Nature关注遗传学新动向:人类基因敲除研究

数十年来,生物学家们一直在小鼠或其他动物模型中,通过失活目的基因来进行功能研究。现在这种基因敲除(knockout)研究有了更理想的模型,那就是人类。 当然,这并不是说像处理小鼠那样,对人类进行遗传学改造。事实上,研究者们是通过分析成百上千的人类基因组,在其中寻找失活某个基因的天然突变。他们希望通过了解这些突变对健康的影响,找到基础生物学和疾病治疗的新线索。 在上周美国人类遗传学会的会议上,遗传学家们探讨了好几个这样的大型研究。“我们现有知识很多都是基于小鼠和大鼠,而不是人类,”麻省总医院的基因组学家Daniel MacArthur说。他的研究团队通过排查九万多人的外显子组,鉴定了差不多十五万天然的被敲除基因。 对于特定基因来说,出现敲除突变是比较罕见的,所以这类研究需要很大的群体。功能缺失性突变一直被认为与疾病有关,但实际上绝大多数这样的天然突变是无害的,有些甚至还对携带者有益。 之前研究者们的注意力主要集中在基因......阅读全文

癌基因敲除可完全抑制肺癌发生

  肺癌是所有肿瘤病症中致死率最高的恶魔。日前,从中科院昆明动物研究所传来了好消息,该所肿瘤干细胞生物学学科组已成功揭示癌基因维持肺癌的发生机制。该成果已在线发表于国际期刊《治疗诊断学》。  据介绍,HUWE1基因是一种泛素化连接酶,它可通过调节底物的稳定性,控制着细胞内大量与肿瘤发生密切相关的生物

基因敲除新技术助力疾病研究

  是什么基因导致了乳腺癌形成?是什么脑细胞突变导致了阿尔茨海默氏症发病?为了寻找新的治疗方法,科学家们必须要了解细胞水平上的疾病触发机制。在转基因小鼠上开展实验成为了基础医学研究一个不可或缺的部分。现在,科学家们开发了一种新方法,可以帮助实验室用较少的实验动物开展他们的研究。  科学家们利用转基因

动物所大鼠基因敲除工作取得突破

  8月8日,Nature Biotechnology杂志在线发表了中国科学院动物研究所周琪研究员领导的生殖工程研究组的研究论文Simultaneous generation and germline transmission of multiple gene mutations in rat

Nature惊人发现:基因敲除技术的缺陷

  当前一些基因组改造新方法在科学界引发了广泛的讨论:例如,采用CRISPR/Cas技术,科学家们可以删除某一基因遗传密码的组成部分,由此敲除掉这一基因。 此外,还有一些方法可以抑制基因翻译为蛋白质。两种方法的共同之处在于,它们都阻碍了蛋白质生成,因此可给生物体造成一些相似的影响。然而,有证据显示敲

组织特异性基因敲除的定义

中文名称组织特异性基因敲除英文名称tissue-specific gene knockout定  义在特定组织细胞类型中使基因功能完全丧失的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)

基因敲除的定义和功能用途

基因敲除(knockout)是用含有一定已知序列的DNA片段与受体细胞基因组中序列相同或相近的基因发生同源重组,整合至受体细胞基因组中并得到表达的一种外源DNA导入技术。它是针对某个序列已知但功能未知的序列,改变生物的遗传基因,令特定的基因功能丧失作用,从而使部分功能被屏蔽,并可进一步对生物体造成影

TetraOne-KO——基因敲除技术的重大突破

  近日,赛业生物科技(Cyagen Biosciences)宣布推出其全球专利技术TetraOne基因敲除,一种不仅在速度上媲美TALEN、CRISPR/Cas9(把ES打靶基因敲除/敲入鼠的定制周期降低至6个月),而且避免了TALEN、CRISPR/Cas9脱靶效应困扰的革命性技术。TetraO

如何选择基因敲除动物模型制备技术?

动物模型是现代生命科学研究的重要工具,特别是基因工程小鼠和大鼠,在基因功能研究、人类生理病理机制研究及新药研发中起着不可替代的作用。近几年来,制 备动物模型的基因修饰技术层出不穷,这不仅包括传统ES打靶、TALEN、CRISPR/Cas9, 还有TetraOne基因敲除新技术。如此繁 多的技

TetraOne-KO——基因敲除技术的重大突破

  TetraOne KO——基因敲除技术的重大突破   近日,赛业生物科技(Cyagen Biosciences)宣布推出其全球ZL技术TetraOne基因敲除,一种不仅在速度上媲美TALEN、CRISPR/Cas9(把ES打靶基因敲除/敲入鼠的定制周期降低至6个月),而且避免了TALEN、

斑马鱼基因敲除是怎么做的

  一、基因敲除的设计方案   1.1 基因的基本信息   确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。   1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析   1.3分析蛋白质的保守结构功能域   通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。   1.4

基因敲除技术的理论基础和应用

基因敲除就是通过同源重组将外源基因定点整合入靶细胞基因组上某一确定的位点,以达到定点修饰改造染色体上某一基因的目的的一种技术。它克服了随机整合的盲目性和偶然性,是一种理想的修饰、改造生物遗传物质的方法。这项技术的诞生可以说是分子生物学技术上继转基因技术后的又一革命。尤其是条件性、诱导性基因打靶系统的

CRISPR-技术进行细胞-TP53-基因敲除

实验原理 TP53 是重要的抑癌基因。在多种肿瘤中都能发现 TP53 基因突变及功能丧失。我们将针对 TP53 基因设计的靶点构建到 pCas9/gRNA1 载体,转染 293T 细胞,构建了 TP53 基因敲除 293T 细胞系。 1、本实验基因敲除原理:pCas9/gRNA1 载体表达

RNAi——双链RNA引起的基因敲除(2)

在构建双链RNA的表达载体时,使用RNA多聚酶Ⅲ来指导RNA的合成。这是因为RNA多聚酶Ⅲ有明确的启始和终止序列,而且合成出的RNA不会带有polyA尾。当RNA多聚酶Ⅲ遇到连续5个胸腺嘧啶时,它指导的转录就会终止,并且转录产物在第二个尿嘧啶处被切下来。U6启动子能被RNA多聚酶Ⅲ识别, 合

斑马鱼基因敲除是怎么做的

  一、基因敲除的设计方案   1.1 基因的基本信息   确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。   1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析   1.3分析蛋白质的保守结构功能域   通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。   1.4

教你学会-CRISPR-Cas9-基因敲除技术

CRISPR/Cas 是进行基因编辑的强大工具,可以对基因进行定点的精确编辑。在向导 RNA(guide RNA, gRNA)和 Cas9 蛋白的参与下,待编辑的细胞基因组 DNA 将被看作病毒或外源 DNA,被精确剪切。一、寻找目的基因的靶标使用在线设计网站 CRISPR direct,如需直接复

斑马鱼基因敲除是怎么做的?

一、基因敲除的设计方案1.1 基因的基本信息确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR,分析其效率及脱靶的情况一般使用C

RNAi——双链RNA引起的基因敲除(1)

1995年,康奈尔大学的Su Guo博士用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现,反义和正义RNA都阻断了基因的表达,他们对这个结果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究证明,在正义RNA也阻断了基因表达的试验中,真正起作用的是双链RNA[1]。这些双链RNA是体外

基因突变

  基因组DNA分子发生的突然的、可遗传的变异现象叫做基因突变。基因突变是变异的主要来源,也是生物进化发展的根本原因之一。从分子水平上看,基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。基因虽然十分稳定,能在细胞分裂时精确地复制自己,但这种稳定性是相对的。在一定的条件下基因也可以从原来的存在

科学家利用天然基因“敲除”人类探索未知基因功能

  人类有大约20000个基因,但实际上大多数基因的功能还未得到了解。了解基因功能的一种方式就是找到缺失特定基因的人,观察一下他们是否存在健康问题。但在大众群体中这样的人很罕见。最近一项新研究指出发现基因功能的一种更加有效的方法:在近亲结婚情况比较常见的人群中进行DNA筛查。  这项研究的基因组数据

大肠杆菌基因组基因无痕敲除的优化方法

  近几十年来, 大肠杆菌是基因工程、 代谢工程和合成生物学等领域的重要工具菌株,是生产重组蛋白、氨基酸、有机酸、能源物质和一些重要化工产品的主力微生物之一。为使大肠杆菌获得新的性状和生产能力, 基因敲除及基因敲入是构建新型大肠杆菌的重要手段。   近几十年来, 大肠杆菌是基因工程、 代谢工程和合成

一步生成条件性基因敲除小鼠ESC

  最近发展的基因组编辑工具,包括转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs)和CRISPR/Cas9,使我们能够通过诱导双链断裂(DSBs)的非同源末端连接(NHEJ)修复,快速而有效的敲除靶向基因。然而,这种方法不能进行必需基因的功能研究,这类研究通常采用的策略是基于Cre-LoxP系统的条件性基

遗传学新动向:人类基因敲除研究

  数十年来,生物学家们一直在小鼠或其他动物模型中,通过失活目的基因来进行功能研究。现在这种基因敲除(knockout)研究有了更理想的模型,那就是人类。  当然,这并不是说像处理小鼠那样,对人类进行遗传学改造。事实上,研究者们是通过分析成百上千的人类基因组,在其中寻找失活某个基因的天然突变。他们希

基因敲除小鼠在抗体药物研发平台的应用

  “千鼠万抗”计划 (Project Integrum) 是百奥赛图抗体药物研发平台的重要组成部分。目标是利用3-5年时间,在全人抗体小鼠RenMab上,逐一对上千个潜在抗体药物靶点进行基因敲除,并利用这些基因敲除小鼠制备抗体的计划。其主要内容包括:   在RenMab上完成1000多个Ta

文献中遇到的实验动物知识:基因敲除小鼠

  投稿人:郭晓冲 中国医科大学动物部   写给看文献的你们:   我在这里想写一些看文献时可能遇到的实验动物知识,希望对大家有帮助。为了便于理解,语言偏通俗,可能不够严谨。如果大家希望深入了解实验动物专业知识,欢迎选修实验动物学。   第一集,关于基因敲除小鼠。   基因敲除小鼠(Knoc

文献中遇到的实验动物知识:基因敲除小鼠

我在这里想写一些看文献时可能遇到的实验动物知识,希望对大家有帮助。为了便于理解,语言偏通俗,可能不够严谨。如果大家希望深入了解实验动物专业知识,欢迎选修实验动物学。第一集,关于基因敲除小鼠。基因敲除小鼠(Knockout Mice),人们使用复杂的方法使小鼠体内的某一个基因不表达,从而使小鼠呈现这个

基因敲除小鼠在抗体药物研发平台的应用

 “千鼠万抗”计划 (Project Integrum) 是百奥赛图抗体药物研发平台的重要组成部分。目标是利用3-5年时间,在全人抗体小鼠RenMab上,逐一对上千个潜在抗体药物靶点进行基因敲除,并利用这些基因敲除小鼠制备抗体的计划。其主要内容包括: 在RenMab上完成1000多个Targets的

CRRSPR/Cas9基因敲除系统之sgRNA设计

sgRNA设计网站介绍sgRNA的在线设计网站有:1、http://crispr.mit.edu/ ;2、http://www.e-crisp.org/E-CRISP/;等网站。这些网站虽然一定程度上满足了部分研究 者的需要,但仍然存在很多不足和缺陷。例如:1、数据分析周期长;2、无具体的脱靶数据;

文献中遇到的实验动物知识:基因敲除小鼠

  投稿人:郭晓冲 中国医科大学动物部   写给看文献的你们:   我在这里想写一些看文献时可能遇到的实验动物知识,希望对大家有帮助。为了便于理解,语言偏通俗,可能不够严谨。如果大家希望深入了解实验动物专业知识,欢迎选修实验动物学。   第一集,关于基因敲除小鼠。   基因敲除小鼠(Knoc

基因定点突变知识

实验原理基因定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法改变目的基因的序列,包括碱基的插入、缺失、点突变等。基因定点突变是基因研究中比较常用的方法,可以短时间内研究目的DNA所表达的目的蛋白的性状及表征。定点突变需要设计特定的突变引物。引物长度一般为25-45 bp,建议选择30-35bp长度

科学家通过基因敲除发现了听力损伤的关键基因

  最近,来自Harwell医学研究委员会(MRC Harwell)的科学家在对超过3000个小鼠基因进行试验后,发现了52个之前未被鉴定的对听力至关重要的基因。通过国际小鼠表型联盟(IMPC)领导了这一研究的科学家表示,这些新发现的基因将为人类听力损失的原因提供见解。   这项发表在Nature