长读长组装错误更多?两派学者起争论

近日,英国爱丁堡大学的研究人员对三个利用长读长测序技术组装的人类基因组进行分析。他们发现,与短读长组装相比,这些长读长组装的蛋白编码区域含有相当多的错误。他们在《Nature Biotechnology》上发表结果,并建议人们花大力气去解决这些错误。 文章的共同作者Mick Watson和Amanda Warr表示:“对于那些准备利用单分子技术来测序基因组以及希望在临床实践中使用长读长技术的研究人员来说,这些结果可能具有警示作用。” 然而,参与长读长组装的研究小组之一在同期杂志上进行了回应,对这些结果提出了质疑。他们认为,新的生物信息学工具已经改善了纳米孔组装,并且“算法和技术的进一步改进将能够从Oxford Nanopore和PacBio数据中获得参考级的一致序列”。 在这项研究中,Watson和Warr对五个已发表的人类基因组组装进行比较。其中两个是只利用PacBio序列组装的(2015年和2017年),一个是利用......阅读全文

复制错误的概念

中文名称复制错误英文名称replication error定  义DNA复制过程中核苷酸配对发生错误的现象。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

移液器操作的常见错误

,装吸头。在移液器使用频繁的实验室里,常常可以听到敲击吸头的声音此起彼伏,颇有为枯燥的实验室生活增添点音乐的味道。走进细看,原来是使用者怕吸头不能装紧,在吸头装到移液器上之后,在吸头盒里再敲击几次,希望通过这种冲击力来保证移液的密封性。那这种操作错在哪里呢?其一,在撞击的作用下,吸头可能会变形而影响

检验标本取样错误举例

1.溶血和凝血。太常见了,不说也罢。   2.静脉采血不当至血液淤滞。这样血浆中的水和无机小分子会扩散到组织间隙中,致使血浆大分子成分和血细胞浓缩,其中血清Ca常与蛋白复络合,因此Ca也可以偏高。  3.处理方式不当。对于不同的项目,根据不同的特点,在采血时要考虑更恰当的处理,这点国内做得都不太好。

血型报告错误原因探析

  正确的ABO血型鉴定,是临床安全的关键。而错误血型的一旦输入,则直接危及患者的生命。笔者回顾性分析多年工作中所观察的32例造成ABO血型定型错误的原因与结果,现报告如下。   1 血型报告错误的原因   1.1 血型测定的错误 血型检测时因患者红细胞悬液浓度过低或离心时间太短(未做反定型检测),

移液器操作的常见错误

移液器的操作(一)常见错误以前在网上写“移液器的选择”时,也写过“移液器的操作”,并且还有幸被引用过几次。当然,在网上也有不止一个人写过类似的东东。但使用者是否都很重视这个问题呢?很遗憾答案是否定的。相当多的人认为移液器是很简单的仪器,其操作也很简单,没必要费口舌,更无需上什么培训课。事实上呢?良好

细胞化学词汇复制错误

中文名称:复制错误英文名称:replication error定  义:DNA复制过程中核苷酸配对发生错误的现象。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

服用毓婷常见的错误

  毓婷紧急避孕药的上市,既弥补了我国常规避孕措施所不及的缺陷,也为广大育龄女性提供了一种方便有效的应急措施。但是,由于部分服药者对毓婷及紧急避孕知识了解不足,出现了一些错误的服药方法,从而直接影响了毓婷的药效,导致紧急避孕失败。    一、 服药期间未禁同房    毓婷紧急避孕药首次服药与第二次服

移液器的错误方法

移液器的错误方法1)吸液时,移液器本身倾斜,导致移液不准确(应该垂直吸液,慢吸慢放)。2)装配吸头时,用力过猛,导致吸头难以脱卸(无需用力过猛,选择与移液器匹配的吸头)。3)平放带有残余液体吸头的移液器(应将移液器挂在移液器架上)。4)用大量程的移液器移取小体积样品(应该选择合适量程范围的移液器)。

标本采集常见错误分析

  送检标本的质量控制包括分析前、分析中、分析后三个主要过程的质量管理。大多数不满意的检验报告单可溯源到标本质量不符合要求,而分析前标本的质量控制对检验结果的可靠性有至关重要的影响,标本采集是影响标本质量最重要的因素之一。我们在加强与临床、护理沟通的同时,坚持标本的核实验收和不合格标本退回制

乙肝常见错误解读

 乙肝五项(也称为“两对半”)是临床常见的化验项目,目前已作为常规的体检项目,几乎在所有级别的医院均可开展,在各种体检中一般均包括此种项目,但由于对乙肝五项的解读需要一定的专业知识,在临床工作中,不但很多普通百姓或患者会对自己的乙肝五项结果产生误解,甚至很多非肝病专业的医生也会对患者给出错误解释,这

发现自己论文的错误怎么办?那就指出自己的错误!

摘要:同一个实验室,如果发现别人的不端行为是否要举报?吹嘘和造假的界限究竟在哪里?     在申请博士后研究经费时,维杰把一篇“正在进行”的论文列为了“已送审”,后来他被解雇,这种惩罚过于苛刻吗?二年级研究生艾伦有了一个令人兴奋

京华时报:想保全声誉-金浩不该用错误掩盖错误

  金浩用N个错误掩盖一个错误,无非是想保全企业声誉,以能够继续从公众身上获取利润,但如此做法,又把关系公众健康的饮食安全问题将置于何处?洞穿这一切后的公众,怎能对视公众健康如无物的企业保持认可?又怎能对截至目前仍未作出回应和解释的当地质监部门保持信任?  

探析血型报告的错误原因

  正确的ABO血型鉴定,是临床安全输血的关键。而错误血型的血液一旦输入,则直接危及患者的生命。笔者回顾性分析多年工作中所观察的32例造成ABO血型定型错误的原因与结果,现报告如下。         1 血型报告错误的原因         1.1 血型测定的错误 血型检测时因患者红细胞悬液浓度过低或

“记忆错误”:来自午睡的恶作剧

  我们的记忆是不完美的:在记住一些时刻的同时,亦会丢失一些重要片段。有时,我们甚至会“记住”从未发生过的事情。研究人员将这一现象称为“错误记忆”。但这些错误记忆从何而来?先前的研究表明,睡眠在错误记忆的形成过程中起着重要作用。在最近的一项小型研究中,研究人员将睡眠纺锤波作为潜在的罪魁祸首进行了首次

探析血型报告的错误原因

    正确的ABO血型鉴定,是临床安全输血的关键。而错误血型的血液一旦输入,则直接危及患者的生命。笔者回顾性分析多年工作中所观察的32例造成ABO血型定型错误的原因与结果,现报告如下。      1 血型报告错误的原因      1.1 血型测定的错误 血型检测时因患者红细胞悬液浓度过低或离心时间

简述突触核蛋白错误折叠

  研究发现α-突触核蛋白正常、错误折叠及其寡聚化之间存在动态平衡,当这种平衡被打破后原纤维迅速聚集成大分子、不溶性的细纤维;α-突触核蛋白在不同的影响因素下会表现出许多种形态,包括舒展态、溶解前球型态、α-螺旋态(膜结合),β-片层态、二聚体态、寡聚体态、以及不可溶的无定型态和纤维态;α-突触核蛋

移液器操作时哪些常见错误?

  移液器又称移液枪,是一种用于定量转移液体的器具,被广泛用于生物、化学等领域和临床诊断实验室,生物技术实验室,药学和化学实验室,环境实验室,食品实验室的一种常用工具,常用的有手动可调移液器和电动的之分,具体还根据移取液体的容积的不同有许多可选规格。  移液器常见的错误操作:  1)装配吸头时,反复

血型报告错误原因的分析

Reason Analysis of Blood Type Report MistakeZHAO Guilan, DU fei(Shuozhou People's Hospital, Shuozhou, Shanxi 038500, ChinaKey words:Blood type; B

图尔克TURCK通过RFID避免错误

  Gefasoft是制造自动化、影像处理和识别领域的专业公司,在汽车和半导体行业各大制造商中享有盛名。其旗下的雷根斯堡分公司已有多年的RFID使用经验,并且尝试过不同制造商的系统,现在他们选择图尔克的BL ident用于其装配和自动化测量设备。   保存记录   图尔克的RFID解决方案BL

低级错误导致的误诊

  病例摘要:(患者有精神病,无家属陪同,病史诉说不清。)    患者,女,42岁,右下腹痛痛4天,伴有恶心,呕吐。近三天来于诊所输液抗炎治疗,右下腹痛无明显好转,恶心呕吐亦无好转,呕吐一般出现在餐后半小时到一小时。    入院查体:生命体征平稳,心肺未见异常,腹部平软,对称,无胃肠型及蠕动波。全腹

器械人因第一因使用错误与使用者错误的判别

一、场景假设设想一个这样的场景:一个护士遵照医嘱,使用微量注射泵给患者补钾,注射泵最大可识别的注射器为60ml,而她却顺手拿了一个100ml的注射器,操作过程中她按照自己通常的习惯完成了设置,设备未出现任何异常警示。巡房却发现,原本预定10小时输完的药物,6小时就输完了。上面是一个真实的不良事件案例

ELISA测定错误结果的原因分析

ELISA即酶联吸附试验,是一种常用的固相酶免疫测定方法。Engvall 和Perlmann于1971年最先应用该法进行了IgG定量测定,并命名为"enzyme linked immunosorbent assay (ELISA)"。 ELISA的基本原理是:①使抗原(或抗体)结合到某种固相载体表面

电源滤波器的常见错误

  在实验测试过程中,我们常遇到这样的情况:虽然设计工程师在设备电源线上接了电源滤波器,但是该设备还是不能通过"传导骚扰电压发射"测试,工程师怀疑滤波器的滤波效果不好,不断更换滤波器,仍不能得到理想的效果。  分析设备超标的原因,不外乎以下两个方面:  1)设备产生的骚扰太强;  2)设备的滤波不足

ELISA测定错误结果的原因分析

ELISA即酶联免疫吸附试验,是一种常用的固相酶免疫测定方法。Engvall 和Perlmann于1971年最先应用该法进行了IgG定量测定,并命名为"enzyme linked immunosorbent assay (ELISA)"。 ELISA的基本原理是:      ①使抗原(或

急诊检验的错误种类与频率

  实行全面实验室质量管理贯穿于申请、测试、报告整个过程.Ros:和Boone报道的实验室错误分布频率为:分析前46%、分析7%、分析后47%;所涉及的336个病人中233个((7000)治疗未受影响,78个((23%)受到不必要处理,25个((7%)受到了危险、不适当的处理.由此可见一斑。   

PNAS:药物伴侣修正蛋白错误折叠

  Oregon Health & Science大学的研究人员在小鼠中展示了一项革命性的新技术,该技术将有望治疗蛋白错误折叠所引起的多种人类疾病,例如囊性纤维化、白内障和阿尔茨海默症等。文章发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上。   基因突变会使蛋白分子发生错误折叠,这些蛋白仍然保有功能,

UVProbe加载报告生成器错误

UVProbe加载报告生成器错误是因为故障UVProbe是具有多功能,操作便捷的软件,作为标准配置于岛津UV-VIS分光光度计中。软件特色:(1)具有多种数据处理和计算功能的测定模式;动力学测定除了光谱和光度模式外,还有动力学模式。综合数据处理功能可提供给每个模式。(2)自由格式的报告创建 自由创建

错误?还是科学艺术的奇迹?

  一位物理学家感叹,“这儿发生了什么奇迹?” ,图福特则笑说“我头一次听见‘错误’被形容为‘奇迹’。”  逢原 编译  费曼图,是诺贝尔奖得主、物理学家理查德﹒费曼在20世纪创造的,他用形象化的方式,直观地展现了量子场中各种粒子的相互作用,如散射、反应、转化……他的每张图,都表达出亚原子微粒的时空

减少测序错误,你做对了么?

  不论是哪种测序平台,在测序过程中都不可避免地存在一些错误。Illumina的低成本高通量测序技术已经在许多领域得到了广泛应用,不过人们还不了解其系统性错误对测序数据的影响。  英国格拉斯哥大学的研究人员在16S rRNA扩增子测序的基础上,全面分析了Illumina台式测序仪的错误模式。他们由此

减少测序错误,你做对了么?

  不论是哪种测序平台,在测序过程中都不可避免地存在一些错误。Illumina的低成本高通量测序技术已经在许多领域得到了广泛应用,不过人们还不了解其系统性错误对测序数据的影响。  英国格拉斯哥大学的研究人员在16S rRNA扩增子测序的基础上,全面分析了Illumina台式测序仪的错误模式。他们由此