基于16SrDNA的系统发育分析在微生物进化关系中的应用*
系统发育树的构建是现代生命科学研究中的重要技术，是分析未知菌种与其它菌种的亲缘关系，为进一步了解生物的进化关系的重要依据。本文对系统发育树的构建进行了详细的介绍，并对其在微生物进化研究中的具体应用进行了阐述。点击这里进入下载页面：进入下载页面......阅读全文
罐头制品中微生物如何检测？
检测之前应完成样品消毒处理任务,这能大大提高实验结果准确性。①进行培养检查。优选适合的培养基,样品量为1.5g或者1.5 mL,不同状态样品同时检验时,样品量各取一半。为了提高样品检验准确性,准备营养琼脂平板,确保培养基管与营养琼脂平板暴露时间一致。样品接种处理后,将二者共同放置于温箱,温箱温度为3
微生物鉴定技术贯穿食品安全始终
随着人们生活水平的不断提高，食品安全问题愈发受到重视，微生物对食品的污染问题也随之备受关注。微生物包括细菌、真菌等，有些微生物还是致病菌，对人体的危害很大，因此食品中微生物的检测非常重要。 微生物鉴定技术在检验检疫，食品、化妆品等产品致病菌的检测，动物源性致病菌的检测，植物病原细菌、真菌的检测
微生物鉴定技术贯穿食品安全始终
随着人们生活水平的不断提高，食品安全问题愈发受到重视，微生物对食品的污染问题也随之备受关注。微生物包括细菌、真菌等，有些微生物还是致病菌，对人体的危害很大，因此食品中微生物的检测非常重要。 微生物鉴定技术在检验检疫，食品、化妆品等产品致病菌的检测，动物源性致病菌的检测，植物病原细菌、真菌的检测
[进化]系统树的定义
中文名称[进化]系统树英文名称phylogenetic tree;family tree;dendrogram定 义用以描绘分类单元之间亲缘关系、由节点分枝构成的树状图。应用学科遗传学（一级学科），进化遗传学（二级学科）
分子生物学技术在微生物检验中的应用
分子生物学技术的迅速发展，拓展了微生物学检验方面的应用空间。该技术具有敏感、特异、安全和快速等特点，在微生物检验中发挥着日益重要的作用。本节简要介绍分子生物学技术在微生物检验中的应用，具体检测方法参见有关专著或试剂盒说明书。一、分子生物学技术在细菌分类中的应用细菌的传统分类法和数值分类法以表型特征相
巨型病毒点燃进化树之争
进化生物学家从来都不知道是什么制造了病毒，对它们的起源争论了十几年。但一组叫作Klosneuviruses的巨型病毒的新发现可能是“缺失的环节”，有助于解决争论——或者引发更多的争论。 2003年，研究人员报道发现了巨型病毒，并将其命名为Mimiviruses。其携带的基因表明，它们的原型可以
Science：鸟类进化树被改写
目前的鸟类进化树正在被美国最大的鸟类遗传学研究所改写。这项研究挑战了目前的分类，改变了我们对鸟类进化的认识，并提供了进行鸟类系统发育和比较研究的珍贵资源。 鸟类是目前研究得最多的动物之一，我们关于生物学的很多知识，从自然史到生态学、物种形成、繁殖等等，都来源于鸟类。尽管如此，鸟类的进化树还是备受争
概述嗜热脂肪芽孢杆菌的演变过程
1917 年 Smith 等人在实验室分离出嗜热脂肪地芽孢杆菌，1920 年 Donk 将其归类于芽孢杆菌属( Bacillus) ，并命名为嗜热脂肪芽孢杆菌( Bacillus stearothermophilus)。传统分类上对于芽孢杆菌属的分类标准较为宽松，导致该属细菌在生理、基因等方面存
454高通量测序——研究土壤微生物的新手段（一）
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物
文献速递－|猴痘病毒系统发育和微进化
近日，Nature Medicine在线发表了葡萄牙里斯本国家卫生研究所的一项研究，题为“Phylogenomic characterization and signs of microevolution in the 2022 multi-country outbreak of monkeypox
人类肚脐生物多样性：含有67种不同细菌
你想过这里居住着什么生物吗？研究发现的大部分微生物种类都属于微球菌属（Micrococcus），为放线菌的种类 北京时间11月13日消息，科学家已经知道我们肚脐里最常见的细菌种类，但不同人的肚脐里细菌种类是否相同？是什么在影响细菌种类的变化？这些都是北卡罗来纳州立大学的罗布·邓恩博
中国地区熊蜂属系统发育获揭示
近日，中国农业科学院蜜蜂研究所传粉蜂生物学与授粉应用团队利用多基因联合对我国熊蜂属的系统发育进行了研究，揭示了中国地区26种熊蜂种的系统发育，为我国熊蜂属的分类奠定分子基础，同时也为熊蜂多样性和保护策略提供依据。相关研究成果在线发表在Zookeys上。 团队从青藏高原和中国北方不同地区采集了26
研究发现树蛙科系统发育和进化新进展
稳健的系统发育假说是生物多样性和进化研究的基础，其对于解决分类争议，理解演化历程和解析分化模式至关重要。树蛙科（Rhacophoridae）隶属于两栖纲Amphibia、无尾目Anura，多样性丰富，目前已描述有约19个属420个物种，广泛分布于东亚、东南亚、南亚和非洲地区。该类群表现出多样的性
猖獗龋患者的病因和口腔微生物种类分析（一）
龋病是一种多因素相关的感染性疾病，其发生原因主要包括宿主因素（唾液，牙齿表面解剖形态和矿化程度，机体健康、营养和激素水平等）和一些外源性因素（食物，定植在牙齿表面的微生物菌群，口腔卫生情况，和相关氟化物的使用情况等）。 近年来，已有大量关于龋病病因的探究，主要从唾液功能方面、机体免疫方面、龋病致病菌
NEJM：利用基因测序谱写“肿瘤进化树”
近几年来，肿瘤产生耐药突变以逃逸靶向治疗的假说已被业内科学家所默认。最近一段时间，几项重要的研究对这一假说进行了充分的证实，肿瘤学家Charles Swanton领导的肺癌癌症进化阻断计划（TRACERx）让耐药逃逸的假说逐渐为更多人所认可。 为了使TRACERx计划能够充分证实部分肿瘤细胞耐
PNAS：科学家构建肿瘤“进化树”
一个肿瘤内的个体细胞并不全是相同的。这可能听起来像是一个现代医学真理，但很久以前并不是这样，当时医生认为，从患者肿瘤采集的单一活检标本，能准确地反映整个肿瘤的生理和遗传构成。 研究人员开始意识到，癌症这种疾病是由相同的“适者生存”力量所驱动的，达尔文提出，适者生存推动了地球上生命的进化。然而，
地质地球所研究发现古老趋磁细菌新类群
北京密云水库中新发现的两类硝化螺旋菌门趋磁细菌的荧光原位杂交（A至I）与透射电子显微镜照片（J和K） 趋磁细菌是一类能够在细胞内合成纳米磁体矿或胶黄铁矿磁小体的原核微生物，目前已发现的趋磁细菌在系统发育上均属于变形菌门 (Proteobacteria)与硝化螺旋菌门(Nitrospira
《科学》：大规模遗传研究重塑鸟类进化树
朝确定鸟类谱系中主要分枝间进化关系的目标迈出了巨大一步 美国科学家近日进行了一项迄今为止规模最大的鸟类遗传学研究，重塑了鸟类进化树。这一研究的范围颇为广阔，许多鸟类的学名将会因之而改变，而生物学教科书和观鸟爱好者指南也不得不进行修订。相关论文发表在6月27日的《科学》（Science）杂志上。
18亿遗传密码重建开花植物进化树
为什么一项关于花花草草的研究，会被评价为“令人难以置信的成就”？英国皇家植物园领导的由279名科学家组成的国际团队，4月24日在《自然》杂志上发表了一篇新论文，公布了科学界对开花植物种系进化树的最新认识。这项研究利用了来自9500多个物种的18亿个遗传密码，覆盖了近8000个已知的开花植物属（约60
流水噪音塑造两栖类鸣声信号进化研究获进展
根据声音适应性假说（acoustic adaption hypothesis, AAH），动物的鸣声信号应该朝有利于在所处环境中高效传播的方向进化。目前，关于AAH的研究多集中于植被对动物声音的影响，从环境噪音的角度对AAH进行检验的工作相对较少。另外，与噪音相关的AAH研究中，仅有少数几个声学
食品检测技术罐头制品中微生物检测方法介绍
罐头制品基本介绍1.基本类型罐头制品类型多样,主要是因为这类食品pH值存在差异,常见类型有两种:①低酸性(pH大于4.5,水活性大于0.86)。②酸性(pH小于4.5)。针对罐头制品微生物检测时,往往以差异性培养基为基础。2.腐败变质现象常见罐头腐败变质现象表现在4个方面:①平酸腐败。罐装内部酸度迅
关于嗜热脂肪芽孢杆菌的鉴定方法介绍
对于嗜热脂肪地芽孢杆菌的鉴定，传统分类中根据形态特征、生理生化特性、生态特性等指标进行鉴定的方法耗时耗力，因此基于分子生物学的鉴定方法不断发展。2005 年， Daniel R． Zeigler报道了利用 recN 基因序列相似性分析鉴定地芽孢杆菌属菌种的研究。研究表明，对于属、种及亚种水平的分
海洋所等研究发现一种新的海洋多细胞趋磁原核生物
日前，中科院海洋研究所肖天研究员课题组与法国科学院吴龙飞教授课题组合作开展了海洋趋磁微生物多样性及系统进化研究。研究人员在我国黄海潮间带沉积物中发现一种新的多细胞趋磁原核生物——菠萝型多细胞趋磁原核生物（pineapple-like MMPs）。 科研人员通过对该多细
人类进化导致微生物灭绝
人类正在驱动灭绝的不只是大象和老虎。人们还在大规模地消灭那些小很多的生物体。一项最新研究显示，人类世带来的微生物灭绝可能是一些身体和心理健康问题以及目前出现的抗菌素耐药性危机的“幕后黑手”。 这一惨淡信息来自对人类历史如何影响地球微生物，尤其是那些生活在人类体内的微生物进行的深度分析。“肠道菌
人类进化导致微生物灭绝
人类正在驱动灭绝的不只是大象和老虎。人们还在大规模地消灭那些小很多的生物体。一项最新研究显示，人类世带来的微生物灭绝可能是一些身体和心理健康问题以及目前出现的抗菌素耐药性危机的“幕后黑手”。 这一惨淡信息来自对人类历史如何影响地球微生物，尤其是那些生活在人类体内的微生物进行的深度
有机氯污染修复与地质杆菌生物多样性研究中获进展
氯代烷烃是一类人工合成、应用于各种工业和农业生产活动中的有机氯化物的统称。由于生产、使用、储存或处置不当等原因，氯代烷烃通过多种途径进入大气、土壤、地下水体系中，成为环境中的常见污染物。有机卤呼吸细菌介导的还原脱氯过程是厌氧环境中包括氯代烷烃在内的有机氯污染物生物降解的主要途径之一。基于有机卤呼
二代测序技术助龙胆族叶绿体基因组进化和系统学获进展
随着二代测序技术的发展，植物叶绿体基因组序列已普遍应用于重建植物“生命之树”研究中。大多数植物叶绿体基因组呈环状四分体结构，包含约80个蛋白编码基因。叶绿体基因组由于缺乏重组，而常被认为是连锁的单一基因座；然而，越来越多的研究表明，叶绿体基因组中不同区域以及不同编码基因具有不同的核酸替代速率，经
发酵产氢菌株与混合培养系统种群生态研究
近年来基于乙醇型发酵制氢工艺和理论,开展了大量以提高该工艺的产氢效率、完善工程控制对策、实现工业化生产为最终目的的理论和应用研究。筛选出若干株产乙醇杆菌,获得了大量工程控制数据,研究取得了很大的进展。但是乙醇型发酵制氢工艺的工程控制对策还有待完善,产氢效率还有待进一步提高。尤其是混合菌种乙醇型发酵产
454高通量测序研究土壤微生物的新手段
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物质循环
昆明动物所等发布超大规模进化树构建软件
近日，中国科学院昆明动物研究所马占山团队与天津大学教授邹权、厦门大学科研人员联合发布了为千兆(GB)级基因序列数据构建进化树的软件HPTree。该软件使用谷歌Hadoop并行技术和美国加利福尼亚大学伯克利分校Spark集群大数据技术作为并行处理平台，利用计算机集群对基因序列大数据进行分割处理和整