OxfordNanopore发布新产品PromethION
Oxford Nanopore似乎与ASHG（美国人类遗传学协会的年会）有着不解之缘。在ASHG 2012上，Oxford Nanopore展示了MinION的真机。在ASHG 2013上，它又宣布启动MinION的早期试用计划。而在今年的ASHG上，Oxford Nanopore揭开了其新产品PromethION的神秘面纱，并宣布了测序仪的一些更新。 PromethION是一款平板电脑大小的台式测序仪，不过要比iPad大一些。这款仪器维持了MinION的简单易用、软件直观和极少样品制备，能够带来低成本、可扩展且长读取的测序，适合那些对流程灵活性有着更好要求的用户。 纳米孔是以模块化的方式排列的，Oxford Nanopore称之为Nanopore cassettes。这些cassettes可根据需要来添加。你可以增加或减少流动槽的数量，而不需要让仪器满负荷地运作，以便维持每个样品的成本。 流动槽设计意味着只需要少量样......阅读全文
长读长组装错误更多？两派学者起争论
近日，英国爱丁堡大学的研究人员对三个利用长读长测序技术组装的人类基因组进行分析。他们发现，与短读长组装相比，这些长读长组装的蛋白编码区域含有相当多的错误。他们在《Nature Biotechnology》上发表结果，并建议人们花大力气去解决这些错误。 文章的共同作者Mick Watson和Am
海关总署发布7台测序仪中标公告－看看那些公司中标？
近日，海关总署发布了资装备采购中心2020年海关总署科技司测序仪（第一批）公开招标采购项目中标公告，本次招标预计涉及金额1472万元，涉及7台测序仪，多家仪器公司相继中标。以下为摘要： 一、项目编号：HG20GK-A0000-D035（招标文件编号：HG20GK-A0000-D035） 二、
【罗氏诊断】讲个故事：大Boss的春天在哪里
辉煌过没落了，飘荡着忧伤；虽有希望，但罗氏面前，迷雾重重。 辉煌与没落 2013年10月，罗氏悄悄地启动454 Life Sciences关闭进程：130名雇员的解聘将在2014-2016年内逐步进行，2015年454测序仪生产计划完成后 ... 辉煌过没落了，飘荡着忧伤；虽有希望，但罗氏面前，
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析－4
表一：NGS平台概述。单分子长读长测序（PacBio和ONT）最近这段时间，最常用的长读长测序法平台就是使用PacBio Biosciences（PacBio）57的单分子实时测序法（single-molecule real-time sequencing, SMRT）（图5a）。该设备使用
基因测序“摩尔定律”初现，“三代测序”要革“二代”的命？
在“二代测序”（NGS）尚未迎来投资热潮的情况下，技术突破捷报连连的“三代测序”（3GS）又进入到了投资人的视野中。1986年，第一台商用基因测序设备正式出现，到第二代测序设备出现，期间间隔了19年时间。而第二代设备问世，到第三代设备的诞生，仅仅用了5年，基因测序设备的更新换代速度正在不断加快。
两大牛人携手发布新测序技术
经济高效的单分子测序平台能为人们提供很大的帮助，比如破解完整基因组序列、确定单倍型和鉴定mRNA可变剪接。为此，哥伦比亚大学的车靖岳（Jingyue Ju）和哈佛大学的George Church教授合作开发了基于纳米孔的单分子边合成边测序（SBS）系统。 他们给四种核苷酸分别标记上不同的聚合物
MinION测序仪再次开放试用
英国Oxford Nanopore Technologies公司近日宣布，它重新开放了MinION测序仪的早期试用计划，希望吸纳更多用户来参与。同时，越来越多的计划参与者开始展示和发表他们的结果。 在上周举行的AGBT 2015大会上，英国基因组分析中心和美国冷泉港实验室的研究人员就介绍了利用
牛津纳米孔技术公司CEO卸任
Oxford Nanopore Technologies（ONT），即牛津纳米孔技术公司，近期发布消息称，Gordon Sanghera 已通知董事会，计划辞去首席执行官（CEO）一职并退出董事会。ONT 董事会现已正式启动寻找继任者的工作，旨在带领公司迈向新的增长与商业化阶段。 Gordon
逐步完善糖分子指纹图谱的全方位绘制，有望实现纳米孔糖测序
糖是一类具有重要生物学功能的大分子，具有高度复杂的化学结构。目前，糖的结构解析依赖于传统的色谱法、质谱法和核磁法等结构表征手段。虽然这些方法相对成熟，但存在检测步骤复杂、无法实时动态检测等局限性，无法满足糖基础和应用科研需求。与另一类生物大分子核酸已实现高通量测序相比，糖的结构解析技术滞后。生物
纳米孔测序“僵尸数据”困境破局！复旦大学联合新华医院推出LongBow算法
纳米孔测序技术凭借其长读长、可直接检测碱基修饰以及实时测序等优势，正在深刻改变生命科学与医学研究的格局。然而，在目前公开的超70万组数据中，约85%因缺乏关键元数据——特别是测序芯片类型与碱基识别配置信息——而成为难以有效利用的"僵尸数据"。近日，上海交通大学医学院附属新华医院与复旦大学合作开发的L
洞察科技完成天使轮融资，加速实时检测和基因测序研究
近日，广州洞察科技有限公司（以下简称“洞察科技”）宣布完成数千万元天使轮融资。此次融资由Forcefield Ventures (IMO Ventures)领投，天图资本和雅亿资本等机构跟投，多维资本担任本轮融资独家财务顾问。洞察科技成立于2022年1月，基于固态纳米孔单分子检测技术，自主研发准确、
第三代DNA测序技术
测序技术在近两三年中又有新的里程碑。以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies纳米孔单分子测序技术，被称之为第三代测序技术。与前两代相比，他们最大的特点就是单分子测序，测序过程无需进行PCR扩增。其中PacBio SMRT技术其实也应用了边合成边测序的思想
Nature子刊首次展示掌上测序仪的巨大潜力
纳米孔测序也被称为第三代测序，而Oxford Nanopore公司则是这一领域的先行者。去年11月，该公司启动了掌上测序仪MinION的早期试用计划。这个备受关注的测序仪只有USB大小，可以实现即插即用。 East Anglia大学和Public Health England的研究团队十二月九
DNA测序概念再升级：新方法每秒识别660亿碱基
DNA测序经历了Sanger测序、二代测序（高通量测序）及三代测序（纳米孔测序），日前，美国国家标准与技术研究所（NIST）模拟了一个新型基因测序概念：通过将DNA分子从微小的、具有化学活性的石墨孔洞中拉动，通过测量石墨孔洞边缘产生的电位变化来实现高速、高精度、高效率的DNA测序；研究人员表明，
盘点：2015年那些横空出世的“非典型”测序仪
提及测序仪，那就不得不说Illumina和Thermo两只“大鳄”。这两家公司提供的测序仪占据了绝大部分市场份额。出于应对特殊政策的需要，国内的几家企业也纷纷推出了“自己”的测序仪。放眼国际市场，有一些企业另辟蹊径，研发出别具特色的测序仪，力图从垄断者手中分得一杯羹。小编今天就带大家认识一下这些
Illumina收购PacBio恐受阻！曾提出向三方授权相关知识产权
2018年11月，基因测序巨头Illumina拟对PacBio的12亿美元收购案一度引发全球基因测序行业的广泛关注。通过将Illumina的短读长测序技术和PacBio的长读长测序技术相结合，这项交易势必将进一步巩固Illumina在基因测序领域的优势地位。 但消息发布后，该交易迅速引起了英国
新DNA测序方法每秒识别660亿碱基
美国国家标准与技术研究所（NIST）模拟了一个新型快速测序概念：通过将DNA从超薄的石墨片层结构的孔洞中拉动，通过测量石墨孔洞边缘产生的电位变化，从而实现高速、高精度、高效率的DNA测序，该方法每秒可识别660亿个碱基，准确度为90%且无假阳性。 DNA测序经历了Sanger测序、二代测序（高通
石墨烯上成功制备可控纳米孔
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2017/9/387887.shtm俄罗斯国家研究型工艺大学（NUST MISIS）的专家，与其他国家物理学家组成的国际小组共同开展一系列快重离子辐照石墨烯实验。结果显示，可以通过这种方式在石墨烯上制备直径可控的纳米孔。
Science及Nature共述：口袋里的DNA测序仪，可实时诊断
纳米孔测序的想法起始于25年前， 2012年5月4日《Science》首次报道了Oxford Nanopore公司研制的纳米孔测序仪样机——MinION，用于破译病毒DNA。然而MinION的发展历程并不那么顺利，英国牛津大学基因组学中心基因组学家Rory Bowden说，“众所周知，在每次读取
普译生物完成1.5亿元B轮融资，加速纳米孔测序产品商业化落地
近日，普译生物科技（绍兴）有限公司（原名称：北京普译生物科技有限公司，以下简称“普译生物”）正式宣布完成1.5亿元人民币B轮融资。本轮融资由浙江银河国科消费健康股权投资基金领投，国科创投、中银资本、昌发展集团等机构共同投资，老股东万孚生物、IDG资本持续加码。本轮融资将重点聚焦核心技术迭代、规模化产
4.96亿，华大智造并购+增资关联方－加码时空组学与纳米孔测序双赛道
2月2日，深圳华大智造科技股份有限公司（证券代码：688114，简称“华大智造”）发布公告，宣布拟以现金方式收购关联方深圳华大科技企业管理有限公司（简称“华大科技”）旗下深圳华大三箭齐发科技有限责任公司（简称“三箭齐发”）和杭州华大序风科技有限公司（简称“华大序风”）两家标的公司100%股权，并
OXFORD563涂层测厚仪工作原理
1. OXFORD-563采用微电阻测试技术，提供了测试表面铜厚度（包括覆铜板、化学铜和电镀铜板）的方法。由于采用了目前市场上zui为先进的测试技术，无论绝缘板层多厚，印刷电路板背面铜层不会对可信的测量结果产生影响。2. 创新型的铜箔测厚仪配置探针可由用户自行更换的SRP-4探头。相对于整个探头
5纳米石墨烯纳米孔精确制备技术研究取得进展
日前，中国科学院重庆绿色智能技术研究院精准医疗单分子诊断技术研究中心在5纳米石墨烯纳米孔精确制备技术研究方面取得进展，研究成果以Precise fabrication of a 5nm graphene nanopore with a helium ion microscope forbiomo
【回顾】一代、二代、三代测序技术
第一代测序技术-Sanger链终止法 一代测序技术是20世纪70年代中期由Fred Sanger及其同事首先发明。其基本原理是，聚丙烯酰胺凝胶电泳能够把长度只差一个核苷酸的单链DNA分子区分开来。一代测序实验的起始材料是均一的单链DNA分子。第一步是短寡聚核苷酸在每个分子的相同位置上退火，然后
U盘大小的DNA测序仪证实可用于检测病原体
由华大基因和生物医学中心（BioMed Central）联合创办的大数据期刊《GigaScience》3月26日报道了掌上手持型DNA测序仪的最新成果，这种测序仪可以在短短6个小时时间里区分细菌和病毒的种类。 去年，由英国Oxford Nanopore公司开发的，仅4英寸长、普通U盘大小Min
Nature－Methods：潜力惊人的掌上测序仪
来自加拿大和英国的研究人员采用牛津纳米孔公司（Oxford Nanopore）的掌上基因组测序仪MinIONTM，首次测序和从头组装了活体生物——大肠杆菌的全基因组。 研究的主要作者、安大略癌症研究所课题负责人Jared Simpson博士说，发表在《自然方法》（Nature Methods）
第三代基因测序技术
问题一：第三代测序技术的第三代测序技术原理 第三代测序技术原理主要分为两大技术阵营：第一大阵营是单分子荧光测序，代表性的技术为美国螺旋生物(Helicos)的SMS技术和美国太平洋生物(Pacific Bioscience)的SMRT技术。脱氧核苷酸用荧光标记，显微镜可以实时记录荧光的强度变化。当荧
纳米孔可成为DNA快速阅读器
据《每日科学》近日报道，由美国华盛顿大学物理学家领导的研究小组设计了一种新技术，可在纳米孔内对DNA进行快速测序，而且价格比较便宜。新方法可为癌症、糖尿病或某些成瘾患者量身绘制个性化基因测序蓝图，提供更加高效的个体医疗。 论文主要作者、华盛顿大学物理教授简斯·冈德拉克表示，
纳米孔尺度对DNA输运速度的影响
图一：实验示意图 图二：分子动力学仿真模型示意图 基于纳米孔单分子传感器的第三代DNA测序技术，因其低成本，高通量等优势很有可能成为人类测序史上的创举。最近的一项研究发现，DNA在穿过10.8纳米的纳米孔道时的速度比穿过4.8纳米的纳米孔的速度降低了一倍，这对于实现DNA减速及单碱基精准测序
利用纳米孔强化金属－强度获得大幅提升
记者8月11日从中国科学院金属研究所沈阳材料科学国家研究中心获悉，该中心金海军研究员团队提出，如果细化至百纳米以下并弥散分布于材料中，孔洞将从有害材料缺陷转变为有益的“强化相”。该团队以金为模型材料，在研究中发现，添加弥散纳米孔在不损失甚至提高塑性的同时，可有效降低材料密度并大幅提升其强度。相关研究