《NatureGenetics》染色体外DNA会改变癌基因扩增水平
恶性胶质瘤（glioblastoma，GBM）是最常见且最具攻击性的脑癌，标准治疗反应很差，两年生存率仅为15%。最近，《Nature Genetics》的一篇文章发现了GBM肿瘤耐药的一个关键密码。 为了靶向遏制GBM的攻击性，杰克逊实验室（Jackson Laboratory，JAX）教授Roel Verhaak和亨利-福特健康系统赫梅林脑肿瘤中心的助理教授Ana C. deCarvalho专门检查了患者治疗前后以及异种移植（PDX）小鼠模型肿瘤细胞进化过程中的基因组变化。 报告指出，肿瘤进展通常由位于染色体外的癌基因（oncogenes）驱动。 通过患者培养细胞和小鼠肿瘤细胞分析，研究人员发现细胞都保持着相同的基因组病变，这表明PDX小鼠是研究GBM的相对准确且有效的实验模型。但是在少数情况下，主要的差别在于PDX小鼠和患者培养细胞的癌基因拷贝数。 这相当重要。因为癌基因增加或扩增会引发癌症和帮助癌细胞生存下来......阅读全文
科学家揭示肿瘤“作弊器”持续存在的关键机制
在癌细胞的生存竞赛中，有一种特殊的“作弊器”——染色体外DNA（ecDNA）。它像是一个游离在细胞内的“外挂程序”，以环状小圈的形式携带关键致癌基因，帮助癌细胞“开挂升级”。临床数据显示，ecDNA存在于30%至50%的恶性肿瘤中，它的存在显著加剧了肿瘤侵袭性、治疗耐药性和患者死亡率。早在1965年
癌症DNA环“密码”被科学家破解
美国斯坦福大学医学院团队及其国际合作者在《自然》杂志上发表了三篇研究论文，彻底改变了科学界对小DNA环（ecDNA）在人类癌症中所起作用的理解。这些研究详细阐述了ecDNA在近15000例癌症患者中的分布及对预后的影响，揭示了一种违反遗传学基本规律的新型遗传方式，并介绍了一种针对ecDNA的抗癌
研究揭示尿路上皮癌进化的核心基因密码
尿路上皮癌是恶性肿瘤，具有易复发、多灶性生长、高度遗传异质性等特点。目前，驱动尿路上皮癌异质性演化的遗传机理尚未阐明。 近日，中国科学院杭州医学研究所科研团队联合中外团队协同攻关，在尿路上皮癌研究领域取得进展。该研究发现名为ecDNA的物质如同肿瘤的“幕后黑手”一般，在尿路上皮癌的演变过程中发
研究揭示尿路上皮癌进化的核心基因密码
尿路上皮癌是恶性肿瘤，具有易复发、多灶性生长、高度遗传异质性等特点。目前，驱动尿路上皮癌异质性演化的遗传机理尚未阐明。 近日，中国科学院杭州医学研究所科研团队联合中外团队协同攻关，在尿路上皮癌研究领域取得进展。该研究发现名为ecDNA的物质如同肿瘤的“幕后黑手”一般，掌握着这种肿瘤的核心基因密
研究揭示尿路上皮癌进化的核心基因密码
尿路上皮癌是恶性肿瘤，具有易复发、多灶性生长、高度遗传异质性等特点。目前，驱动尿路上皮癌异质性演化的遗传机理尚未阐明。近日，中国科学院杭州医学研究所科研团队联合中外团队协同攻关，在尿路上皮癌研究领域取得进展。该研究发现名为ecDNA的物质如同肿瘤的“幕后黑手”一般，掌握着这种肿瘤的核心基因密码，在尿
科学家首次证实促癌的ecDNA在细胞癌变之前就已经存在！
在细胞中，DNA紧密盘绕成染色体结构，储存着正常细胞生长和存活所需的所有遗传物质。然而，也存在一些微小的环状DNA片段属于“编制外人员”，它们游离在染色体之外，被称为染色体外DNA（ecDNA）[1,2]。 作为编制外人员，ecDNA很是自由自在，想去哪就去哪。在细胞复制时，不同于“捆绑”在染
肿瘤细胞中ecDNA新机制在斯坦福大学致癌基因研究应用2
（5）EcDNA hubs调控两个癌基因位点的分子互作上述研究证明ecDNA hubs可能促进分子间增强子-启动子相互作用。为了验证这些相互作用，作者对人类胃癌细胞系中两种类型的ecDNA进行了研究，一种ecDNA包含来自8号染色体的MYC扩增子，另一种包含来自10号染色体的FGFR2扩增子。用
肿瘤细胞中ecDNA新机制在斯坦福大学致癌基因研究应用1
文章导读eccDNA是染色体外的一种特殊的环状DNA，从它的出现至今已长达数年，但在起初的很长一段时间里并未得到人们的重视。随着高通量技术的发展，eccDNA(extrachromosomal circular DNAs，eccDNAs)作为染色体外的环状DNA的研究也进一步深入。在国际学术
《Nature－Genetics》染色体外DNA会改变癌基因扩增水平
恶性胶质瘤（glioblastoma，GBM）是最常见且最具攻击性的脑癌，标准治疗反应很差，两年生存率仅为15%。最近，《Nature Genetics》的一篇文章发现了GBM肿瘤耐药的一个关键密码。 为了靶向遏制GBM的攻击性，杰克逊实验室（Jackson Laboratory，JAX）教授
《Nature》：癌基因“地震扩增”，驱动多种癌症！
染色体外DNA（ecDNA）是一类特殊的从正常基因组上脱落下来的游离于染色体外的环状DNA。早在1964年，人们就在神经母细胞瘤细胞中观察到了ecDNA的存在 ，但由于技术受限，人们对于ecDNA在肿瘤发生发展中发挥的具体作用未能有更进一步认识。 2017年Paul Mischel团队在《自然
科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能
早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年，来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出，它们是以染色体外DNA（extrachromosomal DNA，ecDNA）的形式存在的，但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。 201
染色体外DNA——导至癌症恶变的罪魁
北京时间11月21日，发表在《Nature》上的一篇新研究发现，在人类肿瘤细胞中发现大量如“甜甜圈”般的环状染色体外DNA(EcDNA)，改变了与癌症相关基因的表达方式，从而促进了癌细胞的侵袭性，并在肿瘤快速进化和抵御威胁的能力（如化疗、放疗和其他治疗）中发挥了关键作用。该研究由美国加州大学圣地亚哥
再登Nature－GeneticsecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良...1
再登Nature Genetics-ecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良预后相关文章导读研究发现，许多扩增的原ai基因，并不只是位于染色体，而且还能变成游离的染色体外DNA（ecDNA），并出现大量拷贝，而且相当高比例的ecDNA是以环状DNA分子的形式存在，即eccDNA（染色体外环状DNA
研究提出单细胞多组学新方法实现胰腺癌循环肿瘤细胞多维度解析
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员林达等报道了新开发的单细胞多组学技术——Uni-C。该方法可在一个细胞中同时解析基因组大尺度结构变异（如SV、CNV、ecDNA）、小尺度突变（SNP/INDEL）及染色质三维构象，实现高分辨率、多维度的联合分析。胰腺癌异质性强、进展迅速，临床面临早筛困
Nature子刊：郑大王立东揭示中国北方贲门癌与饮食相关性
河南、河北和山西三省交界的南太行山地区，特别是河南林州（原林县）是中国也是世界上食管癌和贲门癌发病率和死亡率最高的地区。 1959年，河南省政府组建以河南医学院牵头的，以沈琼教授、刘桂亭教授、裘宋良教授等为代表的食管癌防治医疗队深入林县开展多学科综合防治研究。从此揭开了郑州大学医科三代人、六十
再登Nature－GeneticsecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良...2
3.与线性DNA相比，ecDNA扩增导致的ai基因转录水平更高环状ecDNA扩增的转录结果发现，在所有扩增子类别中观察到DNA CN和ai基因表达水平高度明显相关(图3a)。然而，DNA CN归一化后，环状扩增子上的ai基因表达明显高于非环状扩增子。转录活性中不依赖于CN的增加现象可能部分是因为
新方法实现胰腺癌循环肿瘤细胞多维度解析
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员林达团队与上海市第一人民医院实验动物中心主任杨玉琴团队开发出单细胞多组学技术-Uniform Chromosome Conformation Capture（Uni-C）。该方法可在一个细胞中同时解析基因组大尺度结构变异（如SV、CNV、ecDNA）、小
癌基因的关键——染色体外环状DNA（eccDNA）
实验方法：环状DNA-seq, RNA-seq（云序生物提供以上服务）1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构，作者通过环状DNA-seq（云序生物提供以上服务）方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外，并且
国自然研究热点——eccDNA的前世今生（三）
小编在这儿也给大家整理了eccDNA表达谱的研究思路，如下图。 （2）生物标志物eccDNA优于线性DNA的生物稳定性以及独特的分子结构特征，为迅速发展的无创活检道路增添了新的方向，如果有较多的临床样本，它非常适合做生物标志物的研究。下面这篇文章是eccDNA在液体活检方面探索的先驱文章，小编带大家
国自然研究热点——eccDNA的前世今生（二）
(3) 形成特征早期的研究发现eccDNA是基因扩增的产物，是基因组不稳定性的一种表现形式。肿瘤基因扩增往往以两种方式，一种是在染色体上进行基因的扩增，另一种则是形成eccDNA。目前关于肿瘤中eccDNA的形成机制还没有定论。早期的研究认为短重复序列是介导eccDNA形成的因素，主要通过基因重组机
国自然研究热点—eccDNA的前世今生
1. eccDNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2019年11月，顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知，同时也迅速引爆了整个生
国自然研究热点—eccDNA的前世今生
2019年11月，顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界，一时之间，将人们的目光都吸引到这个科研界的新宠
肿瘤研究，从认识肿瘤细胞开始
最近一段时间我们一直围绕着肿瘤动物模型的构建，为大家介绍了肿瘤研究中各种实用动物模型的建立方法，相信大家应该收获颇多。动物水平的研究为我们提供了更接近临床的数据分析，与此同时，肿瘤细胞的实验研究也同样重要，它是肿瘤研究的初级阶段，可以更加快捷地提供在体外水平的研究结果。本期我们就开启肿瘤细胞学新
肾盂肿瘤和输尿管肿瘤的基本介绍
肾盂肿瘤和输尿管肿瘤，约占所有尿路上皮肿瘤的10%左右。本病多数为移行细胞癌，少数为鳞癌和腺癌，后二者约占肾盂癌的15%左右，它们的恶性程度远较移行细胞癌为高。临床所见移行细胞癌可在任何被覆有移行上皮的尿路部位先后或同时出现，因此，在诊断及处理上应视为一个整体，不能孤立地对待某一局部的移行细胞癌
肿瘤标志物高是否就有肿瘤？
肿瘤标志物是指在肿瘤发生和增殖的过程中，由肿瘤细胞合成、释放或者是机体对肿瘤细胞反应而产生的一类物质。当机体发生肿瘤时，血液、细胞、组织或体液中的某些肿瘤标记物就可能会相应的升高。通过肿瘤标志物的检查可以在肿瘤普查中早期发现肿瘤病人，帮助观察抗肿瘤治疗疗效以及判断预后。
研究成功抑制肿瘤血管、阻止肿瘤生长
美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)和其他机构的科学家设计了一种新策略，以阻止肿瘤生长所需的新血管。曾经被认为是极有希望的癌症治疗手段--阻断刺激新的血管生长(血管生成)的分子已被证明无效，因为肿瘤细胞的反应会产生更多的刺激分子。新的策略包括使关键的酶
肿瘤微环境稳态重塑可阻抑肿瘤进展
肿瘤的发生、发展、侵袭和转移等生物学行为与其所处环境——肿瘤微环境（TME）密切相关。因此，对TME的稳态重塑和免疫调节机制的深入理解，是实现对恶性肿瘤有效抑制、克服免疫逃逸以及逆转药物耐受的关键。中国工程院院士、国家分子医学转化中心主任、空军军医大学基础医学院细胞生物学教研室陈志南教授和边惠洁、杨
关于肾盂肿瘤和输尿管肿瘤的检查介绍
1、肾盂肿瘤和输尿管肿瘤的检查— 排泄性泌尿系造影 可见充盈缺损，应与尿酸结石、基质石鉴别，有时缺损可因血块所致，肾实质肿瘤和囊肿均可能见肾盂肾盏充盈缺损，有时需配合B超和CT方可确诊。 排泄性泌尿系造影不良时应配合逆行性造影或其他检查。 2、肾盂肿瘤和输尿管肿瘤的检查— 逆行性泌尿系造影
肿瘤微环境稳态重塑可阻抑肿瘤进展
肿瘤的发生、发展、侵袭和转移等生物学行为与其所处环境——肿瘤微环境（TME）密切相关。因此，对TME的稳态重塑和免疫调节机制的深入理解，是实现对恶性肿瘤有效抑制、克服免疫逃逸以及逆转药物耐受的关键。 中国工程院院士、国家分子医学转化中心主任、空军军医大学基础医学院细胞生物学教研室陈志南教授和边
循环肿瘤细胞检测有助早期发现肿瘤转移
本报讯 1896年，澳大利亚学者Ashworth在一例转移性肿瘤患者血液中首次观察到从实体肿瘤中脱离并进入血液循环的肿瘤细胞，并率先提出了循环肿瘤细胞(CTC)的概念。近年来世界各国研究人员围绕CTC在乳腺癌、结直肠癌等肿瘤中的应用价值开展了多项探索研究。美国乔治敦大学医院教授Minetta