综述：代谢组学研究加快医学生物标志物的发现

利用代谢组学发现中医黄疸病证候的关键生物标记物

　　国际蛋白质组学领域权威杂志《Molecular & Cellular Proteomics》(5-Year IF：9.392)2012年第8期发表了黑龙江中医药大学中药血清药物化学国家中医药管理局重点研究室王喜军课题组利用代谢组学全面解析中医黄疸证的研究论文《尿液代谢组学分析黄疸证的关键生物

我国科学家提出合成微生物组代谢调控的新方案

　　微生物感应群体密度，调控自身基因表达情况和群体行为的现象称为群体感应(QS, quorum sensing)现象。群体感应系统(Quorum Sensing System)是指参与该现象的基因簇，其天然广泛存在于微生物群体中，通过以高丝氨酸内脂(AHLs)为代表的一系列小分子传递信号，在微生物种

Science：新方法鉴定肠道微生物组产生的代谢物分子

　　肠道菌群产生数百种以高水平存在于血液循环中的分子，它们的水平在不同人之间差异很大。这些分子是研究肠道微生物组与宿主相互作用的一个有前景的起点；少数经过详细描述的分子具有强效的免疫或代谢调节活性，并且是G蛋白偶联受体或核激素受体的配体。但是，在大多数情况下，这些分子的产生尚未与特定的细菌菌株或代谢

近亿元！百趣生物完成A轮融资，加快代谢组学产品转化

近日，代谢组学专精特新企业——上海百趣生物宣布，完成近亿元 A 轮融资，本轮融资由启明创投独家领投。此次融资将主要用于百趣生物代谢组学科研服务仪器平台的扩建、检测试剂的研发及生产，促进代谢组学与蛋白质组学等多组学的技术融合，加快代谢组学产品的临床转化进程，推进质谱在生命科学领域的快速发展。百趣生物是

利用精确血浆代谢组学方法揭示衰老相关代谢特征

　　过去二十年里，代谢（脂质）组学研究得到了迅速发展。液相色谱与高分辨质谱联用（LC-HRMS）技术是目前内源性代谢物最常用的手段，然而困扰LC-HRMS技术的分析精度和结构鉴定的瓶颈问题仍然存在。尤其是血浆样本，其组分化学性质各异，同时复杂的基质会显著减低代谢物定性与定量结果的准确性，导致生物学信

Cell：广泛靶向代谢组技术揭示番茄代谢育种与驯化历史

　　继广泛靶向代谢组技术成果在NG、NC、PNAS发表后，2018年1月11日，《Cell》在线发表了题为“Rewiring of the fruit metabolome in tomato breeding”的研究论文。论文的通讯作者为迈维代谢首席科学家华中农业大学罗杰教授与中国农业科学院深圳农

实质等同性（代谢组学）实验

实验材料 SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒 [ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤 本章描述的方法最适合于分析小麦精白面，但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织，如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前，如其他任何田间试

合作成果丨靶向代谢组学

     本文内容非商业广告，仅供专业人士参考。关于岛津      岛津企业管理（中国）有限公司是（株）岛津制作所于1999年100%出资，在中国设立的现地法人公司，在中国全境拥有13个分公司，事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心，并拥有覆盖全国30个省的销售代理     

实质等同性（代谢组学）实验

实验材料：SIMCA - P 多变量统计软件    试剂、试剂盒：[ 1H ] - NMR 抽提剂      仪器、耗材：Eppendorf 聚丙稀管                                                                  NMR 管    

临床代谢组学研究常见问题

分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。Q：如何设置验证集和测试集？A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这几个数据集概念，通常

实质等同性（代谢组学）实验

实验材料SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒[ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤本章描述的方法最适合于分析小麦精白面，但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织，如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前，如其他任何田间试验或温室

代谢组学全流程解决方案

赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱（Orbitrap）质谱平台结合其功能强大的软件平台，提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求，而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标

欢迎加入【中药代谢组学与脂质组学】网络讲座

定量代谢组学案列：用小分子代谢产物诊断肠癌

近年来，医学领域的基础研究日趋系统化和多学科交叉，系统生物学的迅猛发展翻开了临床实践、药物研发的新篇章。作为国内较早涉足系统生物学研究的贾伟教授研究团队，近年来应用代谢组学技术对各种临床疾病的早期预测、诊断和预后的生物标志物进行了广泛的研究，现以结直肠癌的系列研究为例介绍我们的研究进展。研究团队首先

定量代谢组学案列：用小分子代谢产物诊断肠癌

　　近年来，医学领域的基础研究日趋系统化和多学科交叉，系统生物学的迅猛发展翻开了临床实践、药物研发的新篇章。作为国内较早涉足系统生物学研究的贾伟教授研究团队，近年来应用代谢组学技术对各种临床疾病的早期预测、诊断和预后的生物标志物进行了广泛的研究，现以结直肠癌的系列研究为例介绍我们的研究进展。 　　

非靶向代谢组学中鉴定代谢产物适宜选用哪些分析方法

据相关科技要闻解读表明非靶向代谢组学已逐步成为研究生命活动的重要基础。它可高清呈现代谢产物的变化规律以及代谢种类，特别是那些评价高的非靶向代谢组学更是揭开了研究集体生命活动发生和发展的本质，现在就非靶向代谢组学中鉴定代谢产物更适宜选用哪些分析方法作简要阐述：1.主成分分析（PCA）非靶向代谢组学中鉴

揭示肥胖和减重干预人群肠道微生物和血清代谢组变化

　　2017年6月19日，来自上海交通大学医学院附属瑞金医院、华大等机构的研究人员通过宏基因组关联分析，结合血清代谢组学和蛋白组学研究手段，完成了中国青年肥胖人群肠道菌群、循环氨基酸和临床表型之间的关系研究，建立了宏基因组和临床指标的分类与预测模型。这项研究阐明了肥胖病的起因和发展的分子机制，为建立

青岛能源所等开发微生物组内部代谢互作示踪新技术

　　微生物组（Microbiome）是微生物在自然界中的存在形式，它们无处不在、无所不能，与我们每个人乃至海洋、土壤、大气的健康都息息相关。在微生物组的内部，不同种类的微生物之间存在着复杂、精妙的相互作用与影响，这一跨物种的细胞间代谢互作网络是群落功能和进化的基础。然而由于自然界中绝大部分微生物尚难

微生物代谢的概念

微生物代谢是指微生物吸收营养物质维持生命和增殖并降解基质的一系列化学反应过程，包括有机物的降解和微生物的增殖。在分解代谢中，有机物在微生物作用下，发生氧化、放热和酶降解过程，使结构复杂的大分子降解；合成代谢中，微生物利用营养物及分解代谢中释放的能量，发生还原吸热及酶的合成过程，使微生物生长增殖。内源

eccDNA新型生物标志物的多种应用

　　新年伊始，eccDNA（染色体外环状DNA）的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现，2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排的全新功能。这一

eccDNA新型生物标志物的多种应用

　　文章导读 　　新年伊始，eccDNA（染色体外环状DNA）的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现，2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排

【盘点】肿瘤常见生物标志物之：胃癌

　　胃癌是发病率和死亡率较高的恶性肿瘤，中国每年胃癌死亡病例占全球同期胃癌总死亡数的40%以上。目前的研究显示胃癌筛查是减少胃癌病死率有效的策略之一。利用胃癌生物标志物代替胃镜筛查，可达到更高的普及率，能做到早发现、早诊断、早治疗。本文介绍了胃癌常见的生物标志物及其研究概况。　　CA与CEA　　糖类

生物标志物biomarker检测技术进展（三）

ELISA酶联免疫分析ELISA（酶联免疫分析）是很早被应用于体液样本临床蛋白标志物检测的技术，因而也被当成“金标准”来使用，但事实上受制于较简单的实验范式和有限的优化措施，ELISA技术的灵敏度非常有限。而ELISA由于其使用抗体的不同，结果也会体现不同的检测效力。粗制多克隆抗体，亲和纯化的多克隆

生物标志物biomarker检测技术进展（二）

生物标志物检测的创始：免疫组织化学人类最早是在组织样本中实现了生物标志物的检测。组织特异性的标志物在现代医疗中被经常用来研究肿瘤等疾病中的病理变化。最经典的被转化医学成功应用于组织中标志物检测的方法是免疫组织化学（Immunohistochemistry），特别是在肺炎中的早期应用。免疫组化技术在1

GEN：五个tips，验证“生物标志物”

　　1998年，美国国立卫生研究院（NIH）将“生物标志物”定义为“一个可以客观地测量和评价正常生物过程、致病过程、或药物治疗干预的反应指标的特征。自那时以来，生物标志物越来越普遍，不仅是在美国并且在其他监管市场，生物标志物加速药物开发的速度和效率。　　尽管生物标志物的应用越来越多，由于缺乏一致的验

生物标志物biomarker检测技术进展（五）

总结抗体依赖的检测方法毫无疑问是目前最为有效的蛋白生物标志物检测技术。通过数十年的努力，研发人员在灵敏度，多重检测能力和检测特异性方面取得了重要突破，使这类技术产生了长足的进步。以单分子检测技术为代表的超高检测灵敏度，以液相悬浮芯片为代表的多重指标检测技术分别为生物标志物的应用在深度和广度方面进行了

wes微量样品临床生物标志物定

后基因组时代，功能蛋白质组研究是临床医学非常重要的研究方向。通过功能蛋白质研究，发现新的生物标志物，用于疾病的临床诊断，药物研发，药物临床试验，对临床医学产生实质性的推动。典型的临床样本是稀缺的科学研究材料，临床研究需要定量的研究工具，因而在临床研究中针对微量样本，实现定量检测是技术平台必不可少的要

生物标志物biomarker检测技术进展（四）

全新的SMC单分子检测技术虽然现有多项生物标志物检测技术已经丰富了人们对生物标志物的认识，获取了大量数据和经验，解决了很多生物学或医学问题，但如前文所述的诸多瓶颈仍限制了生物标志物的应用。尤其是对于疾病，特别是肿瘤的早期诊断或预防而言，在疾病的潜伏期或是发生早期，就能在血清/血浆这样容易获得且远离病

eccDNA新型生物标志物的多种应用

　　新年伊始，eccDNA（染色体外环状DNA）的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现，2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排的全新功能。这一

生物标志物biomarker检测技术进展（一）

生物标志物的概念早在1983年被首次提出，它是指可以标记系统、器官、组织、细胞及亚细胞结构或功能的改变的生化指标，具有非常广泛的用途。由于生物标志物可用于疾病诊断、判断疾病分期或用于评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性，展示出在药物研发领域的重要作用。2010年10月，美国FDA出台文件讨论