上海巴斯德所研究人员阐述丙型肝炎病毒体外复制机制

4月30日,Plos pathogens在线发表了中科院上海巴斯德所丰田哲也研究组关于丙型肝炎病毒体外复制机制的最新研究成果。这项研究由丰田哲也研究组的研究人员与日本国立感染症研究室的Takaji Wakita研究室共同完成。 由于体外感染系统模型有限,丙型肝炎病毒(HCV)领域的科学研究进展受到限制。到目前为止,只有JFH1(2a)株病毒可以在体外培养的Huh7细胞中复制并产生具有感染性的病毒。为了找到JFH1复制的机制,研究人员首先比较了JFH1,HCR6(1b)和J6CF(2a)三株病毒RNA聚合酶的结构与生化特性等差异,并找到了能激活HCR6和J6CF聚合酶活性的JFH1特异性的氨基酸位点。在含有JFH1 N3H和3’ UTR区域时,在J6CF的RNA聚合酶中引入A450S,R517K和Y561F三个突变就可以使J6CF基因组在培养的细胞中复制并产生子代病毒粒子。研究人员在深入分析了其机制后,发现......阅读全文

RNA聚合酶的分类

通常可根据生物的类别,将RNA聚合酶分为原核生物RNA聚合酶、真核生物RNA聚合酶。原核生物和真核生物的RNA聚合酶有共同特点,但在结构、组成和性质等方面又不尽相同。(1)原核生物RNA聚合酶 研究得最清楚的是大肠杆菌RNA聚合酶。该酶是由五种亚基组成的六聚体(α2ββ'ωσ)分子量约500

DNA聚合酶及其应用

(一)大肠杆菌DNA聚合酶I是Kornberg A. 1956年首先从大肠杆菌E。Coli 细胞中分离出来的。它是一种多功能性的酶,包括 3种不同的酶活力:5′→ 3′聚合酶活性(模板, 带3′-OH游离基团的引物、4dNTPs、 Mg2+ )。双链特异性的5'→3'核酸外切酶活性。

RNA聚合酶的类别

通常可根据生物的类别,将RNA聚合酶分为原核生物RNA聚合酶、真核生物RNA聚合酶。原核生物和真核生物的RNA聚合酶有共同特点,但在结构、组成和性质等方面又不尽相同。(1)原核生物RNA聚合酶 研究得最清楚的是大肠杆菌RNA聚合酶。该酶是由五种亚基组成的六聚体(α2ββ'ωσ)分子量约500

RNA聚合酶的作用

  RNA聚合酶(RNA polymerase)的作用是转录RNA。有的RNA聚合酶有比较复杂的亚基结构。如大肠杆菌RNA聚合酶有四条多肽链,另有一个促进新RNA分子合成的σ因子,因此它的组成的是α2ββσ。这种结构称为全酶(holoenzyme),除去了σ因子的酶称为核心酶。噬菌体RNA聚合酶则没

关于聚合酶的介绍

  1957年,美国科学家阿瑟·科恩伯格(Arthur Kornberg)首次在大肠杆菌中发现DNA聚合酶,这种酶被称为DNA聚合酶I(DNA polymerase I,简称:Pol I)。1970年,德国科学家罗尔夫·克尼佩尔斯(Rolf Knippers)发现DNA聚合酶II(Pol II)。随

定量聚合酶链反应

中文名称定量聚合酶链反应英文名称quantitative PCR;qPCR定  义将某种已知含量的DNA模板作为内标准进行PCR反应,对待测模板进行定量分析的方法。更灵敏的定量PCR是采用实时PCR方法。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)

DNA聚合酶的功能

  [1] 聚合作用:在引物RNA'-OH末端,以dNTP为底物,按模板DNA上的指令由DNApolⅠ逐个将核苷酸  加上去,就是DNApolⅠ的聚合作用。 酶的专一性主要表现为新进入的脱氧核苷酸必须与模板DNA配对时才有 催化作用。dNTP进入结合位点后,可能使酶的 构象发生变化,促进3&

聚合酶的分类介绍

  可分为以下几个类群:(1)依赖DNA的DNA聚合酶;(2)依赖RNA的DNA聚合酶;(3)依赖DNA的RNA聚合酶;(4)依赖RNA的RNA聚合酶。前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为PolⅠ,PolⅡ和PolⅢ等);D

DNA聚合酶的种类

原核生物大肠杆菌DNA聚合酶DNA聚合酶最早在E.coli中发现,到目前为止已确定有5种类型,分别为DNA聚合酶Ⅰ、DNA聚合酶Ⅱ、DNA聚合酶Ⅲ、DNA聚合酶Ⅳ和DNA聚合酶V,都与DNA链的延长有关。其中DNA聚合酶I、Ⅱ、Ⅲ研究得比较明确。 DNA聚合酶Ⅰ是1956年由Arthur Kombe

关于副反转录病毒的基本介绍

  副反转录病毒(retrovirus)的病毒特征为其基因组是双股(+)RNA,病毒含有RNA-DNA聚合酶(RNA-directed DNA polymerase)亦即反转录脢(retrotranscriptase)做为复制之用,反转录病毒具有二十面体对称核心,内含核醣蛋白,外有包膜,一般研究认为

研究揭示黄病毒科NS3蛋白酶解旋酶协同作用新机制

  目前已知的RNA病毒的基因组长度均不超过35kb,编码容量非常有限。因此包含一个以上功能域的蛋白在这类病毒中较为常见,黄病毒科NS3蛋白即为丝氨酸蛋白酶和超家族二解旋酶的天然融合体,在病毒多聚蛋白酶解和基因组复制这两个重要过程中发挥关键作用,其两个功能域之间的协同作用机制尚不清晰。  中国科学院

关于HBV病毒的基本信息介绍

  核心颗粒直径28纳米,呈二十面体立体对称,它的表面才是病毒真正的衣壳,由乙肝病毒的核心抗原(HBcAg)组成。通过强去垢剂或者酶处理的方法,还可以暴露出HBV的另一个主要的抗原e抗原,它的本质还不是十分清楚,但多数人认为是核心的断片。 Dane颗粒的中心部位就是环状并且有缺口的DNA双链,和依附

武汉病毒所发现沙粒病毒影响天然免疫系统的新机制

  中国科学院武汉病毒研究所肖庚富研究团队在沙粒病毒和宿主天然免疫系统相互作用的分子机制方面取得新进展,首次提出了沙粒病毒聚合酶L蛋白具有多种生物功能的观点,相关论文Activation of the RLR/MAVS signaling pathway by the L protein of Mo

研究报道首个病毒RdRP转位中间体晶体结构

   核酸聚合酶是核酸生物合成的分子机器,是实现核酸遗传信息复制和传递的关键蛋白。在模板序列的指导下,聚合酶以NTP或dNTP为底物将单磷酸核苷(NMP)逐个添加到产物链上。每一次添加过程又称核苷酸添加循环(nucleotide addition cycle或NAC),由底物结合并诱导活性中心关闭、

eLIFE:艾滋病毒,人类基因组编辑新工具

  丹麦奥胡斯大学开发出了一项新技术利用HIV病毒来作为对抗遗传性疾病的一种工具。  研究人员首次成功地改造了HIV病毒颗粒,使得它们能够通过一些生物学过程(可以说是)同时“剪切和粘贴”我们的基因组。由奥胡斯大学生物医学系开发的这项新技术,使得以一种新的方式修复基因组变为可能(延伸阅读:2014值得

新冠病毒全基因组大小和序列的研究进展

  2月3日,《自然》在线发表论文介绍了上海公共卫生临床中心和复旦大学公共卫生学院教授张永振等人对2019-nCov的基因组序列的分析。该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。基因组分析显示,该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。  通过对从患者收集的

我国解析首例输入性寨卡病例病毒全基因组信息

  新华社北京2月23日电 记者23日从中国疾病预防控制中心了解到,中国疾控中心病毒病预防控制所专家团队与江西省疾控中心合作,对我国首例寨卡病毒感染病例血液标本中的寨卡病毒基因组进行了全面解析,已成功获得病毒全基因组序列。  寨卡病毒近来引起国际社会广泛关注。2015年5月,巴西出现首例寨卡病毒本地

我国首例输入性裂谷热病毒全基因组序列测定完成

  记者从国家质量监督检验检疫总局获悉:7月24日凌晨,该局和军事医学科学院微生物流行病研究所联合攻关,获得了我国首例输入性裂谷热病例的病毒全基因组序列。  “测序结果确认了该输入性病例为非洲流行的裂谷热病毒感染所致。”军事医学科学院微生物流行病研究所研究员童贻刚告诉科技日报记者,经测定,该病毒基因

人类肠道宏基因组的古菌病毒研究新进展

  2022年12月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在《自然-通讯》(Nature Communications)上,发表了题为Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in

新冠病毒基因组测序的方法有哪几种?

新冠病毒基因组测序的方法有宏基因组测序和靶向测序。

便携式基因组测序装置可快速检测埃博拉病毒

   [导读] 本周出版的英国《自然》杂志上发表的一项传染病学研究论文,描述了一个可以被装入行李箱并运输到现场使用的埃博拉病毒基因组测序监测系统,这个系统在收集样本后24小时内就可以得出结果。  该便携式基因组测序装置可插入笔记本电脑USB接口   科技日报北京2月4日电 (记者张梦然)本周出版的英

病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒使用说明

病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒一、简介病毒总核酸提取试剂盒适合于从血清、血浆、组织匀浆等样品中提取病毒总核酸。试剂盒基于硅胶柱纯化技术,提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提,也无需进行耗时的醇类沉淀。该产品已经成功地提取了乙肝A/C、丙肝、以及诺如病毒标准品等的核酸。获得的DNA/RNA可直接用于

首次体外合成新冠病毒,只需一周!

  反向遗传学是一种不可或缺的工具,它彻底改变了我们对病毒发病机制和疫苗开发的认识。大型RNA病毒基因组,如冠状病毒基因组,在大肠杆菌宿主中克隆和操作都很麻烦,因为它们体积庞大,而且有时不稳定。因此,为RNA病毒提供另一种快速、适用的反向遗传学平台将有利于研究人员加快相关研究。  近日来自瑞士伯尔尼

登革病毒的复制周期的相关介绍

  登革病毒与敏感细胞表面受体(可能是Fc受体)结合,通过细胞吞饮和膜融合形式进入细胞后,在溶酶体酶等作用下脱壳、释放病毒RNA。一方面,直接以病毒基因组RNA为mRNA,从单一翻译起始点开始合成多聚蛋白前体,进而经细胞信号酶的催化进行蛋白C与PrM、PrM与E、E与NS1之间的切割。因C、PrM和

武汉病毒所获得首个病毒RdRP转位中间体晶体结构

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科学家成功从结构上揭示牛痘病毒增殖机制

  为了让病毒增殖,它们通常需要被感染细胞的支持。在许多情况下,在感染附近的其他细胞之前,只有在宿主细胞的细胞核中才能找到它们复制它们自己的遗传物质所需的分子。但是并非所有病毒都能进入细胞核中。一些病毒停留在细胞质中,因此必须能够独立地复制它们的遗传物质。为此,它们必须带上它们自己的“加工零件”。在

近期两篇Cell新文:从结构上揭示了牛痘病毒增殖机制

  为了让病毒增殖,它们通常需要被感染细胞的支持。在许多情况下,在感染附近的其他细胞之前,只有在宿主细胞的细胞核中才能找到它们复制它们自己的遗传物质所需的分子。但是并非所有病毒都能进入细胞核中。一些病毒停留在细胞质中,因此必须能够独立地复制它们的遗传物质。为此,它们必须带上它们自己的“加工零件”。在

PCR的原理是什么

PCR全称多聚酶链式反应,原理是DNA的体外扩增。具体来说:在EP管里加入DNA、合成原料(dNTP、引物)、耐热的DNA聚合酶(taq)后,放入PCR仪,PCR仪会利用升温使DNA变性,在聚合酶的作用下使单链复制成双链,进而达到基因复制的目的。用途:1、核酸的基础研究:基因组克隆2、不对称PCR制

关于登革病毒的基因与蛋白的介绍

  登革病毒基因组RNA约含有11000个核苷酸,MW为4.2×106。其5′端为I型帽子结构,3′端缺乏poly(A)尾,基因组的5′端和3′端均有一段非编码区。基因组只有一个开放读码框,其5′端1/4编码病毒3个结构蛋白(C、PrM和E),3′端3/4编码7个非结构蛋白(NS1、NS2a、NS2

关于拟病毒的基本信息介绍

  拟病毒( virusoids)又称类病毒(viroid  -like)或壳内类病毒,是指一类包裹在真病毒粒子中的缺陷类病毒。拟病毒极其微小,一般仅由裸露的RNA(300~ 400个核苷酸)所组成。拟病毒是一种环状单链RNA。它的寄生对象是病毒,被寄生的病毒称为辅助病毒(help-er virus