质鉴定等方面的研究展开了探讨。北京协和医院检验科临床微生物专