奇拉实验室在计算生物学所成立

王学才和Kirstin Augsburg共同为实验室揭牌 9月16日上午,奇拉实验室在上海生命科学研究院计算生物学所内正式挂牌成立。计算生物学所执行所长金力、党总支书记兼副所长王学才、德国驻沪总领事馆文化事务与新闻领事Kirstin Augsburg、领事Fredric Jorgens参加了成立仪式。 金力在成立仪式上致辞。他对奇拉实验室的成立表示祝贺,希望奇拉实验室依托研究所,以中科院实施“创新2020”为契机,努力发挥自身优势,广泛集聚人才,在计算蛋白质研究领域攻坚克难,做出成就。随后,王学才和Kirstin Augsburg共同为实验室揭牌。 奇拉实验室同时举办了主题为How nature masters materials 的学术研讨会。复旦大学邵正中教授、新加坡国立大学严洁教授、北京大学马玉荣教授以及计算生物学所Scott Edwards博士分别作了学术报告。 据悉,奇拉实验室的英文全称是K......阅读全文

奇拉实验室在计算生物学所成立

  王学才和Kirstin Augsburg共同为实验室揭牌  9月16日上午,奇拉实验室在上海生命科学研究院计算生物学所内正式挂牌成立。计算生物学所执行所长金力、党总支书记兼副所长王学才、德国驻沪总领事馆文化事务与新闻领事Kirstin Augsburg、领事Fredric Jor

柯萨奇病毒的生物学性状

  本病毒的生物学性状与脊髓灰质炎相似,病毒体直径为28nm,核酸为单股RNA。该病毒可在多种组织细胞中增殖,并引起细胞病变。新生乳鼠有较高的敏感性。根据病毒在乳鼠细胞内的致病特点不同分为A、B两组。A组有23个血清型,能使新生乳鼠产生广泛性骨骼肌炎,导致弛缓性麻痹;B组分为6个血清型,引起新生乳鼠

柯萨奇病毒的生物学性状

  本病毒的生物学性状与脊髓灰质炎相似,病毒体直径为28nm,核酸为单股RNA。该病毒可在多种组织细胞中增殖,并引起细胞病变。新生乳鼠有较高的敏感性。根据病毒在乳鼠细胞内的致病特点不同分为A、B两组。A组有23个血清型,能使新生乳鼠产生广泛性骨骼肌炎,导致弛缓性麻痹;B组分为6个血清型,引起新生乳鼠

拉曼测试深度怎么计算

原则上说,拉曼谱中的荧光和荧光谱中的荧光是一样的,只要激发波长和功率密度相同。注意横坐标要从波数变换为纳米,即用10000000nm(1cm)除以波数就行了。但有一点要注意,不同波长的激发光照射样品,得到的拉曼相近,但荧光可以有很大不同,甚至相同波长不同功率激发,荧光谱都大不一样

田奇加入华为诺亚方舟实验室,任计算视觉首席科学家

近日,IEEE Fellow、美国德克萨斯大学圣安东尼奥分校计算机系教授、教育部长江讲座教授田奇加入华为诺亚方舟实验室,任计算视觉首席科学家,主导视觉方向的前沿研究,并落实在平安城市、终端手机、自动驾驶、网络运维大脑等方向上的算法竞争力。这一事件在雷锋网旗下学术频道AI科技评论数据库产品「AI 影响

计算生物学所量化生物学平台正式投入运行

  近日,中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所量化生物学平台(Omics Core)正式投入运行。平台配备有Illumina HiSeq 2000测序系统和相关仪器设备,该测序系统将文库DNA/cDNA片段附着到特殊处理的光学透明玻璃表面(即Flow cell),并采用可逆终止法边

拉曼光谱分析-id/ig怎么计算

找到材料Raman光谱中的 D峰,和G峰。然后读出最强位置的光谱强度,两者做比值即可。一般计算中,就用峰的最大值代表峰的强度即可。

许锦波当选国际计算生物学学会Fellow

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503301.shtm近日,国际计算生物学学会(ISCB)发布消息,计算生物学家、清华大学智能产业研究院卓越访问教授许锦波当选ISCB Fellow,当选理由为“通过开创全新计算方式及软件程序,为蛋白质结构

简述霍奇金病的实验室检查

  贫血多见于晚期患者,为正色素、正细胞性贫血。偶见溶血性贫血,2%~10%患者Coombs试验阳性。少数病例可出现中性粒细胞增多,嗜酸性粒细胞增多。外周血淋巴细胞减少(

关于阿奇霉素的计算机化学数据介绍

  疏水参数计算参考值(XlogP):4  氢键供体数量:5  氢键受体数量:14  可旋转化学键数量:7  互变异构体数量:0  拓扑分子极性表面积(TPSA):180  重原子数量:52  表面电荷:0  复杂度:1150  同位素原子数量:0  确定原子立构中心数量:18  不确定原子立构中心

拉曼光谱在生物学研究中的应用

  拉曼光谱是研究生物大分子的有力手段,由于水的拉曼光谱很弱、谱图又很简单,故拉曼光谱可以在接近自然状态、活性状态下来研究生物大分子的结构及其变化。  生物大分子的拉曼光谱可以同时得到许多宝贵的信息:  (1)蛋白质二级结构:α-螺旋、β-折叠、无规卷曲及β-回转。  (2)蛋白质主链构像:酰胺Ⅰ、

关于维拉帕米的计算化学数据介绍

  维拉帕米的计算化学数据:  1、疏水参数计算参考值(XlogP):无  2、氢键供体数量:0  3、氢键受体数量:6  4、可旋转化学键数量:13  5、互变异构体数量:0  6、拓扑分子极性表面积:64  7、重原子数量:33  8、表面电荷:0  9、复杂度:606  10、同位素原子数量:

关于索拉非尼的计算化学数据介绍

  索拉非尼的计算化学数据:  1、疏水参数计算参考值(XlogP):4.1  2、氢键供体数量:3  3、氢键受体数量:7  4、可旋转化学键数量:5  5、互变异构体数量:6  6、拓扑分子极性表面积:92.4  7、重原子数量:32  8、表面电荷:0  9、复杂度:646  10、同位素原子

生物学,崛起的下一代计算平台

  Synhego公司距离Facebook总部仅五分钟车程,从外观来看,它和硅谷的其他创业公司并无差异,但是在它米色的办公园区里,一模一样的黑色服务器机架整齐地排列着,灯光闪烁,发出呼呼的排气声,然而这些金属架子里并没有零件在驱动网络的运行。这些机器正在利用分子改写生代码。   Crispr是一种

NSF斥巨资-计算机助力植物生物学研究

就像谷歌地球能够让你从空中放大自己的家一样,有朝一日,或许只需要点击几下鼠标,研究人员便能够在植物的整个生态系统与分子结构之间任意切换。1月30日,美国国家科学基金会(NSF)向5家研究机构提供了5000万美元的资金,这些钱将用于研制那些联系和分析多领域数据的软件和硬件,旨在实现解答有关植物复杂问题

阿奇霉素注射液的实验室检查

  血清ALT、AST、肌酐、LDH、胆红素及碱性磷酸酶升高,白细胞、中性粒细胞及血小板计数减少。

中科院计算生物学重点实验室举行学术委员会第二次会议

会议现场  3月7日上午,中科院计算生物学重点实验室召开了学术委员会第二次会议。重点实验室学术委员会主任陈晓亚院士,学术委员会委员中科院上海分院副院长张旭研究员、中科院数学与系统科学研究院袁亚湘研究员、中国科技部国家遥感中心邵立勤教授、上海生科院健康所所长时玉舫研究员、上海生科院生化

拉曼光谱应用(四)在生物学研究中的应用

拉曼光谱是研究生物大分子的有力手段,由于水的拉曼光谱很弱、谱图又很简单,故拉曼光谱可以在接近自然状态、活性状态下来研究生物大分子的结构及其变化。生物大分子的拉曼光谱可以同时得到许多宝贵的信息:(1)蛋白质二级结构:α-螺旋、β-折叠、无规卷曲及β-回转。(2)蛋白质主链构像:酰胺Ⅰ、Ⅲ,C-C、C-

计算生物学研究所“蛋白建模”学习班举办

    Juergen Schlitter教授讲课中  6月7日至11日,中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所、中科院计算生物学重点实验室举办了为期一周的“Protein Modeling” 学习班。学习班面向生科院各所研究生开放,来自全院的多名研究生参加了学习培训。  学习班由

关于盐酸妥拉唑林的计算化学数据介绍

  盐酸妥拉唑林的计算化学数据:  计疏水参数计算参考值(XlogP):无  氢键供体数量:2  氢键受体数量:2  可旋转化学键数量:2  互变异构体数量:0  拓扑分子极性表面积(TPSA):24.4  重原子数量:13  表面电荷:0  复杂度:169  同位素原子数量:0  确定原子立构中心

生物学实验室常规设备介绍

生物学实验室常规设备介绍:1、超净工作台/生物安全柜细胞培养需要无菌要求高的环境,在进行操作细胞的实验时,需要在100级的空气下进行,那我们就需要购买能提供百级洁净度的超净工作台或生物安全柜了。2、二氧化碳培养箱细胞培养所用的缓冲体系是碳酸氢钠+HEPES体系,所以需要二氧化碳提供缓冲能力维持pH。

“云计算联合实验室”在京建立

  曙光公司与北京市计算中心对外宣布,共同建设“云计算联合实验室”。据了解,在云计算联合实验室的基础设施构建上,曙光投资了500多万元进行基础构建,同时该云计算实验室集合了曙光公司在云计算平台构建运营经验的优势以及北京市计算中心计算平台成熟化应用经验上的优势,以辐射北京区域经济发展、提升中

霍奇金淋巴瘤的实验室检查介绍

  贫血多见于晚期患者,为正色素、正细胞性贫血。偶见溶血性贫血,2%~10%患者Coombs试验阳性。少数病例可出现中性粒细胞增多,嗜酸性粒细胞增多。外周血淋巴细胞减少(

激光拉曼光谱仪在生物学研究中的应用

生物大分子的拉曼光谱可以同时得到许多宝贵的信息:  (1)蛋白质二级结构:α-螺旋、β-折叠、无规卷曲及β-回转  (2)蛋白质主链构像:酰胺Ⅰ、Ⅲ,C-C、C-N伸缩振动  (3)蛋白质侧链构像:苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸的侧链和后二者的构像及存在形式随其微环境的变化  (4)对构像变化敏感的羧基、

激光拉曼光谱仪在生物学研究中的应用

生物大分子的拉曼光谱可以同时得到许多宝贵的信息:  (1)蛋白质二级结构:α-螺旋、β-折叠、无规卷曲及β-回转  (2)蛋白质主链构像:酰胺Ⅰ、Ⅲ,C-C、C-N伸缩振动  (3)蛋白质侧链构像:苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸的侧链和后二者的构像及存在形式随其微环境的变化  (4)对构像变化敏感的羧基、

表面增强拉曼光谱技术引入到辐射生物学分析

电离辐射作用于生物可产生丰富的生物学效应。研究生物分子在电离辐射条件下结构和功能变化是理解辐射生物学效应及其早期生物过程的关键。目前,辐射生物光谱检测存在两个亟待解决的问题:一是在生物体内,对少量生物分子实现高灵敏光谱检测,二是在生物分子化学反应过程中,对含混合物的复杂体系进行光谱定性和定量分析。中

计算生物学家为分析解释遗传测序数据开发平台

  我们可以在现场获得可操作信息,从而让我们很快地就如何向前推进做出决策。  对于设法治疗无明显致病原因患者的医生来说,基因测序技术可能会为他们指点迷津。但大量的信息也会使其很难快速找到答案。  两三年前,位于秘鲁利马的美国海军医学研究六所(NAMRU-6)的医生必须将其测序数据送往美国分析,这一过

新药如何“算出来”:上海计算生物学创新大赛结果揭晓

化合物多如牛毛,靶点信息有限,作用机制难以明确,这些使得药物发现的过程投入巨大,时间漫长。而计算生物学可以通过模拟和计算大大加快这一进程。9月9日,“2024浦江创新论坛——上海国际计算生物学创新专题论坛”举行。该论坛以“计算生物学赋能生物医药”为主题,在论坛上,2023上海国际计算生物学创新大赛公

技术方法:如何计算进化生物学的突变率

  突变率有多种计算用途,比如,进化生物学家可以基于物种的突变率,预测一个物种首次分化为两个物种时的“分子钟”。科学家们还利用这些速率来追踪流感等病毒的演变速度。癌症生物学家也可以利用突变率估计肿瘤细胞基因组随时间变化的速度。  “这是每一个进化模型中必须输入的参数,”新加坡基因组研究所的博士后Yu

路甬祥与马普学会主席续签计算生物学伙伴所协议

路甬祥与马普学会主席续签计算生物学伙伴所协议并访问德科研机构   9月9日至14日,应德国马普学会Peter Gruss主席的邀请,路甬祥院长率团访问了马普学会及相关研究所。   路甬祥在会见Peter Gruss主席时,双方共同回顾了合作近40年来取得的成果与经验,并深入探讨了中