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CRISPR先驱发表研究新成果

细菌和古生菌一直在与入侵者做斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR-Cas适应性免疫系统就是其中之一。Cas1-Cas2蛋白复合体会捕获30–40bp的外源DNA,将它们整合到CRISPR的间隔区,形成自己的免疫记忆。如果这种外源DNA再次入侵,细菌就能够及时将其剪切,从而保护自身安全。 加州大学伯克利分校的研究团队前不久在Molecular Cell杂志上发表文章,揭示了CRISPR介导免疫记忆的一个重要机制。这篇文章的通讯作者是著名CRISPR先驱Jennifer A. Doudna。Doudna教授是CRISPR技术的共同开发者,曾因这一技术获得了“生命科学突破奖”(Breakthrough Prize),是CRISPR专利的有力竞争者。 规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在引导RNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点,将CRISPR系统发展......阅读全文

Science子刊:在深海中,病毒对古生菌进行大屠杀

  根据一项新的研究,在深海沉积物的微生物群体中,古生菌(archaea, 也译作古细菌)遭受的病毒感染频率通常是细菌的两倍,尽管后者更加丰富。考虑到深海生态系统的巨大规模,这一结果表明古生菌-病毒关系可能是全球生物地球化学循环的主要促进者。相关研究结果发表在2016年10月12日那期Science

粪便移植,移植了什么?

  由美国凡德比特大学研究人员发表的论文《粪便移植,移植了什么》表明弄清楚粪便中的微生物种类及非微生物成分,或对粪便移植至关重要。研究发现粪便中含有细菌,病毒,真菌,古生菌,原生生物及食物代谢物。  人们很少会去考虑自己粪便中都含有些什么。但弄清楚粪便成分对粪便移植至关重要。粪便移植,顾名思义就是将

北大西洋深海古菌:从原核到真核的桥梁

  科学家们普遍认为,20亿年前,单细胞结构简单的原核生物产生了结构更加复杂精细的真核生物。最终,这些真核生物不断发展,形成了今天丰富的生物种类,比如真菌,植物,还有我们这样的动物。然而,从原核到真核,这个转变的具体细节仍然无法得知。  如今,科学家们在《Nature》刊文,宣布在北大西洋海底发现了

《自然》文章盘点关于基因“剪刀”的五大谜题

  它是个非常了不起的工具。我想知道这个系统从头到尾如何工作。  Francisco Mojica并非第一个看见CRISPR的人,但他可能是第一个为它着迷的人。他还记得1992年当他首次瞥见可能引发一场生物技术革命的这个微生物免疫系统的那一天。他在评估地中海嗜盐菌的基因测序数据,注意到14个不寻常的

《自然》文章盘点关于基因“剪刀”的五大谜题

原核生物利用CRISPR-Cas抵抗在细胞上形成图中结构的病毒。 它是个非常了不起的工具。我想知道这个系统从头到尾如何工作。Francisco Mojica并非第一个看见CRISPR的人,但他可能是第一个为它着迷的人。他还记得1992年当他首次瞥见可能引发一场生物技术革命的这个微生物免疫系

PNAS:揭秘保守的病毒感染机制

  近年来人们发现,包括HIV、Ebola在内的许多病毒,都会利用细胞的蛋白复合体ESCRT(Endosomal Sorting Complexes Required for Transport)为自己打开出口,以便从受感染细胞释放出去。   现在,印第安纳大学和蒙大拿州立大学的生物学家发现,

乙烷消失的“幕后推手”是谁

  在自然界,许多有机物的生物降解需要氧气来提供能量。  然而,自然界还普遍存在着无氧或缺氧环境,微生物如何在这样的条件下活下去,并且有效处理环境中的“疑难杂症”,其背后机制是科学家们一直想要解析的生命奥秘。  无氧或缺氧,科学上被称为厌氧。  近日,中国科学院生态环境研究中心研究员朱永官团队参与的

2013年04月05日《科学》杂志精选

  封面故事:类似生物组织的3-D印刷材料  A Tissue-Like Printed Material  新的研究显示,一种三维材料可能在未来模仿组织中细胞的行为。由Gabriel Villar及其同事研发的组织样材料具有软橡胶的密实度,并且其质地与大脑和脂肪组织相似。研究人员的目标是最终构建可

4月5日《科学》杂志内容精选

  极端微生物可处理高氯酸盐   一项新的研究揭示,被称作闪烁古生球菌的古生菌可在极端炎热的条件下茁壮生长,并且为了生长它还会还原有毒的氯酸盐和高氯酸盐。在此之前,只有少数种类的细菌被证明会还原氯酸盐和高氯酸盐。但是Martin Liebensteiner 及其同事用闪烁古生球菌进行

研究发现极端微生物可处理高氯酸盐

  一项新的研究揭示,被称作闪烁古生球菌的古生菌可在极端炎热的条件下茁壮生长,并且为了生长它还会还原有毒的氯酸盐和高氯酸盐。   在此之前,只有少数种类的细菌被证明会还原氯酸盐和高氯酸盐。但是Martin Liebensteiner及其同事用闪烁古生球菌进行了一系列的试验并发现这种古生菌同样也

自然界神奇“偷基因”生存策略:给物种带来顽强生命力

  据国外媒体报道,世界上最顽强的生命形式是什么?科学家们在寻找这一问题答案的过程中,发现了自然界一种“偷”的生存策略。一些生物可以生存于极热、极寒、极酸、极毒的极端环境中,比如美国黄石国家公园沸腾的温泉中的一种水藻,它的生存秘密就是从其它生命形式那里偷来生存的必要基因,而不是从父辈那里遗传。这种“

科学家发现细胞进化缺失环节 或填补生命起源研究空白

  发表在《自然》杂志上的一项研究称,新发现的一种微生物极有可能代表着从单细胞到复杂细胞进化过程中所缺失的一环。它的发现填补了生命进化过程中一个空缺已久的“真空地带”,有望为揭示复杂生命的起源和演化带来全新见解。  细胞是地球上所有生命的基本组成部分。细菌和微生物的细胞小而简单,而包括人类在内的,所

研究发现分娩方式影响新生儿胎便微生物群落

  近日,昆明理工大学柳陈坚教授课题组在the Lancet(柳叶刀)子刊EBioMedicine最新一期(2019.11)发表高水平研究论文“Is the delivery mode a critical factor for the microbial communities in the me

盘点:Nature杂志5月亮点研究速览

  【1】合成生物学:一个用来控制转基因生物的内置毁灭开关  Nature Communications DOI:10.1038/ncomms7989  Nature Communications在线发表的一篇论文介绍了一个基于CRISPR的内置器件,它设计用来专门破坏转基因生物的特定DNA序列。控

本期《自然》《科学》精选

10月4日《Nature》   封面故事: 纪念“太空竞赛”50周年“太空竞赛”今天是50周年。1957年10月4日(星期四),前苏联发射了第一颗人造地球卫星,让世界为之震动。不管是第一颗人造地球卫星还是前苏联都没有能够穿越时间的长河维持到今天,但前苏联的精神似乎在这一古老帝国核心地区

7月25日 Nature 杂志生物学精选

  未培养微生物的基因组   现有基因组序列只能让我们对微生物引人注目的多样性有一个很有限的认识,因为它们中绝大部分从未被培养出纯培养物。在这项研究中,Tanja Woyke 及其同事利用单细胞基因组学方法来研究和测序来自九个多样化生境的 201 种未培养的古生菌和细菌细胞。该信息显示了无

细菌的概述

细菌的概述:细菌(英文:germs;学名:bacteria)是生物的主要类群之一,属于细菌域。广义的细菌即为原核生物, 是指一大类细胞核无核膜包裹,只存在拟核区(nuclear region)(或拟核)的裸露DNA的原始单细胞生物,包括真细菌(eubacteria)和古生菌(archaea)两大类群

纳米二次离子质谱技术在 微生物生态学研究中的应用

纳米二次离子质谱技术(NanoSIMS)在 微生物生态学研究中的应用氮(N)、碳(C)、硫(S)等生命元素的生物地球化学循环过程主要由微生物所驱动。 耦合分析自然环境中 微生物遗传多样性与其代谢多样性是当今微生物生态学研究的难点和热点。 自然环境中的微生物多样性极 为丰富,每吨土壤中的微生物类

细菌34亿年前便已有复杂酶

  一项日前发表于《细胞化学生物学》杂志的研究显示,34亿年前,所有细菌的祖先可能拥有复杂的酶,而这比地球上生命的起源仅晚了6亿年。此项发现令人感到惊讶,因为人们曾推断,细菌并未进化,直到很晚以后,甚至是在生命起源的10亿年之后。  现代酶同其发生相互作用的分子,就像锁和钥匙一样的对应关系。它们通常

弥补原核与真核生物进化上的裂隙

  沿北冰洋大洋中脊(Arctic Mid-Ocean Ridge)的沉积物中发现了一组新的古菌(archaea),一种新的生命形式可能有助于解决困惑现代生物界最持久的一个谜团。  地球上的生物皆可以被分成原核生物和真核生物两大类,前者结构简单,后者常更加复杂。这两类生物细胞间存在差别的显著,对于如

2月3日《科学》杂志精选

   吸毒成瘾者与他们的兄弟姐妹都有相同的脑部异常   据研究报道,吸毒成瘾者和他们的无成瘾的兄弟姐妹在控制自身冲动上的能力相对较差,他们还共有一些在其他健康人中所没有发现的、脑部特征。因此这些脑部异常可能是一种遗传的、容易对毒品成瘾的标记——尽管这是一个可以克服的问题。

上海生命科学研究院王恩多研究组最新成果

  12月16日,国际学术期刊Journal of Biological Chemistry 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新研究成果:C-terminal domain of leucyl-tRNA synthetase from pathogen

澳大利亚科学家南极发现罕见微生物:为病毒起源提供

  英国《自然•微生物学》杂志近日发表的一篇论文称,科学家在南极发现一种独特且罕见的微生物,对该微生物的分析能为进化中最大的奥秘——病毒的起源提供极其重要线索,有助于解决病毒如何首次出现的谜团。   病毒不同于其他生命形式。所有其他的生命形式是由细胞构成的,细胞是复杂的机器,可以独立生存和繁殖。病

南极罕见微生物或可揭示病毒起源

  英国《自然·微生物学》杂志近日发表的一篇论文称,科学家在南极发现一种独特且罕见的微生物,对该微生物的分析能为进化中最大的奥秘——病毒的起源提供极其重要线索,有助于解决病毒如何首次出现的谜团。  病毒不同于其他生命形式。所有其他的生命形式是由细胞构成的,细胞是复杂的机器,可以独立生存和繁殖。病毒却

《科学》:太平洋海底发现上千种新型微生物

美国海洋生物学家在太平洋的俄勒冈州沿海的深海热液喷口发现了上千种微生物新物种。参与该项研究的科学家来自于缅因州的伍兹霍尔海洋生物实验室以及华盛顿大学的大气和海洋联合研究所。 利用一种被称为“454标签测序法”的新型分析技术,科学家们分析了微生物和古生菌的1百万个DNA序列。这些DNA取自于

浙江大学Nature子刊聚焦CRISPR–Cas的抑制系统

  来自浙江大学生命科学研究院的研究人员揭示出了,噬菌体蛋白AcrF3抑制Cas3的结构基础。他们的研究结果发布在7月25日的《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。  浙江大学生命科学研究院的朱永群(Yongqun Zh

Crispr技术:蹒跚起步 渐成新宠

  1月30日,《细胞》杂志网站报道,全球首对靶向基因编辑猴子已在中国出生,科学家采用的是最新基因编辑技术Crispr,可以对目标DNA进行插入、删除或重写,类似计算机编辑文字一样让科学家对物种的基因进行编辑,而且成功率一般可提高到30%,甚至50%。美国哈佛大学的George Church说,

革命性基因编辑技术CRISPR渐成科学家新宠

当病毒攻击细菌时,细菌会作出以DNA为目标的防御反应,生物学家利用此机理研发基因工程技术。   如果只是一份报告发表的话,仅会获得一些关注。但是当有6份报告同时发表时,这便意味着它是大势所趋。   细菌也会生病,这对于乳品业来说是一个潜在的大问题。乳品业通常依靠细菌(诸如嗜热链球菌)生产酸奶和乳

基因编辑器:编出新生命

          细菌也有敌人,其最大的敌人之一是噬菌体,因为后者可以进攻和吞食细菌。面对攻击,细菌最有效的还击是,“祭”出一种武器CRISPR,以保护自身。CRISPR有些拗口,称为规律成簇间隔短回文重复,实际上就是一种基因编

Nature突破性成果:首次证实南极冰层之下也有生命

  科学家们首次发现,西南极冰盖半英里之下也存在着生命,而且这些生命组成了活跃的生态系统。这一重大成果发表在八月二十一日的Nature杂志上。  南极位于地球的最南端,是世界上发现最晚的大陆,覆盖着厚度极高的冰层。研究显示,在庞大的南极冰盖之下,生命以微生物的形式存在。这些微生物大多是单细胞的古生菌