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DNA酶I足迹法对DNA上的蛋白质结合位点作图实验

实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分试剂、试剂盒 细胞匀浆缓冲液细胞重悬缓冲液细胞淋洗缓冲液乙醇Ficoll 400甲酰胺染色液MgCl2 CaCl2 溶液NaClNonidetP-40酚:氯仿磷酸盐缓冲液聚乙烯醇终止液组织匀浆液组织重悬缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I变性聚丙烯酰胺测序胶poly(dI-dC)测序胶长度标准品 32P 末端标记的 DNA仪器、耗材 Beckman SW28 转头或类似产品Sorvall Hl000B 转头或类似产品沸腾的水浴锅 带 B 型研杵的 Dounce 匀浆器 晶型塑料或超明亮型吊桶式离心管 橡胶棒实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液、缓冲液和试剂的组成请参见附录 1。贮存液需稀释到适当浓度。细胞匀浆缓冲液10 mmol/LHEPES-KOH(pH7.9)1.5 mml/LMgCl210mmol/LKCl0.5 mmol/LDTT0.5 mmol/L 苯甲基磺酰氟......阅读全文

DNA 酶 I 足迹法对 DNA 上的蛋白质结合位点作图实验

实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分试剂、试剂盒 细胞匀浆缓冲液细胞重悬缓冲液细胞淋洗缓冲液乙醇Ficoll 400甲酰胺染色液MgCl2 CaCl2 溶液NaClNonidetP-40酚:氯仿磷酸盐缓冲液聚乙烯醇终止液组织匀浆液组织重悬缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I

DNA 酶 I 足迹法对 DNA 上的蛋白质结合位点作图实验

本方案介绍在放射性标记的 DNA 片段上确定蛋白质结合位点的作图方法。本方案使用 DNA 酶 I 切割 DNA, 而在替代方案中是用羟自由基断裂 DNA。如果希望得到优化足迹法反应的建议,请参见本方案最后部分的疑难解析以及优化 DNA 酶 I 足迹法反应的栏目。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)

DNA 酶 I 足迹法对 DNA 上的蛋白质结合位点作图实验

DNA 酶 I 足迹法对 DNA 上的蛋白质结合位点作图实验             实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分

DNA 酶 I 超敏感位点作图

实验材料 真核细胞试剂、试剂盒 缓冲液 AEDTA乙醇裂解缓冲液磷酸盐缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I 稀释缓冲液DNA 酶 I 溶液蛋白酶 K 溶液RNA 酶溶液酚:氯仿SDS 缓冲液TE仪器、耗材 Sorvall H1000B 转头或等价物带螺帽的试管振荡水浴锅实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液、缓

DNA 酶 I 超敏感位点作图

DNA 酶 I 超敏感位点作图法经常用于定位真核基因的调控区。由于还未被理解的原因,基因带有对 DNA 酶 I 切割敏感的分开的序列,而且这些所谓超敏感位点图谱是随基因的激活状态而变化的(Weintrauband Gmudine1976)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J.

DNA 酶 I 超敏感位点作图

            实验材料 真核细胞 试剂、试剂盒 缓冲液 A EDTA 乙醇 裂解缓冲液

DNA酶I足迹分析法实验

DNA酶I足迹分析法 用光密度及数值分析法决定蛋白质结合的平衡常数 粗制品的DNA酶足迹分析法             实验方法原理

DNA酶I足迹分析法实验——NA酶I足迹分析法

本分析方法用来检测DNA上特异的蛋白质结合位点。位点上结合的蛋白质可保护 D N A 的 磷 酸 二 酯 键 骨 架 免 于 受 D N A 酶 I 催 化 的 水 解 。 水 解 后 D N A 片 段 在 变 性DNA测序胶上分离,通过放射自显影可使结合位点显示出来。足迹法已进一步发展成为确定D

DNA 酶 I 足迹分析实验

试剂、试剂盒 32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚 氯仿乙醇聚乙烯醇竞争 DNA 缓冲液 Z'(或缓冲液 Ze)DNA 酶 IMgCl2(10 mmol L) CaCl2(5 mmol L)DNA 酶 I 终止液蛋白酶 K甲酰胺加样缓冲液实验步骤 材料32P-标记 DNA 酶 I 足迹探

DNA 酶 I 足迹分析实验

试剂、试剂盒32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚 氯仿乙醇聚乙烯醇竞争 DNA 缓冲液Z'(或缓冲液 Ze)DNA 酶 IMgCl2(10 mmol L) CaCl2(5 mmol L)DNA 酶 I 终止液蛋白酶 K甲酰胺加样缓冲液实验步骤材料32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚/

DNA 酶 I 足迹分析实验

DNA 酶 I 足迹分析实验             试剂、试剂盒 32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针 酚 氯仿

DNA酶I足迹分析法实验2

实验材料含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒适当的限制性内切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE缓冲液[α-32P] dNTP (3000〜6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段缓冲液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol L 4dNTP 混合液脱氧

DNA酶I足迹分析法实验——粗制品的DNA酶足迹分析法

实验方法原理DNA酶足迹分析常用来寻找粗制品中的蛋白质,因而提供了一种在纯化过程中采用的分析方法。通过改变条件,如在反应体系中加入大量的竞争性DNA,或增加反应中盐的浓度,可抑制非特异性的DNA结合蛋白结合到标记的DNA上。实验材料含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒适当的限制性内切核酸酶10

DNA酶I足迹分析法

实验方法原理 实验材料 含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒 适当的限制性内切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE缓冲液[α-32P] dNTP (3000〜6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段缓冲液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol

DNA 酶 I 足迹探针的制备实验

试剂、试剂盒TE牛肠碱性磷酸酶缓冲液T4 多核苷酸激酶缓冲液TBE 加样缓冲液TBE质粒 DNA合适的限制酶粉 氯仿氯仿 异戊醇(3-甲基-1-丁醇)乙醇牛肠碱性磷酸酶[γ-32P]ATPT4 多核苷酸激酶乙酸铵乙酸钠丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵TEMED仪器、耗材SpeedVac 旋转浓缩器实验步骤

DNA 酶 I 足迹探针的制备实验

DNA 酶 I 足迹探针的制备实验             试剂、试剂盒 TE 牛肠碱性磷酸酶缓冲液 T4 多核苷

DNA 酶 I 足迹探针的制备实验

试剂、试剂盒 TE牛肠碱性磷酸酶缓冲液 T4 多核苷酸激酶缓冲液TBE 加样缓冲液TBE质粒 DNA合适的限制酶粉 氯仿氯仿 异戊醇(3-甲基-1-丁醇)乙醇牛肠碱性磷酸酶[γ-32P]ATPT4 多核苷酸激酶乙酸铵 乙酸钠丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵TEMED仪器、耗材 SpeedVac 旋转浓缩器

DNA作图实验——多种酶消化

主要用于显示基因以及其他序列待征在基因组上位置的图。实验方法原理应用遗传学技术构建能显示基因以及其他序列待征在基因组上位置的图。实验材料DNA试剂、试剂盒限制酶缓冲液仪器、耗材电泳仪实验步骤1.  用低频率切割的不同限制性内切酶分别完全消化DNA。 2.  从每个反应取小份样品作电泳分析,用已知的分

DNA酶足迹法的原理介绍

DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解,在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区),从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。在用酶移出与蛋白质结合的DNA后,又可测出被结合处DNA的序列。

DNA酶足迹法的功能介绍

DNA酶足迹法是一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法。用于检测与特定蛋白质结合 的DNA序列的部位,可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。

DNA作图实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 限制酶缓冲液仪器、耗材 电泳仪实验步骤   用低频率切割的不同限制性内切酶分别完全消化DNA。2.  从每个反应取小份样品作电泳分析,用已知的分子量标准作对照。剩余的样品置于冰浴。3.  比较分子量标准估算出DNA片段的长度,推导出每种限制性内切酶的酶切位点数目。4. 

DNA作图实验

多种酶消化 限制酶部分消化             实验方法原理 应用遗传学技术构建能显示基因以及其他序列待征在基因组上位置的图。

DNA酶足迹法的原理和应用

DNA酶足迹法是一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法。用于检测与特定蛋白质结合 的DNA序列的部位,可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。其原理为:DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解,在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区),从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。在用酶移

DNA作图实验——限制酶部分消化

实验材料DNA试剂、试剂盒限制酶缓冲液仪器、耗材电泳仪实验步骤1.  用低频率切割的不同限制性内切酶分别完全消化DNA。2.  用32P末端标记消化产物,5’末端可先用小牛肠碱性磷酸酶处理。3.  用T4多核苷酸激酶进行标记。4.  3’末端可先用大肠扞菌DNA聚合酶ⅠKlenow片段或T4 DNA

DNA足迹法介绍

DNA足迹法,中文名称:DNA足迹法英文名称:DNA footprinting定义:检测DNA序列中DNA结合蛋白识别部位的一种方法。

DNA酶足迹法的基本原理

原理为:DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解,在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区),从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。在用酶移出与蛋白质结合的DNA后,又可测出被结合处DNA的序列。

甲基化干扰法鉴定与蛋白结合的DNA位点

放射性标记DNA探针的制备l      聚丙烯酰胺凝胶的制备1.按照(三)中操作流程灌制非变性聚丙烯酰胺凝胶。将10×TBE稀释成0.5×的工作浓度。聚丙烯酰胺的工作浓度取决于待测DNA片段的大小,200bp左右的片段需要4~5%的凝胶,小于100bp的片段应灌制6~8%的凝胶。 l      DN

DNA足迹法的原理介绍

DNA被蛋白质结合后,由于蛋白质的构象保护,DNaseI不能降解这一结合位点,如果对该DNA进行一端的末端标记,并控制好DNaseI的酶量和作用时间,可将该DNA切割成大小不等的DNA片断而蛋白质保护区域不被酶解,这段区域到标记末端的片断是缺失的,对其电泳,可找出蛋白质结合位点的精确位置。

方案7 位点特异性蛋白质-DNA 光交联法实验

实验材料DNA 聚合酶 I Klenow 片段限制性内切酶A 和 B单链 DNA 结合蛋白单链 DNA 模板T4 DNA 连接酶T4 DNA 聚合酶T4 多聚核苷酸激酶T7 DNA 聚合酶上游引物试剂、试剂盒10 X 退火缓冲液ATP对叠氮化苯甲酰甲溴生物素-11-dATP生物素-11-dCTP生物

结合DNA的酶

核酸酶和连接酶:核酸酶是能够切割DNA链的酶,因为它们催化磷酸二酯键的水解。从位于DNA链末端的核苷酸开始水解DNA的核酸酶称为核酸外切酶。另一方面,直接切入DNA链的那些是内切核酸酶。分子生物学中使用最广泛的核酸酶,称为限制性内切酶,以切割特定序列的DNA。在自然界中,这种酶通过在进入细菌细胞时消