美开发出专攻致命脑癌的“设计蛋白”
据美国物理学家组织网8月3日报道，美国研究人员在靶向攻击和破坏致死型脑部肿瘤——胶质母细胞瘤（GBM）方面取得了重大突破，他们创造出了一种设计蛋白（designer protein），它不仅可以找到GBM，而且可以侵入该细胞并杀死它，同时不会伤害邻近的健康细胞。相关研究报告发表在最新一期《基因和癌症》杂志上。 领导该项研究的美国维克森林大学浸会医学中心脑肿瘤中心主任沃尔德马·戴宾斯基表示，与手术、放射和化学疗法相比，他们采用的分子靶向方法侵入性更小。新研究或将开辟癌症治疗的新领域。 戴宾斯基解释说，GBM是最普遍的致死型脑部肿瘤。在确诊患有这种癌症后，病人的平均存活时间为14.5个月。在过去三四十年间，平均每十年的研究仅将病人的寿命延长一个月。在患者身上应用放射物治疗，对杀死这类癌细胞来说功效不大，因为它无法深入体内，到达其活性位点发挥作用。 大约20年以前，戴宾斯基和同事就已研发出了所谓“......阅读全文
西南大学特聘教授揭示癌症新机制
CSN6是组成型光形态发生因子9信号复合体的一个关键亚基。CSN6可以通过泛素-蛋白酶体系统调控癌症相关蛋白（比如p53、c-myc和c-Jun）的降解，因此受到了研究者们的广泛关注。 西南大学的研究人员最近在Oncogene杂志上发表文章，揭示了CSN6在胶质母细胞瘤（GBM）中的生物学功能
一个蛋白质引发的惨案－|－蛋白质促进癌细胞转移
最近，挪威卑尔根大学(UiB)的研究人员分离出了一种蛋白质，可使癌细胞能够进行扩散。相关研究结果发表在4月14日的《Cancer Cell》。 在一个肿瘤内的细胞差异很大。尽管一些仍然是“好”细胞，不制造麻烦，但是其他一些细胞会变得具有侵袭性，并开始扩散到其他器官部位。我们很难预测哪些细胞会变
Cell：设计蛋白质－抵御艾滋病
10年前，一些研究人员着手研究一种有着根本上区别的疫苗研发策略：如何“哄骗”免疫系统制造一类罕见而强大的广泛中和抗体（bNAb），其能消灭几乎每一个艾滋病病毒的变种。如今，3个不同的小组已朝着这个目标迈出了至关重要的步伐。艾滋病病毒之所以能战胜候选疫苗以及人体自身防线，是因为它变异得非常快，从而
Science:人为设计蛋白可抑制流感病毒
流感，是全球最危险的传染病之一，在这场流感战争中出现了一种新的武器。科学家们开发了一个设计蛋白，可阻止流感病毒感染培养的细胞，在具有大量病毒的环境下亦可保护老鼠免受得病。这也可作为较为敏感的诊断。此外，该蛋白并不是用于治疗，或许可在未来用于开发流感药物，科学家说道。 “这是个振奋人心的消息，”
AI设计出具非凡结合强度蛋白质
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514540.shtm 一种使用深度学习方法设计出来的新蛋白质。图片来源：华盛顿大学医学院蛋白质设计研究所美国科学家借助机器学习软件，创建出一批具有非凡结合强度的蛋白质分子。这些分子与包括人类激素
设计的蛋白质的应用和实例
酶设计新酶的设计是蛋白质设计在生物工程和生物医学领域的巨大应用。通常，设计蛋白质结构可能与设计酶不同，因为酶的设计必须考虑催化机制中涉及的许多状态。然而，蛋白质设计是从头进行酶设计的先决条件，因为至少催化剂的设计需要支架，在支架中可以插入催化机理。在21世纪的前十年，从头酶设计和重新设计取得了巨大进
AI首次“从零开始”设计蛋白酶
在新一期《科学》期刊上，诺贝尔奖得主、美国华盛顿大学的大卫·贝克及其团队发表了一篇突破性研究论文：他们首次利用人工智能（AI）技术，从零开始设计了具有复杂活性位点的丝氨酸水解酶。这项成就标志着酶工程领域的一个重要里程碑，表明现在人们有能力设计出具有天然酶活性的酶，并且这些人工设计的酶还具备实际应用潜
Nat－Commun：天然蛋白可用于设计抗癌疫苗
纳米疫苗在治疗癌症方面取得了一定的成效，但由于大规模生产以及质量控制问题导致其临床应用仍受到局限。最近，来自NIBIB的研究者们开发出了一种新的技术，将纳米疫苗与机体天然清蛋白相结合，清蛋白能够运送纳米复合物进入淋巴结，引发小鼠的抗肿瘤免疫反应。这一突破为纳米疫苗的临床应用提供了新的思路。（图片
AI可据蛋白结构快速设计药物分子
一种新的生成式AI可从头开始设计分子，使其与相应蛋白质精确匹配。图片来源：苏黎世联邦理工学院科技日报讯 （记者张梦然）瑞士苏黎世联邦理工学院化学家开发出一种新的人工智能（AI）算法程序，可根据蛋白质的三维表面快速、轻松地设计活性药物成分。最新一期《自然·通讯》杂志刊发的这一成果，可能彻底改变药物研发
人工设计酶蛋白带来“更绿”制造
在化学反应中，催化剂能改变反应的速度和效率，而酶可谓现代生物催化反应的“芯片”。若用理想的生物酶为“媒”，生物催化可事半功倍。 “生物酶本质上是一种蛋白质，或称酶蛋白。”中科院微生物所研究员吴边解释说，“蛋白质的功能主要由它的结构，即蛋白折叠方式来决定，而其结构则由基本构成单位——氨基酸的
研究揭示ATF4依赖果糖代谢促胶质瘤恶性进展
多形性胶质母细胞瘤（Glioblastoma multiforme，GBM）是一种恶性程度极高的脑部肿瘤。在正常生理条件下，GBM利用葡萄糖作为主要能量物质来源支持肿瘤细胞的快速增殖，此外，其他营养物质如果糖、氨基酸和脂肪酸等也可作为GBM的能量来源。流行病学研究表明，果糖的过量摄取与肿瘤恶性进展密
揭示USP9X去泛素化ALDH1A3并维持GCSs的间充质特性
胶质母细胞瘤（GBM）是最常见和破坏性的人脑恶性肿瘤，其特征在于广泛的肿瘤内异质性。尽管最近在多模式治疗方面取得了进展，但GBM患者的结果仍然令人沮丧。GBM拥有一个细胞亚群，称为GBM干细胞（GSCs），具有自我更新活性和多向分化潜能以及肿瘤起始能力。因此，迫切需要探索针对GSC的新治疗策略。
多肽药物解除蛋白相互作用抑制癌细胞转移
近日，来自美国奥古斯塔大学的研究人员发现一个叫做WASF3的基因在癌细胞中持续表达，但在健康细胞中处于静默状态，该基因或成为降低癌细胞转移能力的重要靶向目标。 之前研究发现WASF3蛋白能够促进癌细胞侵袭，最近科学家们通过药物阻断该蛋白与另外一个帮助其维持功能的蛋白的相互作用，发现能够抑制具有
纳米粒子与转铁蛋白可猎杀癌细胞
据物理学家组织网报道，转铁蛋白与纳米粒子结合就可瞄准并杀死拉莫斯癌细胞，而无需负载其他化疗药物，此项发现将有望发展出癌症靶向治疗的新策略。相关研究成果发表在本周的《美国化学协会杂志》上。 美国北卡罗莱纳大学教堂山分校文理学院的首席化学教授约瑟夫·德西蒙博士领导的研究小组发现
Nat－Cell－Biol:－关键蛋白预测癌细胞向脑部的转移
最近，来自威尔·康奈尔医学院等机构的研究人员发表一项研究，发现了促进乳腺癌，肺癌和其他癌症细胞向大脑扩散或转移的关键蛋白质——“CEMIP”，该蛋白未来或许会成为预测，预防和治疗癌细胞脑部转移症状的重点靶标。 相关结果发表在最近的《Nature Cell Biology》杂志上。在该研究中，科
《癌细胞》：特殊蛋白质开关抑制皮肤癌形成
这一发现为预防皮肤癌提供了新的治疗标靶 美国科学家近日研究发现，蛋白IKK alpha(IKKα)调控着角化细胞的细胞周期，并在阻止这些皮肤细胞转化为恶性肿瘤方面扮演了关键角色。研究人员称，这一发现为预防皮肤癌提供了新的治疗标靶。相关论文发表在9月9日的《癌细胞》(Cancer Cell)杂志上。
Nature：蛋白过度表达可能是癌细胞的致命弱点
在一项使用酵母细胞和癌症细胞系的研究中，约翰霍普金斯大学的科学家们报告说，他们发现在拥有额外染色体组的癌细胞中存在一个潜在的弱点。染色体组是携带遗传物质的结构。研究人员表示这种脆弱性根源于癌细胞的一个共同特征--细胞内蛋白质浓度高--这使它们看起来臃肿不堪，而且可能成为癌症治疗的新靶点，相关研究
Nat－Methods－：探测癌细胞蛋白激酶构成的新工具
近日，科学家们开发出一种能更好地识别和衡量控制癌细胞行为的重要分子（蛋白激酶），这就为癌症诊断，预测和监测工具的改善铺平了道路。探测癌细胞蛋白激酶构成的新工具 英国癌症研究中心研究人员关注于蛋白激酶，其是控制细胞各个功能的分子。这项研究发表在Nature Methods杂志上。 早期的工作表
PNAS：癌细胞或能利用特殊铜结合蛋白来发生转移
日前，一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究报告中，来自瑞典查尔姆斯理工大学等机构的科学家们通过研究发现，乳腺癌细胞中发现的一种名为Atox1的蛋白或参与了癌细胞的转移过程，该蛋白或有望作为一种潜在的生物标志物来帮
芬戈莫德抗胶质母细胞瘤的研究进展
芬戈莫德（fingolimod，FTY720）作为一种新型免疫抑制剂，是其前体药物鞘氨醇-1-磷酸（sphingosine-1-phosphate，S1P）的受体激动剂，是第1个批准口服治疗复发缓解型多发性硬化（relapsing-remitting multiple sclerosis，RRM
Nature－Communications：微流控捕获脑肿瘤脱落的细胞外囊泡
精确的癌症治疗依靠获得有关肿瘤的分子信息来指导有效的治疗决策。由于脑肿瘤的针头活检是侵入性的且困难的，因此生物工程师已经开发了捕获脑肿瘤释放的细胞外囊泡(EV)的微技术。囊泡携带突变的遗传物质和蛋白质样品，引起恶性肿瘤，研究人员希望对其进行分析以优化治疗方法。 尽管它们携带大量信息，但来自肿瘤
《Nature－Genetics》染色体外DNA会改变癌基因扩增水平
恶性胶质瘤（glioblastoma，GBM）是最常见且最具攻击性的脑癌，标准治疗反应很差，两年生存率仅为15%。最近，《Nature Genetics》的一篇文章发现了GBM肿瘤耐药的一个关键密码。 为了靶向遏制GBM的攻击性，杰克逊实验室（Jackson Laboratory，JAX）教授
新策略助力蛋白蛋白相互作用先导化合物设计
中国科学院上海药物研究所研究员罗成、周兵、陈奕和华东师范大学研究员陈示洁合作，提出“强支点占据-杠杆干扰”（FOLP）的蛋白-蛋白相互作用（PPI）先导化合物设计策略，为PPI领域研究提供新的概念和方法，将有助于未来其他PPI调控剂的开发。相关研究8月19日发表于《德国应用化学》，并被推荐为“Hot
新策略助力蛋白蛋白相互作用先导化合物设计
中国科学院上海药物研究所研究员罗成、周兵、陈奕和华东师范大学研究员陈示洁合作，提出“强支点占据-杠杆干扰”（FOLP）的蛋白-蛋白相互作用（PPI）先导化合物设计策略，为PPI领域研究提供新的概念和方法，将有助于未来其他PPI调控剂的开发。相关研究8月19日发表于《德国应用化学》，并被推荐为“H
李蔚博士Nature遏制肿瘤生长的开关
就像用调光开关来调节房间的光亮一样，生物化学家们鉴别出了一种蛋白，可利用它来减慢或加速小鼠脑瘤的生长。这项研究发表在5月11日的《自然》（Nature）杂志上。 来自贝勒医学院的李蔚（Wei Li）博士与德克萨斯大学健康科学中心的Eric J. Wagner博士及Ann-Bin Shyu博士共
生成式AI设计出非天然蛋白质
加拿大多伦多大学研究人员开发了一种人工智能系统，可以使用生成扩散来创建自然界中不存在的蛋白质。该系统有望使治疗蛋白的设计和测试更加高效和灵活，从而加速人类药物开发。研究发表在最新一期《自然·计算科学》杂志上。 蛋白质由氨基酸链组成，氨基酸链折叠成的三维形状反过来又决定了蛋白质的功能。这些折叠的
首个人工设计的特定跨膜蛋白诞生
西湖大学未来产业研究中心特聘研究员卢培龙课题组首次实现了跨膜荧光激活蛋白的从头设计，这也是第一个通过人工设计得到的能够非共价结合特定小分子的跨膜蛋白。2月20日，相关研究成果发表在线发表于《自然》。从头设计跨膜荧光激活蛋白模型。课题组供图 如果将细胞膜看作城墙的话，膜蛋白就是进出城市的城门，细
AI无需人干预设计新蛋白质
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516030.shtm
人工智能可从头开始设计灭菌蛋白
美国科学家在最新一期《自然·生物技术》杂志上发表论文指出，他们开发出一款新的人工智能（AI）工具ProGen，其能从头开始设计出已被证明有效的抗菌蛋白质，最新方法有望用于研制新药。 蛋白质由氨基酸链组成，这些氨基酸的顺序决定了蛋白质的形状和功能。在最新研究中，加州生物技术初创公司Profilo
Science：从头设计出能够自我组装的蛋白丝
在自然界中，蛋白丝（protein filament）是活细胞中的若干结构部分和运动部分以及许多身体组织的必要组分。这其中就包括赋予细胞形状的细胞骨架、协调细胞分裂的细胞微管以及我们体内最常见的蛋白---胶原蛋白，它给我们的软骨、皮肤和其他组织提供强度和灵活性。 在一项新的研究中，美国华盛顿大