《自然》:上海交大中药代谢组研究新方法
来自上海交通大学药学院的研究人员介绍的中药代谢组学研究新方法登上了7月12日出版的《自然》杂志的新闻特写(News Feature)栏目,并受到了高度评价。 代谢组学将成为评价中药体内整体性疗效的有效方法,并有可能使中医药和现代科学技术完全融合。采用系统生物学手段开展中药现代化研究受到国际学术界和医疗界越来越多的关注。上海交大药学院贾伟教授及其工作团队今年上半年数次登上《自然》杂志,他们所从事的中药代谢组学研究新方法被介绍在7月12日出版的最新一期的新闻特写(News Feature)栏目。 这篇题为“A Culture in the Balance”的特写文章,提出“在中医药与西方科学面临无可调和的差别之下,系统生物学是否可能使两者互融”的问题,其中着重介绍了贾伟教授团队采用的代谢组学用来评价中药体内整体性疗效的方法。 这些采用系统生物学的思维所开展的中药研究,在最近一期的《Nature Reviews Drug Dis......阅读全文
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息
上海交大微生物代谢国家重点实验室通过验收
近日,科技部基础研究管理中心在上海交通大学召开了微生物代谢国家重点实验室建设验收会。本次会议专家组由9位微生物领域知名专家组成,组长为吉林农业大学李玉院士。教育部科技司基础处副处长明媚代表主管部门出席,上海交通大学副校长梅宏出席会议并致辞,上海交通大学生命科学技术学院领导、微生物代谢国家重点实验
高分辨质谱仪拟建设中药药动蛋白组代谢组学分析平台!成都中医药大学公开招标
为便于供应商及时了解政府采购信息,根据《四川省财政厅关于开展政府采购意向公开工作的通知》(川财采〔2021〕153号)要求,现将成都中医药大学2023年度(第34批)采购意向公开如下:号采购项目名称采购需求概况预算金额(万元)预计采购时间备注1成都中医药大学“国一流”学科科研平台建设项目采购采购
物质代谢检查方法器官水平的代谢研究
切除某种动物的器官后给予某种物质,观察其代谢改变,可推知该器官的代谢功能。如在对排尿动物的尿素合成部位进行研究时,切除动物的肝脏后发现动物血液中氨基酸水平和血氨水平均升高,而尿中尿素含量下降,动物存活期很短,但切除动物的肾脏却无此现象,说明肝脏与尿素的合成有关。
检验肝脏的代谢考点:蛋白质代谢
(1)合成自身结构蛋白并合成多种血浆蛋白质,其中合成量最多的是白蛋白。(2)肝脏合成的许多凝血因子和纤维蛋白原等,在血液凝固功能上起重要作用。(3)有丰富的氨基酸代谢酶,转化和分解氨基酸。(4)经鸟氨酸循环合成尿素(尿素是血中非蛋白含氮物质主要成分)。
遗传代谢病的代谢紊乱的表现
本病的代谢紊乱表现为以下几个方面: (1)代谢终末产物缺,正常人体所需的产物合成不足或完全不能合成,临床上出现相应症状,如缺乏葡萄糖—6—磷酸酶的糖原累积症,肝糖原分解葡萄糖不足,在饥饿或进食延迟时出现低血糖。 (2)受累代谢途径的中间和(或)旁路代谢产物蓄积,引起相应的细胞、器官肿大,出现
脂肪代谢与糖代谢的相互关系
消化主要在小肠上段经各种酶及胆汁酸盐的作用,水解为甘油、脂肪酸等。 脂类的吸收含两种情况: 中链、短链脂肪酸构成的甘油三酯乳化后即可吸收——>肠粘膜细胞内水解为脂肪酸及甘油——>门静脉入血。长链脂肪酸构成的甘油三酯在肠道分解为长链脂肪酸和甘油一酯,再吸收——>肠粘膜细胞内再合成甘油三酯,与载脂蛋白、
脂肪代谢和糖代谢之间有哪些联系
1.糖转变为脂肪:糖酵解所产生的磷酸二羟丙酮还原后形成甘油,丙酮酸氧化脱羧形成乙酰辅A是脂肪酸合成的原料,甘油和脂肪酸合成脂肪。2.脂肪转变为糖:脂肪分解产生的甘油和脂肪酸,可沿不同的途径转变成糖。甘油经磷酸化作用转变为磷酸二羟丙酮,再异构化变成3-磷酸甘油醛,后者沿糖酵解逆反应生成糖;脂肪酸氧化产
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...(二)
2. 筛选修饰蛋白进行验证并探究修饰位点功能进一步,作者对6个候选琥珀酰化蛋白进行验证(LuxS、PkG等),先通过Co-IP富集候选的修饰蛋白,随后利用琥珀酰化抗体进行WB,证明了这些蛋白确实发生了琥珀酰化修饰。随后,作者锁定了一个调节群体感应自诱导剂AI-2的合成酶-----LuxS进行深入研究
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(二)
案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现,CrPV
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...(一)
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的代谢调控机制 随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(一)
在疫情逐步可控的情形下,一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学,脂质组学,以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示,新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,
我所基于功能代谢组学策略揭示EGFR突变型肺腺癌的嘌呤代谢调控机制
近日,我所生物技术研究部生物分子高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)刘心昱研究员、许国旺研究员团队与郑州大学第一附属医院李向楠教授合作,基于功能代谢组学策略,整合毛细管电泳-飞行时间质谱的代谢组学分析和分子生物学手段,揭示了表皮生长因子受体(EGFR)突变型肺腺癌的嘌呤代谢重塑及其作用机制,
3min-400种代谢物LCMS/MS分析方法有效提高代谢组研究通量
在精准医学所依赖的大规模队列研究中, 实验通量和数据重现性是最为重要的考量指标。Angelo D'Alessandro教授课题组基于Vanquish-Q Exactive 技术建立了3min方法测定400多种代谢物的方法,覆盖到糖酵解途径、磷酸戊糖途径、三羧酸循环、鸟氨酸循环、氨基酸代谢
高深度空间代谢组学助力肿瘤微环境研究
肿瘤的发展除了与癌细胞自身基因突变导致的恶性增殖有关以外,还与肿瘤微环境息息相关。在癌症中,正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏,原本保护正常细胞生存的微环境在肿瘤细胞的影响下,逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。针对肿瘤微环境的检测和表征研究也可为癌症治疗提供新的思路。目前空间多组学技术已用于研究几种
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan s
代谢组学技术在临床医学中的应用
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新发展起来的一门学科,它通过对人体内小分子代谢物(50~1,500 Da)进行精准定性定量,分析代谢物与人体生理病理变化的关系,研究疾病发生发展、寻找疾病生物标记物、预测疾病预后等。代谢组学在临床诊断上将有广阔的发展前景,主要应用方向有四个方面:在临床诊断(B
中科院:解析菌血症代谢组研究新发现
近日,依托于中科院武汉物理与数学研究所的中国科学院生物磁共振分析重点实验室的生物医学代谢组学研究组,在菌血症的代谢组研究方面取得新进展,相关研究结果发表在PLoS ONE上。 菌血症(bacteremia)是指外界的细菌经由体表或感染的入口进入血液系统内繁殖并随血流在全身播散,从而激发
细胞衰老的溶酶体代谢组学研究的新突破
溶酶体对细胞代谢至关重要,并异质地参与各种细胞过程。测量溶酶体代谢异质性的能力对于理解它们的生理作用至关重要。 2021年6月14日,中国科学技术大学熊伟与仓春蕾共同通讯在Nature Methods 在线发表题为“Metabolomic profiling of single enlarge
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan speed≤3
代谢组学与临床医学的研究进展
人体是一个复杂的系统,存在于这一系统中的生物分子相互关联、互相依赖。近年来,人们已经意识到生物学的整体复杂性以及基因构成与环境因素之间的复杂交互作用,而对这些交互作用的理解已经不能单单从基因组学、蛋白质组学或转录组学水平去揭示。关注生物分子之间途径及网络的动态变化和关系的系统生物学(
“基因组规模系统代谢育种”项目取得重要进展
微生物制造技术在降低环境污染、促进可再生资源替代化石资源方面有着良好的发展前景。而我国微生物制造产业水平与国际差距明显,主要原因在于工业菌种水平低下,某些重要的氨基酸、化工醇等产品长期依赖进口。发展微生物的基因组规模系统代谢育种技术改造工业菌种,是加速我国工业菌种性能提升的重要前提。 由安徽
2015-年代谢组学技术高级培训班通知
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统 生物学的重要组成部分。已在疾病诊断、医药研发、精准医学、营养食品科学、 毒理学、环境学,植物学等领域得到广泛应用。 中国的代谢组学与国际在同步发展,到目前为止,中国人发表的代谢组学相 关的文章数量已在国际上排第
布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略
摘要 * 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学(SSCM)能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征; * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像; * 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict
代谢组学与临床医学的研究进展
人体是一个复杂的系统,存在于这一系统中的生物分子相互关联、互相依赖。近年来,人们已经意识到生物学的整体复杂性以及基因构成与环境因素之间的复杂交互作用,而对这些交互作用的理解已经不能单单从基因组学、蛋白质组学或转录组学水平去揭示。关注生物分子之间途径及网络的动态变化和关系的系统生物学(system
最新抗衰老靶点:控制蛋白质组代谢
“蛋白质合成对细胞来说是一个极耗能的过程,当细胞投入宝贵资源生产蛋白时,其他重要功能很可能就会被忽视。我们的工作表明,正常和异常老化的一个驱动器会加速蛋白质周转(protein turnover),”文章通讯作者、Salk研究所首席科学官和副总裁Martin Hetzer说道。 注:Water
功能代谢组学用于胶质瘤研究获进展
近日,中国科学院大连化学物理研究所与美国NIH、哈尔滨医科大学附属第一医院合作将功能代谢组学用于胶质瘤研究取得新进展:利用毛细管电泳-质谱技术,发现瘤组织中的亚牛磺酸含量显著高于癌旁对照组织中的亚牛磺酸,并且与胶质瘤分级即恶性程度呈正相关。经过分子对接计算机模拟,科研人员发现亚牛磺酸能够与α-酮
物质代谢调节
物质代谢是生命现象的基本特征,是生命活动的物质基础。人体物质代谢是由许多连续的和相关的代谢途径所组成,而代谢途径(如糖的氧化,脂肪酸的合成等)又是由一系列的酶促化学反应组成。在正常情况下,各种代谢途径几乎全部按照生理的需求,有节奏、有规律地进行,同时,为适应体内外环境的变化,及时地调整反应速度,保持
糖代谢简介
糖代谢可分为分解代谢和合成代谢两个方面,生物体内的糖代谢基本过程相类似。糖的分解代谢是指糖类物质分解成小分子物质的过程。糖在生物体内经过一系列的分解反应后,释放出大量的能量,供机体生命活动之用。同时在分解过程中形成的某些中间产物,又可作为合成脂类、蛋白质、核酸等生物大分子物质的原料(作为碳架)。糖的
糖代谢概述
一、代谢的基本概念(Basis concepts of Metabolism) 机体内的化学反应是在酶的催化下完成的。在细胞内这些反应不是相互独立的,而是相互联系的,一个反应的产物可能就是下一个反应的底物,这样构成一连串的反应,称之为代谢途径(pathway),由不同的代谢途径相互交叉构成一个有组