OxfordNanopore发布新产品PromethION
Oxford Nanopore似乎与ASHG(美国人类遗传学协会的年会)有着不解之缘。在ASHG 2012上,Oxford Nanopore展示了MinION的真机。在ASHG 2013上,它又宣布启动MinION的早期试用计划。而在今年的ASHG上,Oxford Nanopore揭开了其新产品PromethION的神秘面纱,并宣布了测序仪的一些更新。 PromethION是一款平板电脑大小的台式测序仪,不过要比iPad大一些。这款仪器维持了MinION的简单易用、软件直观和极少样品制备,能够带来低成本、可扩展且长读取的测序,适合那些对流程灵活性有着更好要求的用户。 纳米孔是以模块化的方式排列的,Oxford Nanopore称之为Nanopore cassettes。这些cassettes可根据需要来添加。你可以增加或减少流动槽的数量,而不需要让仪器满负荷地运作,以便维持每个样品的成本。 流动槽设计意味着只需要少量样......阅读全文
英科学家提出可6小时准确识别下呼吸道病原体的新方案
英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。 近日,英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。该优化后的方案针对细菌性下
用纳米孔检测蛋白质获重要突破
对通过纳米孔的DNA进行测序,可提供长的读长,单分子的读数,并且能够避免昂贵的荧光标记和费时的扩增步骤。那么,纳米孔方法能为蛋白质研究做什么呢? 虽然肉眼看不见,但是这种最新的分子生物学技术是强大的。纳米孔的直径约4纳米,是一层人造膜上产生的一个纳米孔,使研究人员能够收集一系列测量,对通过这些
新型碳基平台石墨烯纳米孔设备问世
据物理学家组织网报道,美国宾夕法尼亚大学的研究人员近日开发出一个纳米级的碳基平台,可用于电子探测单个DNA(脱氧核糖核酸)分子。该技术最终有望在快速DNA电子测序方面发挥“用武之地”。相关研究论文发表于最新一期的《纳米快报》。 这个纳米平台由石墨烯制成。研究小组利用电子束技
纳米孔检测法可鉴别单个流感病毒
大阪大学与东京工业大学的一个联合研究小组开发出一种新型单个颗粒检测法,利用纳米孔传感器和AI技术结合,可高精度鉴别出单个流感病毒的类型(A型、B型、A亚型)。 迄今为止鉴别流感类型的方式,是由专业人员目视判断免疫层析检测试剂盒中是否出现标记物。这种方法在病毒数量较少的感染初期很难判断,准确率还
纳米孔技术检测蛋白质获重要突破
对通过纳米孔的DNA进行测序,可提供长的读长,单分子的读数,并且能够避免昂贵的荧光标记和费时的扩增步骤。那么,纳米孔方法能为蛋白质研究做什么呢? 虽然肉眼看不见,但是这种最新的分子生物学技术是强大的。纳米孔的直径约4纳米,是一层人造膜上产生的一个纳米孔,使研究人员能够收集一
JACS-赵东元团队纳米微乳液精确介孔碳球的孔尺寸和架构
尽管介孔碳纳米球具有如此优异特性和应用前景,但其孔隙大小和架构的精确调控非常困难。特别是大孔(>20 nm)介孔碳球的合成具有巨大的挑战性。人们发展了许多方法想实现这一目标。 有代表性的是以大分子量表面活性剂为模板的软模板法(例如PS-b-PS),通过调控表面活性剂疏水段(PS段)的长度来实现
DNA测序技术的现状和发展(八)
虽然这些最初的纳米孔实验并没有获得预期结果,但它们至少显示出纳米孔在单分子技术方面的应用优势,例如高度的敏感性,同时也带动了纳米孔核酸分析技术的研究热潮,并在理论及实验方面取得了一些成果。自从发现在电场力作用下,长达1000个碱基的单链DNA分子也能通过纳米孔之后,人们就更加坚信, 廉价的纳米孔
Oxford-CMI563面铜测厚仪操作指导
CMI563是一种专用的非破坏性铜厚度测试仪。它的设计目的是为了测量铜的厚度。563只由9伏电池供电。当电池电压降至低于操作要求的水平时,就会出现低电池状态。该单元将在显示的右下方显示“BAT”。电池应该用碱性电池代替,然后才能正常工作。 电源开/关在任何时候,只要按下开关键或将探头与样品接触(即测
长读长测序技术:拯救基因组组装项目
随着高精度长读长测序技术的出现,基因组难以组装的状态正在改变。《Nature Methods》杂志上近日发表了一篇文章,介绍了基因组组装项目如何受益于这种技术。 自测序技术问世以来,利用DNA序列的片段来组装人类、动植物或微生物的基因组就一直是难题。许多参考基因组都存在缺陷,如组装错误或存在缺
科研人员提出孔径小于10纳米的固态纳米孔制备新方法
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503646.shtm近日,中国科学院近代物理研究所材料研究中心科研人员与俄罗斯杜布纳联合核子研究所合作,研发了一种孔径小于10纳米的固态纳米孔制备新技术。相关成果发表在《纳米快报》(Nano Letter
金属掺杂的介孔氧化硅纳米药物提出纳米催化医学新策略
介孔氧化硅纳米颗粒(MSNs)具有大的比表面积、高的孔容、均匀可调的孔径、易于化学改性的内外表面及良好的生物相容性,在药物输运、基因治疗、生物传感器、分子影像、组织工程等纳米生物技术领域显示出良好的性能与广阔的应用前景。近年来,介孔氧化硅纳米颗粒被广泛地用作分子药物或功能材料的载体,用于重大疾病
关于三代基因测序,你所需要知道的都在这儿!
一、导读: 在大部分投资者对“二代测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。 6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代
关于三代基因测序,你所需要知道的都在这儿!
一、导读: 在大部分投资者对“二代测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。 6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代
指尖“质谱”:纳米孔技术打造便携肽段质谱仪
质谱仪对蛋白质研究来说可谓是无价之宝,但是它们通常体积庞大,价格昂贵,局限于专门的实验室。当下,生物医学领域的下一个革命直指蛋白质组学——对不同细胞类型中表达的蛋白质进行大规模分析。尽管你的身体里每一个细胞似乎都携带相同的DNA,但不同细胞类型的蛋白质表达差异很大。此外,蛋白质生产出来后会被修饰
本周要闻:Centogene、ARUP实验室、Oxford-Nanopore、GenTegra等新动向
Centogene本周表示,已完成与Lifera(沙特阿拉伯公共投资基金(PIF)全资拥有的生物制药公司)组建合资企业的计划。这项交易最初于六月宣布。这家位于利雅得的合资企业将命名为Lifera Omics,旨在增加沙特阿拉伯和海湾合作委员会国家患者获取基因组和多组学检测的机会。根据协议的条款,Li
长读长测序显优势-基因组复杂结构变异检测实现新突破
基因组结构变异是很多癌症、遗传病等疾病的重要诱因。目前基于二代测序技术检测基因组结构变异存在很大的局限性,而三代测序存在错误率较高等多种问题,尤其针对复杂结构变异大多软件识别能力较差。针对这一问题,近日,在Nature Methods发表的一项最新研究中,研究人员开发了基因组比对工具NGMLR和
纳米孔“ARMA”分析工作流——实时检测抗生素抗性基因
据世界卫生组织报道:“抗微生物药物耐药性(AMR) 是一种全球性的公共卫生危机,将会严重危害现代医学的发展”。纳米孔读长已作为一项独立工具或作为混合测序方法的一部分,成功应用于抗微生物药物耐药性分析,以帮助处理复杂的重复区域。除此之外,我们还开发了能够实时进行微生物鉴定和抗微生物药物耐药性分析的
全球基因组测序市场展望与预测(20212026)
行业洞察 2020 年全球基因组测序市场规模为 29 亿美元,预计到 2026 年将达到 50 亿美元,2021-2026 年的复合年增长率为 9%。 癌症病例的不断增加正在成比例地增加市场上基于测序的诊断和治疗方案的数量。随着制药和生物技术公司对基因组测序表现出浓厚的兴趣,供应商提供了新一代测
一代测序、二代测序及三代测序的应用对比
一、初现庐山真面目 一代测序:又称Sanger测序(多分子,单克隆) 历史:第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年,由Sanger等人开创,并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174),全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用
一代测序、二代测序及三代测序的应用对比
一、初现庐山真面目 一代测序:又称Sanger测序(多分子,单克隆) 历史:第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年,由Sanger等人开创,并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174),全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用
大连化物所纳米孔晶体材料传质研究取得新进展
近日,中国科学院大连化学物理研究所甲醇制烯烃国家工程实验室研究员叶茂、中科院院士刘中民团队在纳米孔晶体材料传质研究中取得新进展。相关工作以通讯的形式发表于《自然》出版集团的新刊《通讯-化学》(Communications Chemistry)上。 纳米孔晶体材料在非均相催化和化学品分离等过程中
美开发出“纳米海绵疫苗”-能大量吸收成孔毒素
据物理学家组织网近日报道,美国加州大学圣地亚哥分校纳米工程师开发出一种“纳米海绵疫苗”,经小鼠实验证明,其能大量吸收耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)产生的成孔毒素——无论在血管还是在皮肤,因此能预防MRSA放出的alpha-溶血素造成的影响恶化,可作为一种安全高效的抗毒素疫苗。相关论文发表在
俄罗斯研发出石墨烯表面纳米微孔成孔技术
俄罗斯国家研究型大学“莫斯科钢铁学院”的研究人员联合国外同行研发出石墨烯薄片表面纳米微孔成孔技术,使纳米微孔的孔径实现技术可控。此项技术的研发成功为石墨烯应用开辟了更广泛的前景。相应成果刊登在“Carbon”学术期刊上。 研究人员首先理论研究了加速离子作用下石墨烯薄片表面纳米微孔成孔机理以及
Dr.-Matthias-Thommes将在复旦举办纳米孔结构分析报告
Dr. Matthias Thommes将在复旦举办纳米孔结构分析专题报告 受中科院院士、复旦大学化学系先进材料实验室主任赵东元教授的邀请,美国康塔仪器公司首席科学家——Dr. Matthias Thommes将举办专题报告 时间:7月28号(周四)下午1:30 地点:复旦大学江湾
两篇PNAS:蛋白纳米孔检测DNA甲基化
两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序,成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 基因组所蕴含的编码信息,包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中,动态的DNA甲基化模式,是基因表达的重要调控者,与细胞分化、胚胎发育和癌症
数十个测序平台技术参数盘点
1.第二代测序技术1.1 Roche 454 测序平台Roche 454(Genome Sequencer 20 System)是第一个NGS测序平台,由美国454 Life Sciences公司于2005年推出,2007年被瑞士Roche公司收购。此后Roche公司在此基础上开发了Roch
基因测序技术发展史
在我心中,近100年生物技术最大的突破就是测序技术,正是由于测序技术的不断进步才使得人类可以破解生命的密码。但是一直以来由于成本较高加之技术复杂,大多数检测实验室始终无法将测序作为常规检测方法。近年来来随着纳米孔测序的兴起,使得大多数实验室使用测序作为常规检测的时代不再遥远!本文将从检测的角度来
三代基因测序融资频爆错误率、成本高制约商用
二代测序还未唱罢,三代测序就已登台。 上周,北京希望组宣布完成由经纬中国和赛富投资领投、清科创投跟投的近亿元人民币A轮融资。12月12日,英国公司Oxford Nanopore Technologies宣布在最近一轮融资中获得了1亿英镑(合计1.26亿美元)融资。 12月13日,第三代基因测
让基因组测序绕过PCR扩增
在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR
让基因组测序绕过PCR
在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-