综述：代谢组学研究加快医学生物标志物的发现
生物标志物(Biomarker)是指“一种可客观检测和评价的特性，可作为正常生物学过程、病理过程或治疗干预药理学反应的指示因子”，作为个体化医疗的“关键词”之一，寻找和发现有价值的生物标志物已经成为当前医学领域的研究热点。 01研究现状和发展趋势 第一个肿瘤标志物可追溯到1846年由H Bence-Jones所证实的本周氏蛋白（Bence Jones Protein)，对多发性骨髓瘤有一定的诊断作用。170余年后的今天，随着基因组学、蛋白质组学、肽组学、代谢组学等在内的组学平台，以及包括纳米技术、生物信息学、抗体芯片等前沿在内的手段与方法，都为快速获得及筛选生物标志物带来了极大的可能。 基因组学及转录组学描述的是机体可能发生改变的生理指标， 而代谢物则是存在于信号通路的终端产物，反映的是机体当时的生理状态。与其他组学相比，代谢组学由于与表型更为接近，因此更适于疾病分型和标志物发现的研究。 2009年，美国密歇根大学霍......阅读全文
肺癌生物标志物的概述
生物标志物一般是指可供客观测定和评价的一个普通生理或病理或治疗过程中的某种特征性的生化指标，通过对它的测定可以获知机体当前所处的生物学过程中的进程。检查一种疾病特异性的生物标志物，对于疾病的鉴定、早期诊断及预防、治疗过程中的监控可能起到帮助作用。非小细胞肺癌(NSCLC)的生物标志物主要分为肿瘤
生物标志物：挑战与希望
“Biomarker”这个词在用于生物医学领域之前，多见于地质学文献，曾被翻译成“生物标志化合物”，指的是地质材料中来自于活的生物体的一些有机化合物。上世纪六十年代，这一词汇开始出现在医学文献中。上世纪八十年代，它被正式地引入到生物医学领域。在生物医学领域，对它也曾有过不同的描述。2001年，美
新型生物标志物——KHKA
由休斯敦德克萨斯大学MD安德森癌症中心领导完成的该项研究，发表在《自然细胞生物学》杂志上的结论如是说。研究表明，一种被称为KHK（己酮糖磷酸激酶或果糖激酶）的基因在癌细胞与正常肝组织中的表达有所不同。MD安德森癌症中心神经肿瘤学教授，资深作者Zhimin Lu说：正常肝细胞催化葡萄糖和果糖发生反应产
生物标志物：挑战与希望
“Biomarker”这个词在用于生物医学领域之前，多见于地质学文献，曾被翻译成“生物标志化合物”，指的是地质材料中来自于活的生物体的一些有机化合物。上世纪六十年代，这一词汇开始出现在医学文献中。上世纪八十年代，它被正式地引入到生物医学领域。在生物医学领域，对它也曾有过不同的描述。2001年，美
心衰生物标志物全面盘点
《中国心血管健康与疾病报告2019》发布，中国心血管病患病率处于持续上升阶段，心血管疾病死亡率仍旧首位，每5例死亡中2例死于心血管病，推算心血管病现患人数3.30 亿。心力衰竭(以下简称"心衰")作为心血管疾病的一种，其发病率正在随着人口老龄化不断增加；此外关于心力衰竭的流行病学新数据显示，2012
代谢组鉴定质控标准正式建立
蛋白质组和代谢组技术都基于质谱，但相比于蓬勃发展的蛋白质组学技术，代谢组虽然技术流程更简单，但其应用却一直十分缓慢。究其原因，是因为蛋白质组学却很早就基于Target-Decoy策略建立了FDR（假发现率）质控策略，可以保证鉴定结果的可靠性；而代谢组全谱鉴定一直缺乏有效的质控手段对鉴定结果进行
做好代谢组学研究的关键
首先明确代谢组学的核心任务。对小分子代谢物的定性、定量分析并发现差异代谢物：（1）对生物体系中的内源性代谢物及其变化规律进行表征；（2）以差异代谢物作为核心对生命奥秘进行解析。而基于色谱/质谱联用的分离分析技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点，已成为代谢组学研究的主流技术平台。其次
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为：“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”，两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度
如何看待代谢组学的前景
是不错的，但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科，一些关键性技术还有待突破，如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题，如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究，所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为：“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”，两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现
如何看待代谢组学的前景
是不错的，但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科，一些关键性技术还有待突破，如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题，如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究，所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越
代谢组学：未来新方向
加拿大阿伯特大学生命科学与计算科学教授David Wishart说，我们自身其实就是一大组生化反应，“因此，基因组和蛋白质组不断进化来支持代谢组，而不是相反的路径。” Wishart说，有别于其他组学方法，代谢组学提供了一种更加直接的生理状态检测方式。代谢组反应营养、胁迫或者疾病状态的速度比转
进入前景光明的代谢组学
内容概要： 一、代谢组学在药物研发中的应用 二、SiDMAP技术在疾病诊断中的应用 三、仪器公司的研究开发：ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研发分析代谢物的更为灵敏的检测方法，而Bio-Rad公司正在发展用Holly Grail作
代谢组学样本收集答疑解惑
样本收集是代谢组学研究的第一步，是保障代谢组学研究结果可靠性的最重要的环节之一。根据不同的研究目的该选取何种生物样本？不同种类的生物样本的规范收集流程是什么？有哪些注意事项（抗凝剂、冻融、抑菌剂等使用细节）？如何保存生物样本？可保存多久等等？这些都是代谢组学实验中小伙伴经常咨询的问题，本文将针对
油菜代谢组研究方面取得进展
华中农大油菜团队联合小麦团队在Genome Biology发表了题为“Characterization of novel loci controlling seed oil content in Brassica napus by marker metabolite-based multi-om
代谢组学——肿瘤研究的利器
细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的，代谢物更多地反映了细胞所处的环境，比如细胞现在是不是健康？药物是否起效？环境污染物是不是正在伤害细胞？等等。由此，20世纪90年代，衍生出了一门新学科：代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题：细胞到底发生了什么？ 1、肿瘤与代谢组学 肿瘤
武汉物数所代谢组学评价纳米金棒生物效应研究获进展
近日，依托于中科院武汉物理与数学研究所的中国科学院生物磁共振分析重点实验室的生物波谱及代谢组学研究组，在纳米金棒暴露的细胞代谢应答方面取得新进展，相关研究结果发表在Biomaterials上(Biomaterials 34; (2013) 7117-7126)。 十六甲基溴化铵(cet
研究发现通过肠道细菌等绘制人类微生物组药物代谢图谱
2019年6月，美国耶鲁大学医学院微生物发病机理和微生物科学研究所Andrew L. Goodman教授团队在国际顶尖杂志Nature上发表了题为“Mapping human microbiome drug metabolism by gut bacteria and their genes”
质谱仪在代谢组学和代谢研究中有着杰出表现
质谱仪以离子源、质量分析器和离子检测器为核心。离子源是使试样分子在高真空条件下离子化的装置。电离后的分子因接受了过多的能量会进一步碎裂成较小质量的多种碎片离子和中性粒子。它们在加速电场作用下获取具有相同能量的平均动能而进入质量分析器。质量分析器是将同时进入其中的不同质量的离子，按质荷比m/e大小分
代谢组学前沿与热点——定性代谢流解决方案
作为代谢组学领域先进解决方案的一贯领导者，安捷伦近期隆重推出了全新的定性代谢流解决方案—— MassHunter VistaFlux 工作流程，旨在关注代谢组学的前沿和热点，提供更快、更准、更完整的高效工作流程，助力科研工作者拓展组学研究的精度与深度。 下面将从五个方面助您了解定性代谢流及安捷
综述－|AD的蛋白质组学格局发病机制和生物标志物新见解
导 读 基于质谱的蛋白质组学使得对阿尔茨海默症(AD)的蛋白质组和蛋白质翻译后修饰(PTM)的深入剖析成为可能。在这里，我们回顾了AD蛋白质组学研究的历史和近期的进展以及局限。作为遗传图谱的补充，蛋白质组学研究不仅验证了典型的淀粉样蛋白和tau通路，而且还发现了蛋白质网络中的新组成部分，如RN
骨质疏松了吗？请抽血检测骨代谢标志物
众所周知，骨质疏松对人体健康的危害很大，传统观点认为，骨质疏松症与衰老有关。然而最新的研究证明，其潜在于人一生的各个年龄段，甚至20多岁的女性都有可能患有此病。我院检验科最新开展了体液中骨代谢标志物的全套检测，相对于骨密度检测（BMD），骨标志物分析对治疗监测更具明显的时间优势，在治疗3个月后即
微生物的代谢
微生物在生长发育和繁殖过程中，需要不断地从外界环境中摄取营养物质，在体内经过一系列的生化反应，转变成能量和构成细胞的物质，并排出不需要的产物。这一系列的生化过程称为新陈代谢。 代谢作用是生物体维持生命活动过程中的一切生化反应的总称。它是生命活动的最基本特征。代谢作用包括分解代谢(异化作用)和合成
3个新肺癌生物标志物
在本期出版的《Carcinogenesis》中，研究小组报道了三个新的容易使人患病的单核苷酸多态性（SNPs），其中2个SNPs可提高非小细胞肺癌（non-small-cell lung cancer，NSCLC），另一个对应肺鳞癌风险。三个新SNPs为肺癌风险筛查和干预提供了潜在候选生物标志物
肿瘤常见生物标志物之：肺癌
肺癌被认为是全球主要的恶性肿瘤之一，提高肺癌早期诊断率及治疗有效率十分必要。发现高效肺癌生物标志物运用于临床是其重要手段之一，本文将介绍几种有研究前景的肺癌生物标记物。肿瘤标志物是指在恶性肿瘤的发生和增殖过程中，由肿瘤细胞的基因表达而合成分泌的或是由机体对肿瘤反应而异常产生的/或升高的、反映肿瘤存在
肿瘤常见生物标志物之：胃癌
胃癌是发病率和死亡率较高的恶性肿瘤，中国每年胃癌死亡病例占全球同期胃癌总死亡数的40%以上。目前的研究显示胃癌筛查是减少胃癌病死率有效的策略之一。利用胃癌生物标志物代替胃镜筛查，可达到更高的普及率，能做到早发现、早诊断、早治疗。本文介绍了胃癌常见的生物标志物及其研究概况。CA与CEA糖类抗原199（
氧化应激的生物标志物
评价方法氧化应激的定量评价方法大致分做三类：1）测定由活性氧修饰的化合物；2）测定活性氧消除系统酶和抗氧化物质的量；3）测定含有转录因子的氧化应激指示物。进一步尚有：1）生物体内氧化应激的程度足以产生应答；2）活体内难以蓄积；3）在活体内不是被代谢，而是稳定存在，等等。理解这些要点对于临床普及推广都
代谢组学研究的影响因素与降低生物化学和化学...（二）
组分提取软件的数据处理工作流程如图 4 所示。该软件能像分析人员一样解析数据，批量处理各个数据文件，而不是单独处理，并将每次运行得到的信息用于验证下一次运行获得的信息。按照这种方式，由于每种组分在数据集中的最大浓度点定义，从而大大减小了数据缺失值现象。同样的组分在低浓度样品中时，可以采用更靶标性
代谢组生物标记物与肾功能下降及高尿酸发病风险的关系
最近，国际临床医学研究期刊《美国肾脏病学会临床杂志》（Clinical Journal of the American Society of Nephrology）和《关节炎护理与研究》（Arthritis Care & Research）先后发表了中国科学院上海营养与健康研究所林旭研究组和中科
Science：新方法鉴定肠道微生物组产生的代谢物分子
肠道菌群产生数百种以高水平存在于血液循环中的分子，它们的水平在不同人之间差异很大。这些分子是研究肠道微生物组与宿主相互作用的一个有前景的起点；少数经过详细描述的分子具有强效的免疫或代谢调节活性，并且是G蛋白偶联受体或核激素受体的配体。但是，在大多数情况下，这些分子的产生尚未与特定的细菌菌株或代谢