上海巴斯德所研究人员阐述丙型肝炎病毒体外复制机制

4月30日,Plos pathogens在线发表了中科院上海巴斯德所丰田哲也研究组关于丙型肝炎病毒体外复制机制的最新研究成果。这项研究由丰田哲也研究组的研究人员与日本国立感染症研究室的Takaji Wakita研究室共同完成。 由于体外感染系统模型有限,丙型肝炎病毒(HCV)领域的科学研究进展受到限制。到目前为止,只有JFH1(2a)株病毒可以在体外培养的Huh7细胞中复制并产生具有感染性的病毒。为了找到JFH1复制的机制,研究人员首先比较了JFH1,HCR6(1b)和J6CF(2a)三株病毒RNA聚合酶的结构与生化特性等差异,并找到了能激活HCR6和J6CF聚合酶活性的JFH1特异性的氨基酸位点。在含有JFH1 N3H和3’ UTR区域时,在J6CF的RNA聚合酶中引入A450S,R517K和Y561F三个突变就可以使J6CF基因组在培养的细胞中复制并产生子代病毒粒子。研究人员在深入分析了其机制后,发现......阅读全文

PNAS:让病毒“吐出”基因组

  病毒感染导致的手足口病,会使儿童出现可能致命的脑肿胀和麻痹,现在科学家们找到了治疗这种疾病的潜在途径,这一发现也为对抗其他相关病毒提供了宝贵线索。   在中国和东南亚国家,每年都会出现手足口病的爆发,这种疾病是由肠道病毒71型(EV71)引起的。在一些受到感染的儿童中,病毒会引发脑炎造成永久性

我国填补禽流感病毒聚合酶结构研究空白

《自然》:为设计抗流感病毒药物提供了真实可用的模型 [科学时报 潘锋 报道]《自然》杂志7月9日在线发表由中国科学院生物物理研究所研究员刘迎芳领导的研究组和南开大学饶子和院士领导的南开大学—清华大学—生物物理所联合研究组,共同完成的一项有关禽流感病毒聚合酶结构的研究,在国际上率先揭示出流感病毒聚

Science:人巨细胞病毒病毒基因组测序

  人巨细胞病毒是一种很常见的疱疹病毒,感染约50-100%的成人,但通常没有不良影响,并且它可以保持潜伏多年。人巨细胞病毒感染是比较常见的,发展中国家感染人数比发达国家人数多。   该病毒可导致出新生儿生缺陷和免疫系统受损,可能会导致致命疾病。该病毒也与癌症发展有关联。这项新的研究分析了病毒的蛋

树懒基因组中发现“化石”病毒

        二趾树懒(Choloepus hoffmanni,如上图)的基因组中隐藏着一个“化石”病毒。   据美国《科学》杂志在线新闻报道,就像恐龙在焦油中留下的脚印一样,逆转录酶病毒会将其DNA中的一些片段插入到一种动物的基因组中。研究人员在树懒的基因组中发现了泡沫病毒的古老片段。研究人

研究发现鞘磷脂能够激活丙型肝炎病毒RNA聚合酶

HCV聚合酶的鞘磷脂结合结构域  10月,病毒研究领域著名学术期刊Journal of Virology在线发表了中科院上海巴斯德所最新研究成果,该研究揭示了作为脂筏主要结构成分之一的鞘磷脂能够以基因型特异性的方式激活丙型肝炎病毒(HCV)1b亚型的RNA聚合酶,并且找到了其结合和激

我国科学家发现RNA病毒聚合酶独特催化机制

  RNA病毒包括SARS冠状病毒、高致病性流感病毒、埃博拉病毒、寨卡病毒等,在过去十五年间多次造成全球性影响,对人类健康构成严重威胁,而针对RNA病毒的药物和疫苗目前严重匮乏。聚合酶作为RNA病毒所必需的复制酶,在病毒RNA基因组复制过程中发挥核心作用,深入了解其催化机制,将为有效应对RNA病毒提

我国科学家发现RNA病毒聚合酶独特催化机制

  RNA病毒包括SARS冠状病毒、高致病性流感病毒、埃博拉病毒、寨卡病毒等,在过去十五年间多次造成全球性影响,对人类健康构成严重威胁,而针对RNA病毒的药物和疫苗目前严重匮乏。聚合酶作为RNA病毒所必需的复制酶,在病毒RNA基因组复制过程中发挥核心作用,深入了解其催化机制,将为有效应对RNA病毒提

Nature-Microbiology:流感病毒聚合酶调控RNA合成机制

  流感病毒是危害全球公共卫生健康的重要病原之一,能在人群中引起大规模流行和季节性流感,每次暴发都会引起人类死亡并造成巨大的经济损失。流感病毒(Influenza virus)是分节段的负链RNA病毒(Segmented Negative-Sense RNA virus, sNSV),属于正粘病毒科

关于病毒基因组的基本介绍

  病毒是最简单的生物,完整的病毒颗粒包括外壳蛋白和内部的基因组DNA或RNA(有些病毒的外壳蛋白外面有一层由宿主细胞构成的被膜(envelope),被膜内含有病毒基因编码的糖蛋白。病毒不能独立地复制,必需进入宿主细胞中借助细胞内的一些酶类和细胞器才能使病毒得以复制。外壳蛋白(或被膜)的功能是识别和

病毒基因组的结构特点介绍

  1.病毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比,病毒的基因组很小,但是不同的病毒之间其基因组相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小,所含信息量也较小,只能编码4种蛋白质,而痘病毒的基因组有300kb之大,可以编码几百种蛋白质,不但为病毒复制所涉及的酶类编码,甚至为核苷酸代谢的酶类编码,因此

研究揭示植物聚合酶参与寄主植物防御类病毒侵染

  近日,中国农业科学院植物保护研究所经济作物病毒病害流行与控制创新团队研究发现,植物RNA依赖的RNA聚合酶1参与寄主防御类病毒的侵染,并参与水杨酸介导的植物对类病毒侵染的防御响应,该研究丰富了目前对植物类病毒与宿主相互作用的认识。相关研究成果在线发表在《分子植物病理学(Molecular Pla

微生物所揭示埃博拉病毒聚合酶的分子机制

  埃博拉病毒是世界上最高级别的致命病毒之一。埃博拉病毒聚合酶负责病毒基因组复制过程,且具有较高保守性,是研发广谱性药物的重要靶标。由于分子量大、不稳定、易降解等原因,埃博拉病毒聚合酶三维结构的解析是世界性难题,严重限制了靶向聚合酶的药物开发。  中国科学院微生物研究所高福/施一团队首次解析了埃博拉

禽流感病毒聚合酶结构领域研究获重大进展

我国科研人员在国际上率先揭示出禽流感病毒聚合酶关键部分PA亚基与PB1多肽复合体的精细三维结构,填补了禽流感病毒聚合酶结构领域研究的空白。这一结构的解析,为研究禽流感病毒的复制机制,以及设计抗流感病毒药物提供了真实可用的模型。7月9日,国际权威杂志《自然》(《Nature》)在线发表了由中国科学院生

研究揭示植物聚合酶参与寄主植物防御类病毒侵染

  近日,中国农业科学院植物保护研究所经济作物病毒病害流行与控制创新团队研究发现,植物RNA依赖的RNA聚合酶1参与寄主防御类病毒的侵染,并参与水杨酸介导的植物对类病毒侵染的防御响应,该研究丰富了目前对植物类病毒与宿主相互作用的认识。相关研究成果在线发表在《分子植物病理学(Molecular Pla

未知基因组的神秘“巨型病毒”揭示病毒世界变异性

  据国外媒体报道,目前,科学家最新发现一种具有未知基因组的神秘巨型病毒。  该病毒被称为“Yaravirus”,是在巴西贝洛哈里桑塔城帕普哈人工湖中发现的,它是以巴西神话传说中“水仙(Yara)”的名字命名的。尽管该病毒可能不是什么超自然警报,但它可能像神话中的“水仙(Yara)”一样神秘。  因

Nature-Biotechnology定义病毒基因组标准:何谓高质量基因组

  据说,地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量,而且病毒总量也要比之前预计的多得多。  在最新的Nature Biotechnology杂志上,美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)构建了重要的病毒序列数据库,同时提出了病毒基因组标准,指出了三类基因组质量的分级。  目前虽然许多病毒未

穿透“衣壳”,看看病毒内部什么样

  人类对疾病的认识进入后基因组时代以来,科学家一直试图测定病毒内部三维结构。湖南师范大学物理与信息科学学院教授刘红荣与清华大学副研究员程凌鹏,利用冷冻电镜及其发展的新方法,求解出了一种双链RNA病毒内部基因组及RNA聚合酶三维结构,首次将对病毒的观察视角从“衣壳”深入到了其内部,该成果刊登于9月1

中国新型冠状病毒的基因组序列

  《自然》杂志2月3日发表了新型冠状病毒的基因组序列(论文:A new coronavirus associated with human respiratory disease in China),病毒样本系从一名曾在最先爆发疫情的海鲜市场工作过的患者体内分离得到。基因组分析显示,该病毒与此前在

研究解析新冠病毒RNA聚合酶三维精细结构

  由饶子和院士/娄智勇教授/王权教授等组成的“上海科技大学-清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析了新型冠状病毒转录复制机器核心单元“RdRp-nsp7-nsp8”复合体的三维空间结构,整体分辨率达到2.9 埃(Å)。  该研究揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,

揭开埃博拉病毒“复制机器”的面纱

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/9/487032.shtm 今年9月,非洲乌干达再次出现新的埃博拉疫情。这意味着埃博拉病毒这把“达摩克利斯之剑”依然悬在头顶,时刻威胁着人们的健康。 科学界一直想研制一款成本低、有利于推广的广谱性抗埃博

​双链RNA病毒的特点

双链RNA病毒有两个特点:一是它的基因组为10-12条双链RNA分子;二是它有双层衣壳,而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中,在该聚合酶的作用下病毒基因组转录正链RNA,它们自髓核逸出。它们既能作为mRNA,又能作为病毒基因组的模板。MRNA翻译结构蛋白,装配内层衣壳后,正链RNA进

乙肝病毒基因组的结构特点和功能介绍

  乙肝病毒(HBV)的基因组DNA结构很奇特,是一环状的部分双螺旋结构,长约3.2kb。其中的2/3为双螺旋结构,1/3为单链,这就是说,DNA中的两条链不等长。长链的5'端与3'端无共价连接,而是与一种蛋白质共价相连。长链的5'端以250-300对碱基互补结合。长链为负链

RNA病毒聚合酶具有一个与宿主适应相关的特征区域

  RNA病毒编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,简称RdRP)是一类独特的核酸聚合酶,在病毒基因组复制和转录过程中发挥核心作用,是抗病毒药物研究的热点靶标。病毒的RdRP由于可与其他功能域融合或与其他病毒蛋白共折叠,其整体结构多样性较高,但其催

沙粒病毒基质蛋白Z负调控聚合酶活性的分子机理

  沙粒病毒属于沙粒病毒科(Arenaviridae),是一类有囊膜的、分节段单股负链RNA病毒(Segmented Negative-Sense RNA virus, sNSV)。其中,目前所有已知能够引起人类疾病的沙粒病毒都属于哺乳动物沙粒病毒属(Mammarenavirus),其典型代表为拉沙

新冠病毒重要药物靶点RNA聚合酶精细结构获解析

  近日,“上海科技大学—清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析新型冠状病毒“RdRp(RNA依赖的RNA聚合酶)-nsp7-nsp8复合物”近原子分辨率的三维空间结构,揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,为开发针对新冠肺炎的药物奠定了重要基础。  3月17日,相关

科学家揭示A型流感病毒RNA聚合酶复合体结构

  A型流感病毒RNA聚合酶复合体四体总体结构及二体、四体、单体之间的转换  1月22日,Molecular Cell 杂志在线发表了题目为Cryo-EM Structure of Influenza Virus RNA Polymerase Complex at 4.3 Å Resolu

酵母还能快速“重建”新冠病毒基因组?

  据《自然》杂志6日发表的一项合成生物学研究,瑞士一个研究团队开发出一种可以快速重建新冠病毒的方法。重建病毒有助于研究人员开发诊疗方法和疫苗,同时,拥有合成能力也被认为是未来防治相关疫情的重要一环。  在实验室重建病毒,是一种有效的研究疾病暴发所涉病原体的方法。发生疫情时,将病毒样本送至研究机构可

SARS病毒基因组复制机制研究获突破

  近日,武汉大学生命科学学院教授郭德银领导的研究组以选择冠状病毒特有的多个RNA加工酶作为主要研究目标,通过酵母菌系统的功能筛选和体外生物化学分析,发现SARS病毒基因组1b区编码的一种非结构蛋白nsp14同时具有两种RNA加工酶活性,一是参与RNA 5’-端加帽的N7-甲基转移酶,二是进行RNA

牛乳头瘤病毒基因组结构和功能

  乳头瘤病毒(papillomavirus)是感染人和动物皮肤、粘膜并引起乳头状瘤病变的一种DNA病毒,属于乳多空泡病毒(papovavirus)科。根据病毒感染的宿主不同可以分为牛乳头瘤病毒(BPV),人乳头瘤病毒(HPV)等。已发现的乳头瘤病毒基因组都具有相似的结构。下面以BPV为例说明乳头瘤

酵母菌基因组转座子的诱变实验—-小载体聚合酶链反应

实验材料诱变转座子基因组文库质粒DNA试剂、试剂盒锚定囊泡引物1和2 、1 mol L MgCl2、普通小载体(UV)和mTn引物、转座子诱变酵母菌株、合适的限制性内切核酸酶(如AZmI或DraI)和缓冲液、10×T4 DNA连接酶缓冲液、5 mmol L ATP、400 U μL T4 DNA连接