益生乳酸菌全基因组序列测定完成
内蒙古农业大学正式公布,益生乳酸菌的全基因组序列测定分析全部完成,这是我国第一个完成的乳酸菌基因全序列测定。 由内蒙古农业大学“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室主持进行的益生乳酸菌的全基因组序列测定Lb.casei Zhang科技项目是经过6年分离、筛选,并进行系统研究开发的具有完全自主知识产权的益生菌,该项目是国家863、国家自然科学基金、教育部科学研究重点项目及内蒙古自治区虚拟乳业研究院的重点研究攻关项目。 目前国际上对益生菌的研究已经进入了基因时代,特别是采用蛋白组学、基因组学、代谢组学的技术和手段,能够高效地将益生菌的功能特性和功能基因进行准确地定位。该项目的完成,为该菌株益生机理研究和相关产品的开发应用从基因水平上奠定了基础,大大提高了研究开发的科学性和效率,使我国益生乳酸菌的研究进入了一个新的发展高度,可以极大地带动我国益生乳酸菌研究和开发,标志着我国在乳酸菌基因组学方面的研究达到国际水平。 目前,内蒙古农......阅读全文
-全基因组测序时代:我们应该探知胎儿的未来吗?
一项新技术或产品的问世,在给人们带来欣喜的同时,也可能引起担忧。 国际权威刊物《自然》杂志曾发表一篇报道,称仅利用怀孕妇女的血液样本就能获得胎儿的DNA,从而进行胎儿的基因组测序。这项研究提示,妊娠早期即可对胎儿进行全基因组测序,这一技术使得产前检查又提高到新的水平。 有了上述新方法之后,准
多名学者推荐全基因组分析转录因子功能新技术
来自北卡罗来纳大学教堂山分校,NIH等处的研究人员利用一种新型方法,分析了酵母转录因子Rap1在整个基因组中的结合动态,从而可以更好研究这一转录因子的功能,这一方法将有助于科学家们实时分析转录情况,相关成果公布在Nature杂志上。 对于这一成果,来自法国国家科学研究中心的François
我国科学家绘制完成鲤鱼全基因组序列图谱
鲤科鱼类是我国最重要的水产养殖种类,年产量占我国淡水养殖总产量的70%以上,其中鲤鱼不仅是我国也是世界性的重要养殖鱼类。5月6日,中国“鲤鱼基因组计划”学术报告会暨新闻发布会在京举行。由中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中科院北京基因组研究所共同实施
国际首例猪T2T全基因组组装成功
2月8日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所张龙超研究员、黑龙江省农业科学院畜牧研究所刘娣研究员、重庆市畜牧科学院王金勇研究员、岳麓山实验室印遇龙院士、四川农业大学李明洲教授联合发布消息,国际首个猪T2T全基因组组装——民猪完整全基因组构建成功完成,标志着猪基因组研究迈入“完整解析”时代,为我国养殖业
中国完成海带等7种海洋生物全基因组测序
中国科学家10月30日在青岛首次披露了海带、栉孔扇贝和南美白对虾全基因组测序的部分成果,至此中国已完成7种大型海洋生物的全基因组测序,为改良这些海洋生物品质、提高产量奠定了科学基础。 中国的海洋生物基因组学研究虽然起步较晚,但现在一些研究成果已达到国际前沿水准。目前,人类完成全基因组测序的
我国解析首例输入性寨卡病例病毒全基因组信息
新华社北京2月23日电 记者23日从中国疾病预防控制中心了解到,中国疾控中心病毒病预防控制所专家团队与江西省疾控中心合作,对我国首例寨卡病毒感染病例血液标本中的寨卡病毒基因组进行了全面解析,已成功获得病毒全基因组序列。 寨卡病毒近来引起国际社会广泛关注。2015年5月,巴西出现首例寨卡病毒本地
新突破!掌上测序仪首次完成人类全基因组测序
最近,英国牛津大学(Oxford University)Wellcome Trust人类遗传学中心(Wellcome Trust Centre for Human Genetics)和在基因组分析领域领先的英国公司Genomics plc宣布,首次使用掌上纳米孔测序仪完成了多个人类全基因组测序和
昆明植物所破译稻属植物5个物种全基因组
亚洲栽培稻(一般称为水稻)是世界上最重要的粮食作物之一,是中国第一大粮食作物,养活了80%以上的中国人口。在水稻与其它约23个物种共同组成的稻属植物中,它和7个稻种(普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻、长雄蕊野生稻和南方野生稻)都是AA基因组类型,这些水稻近缘物种间断分
全基因组解析推动中药灵芝成为首个药用模式真菌
《自然》 子刊 《Nature Communications》近期发表了中国医学科学院药用植物研究所陈士林课题组与美国、法国等合作单位关于基因组解析推动灵芝成为药用模式真菌的论文,并以特别图片(Featured Image)形式进行了推介,随后《今日美国》(US TODAY)以“揭秘
全基因组测序用于临床之前,技术性挑战仍然存在
据3月12日发表在《美国医学会杂志》上的一则研究报告披露,在一项有12名成年人参与的探索性研究中,应用全基因组测序(WGS)与不完整的遗传性疾病基因的覆盖、检测具有最高潜在临床影响的基因变异的低复验性,以及临床报告发现的不确定性有关,尽管在某些案例中,WGS会发现基因变异株从而引入早期的医疗干预
全基因组测序在临床感染疾病研究中的应用
感染病分子诊断中,PCR是公认的首选技术。然而全基因组测序(WGS)可能会超越PCR成为首选。在今年举行的欧洲临床微生物学和感染病大会(ECCMID)上,关于该技术的科学研究展示数量迅速增长,正好证明了这一点。 大会上研究人员从多个方面探讨了WGS在临床中的应用,包括帮助预测耐药性,促进流感疫
长牡蛎和栉孔扇贝全基因组框架图绘制完成
日前,长牡蛎和栉孔扇贝全基因组框架图绘制完成,并筛查得到与重要性状相关的基因或信号通路,在国际上填补了冠轮动物基因组学研究空白。 这是在国家863计划支持下,由中国海洋大学、中国科学院海洋研究所、中国水产科学研究院黄海水产研究所、中国科学院南海海洋研究所、威海长青海洋科技股份有限公司、大连獐子
云健康开启Illumina-HiSeq-X-Ten全基因组测序时代
1月20日,沪上百余位知名媒体人及社会各界名流云集悦达889广场6楼云健康医疗科技集团总部(Cloud Health Medical Group,Ltd),共同见证航母级健康平台——云健康的上海首度公开亮相。当天云健康宣布启动 Illumina HiSeq X Ten 全基因组测序,同时旗下云健
我国科研机构联合破译白公式豚全基因组图谱
南京师范大学、华大基因等单位的科研人员成功破译了白鱀豚全基因组图谱,为解析白鱀豚独特的生活习性及进化历程奠定了重要的遗传学基础,同时也为哺乳动物尤其是鲸类的研究与保护提供了宝贵资源。最新研究成果今天在《自然·通讯》杂志发表。 科研人员对一只雄性白鱀豚进行了全基因组测序,并构建了高质量基因组
mosquito--dragonfly在新冠病例全基因组测序中的应用
截止目前,全球新冠确诊病例超200万例,在国内疫情被逐步控制的情况下,国外却呈现愈演愈烈之势,总体情况不容乐观。在这个背景下,世界各国对新冠疫苗和药物研发以及相关的检测试剂盒的开发也在紧锣密鼓的进行中,并取得了初步的成果。 近日,英国政府投资2000万英镑,联合NHS、公共卫生机构、Sanger研究
中国古代家犬线粒体全基因组揭示其种群扩散
1月8日,中科院生物一区杂志《分子生物学与进化》(Molecular Biology and Evolution)在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古DNA实验室付巧妹研究员团队与中国科学院昆明动物研究所、陕西省考古研究院、浙江省文物考古研究所、兰州大学和四川大学等合作完成的关于中国古
盘点全基因组检测CRISPR脱靶位点的几种重要技术
在2013年,来自麻省总医院的研究人员发现使用CRISPR-Cas RNA引导性核酸酶的一个重要局限:会在预期靶点以外的位点上生成多余的DNA突变。此后陆续有研究直接说明了CRISPR/Cas9存在严重的脱靶性,即该技术可以发生非特异性切割,引起基因组非靶向位点的突变,这样会造成研究结果的不确定
新研究可大幅提高杂交水稻全基因组选择预测精度
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505572.shtm水稻是人类重要的粮食作物之一,水稻杂交种的产量高于常规自交系品种,但由于杂交稻存在显性等非加性效应,稻米品质的遗传改良比自交稻更具挑战性。湖南农业大学植物保护学院副教授李兰芝团队联合美
我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制
近日,由中国水产科学研究院首席科学家孙效文牵头,中国水产科学研究院联合黑龙江水产研究所、中科院基因组研究所、哈佛大学、奥本大学等单位组建的国际合作研究团队,完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制,在国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究成果于9月21日在国际生物学权威期刊《自然—
从全血和体液中提取基因组DNA的操作步骤
提取DNA需要的仪器和试剂: ⑴ 1.5ml 离心管⑵ 移液管: 1000μl, 200μl, 40μl 各一支和移液管尖头: 100-1000μl, 1-200μl 各一盒⑶ 微型滤柱(备用)⑷ 小型旋转混合器一台⑸ 小型离心机: 可放入1.5ml 离心管和2ml收集管.⑹ 恒温水浴⑺ 电冰箱:
浙江省农科院获取小黄鱼全基因组
17日,记者从浙江省农科院获悉,该院水生生物研究所小黄鱼科研团队与美国奥本大学、厦门大学合作,首次完成小黄鱼全基因组组装注释与精细图谱绘制,为建立小黄鱼基因组选择育种、培育高产抗病优质良种提供了基因资源和技术手段,相关研究论文近日在线发表于学术期刊《分子生态学资源》上。
我国科学家成功获取奥氏马全基因组数据
日前,吉林大学考古学院蔡大伟教授团队与西北农林科技大学动物科技学院姜雨教授团队在马属动物古DNA研究领域取得重要进展。该研究在国际上首次成功获取已灭绝马属动物奥氏马的高质量全基因组数据,重建了马属动物的演化历史。 马科动物自古以来就与人们的关系密切,对人类社会文明的发展产生了重大影响。中国家马起
重磅喜讯:全基因组测序助力准父母订制双胞胎!
一个科学家研究小组开发出一种新型的全基因组测序方法: 可用来检测体外受精(IVF)的胚胎是否发生了突变 随着女性生殖年龄的推迟及环境等因素,许多育龄夫妇虽然很想要孩子,但是由于身体的原因一直不能如愿。随着生物科学和医学研究的发展,对于这样的夫妇来说,终于有补救措施了——他们可以寄希望于试管婴
中澳科学家对高粱进行全基因组测序分析
由澳大利亚昆士兰大学、华大基因等单位的科学家对高粱进行了全基因组测序及分析,发现高粱基因组中存在大量的遗传变异,为高粱及其它粮食作物的育种改良提供了宝贵的遗传资源。8月28日,最新研究结果在《自然·通讯》杂志上发表。 中澳两国的科学家通过对44株不同来源的高粱样本,包括地方品种、改良品种和
科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱
近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合
科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱
近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合
多囊卵巢综合征最大规模全基因组研究
Andrea E Dunaif PCOS是育龄妇女最常见的内分泌紊乱之一,是不孕症和II型糖尿病的主要原因。PCOS的起源尚不清楚,诊断往往基于不同临床标准,准确程度备受争议。 研究人员通过对7项涉及10000多名PCOS患者和10万欧洲血统对照者的全基因组关联研究(WGAS)进行荟萃分析,探讨
从全血中提取基因组DNA用到各试剂的作用
全血基因组DNA提取试剂盒(离心柱型)作用原来具体是这样的:独特的结合液/蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸酶,然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA
基于碱基编辑的全基因组扰动文库构建与筛选技术
通过全基因组规模扰动文库的构建与筛选,从宏观基因组层面系统研究基因型与表型的对应关系,是微生物功能基因组学研究的重要方法。相较于单个基因扰动文库的构建与筛选,混合文库的构建与筛选可通过一次实验实现特定条件下对上千个基因的同时筛选,显著提高通量。近年来,CRISPR/Cas技术凭借着精简高效、可编
Nature子刊:对年轻癌症患者进行全基因组测序势在必行
相关研究最近以“Clinical cancer genomic profiling by three-platform sequencing of whole genome, whole exome and transcriptome”为题发表在《Nature Communications》杂志