基于微生物组大数据的疾病检测方法来了
微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems（美国微生物学会会刊）。 作为与生俱来、无处不在的“小伙伴”，微生物组与人体、环境的健康有着千丝万缕的关联。同时，菌群检测具有非侵入性、可量化、可预警等优势。因此，如何用菌群来判断和识别人体或环境的健康状态，一直是精准医学和大健康的热点问题之一。但是，作为一种疾病诊断手段，菌群面临着三个关键的挑战。 首先，“漏诊”问题：现有的检测手段通常只针对特定疾病，并依赖于该疾病已知的标识微生物来构建检测模型。然而很多疾病尚无明确标识物，而且同一种疾病在不同人群中的生物标识物种经常不尽一致，因此难以普适性地判断待检样本是否健康。其次，“误诊”问题：同一种生物标识经......阅读全文
基于微生物组大数据的疾病检测方法来了
微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems（美国微生物学会会刊）
苏晓泉团队开发出基于微生物组大数据的疾病检测方法
微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems（美国微生物学会会刊）
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
全球微生物组大数据搜索引擎上线
日前，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE（Microbiome Search Engine； http://mse.single-cell.cn），使得以整个微生物组为分析单元的智能搜索和大数据挖掘成为现实。 微生物组，又称“菌群”。
微生物组测序分析的一大问题
BMC Biology杂志上的一项研究指出，许多已发表的微生物组研究其实受到了污染，错误的报告了来自于环境的杂菌。研究人员认为，在临床样本中检测到出人意料的细菌时，不应过早将其于疾病联系在一起。 我们机体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。微生物组参与了许多重要的机体功能
微生物组大数据搜索引擎入选中国医药生物技术十大进展
目前，中科院青岛生物能源与过程研究所研发的“微生物组大数据搜索引擎”（Microbiome Search Engine； MSE）入选“2016年中国医药生物技术十大进展”。 微生物组（又称“菌群”）在人体中与生俱来，与人体健康息息相关。因此，对海量微生物组“大数据”的搜索与挖掘，有助于认
全基因组测序助力食源性疾病检测
CDC研究人员检查用于全基因组测序的电脑芯片。 李斯特菌暴发致3人死亡并且迫使美国得克萨斯州蓝铃冰淇淋公司在上个月底召回其全部产品，这是遗传流行病学如何正在改变食源性疾病检测的最新例子。两年前，位于亚特兰大的美国疾病控制和预防中心（CDC）启动一项试点计划，测序与某种疾病相关联的每个李斯特菌样品的
青岛能源所微生物组大数据分析工具开发获进展
元基因组是当前微生物组大数据最主要的存在形式之一。由于元基因组数据的复杂性、异质性以及指数级增长的体量，从中深度且快速发掘微生物群落结构和功能上的变化规律，一直是业界的一个重要技术瓶颈。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心发表了元基因组高性能计算分析软件Parallel-MET
华大参与：复杂宏基因组数据的新分析法
当前分析宏基因组数据的大多数方法，都依赖于与参考基因组的对比，但是许多环境中的微生物多样性远远超过了参考数据库所覆盖的范围。将复杂的宏基因组数据从头划分为特定的生物学实体（如特定的菌株或病毒），在很大程度上仍然是一个未解决的问题。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnolog
大血管疾病的原因
大血管疾病分为两大类：狭窄性和扩张性的。 狭窄性大血管疾病临床表现取决于狭窄部位对应的供血器官。主动脉缩窄主要表现为高血压和充血性心衰。如果累及脑供血，可表现为头晕、头痛、耳鸣、视力损害、语言障碍，甚至意识模糊和瘫痪；如果影响肢体供血，可表现为疼痛和间歇性跛行。 扩张性的大血管疾病就是我们通