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ABSOLiD测序仪

AB SOLiD测序仪可以对由任何方法制成的DNA文库进行测序。AB SOLiD测序仪有一个极大的特点就 是能够将富集模板片段的微珠在芯片上进行高度可控的任意排列。AB SOLiD测序仪也是使用如图5a中所示 的微乳液PCR方法扩增模板片段的,不过,它这里使用的是直径只有1μm的小磁珠。PCR扩增反应结束之 后,微乳液滴被打破,小磁珠被富集起来固定到固态平板上,制成高密度测序芯片。后面的合成测序法由 DNA连接酶而非DNA 聚合酶 完成。 首先,通用引物与模板片段两端的接头序列互补结合,然后连接酶将一个被荧光标记的8bp长的核酸探 针片段(fluorescently labeled octamers)连接到引物末端(图6c)。这段8bp长的核酸探针片段是经过设计 的,比如其中第五位碱基上就标记了荧光。连接反应完成之后,就可以采集荧光图像,然后在第五位碱基和 第六位碱基之间切断,去掉荧光标签。如此反复,就可以获得每间......阅读全文

DNA测序技术的现状和发展(五)

1.3 AB SOLiD测序仪AB SOLiD测序仪可以对由任何方法制成的DNA文库进行测序。AB SOLiD测序仪有一个极大的特点就是能够将富集模板片段的微珠在芯片上进行高度可控的任意排列。AB SOLiD测序仪也是使用如图5a中所示的微乳液PCR方法扩增模板片段的,不过,它这里使用的

法医DNA检测仪器及其发展动向分析

摘    要:实践证明,法医DNA检测技术和相关仪器在犯罪嫌疑人认定、亲权鉴定和系列串并案侦破中发挥了显著作用,是我国公安一线侦察破案和打击犯罪的重要技术手段。以法医DNA检测技术为主线,对相关仪器的产生背景、发展历程、工作原理、各类技术优劣,以及国内外研究现

安捷伦指定首家认证的靶向富集和芯片服务提供商

安捷伦科技指定贝克曼库尔特基因组学公司为首家认证的靶向富集和芯片服务提供商   2010 年 11 月 3 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)和贝克曼库尔特基因组学公司今日宣布,贝克曼库尔特基因组学公司正式成为安捷伦认证的SureSelect 靶向序列捕获系统(包括结合

第二代高通量测序技术使用的DNA装配工具

第二代高通量测序仪实现了较廉价和快速的DNA测序方法,但是它们有一个共同的缺点即读出序列(reads)太短,大约在几十个bp到几百个bp。与生物的染色体长度相比,这样长度的reads给下一步的装配工作带来麻烦。看似种类繁多的生物界其实只使用4种核苷酸,分别为A,T,G,C。这意味着DNA序列中会有数

ChIP-Seq分析常见问题集锦

染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq)是指对染色质免疫共沉淀(ChIP)获得的DNA片段进行大规模测序,并能把所研究蛋白的DNA结合位点精确定位到基因组上。Roche GS FLX Titanium 、Illumina Hiseq2000和AB SOLID 4 这3种测序技术均可以用于ChIP-

一步一步教你使用NCBI数据库资源2

6 基因组信息6.1 数据库6.1.1 Entrez GenomeEntrez Genome数据库收录了850多种微生物、3100多种病毒以及1600多种真核生物细胞器的完整基因组数据以及将近50种动物、绿色植物和真菌的700多条染色体信息,总共收录有6200多条序列,其中有882条是去年新增的序列

ABI推出新型质谱,欲图扭转质谱业务再上顶峰

2008年10月16日 经过几个月的猜测和预期,美国ABI公司和它的质谱合资伙伴MDS于上周推出了两款新型质谱系统,从而结束了ABI公司在历经18个月技术创新乏力而导致的质谱业绩下滑局面。 这两台新型仪器分别是5500型三重四级杆质谱仪和5500型Qtrap线性离子阱质谱仪,根据AB和MDS的说

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验6

方案6 羧基端序列分析实验实验材料利用一维或二维聚丙烯酰胺凝胶分离的蛋白质或溶液中的蛋白质试剂、试剂盒乙酸酐 二甲基吡啶烷基化乙内硫酰脲 (ATH) 氨基酸标准品溴甲基萘的乙腈溶液考马斯亮蓝(R250)二异丙基乙胺(DIEA)的庚烷溶液乙酸乙酯甲醇N-甲基咪唑的乙腈溶液异氰酸苯酯的乙腈溶液哌嗪硫氰酸

单亲二倍体的分子检测实验

实验材料样品 DNA试剂、试剂盒引物dNTP 混合物反应缓冲液Taq DNA 聚合酶丙烯酰胺甲叉丙烯酰胺TBE过硫酸铵仪器、耗材热循环仪PCR 管电泳装置实验步骤一、PCR 反应实验程序1.准备 PCR 反应混合物:根据 DNA 样本的数量来确定除了 DNA 外其他混合物的体积(额外增加一份来确保有

DNA测序技术的现状和发展(八)

虽然这些最初的纳米孔实验并没有获得预期结果,但它们至少显示出纳米孔在单分子技术方面的应用优势,例如高度的敏感性,同时也带动了纳米孔核酸分析技术的研究热潮,并在理论及实验方面取得了一些成果。自从发现在电场力作用下,长达1000个碱基的单链DNA分子也能通过纳米孔之后,人们就更加坚信, 廉价的纳米孔

反相高效液相色谱6

方案6 计算机辅助方法优化梯度条件的 RP-HPLC 蛋白质分离实验实验材料HPLC 肽标准品蛋白质样品试剂、试剂盒丙酮乙腈(HPLC级)磷酸磷酸二氢钠硫脲硝酸钠三氟乙酸仪器、耗材分析型 HPLC 装置色谱柱洗脱液瓶Hamilton 玻璃注射器氮气量筒微量离心机流动相过滤装置实验步骤一、配制流动相以

反相高效液相色谱5

方案5 用 RP-HPLC 技术对多肽和蛋白质混合物进行脱盐实验实验材料蛋白质或多肽样品试剂、试剂盒乙腈(HPLC级)2 -丙醇硝酸钠硫脲三氟乙酸仪器、耗材分析型 HPLC 装置色谱柱洗脱液瓶Hamilton 玻璃注射器氮气量筒微量离心机流动相过滤装置实验步骤一、流动相的配制1.配制缓冲液 A(弱流

荧光基因分型筛查微小亚端粒重排实验

实验材料样品 DNA试剂、试剂盒PCR 引物氯化镁溶液dATP、dGTP、dCTP 和 dTTP 混合液Taq 聚合酶96孔板PCR热循环仪琼脂糖EB 溶液上样缓冲液电泳缓冲液Long Ranger™ 凝胶溶液尿素仪器、耗材水平凝胶电泳装置紫外透射反射仪滤膜GS-400 HD ROXABI 377

自动荧光的分型实验

实验材料DNA 样本试剂、试剂盒4dNTP 混合液MgCl2荧光染料标记的每个微卫星标记的正向引物每个微卫星标记的正向引物Taq DNA 聚合酶仪器、耗材96孔板烤干炉多道排管吸液器和消毒的试剂盘96孔塑料封膜5ml 和 50ml 的管子热循环仪实验步骤支持方案1 混合用于基因分型的荧光标记的 PC

反相高效液相色谱4

方案4 用 RP-HPLC 对固相合成的多肽进行纯化实验实验材料用于分析的肽或蛋白试剂、试剂盒丙酮乙腈(HPLC级)2 -丙醇乙醇硝酸钠硫酸钠硫脲三氟乙酸仪器、耗材分析型 HPLC 装置离心机锥形瓶玻璃容器Hamilton 玻璃注射器氮气冷冻干燥机流动相过滤装置氦气制备型 HPLC 装置实验步骤一、

异显示技术(DD)实验

D D 由 Liang和 Pardee在 1992年首次提出。至今有大约1700篇 与 DD相关的文章发表,可见其影响巨大。许多与神经变性和凋亡相关的基因也通过DD 的方法得以鉴定。 .DD的原理基于对cDNA分子进行随机扩增和随后按大小进行的分离。

基于 PCR 的基因分型实验——无放射性的多重分析SSLP

实验材料模板DNA试剂、试剂盒10XPCR扩增缓冲液混合引物Taq DNA 聚合酶轻矿物油Qiaex Gel Extraction Kit (Qiagen)2X 甲酰胺载样缓冲液M13序列泳道内标TBE 缓冲液预杂交液地高辛标记的探针Oligo 清洗缓冲液阻滞液碱性磷酸盐连接的抗地高辛Fab片段检测

方案2 蛋白质还原和S-羧甲基化:大规模方法

实验方法原理蛋白质链间或链内完整的二硫键,会给酶解或化学裂解带来麻烦。如:1.二硫键连接的肽段洗脱物,在基于RP-HPLC的肽段作图中会产生单个的峰,从而使这些肽段图很难解释;2.最理想的方法是在序列测定之前,分离由S—S键连接的肽段,否则会使序列数据的解释变得复杂;3.没有断裂二硫键的蛋白质不便于